Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G31180.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os008844 |
not found in 258aa |
AT3G23250.1 |
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II |
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not found in 258aa |
AT3G23250.1 |
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II |
Sb029619 |
not found in 450aa |
AT3G23250.1 |
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III |
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AT3G23250.1 |
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III |
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not found in 294aa |
AT2G31180.1 |
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Ia |
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not found in 272aa |
AT2G31180.1 |
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II |
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not found in 264aa |
AT3G23250.1 |
not_not |
0.470476190 |
III |
Gm002620 |
not found in 264aa |
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III |
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not found in 275aa |
AT3G23250.1 |
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III |
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not found in 272aa |
AT3G23250.1 |
not_not |
0.459047619 |
III |
Gm053246 |
not found in 212aa |
AT3G23250.1 |
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III |
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not found in 209aa |
AT2G31180.1 |
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0.409523809 |
II |
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not found in 272aa |
AT2G31180.1 |
1st_1st |
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Ia |
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not found in 273aa |
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0.481904761 |
III |
Pt042984 |
not found in 287aa |
AT3G23250.1 |
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0.462857142 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT2G31180.1 -----------------------------------MGRA-------PCCEKMG-------
Sb020839_Sorbi1 GEGAVLREGGAAAGRVEPRGGPAPGGLHPAERPPQLARAAPAGRPPPLREELPPPLDQLP
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gm055362_Glyma2 -----------------------------------MVRA-------PCCEKMG-------
Sb029619_Sorbi1 --------------------------------------A-------SITDILS--IDLY-
gm002620_Glyma0 -----------------------------------MVRA-------PCCEKMG-------
gm008200_Glyma0 -----------------------------------MTRT-------PCCERMG-------
Sb010751_Sorbi1 -----------------------------------MGRA-------PCCEKMG-------
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gm053246_Glyma1 -----------------------------------MTRT-------PCCERMG-------
pt001186_POPTR_ -----------------------------------MVRA-------PCCEKMG-------
: . : :
AT2G31180.1 ---------VKR--GPWTP-----------------------EEDQILINYIHLYGHSNW
Sb020839_Sorbi1 PPGHQARQLLRRRGGPHRPPPPRARQQVVSDRGAAAGAHRQRDQERVAHPHQEAPGGRRR
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Os008844_Os02t0 ---------LKR--GPWTA-----------------------EEDRILVAHIERHGHSNW
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gm008200_Glyma0 ---------LKK--GPWTA-----------------------EEDQILVSHIQRYGHGNW
Sb010751_Sorbi1 ---------LKR--GPWTP-----------------------EEDRVLVAHIERHGHSNW
pt042984_POPTR_ ---------LKR--GPWTP-----------------------EEDQILISYVQKYGHSNW
gm053246_Glyma1 ---------LKK--GPWTA-----------------------EEDQILVSHIQQYGHGNW
pt001186_POPTR_ ---------LKK--GPWTA-----------------------EEDQILINYIQLHGHGNW
::. * .::: .
AT2G31180.1 RALPKHAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
Sb020839_Sorbi1 RGGQEEGGA-----QKQARRC-------------------RQEIIRRQEDRRRQRRGQQQ
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gm007227_Glyma0 RALPKLAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
gm026385_Glyma1 RALPKLAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
gm028054_Glyma1 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
Os008844_Os02t0 RALPRQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
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gm055362_Glyma2 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
Sb029619_Sorbi1 RLSLSPSSVNWLCPLRC-KTCAEGEEKNHESISQGTENSSRARGLNLRQ-FLVHVAGLHE
gm002620_Glyma0 RALPKLAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
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Sb010751_Sorbi1 RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
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pt001186_POPTR_ RALPKQAGL-----LRCGKSC-------------------RLRWINYLR-----------
* .. : : * * . :. .
