Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G26580.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os014123 |
not found in 186aa |
AT2G26580.2 |
1st_not |
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II |
Os014122 |
not found in 186aa |
AT2G26580.2 |
not_not |
0.545994065 |
III |
Os041930 |
not found in 207aa |
AT2G26580.2 |
not_not |
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III |
Os041929 |
not found in 207aa |
AT2G26580.2 |
not_not |
0.525222551 |
III |
Os008985 |
not found in 256aa |
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III |
Os018243 |
not found in 266aa |
AT2G45190.1 |
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III |
Os027003 |
not found in 169aa |
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not found in 385aa |
AT2G26580.2 |
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not found in 453aa |
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not found in 280aa |
AT1G08465.1 |
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not found in 431aa |
AT4G00180.1 |
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not found in 186aa |
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II |
Gm046764 |
not found in 186aa |
AT2G26580.2 |
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III |
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not found in 181aa |
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III |
Gm034118 |
not found in 181aa |
AT1G08465.1 |
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III |
Gm033263 |
not found in 181aa |
AT1G08465.1 |
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III |
Gm033264 |
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III |
Gm033262 |
not found in 185aa |
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III |
Gm016718 |
not found in 188aa |
AT1G08465.1 |
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0.554896142 |
III |
Gm016717 |
not found in 188aa |
AT1G08465.1 |
not_not |
0.554896142 |
III |
Gm047022 |
not found in 215aa |
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not found in 214aa |
AT2G45190.1 |
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III |
Gm001387 |
not found in 215aa |
AT2G45190.1 |
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not found in 216aa |
AT2G45190.1 |
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III |
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Gm014655 |
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not found in 238aa |
AT1G23420.1 |
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AT1G23420.1 |
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0.442136498 |
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Gm011377 |
not found in 174aa |
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AT1G23420.1 |
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Pt005407 |
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II |
Pt009491 |
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AT2G26580.2 |
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Pt016250 |
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III |
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MSSSSTLSLDLLPSSE in 6/213 |
AT2G45190.1 |
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III |
Pt029907 |
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Pt033007 |
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AT2G45190.1 |
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0.507418397 |
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Pt040476 |
not found in 167aa |
AT2G45190.1 |
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Pt043388 |
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AT1G08465.1 |
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Pt035033 |
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III |
Pt041095 |
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AT1G23420.1 |
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0.421364985 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT2G26580.1 ----------------------------------------------------MANS----
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Sb031935_Sorbi1 ------------------------SEG-------------------------MSSA----
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pt033007_POPTR_ -----------------------------------------------------MSSSSS-
pt016250_POPTR_ ----------------------------------------------------MASSSAA-
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gm006033_Glyma0 ----------------------------------------------------MSSSSTS-
Os041929_Os12t0 -----------------------------------------------------MSA----
gm009436_Glyma0 ----------------------------------------------------MSTL----
gm046764_Glyma1 ----------------------------------------------------MSSCS---
gm011376_Glyma0 ----------------------------------------------------MSSSSTT-
pt035033_POPTR_ ----------------------------------------------------MSTL----
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pt029907_POPTR_ ---------------------------------------------------MLARV----
gm001387_Glyma0 ----------------------------------------------------MSSSSTS-
Os014122_Os03t0 -----------------------------------------------------MSA----
Sb022660_Sorbi1 -------------------------------------------------LCFASSLPPSR
gm033263_Glyma1 ----------------------------------------------------MSME----
Os027003_Os07t0 ------------------------------------------------------------
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gm037785_Glyma1 ----------------------------------------------------MSMD----
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gm014655_Glyma0 ----------------------------------------------------MSTL----
pt009491_POPTR_ ----------------------------------------------------MSSC----
Sb027997_Sorbi1 PDRARRRVLDDDSSLHRSSDRSIFSTASAPQVDQVVVGASCYISVLLGDRIMMSSSSSSS
gm047022_Glyma1 ----------------------------------------------------MSSSSST-
AT2G26580.1 ----------------V--------------MAT-E----------------QLCYIPCN
gm011377_Glyma0 ---------LSLD--HL-----------PP---S-E----------------QLCYVHCN
pt005407_POPTR_ --------------IDA--------------VPN-E----------------QLCYIPCN
Os018243_Os04t0 ---------FSLD--HLSQH---QQQQPPPLAEQ-E----------------QLCYVHCN
pt043388_POPTR_ ---------MSLD------------------IAS-E----------------RVCYVHCN
pt041095_POPTR_ --------------NHL---------FDLP-----D----------------QICYVQCG
Os008985_Os02t0 A-------VFPLD--HL--------AAPSP---T-E----------------QLCYVHCN
gm033264_Glyma1 ----------------M--------------MAT-E----------------RVCYVHCN
Os014123_Os03t0 ---------------QI--------------VPAPE----------------HVCYVHCN
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gm036154_Glyma1 --------------IDV--------------AP--E----------------QLCYIPCN
pt040476_POPTR_ ---------FGPD--HL-----------SS---S-E----------------QLCYVHCN
Sb031935_Sorbi1 ---------------QI--------------APA-D----------------HVCYVHCN
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Os041930_Os12t0 ---------------QI--------------APA-E----------------QVCYVHCN
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pt016250_POPTR_ ---------FSPD--HL-----------SS---S-D----------------QLCYVHCN
gm049372_Glyma1 --------------NHL---------FDLP-----E----------------QICYVQCG
Sb029682_Sorbi1 ---------FNLD--Q--QHLVVQQQQPPP-AEQ-E----------------QICYVHCS
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gm016718_Glyma0 ----------------M--------------MAT-E----------------RVCYVHCN
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Os041929_Os12t0 ---------------QI--------------APA-E----------------QVCYVHCN
gm009436_Glyma0 --------------NHL---------FDLP-----E----------------QICYIQCG
gm046764_Glyma1 --------------IDV--------------AP--E----------------QLCYIPCN
gm011376_Glyma0 ---------LSLD--HL-----------PP---S-E----------------QLCYVHCN
pt035033_POPTR_ --------------NHL---------FDPP-----D----------------QICYVQCG
pt010908_POPTR_ ---------LSLD--LL-----------PS---S-E----------------QLCYVHCN
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gm001387_Glyma0 ---------FSPD-QHL-----------SP---S-D----------------QLCYVHCN
Os014122_Os03t0 ---------------QI--------------VPAPE----------------HVCYVHCN
