|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT2G29580.1 MAHRILRDHEADGWERSDFPIICESCLGDNPYVRMTKANYDKECKICTRPFTVFRWRPGR pp020977_Pp1s15 MAHKMLRVTEADGWERSDFPITCDCCLGDNPYVRMTKANFEKECKICIRPFTVFCWRSGR gm034934_Glyma1 MAHRLLRDHEADGWERSDFPIICESCLGDSPYVRMTKAEYDKECKICTRPFTVFRWRPGR gm005631_Glyma0 MAHRLLRDHEADGWERSDFPIICESCLGDSPYVRMTRAEYDKECKICTRPFTVFRWRPGR pt020818_POPTR_ MAHRLLKDPEADGWERSDFPIICESCLGDNPYVRMTRADFDKECKICTRPFTVFRWRPGR pt020819_POPTR_ ----------------------------------MTEG---------------------- Os027668_Os07t0 MAHRLLRDAQADGWERSDFPIICESCLGDNPYVRMLRAEYDKECKICARPFTVFRWRPGR Sm004248_Selmo1 ----------------------------------MTKANFDKECKICARPFTVFRWKAGR * .. AT2G29580.1 DARYKKTEVCQTCCKLKNVCQVCLLDLEYGLPVQVRDTALNISTHDSIPKSDVNREFFAE pp020977_Pp1s15 DARYEKTEVCQTYSKLKNVCQVCLLDLEYGLPVQVRDTALGINTSESIPKSD-------- gm034934_Glyma1 DARYKKTEICQTCSKLKNVCQVCLLDLEYGLPVQVRDSALSIDSNDAIPKSDVNREYFAE gm005631_Glyma0 DARYKKTEICQTCSKLKNVCQVCLLDLEYGLPVQVRDTALSIDSNDAIPKSDVNREYFAE pt020818_POPTR_ DARFKKTEVCQTCSKLKNVCQVCLLDLEYGLPVQVRDTALSINSNDAIPKSDVNREYFAE pt020819_POPTR_ ------------------------------------------------------------ Os027668_Os07t0 DARYKKTEICQTCCKLKNVCQVCLLDLEYGLPVQVRDTALSTNSNDAIPRSDVNREYFAE Sm004248_Selmo1 DSRYKKTEICQTCSKLQ--------------------------------RSDVNREYFAE AT2G29580.1 EHDRKTRAGLDYESSFGKIRPNDTIRMLQRTTPYYKRNRAHICSFFIRGECTRGDECPYR pp020977_Pp1s15 -----AKAGLDYESFFDKARPTDAILKLQRTTPYYKRNCAHICSFYVREECTRGSECPYR gm034934_Glyma1 EHDRKARAGIDYESSYGKVRPNDTILKLQRTTPYYKRNRAHICSFYIRGECTRGAECPYR gm005631_Glyma0 EHDRRARAGIDYESSYGKVRPNDTIMKLQRTTPYYKRNRAHICSFYIRGECTRGAECPYR pt020818_POPTR_ EHDRRARAGIDYESSYGKAQANDTILKLQRTTPYYKRNRAHVCSFFARGECTRGAECPYR pt020819_POPTR_ -------AGIDYESSYGKAQANDTILKLQRTTPYYKRNRAHVCSFFARGECTRGAECPYR Os027668_Os07t0 EHDRRARAGIDYDSSNGKARANDTILKLQRTAPYYKRNRAHVCSFYVRGECTRGAECPYR Sm004248_Selmo1 EHDRK----VDHESSFGKVRPNDMILKLQRTSPYYKRNRAHVCSFFVRGGCQRGDACPYR :*::* .* :..* * ****:****** **:***: * * ** **** AT2G29580.1 HEMPETGELSQQNIKDRYYG---VNDPVALKLLGKAGEMGTLESPEDQSIRTLYVGGLNS pp020977_Pp1s15 HEMPVTGELSQQNIKDRYYGYVDVNDPVAAKLLRKAGEMPSLAPPEDMSIKTLYVGGLID gm034934_Glyma1 HEMPVTGELSQQNIKDRYYG---VNDPVALKLLGKAGEMSTLEAPEDESIKTLYVGGLDA gm005631_Glyma0 HEMPETGELSQQNIKDRYYG---VNDPVALKLLGKAVEMNTLEAPEDESIKTLYVGGLDA pt020818_POPTR_ HEMPITGELSQQNIKDRYYG---VNDPVAMKLLNKAGDMPSLEPPEDESIKTLYVGGLDA