AT2G31180.1 ------PDIKRGNFTPQEE--QTIINLH---------------------ESLGN------
Sb020839_Sorbi1 RAAAAVPDSVAGAVEQREQRRDDVLHGH---------------------GLRGGRVVGRQ
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Sb029619_Sorbi1 HSE---PVVQVAVGANRRR-AQRVVGLHGDVEALERHGQRLRPEGVVELELLGV------
gm002620_Glyma0 ------PDIKRGNFSSEEE--EIIIKMH---------------------ELLGN------
gm008200_Glyma0 ------PDIKRGKFSKEEE--DTILKLH---------------------GILGN------
Sb010751_Sorbi1 ------PDIKRGNFTAEEE--DAIIQLH---------------------QMLGN------
pt042984_POPTR_ ------PDIKRGNFSKEEE--EAIIKLH---------------------EILGN------
gm053246_Glyma1 ------PDIKRGKFSKEEE--HTILKLH---------------------GILGN------
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* . ... . :: * *
AT2G31180.1 ------------RWSAIAAKLP-----GRTDNEIKNVWHTHLKKRLSKN-----------
Sb020839_Sorbi1 RGHHQPPARARARAGAGAARRQQGG-DGHGDGEL------HQLRRVPAHRRHLLVVGGRD
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gm028054_Glyma1 ------------RWSAIAAKLP-----GRTDNEIKNVWHTNLKKRLLKSDQ---------
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gm055362_Glyma2 ------------RWSAIAAKLP-----GRTDNEIKNVWHTNLKKRLLKSDQ---------
Sb029619_Sorbi1 ------------RGGGGEALLLDGEPAGRAPRVALLLLLLRHGRRLGHR-----------
gm002620_Glyma0 ------------RWSAIAAKLP-----GRTDNEIKNVWHTHLKKRLLNSDI---------
gm008200_Glyma0 ------------RWSAIAASLP-----GRTDNEIKNFWHTHLKKRIQKSG----------
Sb010751_Sorbi1 ------------RWSAIAARLP-----GRTDNEIKNVWHTHLKKRLE-------------
pt042984_POPTR_ ------------RWSAIASRLP-----GRTDNEIKNVWHTHLLKRLKQNG----------
gm053246_Glyma1 ------------RWSAIAASLP-----GRTDNEIKNFWHTHLKKRIQKSG----------
pt001186_POPTR_ ------------RWSAIAARLP-----GRTDNEIKNVWHTHLKKRLEKNHVT--------
* .. : *: . :*:
AT2G31180.1 ------LNNGGDTKDVNGI-------NETTNEDKGSVI----------------------
Sb020839_Sorbi1 GHGPR-RHGRGAGPRARRP-----------------------------------------
gm052305_Glyma1 ------QQSHHTKKRSKKQPPKLDADASKSNQDAKLE-Q---QDPVN----IHGSNSED-
gm007227_Glyma0 ------KQSHDQKKRSKKQ-PKLDVDASKSNQDAKLEQQ---QEPVNNNFPFHASNSED-
gm026385_Glyma1 ------------NKRVSKP--RI------KRSDSNSST----------------------
gm028054_Glyma1 ------SKSKPSSKRAIKP--KI------ERSDSNSSI----------------------
Os008844_Os02t0 ---P--KPSSGREAAAPKR----------KATKKA----------AAVAVAIDVPTT---
pt040508_POPTR_ ---PEINGRSVDVSRFNHE----------LKTGPEI-------VSSSNVVAAGCDQSKE-
gm055362_Glyma2 --------SKPSSKRATKP--KI------KRSDSNSSI----------------------
Sb029619_Sorbi1 ------RRGRRPFRRHRRGG---------SWDDGDVVGRRLLGGPALGPVLLAGATCLRP
gm002620_Glyma0 ------------QKRVSKP--RI------KRSDSNSST----------------------
gm008200_Glyma0 ------VHNGNPSSRI-----------------------------------------LQ-
Sb010751_Sorbi1 ---PTTKPASQAPKRKPKK----------QQQQPE----------TTAVTALEGPTTGA-
pt042984_POPTR_ ------EPKSQQHIRIPDC----------HLNDNKLS-----QSANSTIPSLSGCKSIE-
gm053246_Glyma1 ------VHNGNASSRI-----------------------------------------LQ-
pt001186_POPTR_ ---PEIKGRSVDISRFDHE----------LNTDQEL-------LDSSN-LAAGSDQTEE-