Sb022660_Sorbi1 SRLHGDGGYLEIE-EKMSAQ-----------FAS-E----------------HACYVNCN
gm033263_Glyma1 ----------------M--------------MAT-E----------------RVCYVHCN
Os027003_Os07t0 ----------------MSVQ-----------FTS-E----------------HVCYVNCN
gm000468_Glyma0 --------------NHL---------FDLP-----E----------------QICYVECG
gm037785_Glyma1 ----------------M--------------MAT-E----------------RVCYVHCN
gm016716_Glyma0 ----------------V--------------YIS-E----------------SVLVLAFY
gm014655_Glyma0 --------------TRL---------FDLP-----E----------------QICYIQCG
pt009491_POPTR_ --------------VDV--------------VPH-E----------------QLCYIPCN
Sb027997_Sorbi1 A-------AFPLD--HL---------APSP---T-E----------------QLCYVHCN
gm047022_Glyma1 ---------LSLD--HL-----------PP---S-E----------------QLCYVHCN
: :
AT2G26580.1 FCNIILAVNVPCSS---LFDIVTVRCGHCTNLWSVNMAAAL-QS----------------
gm011377_Glyma0 ICDTVLAVSVPCTS---LFKTVTVRCGHCTNLLPVNMRGLL-MP-----SPTQFH----L
pt005407_POPTR_ FCNIVLAVSVPCSS---LFDIVTVRCGHCTNIWSVNMAAAF-QS----------------
Os018243_Os04t0 FCDTILAVGVPCSS---LFKTVTVRCGHCANLLSVNLRGLL-LP-AAASTANQLP----F
pt043388_POPTR_ FCNTILVVNIPCSANSILLNTVTVRCGRCANLLSLNTGSLL-QT----------------
pt041095_POPTR_ FCTTILLVSVPCSS---LSTVVTVICGHCTSLFSVNMKKFSFLP---------FNRSTSL
Os008985_Os02t0 CCDTILAVGVPCSS---LFKTVTVRCGHCANLLSVNLRGLL-LPAPAPAPANQLH----F
gm033264_Glyma1 FCNTILAVSVPYSS---LLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL-QA----------------
Os014123_Os03t0 FCNTIFAVSVPSNS---MLNIVTVRCGHCTSLLSVNLRGLV-QA----------------
gm033262_Glyma1 FCNTILAVSVPYSS---LLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL-QA----------------
gm036154_Glyma1 FCNIVLAVSVPCSS---LFDIVTVRCGHCTNLWSVNMAAAF-QS----------------
pt040476_POPTR_ FCDTVLAVSVPCTS---LYKTVAVRCGHCTNLLSVSMHG-L-LP-----AANQFY----L
Sb031935_Sorbi1 FCNTVLAVSVPGNS---MLNIVTVRCGHCTNLLSVNLRALM-HS----------------
gm016717_Glyma0 FCNTILAVSVPYSS---LLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL-QA----------------
Os041930_Os12t0 FCNTILAVSVPGNS---MLNIVTVRCGHCTNLLSVNLRGLM-HS----------------
pt033007_POPTR_ ICDTVLAVSVPCTS---LFKTVTVRCGHCTNLLPVNMRGLF-LP-----SASQFP----L
pt016250_POPTR_ FCDTVLAVSVPCSS---LFKTVTVRCGHCTNLFSVNMRS-L-LP-----AANQFY----L
gm049372_Glyma1 FCTTILMVSVPCSI---LSTVVTVRCGHCTSLLSVNMKKASLVP---------FHLLASL
Sb029682_Sorbi1 YCDTILAVGVPCSS---LFQTVTVRCGHCSNLLYVNLRALL-LP-AA---ANQLPP--FG
gm034118_Glyma1 FCNTTLAVSVPCSS---LLTIVTVRCGHCANLLTVNMGASL-QT----------------
gm016718_Glyma0 FCNTILAVSVPYSS---LLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL-QA----------------
gm006033_Glyma0 FCDTVLAVSVPCTS---LFKNVTVRCGHCTNLLSVNMRGLL-LP-----SANQLH----L
Os041929_Os12t0 FCNTILAVSVPGNS---MLNIVTVRCGHCTNLLSVNLRGLM-HS----------------
gm009436_Glyma0 FCSTILMVSVPCSS---LSMVVTVRCGHCTSLFSVNMSKASFIP---------FHLLASL
gm046764_Glyma1 FCNIVLAVSVPCSS---LFDIVTVRCGHCTNLWSVNMAAAF-QS----------------
gm011376_Glyma0 ICDTVLAVSVPCTS---LFKTVTVRCGHCTNLLPVNMRGLL-MP-----SPTQFH----L
pt035033_POPTR_ FCTTILLVSVPCSS---SSTVVTVICGHCSSLLSVNLTKISFLP---------FNLLTSL
pt010908_POPTR_ ICDTVLAVSVPCTS---LFKTVTVRCGHCTNLLPVNMRGLL-LP-----SANQFH----L
pt029907_POPTR_ FTNSSWQVSVPSSS---LFNIVTVRCGHCGNLLSVNMGASL-QT----------------
gm001387_Glyma0 FCDTVLAVSVPCTS---LFKTVTVRCGHCTNLLSVNMRGLL-LP-----SANQLH----L
Os014122_Os03t0 FCNTIFAVSVPSNS---MLNIVTVRCGHCTSLLSVNLRGLV-QA----------------
Sb022660_Sorbi1 YCNTILVVNVPNSC---SHNIVTVKCGHCTMVLSMDLSPFHQQARTV-------------
gm033263_Glyma1 FCNTILAVSVPYSS---LLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL-QA----------------
Os027003_Os07t0 YCNTILVVNVPNNC---SYNIVTVRCGHCTMVLSMDLAPFH-QARTV-------------
gm000468_Glyma0 FCATILMVSVPSSS---LSMVVTVKCGHCTSVLSVNMMKASFVP---------FHLLASL
gm037785_Glyma1 FCNTTLAVSVPCSS---LLTIVTVRCGHCANLLTVNMGASL-QT----------------
gm016716_Glyma0 FLVYIL-VSVPYSS---LLTIVTVRCGHCANLLSVNMGASL-QA----------------
gm014655_Glyma0 FCNTILMVSVPCSS---LSMVVTVRCGHCTNLLSVNMLKASFIP---------FHLLASL
pt009491_POPTR_ FCNIVLAVSVPCSN---LFDIVTVRCGHCTNLWSVNMAAAF-QS----------------
Sb027997_Sorbi1 CCDTILAVGVPCSS---LFKTVTVRCGHCANLLSVNLRGLL-LP-PAAPPANHLN----F
gm047022_Glyma1 ICDTVLAVSVPCTS---LFKTVTVRCGHCTNLLPVNMRGLL-MP-----SPTQFH----L
*.:* . *:* **:* : :. .