pt020819_POPTR_ HEMPITGELSQQNIKDRYYG---VNDPVAMKLLNKAGDMPSLEPPEDESIKTLYVGGLDA Os027668_Os07t0 HEMPETGELSQQNIKDRYYG---VNDPVALKLLSKAGEMPSLTPPDDESIRTLYIGGLDS Sm004248_Selmo1 HEMPVTGELS-------HYG---LNDPVAAKLLKKAEEMSTLT-PDDATVRTLYVGGLDE **** ***** :** :***** *** ** :* :* *:* :::***:*** AT2G29580.1 RVLEQDIRDQFYAHGEIESIRILAEKACAFVTYTTREGAEKAAEELSNRLVVNGQRLKLT pp020977_Pp1s15 RVTEEDLKVQSYSYGEIESIRMVRQRACAFVTYTTREGAEEAADHLANKLVINGLRLK-- gm034934_Glyma1 RVTEQDLRDHFYAHGEIESIKMVLQRACAFVTYTTREGAEKAAEELSNKLVIKGLRLKLM gm005631_Glyma0 RVTEQDLRDHFYAHGEIESIKMVLQRACAFVTYTTREGAEKAAEELSNKLVIKGLRLKLM pt020818_POPTR_ RINEQDLRDQFYAHGEIESIKMVPQRAIAFVTYTTREGAEKAAAELSNRLVIKGLRLKLM pt020819_POPTR_ RINEQDLRDQFYAHGEIESIKMVPQRAIAFVTYTTREGAEKAAAELSNRLVIKGLRLKLM Os027668_Os07t0 RVTEQDLRDQFYAHGEIETIRMVLQRACAFVTYTTREGAEKAAEELANKLVIKGVRLKLM Sm004248_Selmo1 RVTTEDLKDNFYSYGEIESLRLVPQRACAFITYTTREDAEKAAEDLSFKHQSRTSKL-LK *: :*:: : *::****::::: ::* **:******.**:** .*: : . :* AT2G29580.1 WGRPQVPKPD------------------------------------QDGSNQQGSVAHSG pp020977_Pp1s15 W-RLQVERMK-----------------------------------------KGHLLQHLG gm034934_Glyma1 WGRPQTTKPES---------------------------------DGSDQARQQASVAHSG gm005631_Glyma0 WGRPQTSKPES---------------------------------DGSDQAKQQASVAHSG pt020818_POPTR_ WGRPQAPKPES---------------------------------ESSDEARQQAAMAHSG pt020819_POPTR_ WGRPQAPKPES---------------------------------ESSDEARQQAAMAHSG Os027668_Os07t0 WGKPQAPKPE------------------------------------EDEAGRQGHVAHGG Sm004248_Selmo1 W---QEIKPKLGAAWPSAKNGFQLAVYLDELNIFLYGGYFKEPASDKDQSDKGEKIRYGS * * : . : : : . AT2G29580.1 -----------LLPRAVISQQQN---------QPPPM---------LQYYMHPPPPQPPH pp020977_Pp1s15 SCHMVECFLVHLFLSNIFILVRN-------KPQTTLI----------------------- gm034934_Glyma1 -----------LLPRAVISQKQS-------QDQTQGM----------LYYNNLPPPQ--- gm005631_Glyma0 -----------LLPRAVISQQQN-------QDQTQGM----------LYYNNPPPLQ--- pt020818_POPTR_ -----------MLPRAVVSQQHNHLNPPGTQDQHPPM----------HYFNIPPPPQ--- pt020819_POPTR_ -----------MLPRAVVSQQHNHLNPPGTQDQHPPM----------HYFNIPPPPQ--- Os027668_Os07t0 -----------MLPRAVISQQQS-----GDQPQPPGMEGQQQPASASYYFNIPAPPA--- Sm004248_Selmo1 ----------WAKSRIFVHQEMSHLVWWCDSLHSVFM---------IEMYKCASKAEE-- .. . : : AT2G29580.1 QDRP------------------------------FYPSMDP----------------QRM pp020977_Pp1s15 YLRP------------------------------LNQMIDPFIPPW----------IRKQ gm034934_Glyma1 QERS------------------------------YYPSMDP----------------RRM gm005631_Glyma0 QERS------------------------------YYPSMDP----------------QRM pt020818_POPTR_ QERA------------------------------FYPSMDP----------------QRM pt020819_POPTR_ QERA------------------------------FYPSMDP----------------QRM Os027668_Os07t0 AERT------------------------------LYPSMDP----------------QRM Sm004248_Selmo1 SGRSKCGKCVCTLSVLLEGCCLVEESMLEWDTLFLYGCMKEVGEKEVTLDDLFLLDLNKL *. :. .: AT2G29580.1 GAVSSSKE----------------SGSSTSDNRGASSSSYTM----PPHGHY-PQHQP-- pp020977_Pp1s15 GGSSNSEQRPQPGQYDGRPMGPPPYGYSQQG--------------PPPHFQH--QHFR-- gm034934_Glyma1 GALVSSQ---------DAPGGPSGSEENNPGLEKQQMQHYAHPMMPPPPGQY-HQY---- gm005631_Glyma0 GALVASE--------DDSPGGPSVSGENKPSLGKQQMQHYAHPMMPPLAGQYHHQY---- pt020818_POPTR_ GALVGSQ--------DGTPNGPAGSGENKSGLEKQLGQHYPYQSMPPPHVQYQQQYQQQH pt020819_POPTR_ GALVGSQ--------DGTPNGPAGSGENKSGLEKQLGQHYPYQSMPPPHVQYQQQYQQQH Os027668_Os07t0 GALVESQE------GDGKP-GPQQAGQGQAS--SSSGQSYPE---PPPPYYHGGQY-PPY Sm004248_Selmo1 DVLNEEDGETD---NDNSDAGSISKGTDEEDDGKVVKKKDVELGLAD------SQQ---- . .. . . * AT2G29580.1 YPPP-SYGGYMQP---PYQQYP--PYHHG----------HSQQADHDY-PQQPGPGSRPN pp020977_Pp1s15 GPPPCAQGG--RPSL-SYQLYP--PHLQG----------GSLQFFR---PL--------- gm034934_Glyma1 YPP---Y-GYMPPPP-PYHQYPQPPYNAA--AAPSQ-------------PPAAAPSQPPA gm005631_Glyma0 YPP---Y-GYMLPVP-PYQQHP-PPYNA-----------------------AVAPSQPPA pt020818_POPTR_ YPA---Y-GYMPPVP-PYQQYP-LPYHTP--VPPPQVVQSTQQYQHRVPPPMAAPAESMT pt020819_POPTR_ YPA---Y-GYMPPVP-PYQQYP-LPYHTP--VPPPQVVQSTQQYQHRVPPPMAAPAESMT Os027668_Os07t0 YPP---YGGYMPPPRMPYQQPPQYPAYQPMLAPPAQSQASSLQ--------QPAPATQQL Sm004248_Selmo1 TPLELRKDGFELAKT-CYRELK--PVLDKL---------VRLEAAHNAEEEATKPSKERS * * . *: * AT2G29580.1 PPHPSSVSAPPPDSVSAAPSGSSQQSADAAVTTGSSQ------------------- pp020977_Pp1s15 -------------------------------------------------------- gm034934_Glyma1 ANHPYPHSMQPGSS------------------------------------------ gm005631_Glyma0 VNHPYQHSMQPGSSQTD--SG---QAAHAPAESGTSTSGSQQQ------------- pt020818_POPTR_ SVPPHQGSRDPAGSMPSEPSS---QGSEAPAGSKRSSPPSPRPGEPEESKPSGPLP pt020819_POPTR_ SVPPHQGSRDPAGSMPSEPSS---QGSEAPAGSKRSSPPSPRPGEPEESKPSGPLP Os027668_Os07t0 GQGPQQQTTQNGMT------------------------------------------ Sm004248_Selmo1 KKKQ----------------------------------------------------
|