AT2G26580.1 ---------LSR-P-------N----------FQATNYAV--PEY------G-----SSS
gm011377_Glyma0 GH-----SFFSP-S--HNLL-E---E-IPN---PSPNFLM--NQ-------------TNL
pt005407_POPTR_ ---------LSW-Q-------D---Q------VQASNYNS--HDYRI--DLG-----SSS
Os018243_Os04t0 GQ-----ALLSP-TSPHGLL-D---E-VPS--FQAPASLM--TEQ-ASPNVSSITS-SNS
pt043388_POPTR_ ---------SHP-Q-------N----------SHKQNLLY--QDLSE----G-----SQS
pt041095_POPTR_ SYEDE----LRP-------------EFNAQKGLEMQNSFMA----------------ISS
Os008985_Os02t0 GP-----SLLSP-TSPHGLL-D---E-V-A--FQTPSLLM--EQA-ASASLSSITGRSSS
gm033264_Glyma1 ---------FPP-Q-------D---P-------QKQHLSF--QEPSS-KELG-----SSS
Os014123_Os03t0 ---------LPA-E-------D---H-LQD-NLKMHNMS--FREN--YSEYG-----SSS
gm033262_Glyma1 ---------FPP-Q-------D---P-----QSQKQHLSF--QEPSS-KELG-----SSS
gm036154_Glyma1 ---------LSW-Q-------D----------VQGSGHCN--PEYRI--DTG-----STS
pt040476_POPTR_ GH-----GFFNP-Q---NIL----------------------------------------
Sb031935_Sorbi1 ---------LPE-Q-------D---Q-LQE-NIKVHGVNGTLHDQCGHLELG---S-SSS
gm016717_Glyma0 ---------FPP-Q-------D---P-----QSQKQLLSF--EEPSSCKELGS----SSS
Os041930_Os12t0 ---------APALQ-------D---H-HHH-HLQESGLSGCFRDQSGYPEFGFSAA-SSS
pt033007_POPTR_ GH-----NLYSP-S--HNLLDD---Q-IPN---PTPNFLI--NQ-------------THV
pt016250_POPTR_ GH-----GFFNP-Q--INIL-E---G-MRSTGAPPS-LMI--NQ-------------PNP
gm049372_Glyma1 TH-------LEP-K-------EGASEDGANKSLSSYNTSTM----------------TNS
Sb029682_Sorbi1 GQ-----ALLSP-TSPHGLL-DA-ET-MSS--FQAPRSLQPSTDP-PSACVSTITS-INN
gm034118_Glyma1 ---------FPS-Q-------D---T-T---QLQRQHLSV--QEACS-KELG-----SSS
gm016718_Glyma0 ---------FPP-Q-------D---P-----QSQKQLLSF--EEPSSCKELGS----SSS
gm006033_Glyma0 GH-----TFFTP-Q---NLM-E---E-IRN--APSTNIMM--NQL------------PNP
Os041929_Os12t0 ---------APALQ-------D---H-HHH-HLQESGLSGCFRDQSGYPEFGFSAA-SSS
gm009436_Glyma0 SH-------LEP-K-------ESSPEEDANKTLNSHSASMM----------------TYS
gm046764_Glyma1 ---------LSW-Q-------D----------VQGPGQCN--PEYRI--DTG-----STS
gm011376_Glyma0 GH-----SFFSP-S--HNLL-E---E-IPN---PSPNFLM--NQ-------------TNL
pt035033_POPTR_ SHDQEQKELLSP------------DEVNAQKGLDTQSSFIA----------------ISS
pt010908_POPTR_ GH-----SFFSP-S--HNLL-D---E-IPN---PTPNFLI--NQ-------------TNV
pt029907_POPTR_ ---------LPL-Q-------D---P-------QKLLLIN--SEDLN-KNFG-----SSS
gm001387_Glyma0 GH-----SFFTP-Q---NLL-E---E-IRN--APSTNMMM--NQL------------PNP
Os014122_Os03t0 ---------LPA-E-------D---H-LQD-NLKMHNMS--FREN--YSEYG-----SSS
Sb022660_Sorbi1 -------------P-------D--NQVVQNRGFQYNNFGS--YEQASSRNLR-----TPS
gm033263_Glyma1 ---------FPP-Q-------D---P---------QHLSF--QEPSS-KELG-----SSS
Os027003_Os07t0 -------------Q-------D--HQ-VQNRGFQGNNFGS--YDIA-SRNQR-----TST
gm000468_Glyma0 SH-------LEP-K-------ESSSEQDANKTLKRHNASMM----------------TYS
gm037785_Glyma1 ---------FPS-Q-------D---T-T---QLQRQHLSV--QEACS-KELG-----SSS
gm016716_Glyma0 ---------FPP-Q-------D---P-----QSQKQLLSF--EEPSSCKELGS----SSS
gm014655_Glyma0 SH-------LEP-K-------ESSPEEDANKTLNSHSASMM----------------TYS
pt009491_POPTR_ ---------LSW-Q-------D---H------VQASNHIS--HDYRI--DMG-----SSS
Sb027997_Sorbi1 GH-----SLLSP-TSPHGLL-D---E-L-A--LQAPSLLM--EQASANLSSSTMTGGSNS
gm047022_Glyma1 GH-----SFFSP-S--HNLL-E---E-IPN---PTPNFLM--NQ-------------TNF
AT2G26580.1 RS-------HTKIPSRISTRT-------ITE-QRIVN-------RPPEKRQRVPSAYNQF
gm011377_Glyma0 S-A-----SNEFSMPARIAAD------------ELPR---PIMNRPPEKRQRVPSAYNRF
pt005407_POPTR_ KC-------NNKISMRTPAAN------IVTQ-ERVVN-------RPPEKRQRVPSAYNQF
Os018243_Os04t0 SCA-----NNAPATSMASAA----NKATQRE-PQQPKNA-PSANRTSEKRQRVPSAYNRF
pt043388_POPTR_ SS------TGNKVSALEPSQN-------EQP-SRTVAVH-----AATGKKQRTPSAYNRF
pt041095_POPTR_ NN--------------------------DED-DRINQVN-RVINKPPEKRQRGPSAYNRF
Os008985_Os02t0 SCA-----SNAPAMQM------PPAKPVQQE-PELPKNAPASANRPPEKRQRVPSAYNRF
gm033264_Glyma1 KC-------SKIAPF-EAVEH-------E-L-PRIPPI------RPTEKRHRVPSAYNRF
Os014123_Os03t0 RYGRVP------MMFSKNDT----------E-HML-HV------RPPEKRQRVPSAYNRF
gm033262_Glyma1 KC-------SKIAPF-EAVEH-------E-L-PRIPPI------RPTEKRHRVPSAYNRF
gm036154_Glyma1 KC-------NNRIAMRAPTTH-------VTE-ERVVN-------RPPEKRQRVPSAYNQF
pt040476_POPTR_ -------------------------------------------------RHRVPSAYNRF
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