AT2G31180.1 ------------------------------------VDTASLQQFSNSITT--FDIS---
Sb020839_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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gm028054_Glyma1 --------------------------ITQSEPDNFNFREMDTITSSA-CTTSSSDFS---
Os008844_Os02t0 ---------------------------VPVSP-----EQSLSTTTTSAATT--EEYSYSM
pt040508_POPTR_ --------------------------HRPISP-----QQCSSDVSSV--TT--VDTS---
gm055362_Glyma2 --------------------------ITQSEPAHLRFREMDT-TSTA-CNTSSSDFS---
Sb029619_Sorbi1 VLLLRLGGGLQPLLEVRVPDVLDLVVRPPGQPG--------------------GDRG---
gm002620_Glyma0 --------------------------LTQLEP-----------TSSA-CTTSLSDFS---
gm008200_Glyma0 --------------------------EAQAN--------TSSNASS--------------
Sb010751_Sorbi1 --------------------------VVPVSP-----EQSLSTSTTS--TT--TDYS---
pt042984_POPTR_ --------------------------YAQISP-----QPSSSDHSSVTDTS--VTTS---
gm053246_Glyma1 --------------------------EAQAN--------TSLDASSAASST--VTA----
pt001186_POPTR_ --------------------------HRPISP-----QQCSSDTSSL--ITGDIDIS---
AT2G31180.1 ------NDNKDDIMSYEDI--------------SALIDDSFWSDVI-----SVDNSNKN-
Sb020839_Sorbi1 ---------------------------------AVVVHEGRGHGVL-----AQDAAGGR-
gm052305_Glyma1 SNVNIINNNHDMSLNVNDY------DIDTPEN-NLALDEDFWSEVL-----SSDNSG-V-
gm007227_Glyma0 GS---INNNHDMSLNVND-------DIDTPEN-NLALDEDFWSEVL-----SSDNSGET-
gm026385_Glyma1 -SFSEGTKNMDNMIKRED--------IESMETVKPPIDESFWPQETV----DYESSTMMQ
gm028054_Glyma1 -SVTVG--DSKN-IKSED--------TESTET-MPVIDESFWSEAAI----DDETPTMS-
Os008844_Os02t0 AS-SADHNTTDSFTSEEE----------------FQIDDSFWSETLAMTVDST-DSGM--
pt040508_POPTR_ ---------NDMCTKVAE--------SDD----FLEMDEIFWSEVL-----SADNSSMM-
gm055362_Glyma2 -SVTVG--DSKNIIKSED--------IESMET-MPVIDESFWSEAAI----DDETPTMS-
Sb029619_Sorbi1 ------PPVAELLVEGDDGVLFLLAEVAALDVRAQVVDPPEPAALA-----APQQPGLLG
gm002620_Glyma0 -SFSEGTKNMDNMIKSED--------IESVETIMPPIDESFWSEATV----DYESSTMM-
gm008200_Glyma0 ---------------------------------------------V-----MIANYGLP-
Sb010751_Sorbi1 AA-SSMENNADSSTSEEE--------EEE----DYQIDDSFWSETLAMTVDSSDDSGM--
pt042984_POPTR_ ------ETNNTGLIKVEN--------IDSSEI-YPVIDEDFWSEPE-----MVENSGMP-
gm053246_Glyma1 --------------------------------------------NV-----MIANYGLP-
pt001186_POPTR_ ---------NNMCMKIES--------SDD----FPEMDESFWSEVL-----SADNSRIV-
AT2G31180.1 ------------------------------EKKIED---------------------WEG
Sb020839_Sorbi1 --------------------------------------------------------RHEG
gm052305_Glyma1 -------TSGFPTLDYD------QRRGPY-R-LFVEY-----------------VRRWHG
gm007227_Glyma0 -------TSGFPTIDYD------HQFLPM-SPLMTE----------------------EG
gm026385_Glyma1 -------SSNSWTISNELA----PPQYQF--------------------------NSVET
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Os008844_Os02t0 -----------------------EMS-GG-DPLGAG---------------------GAS
pt040508_POPTR_ -------S------DYSAISTEPQLQFPF-SPLIID---------------------VEQ
gm055362_Glyma2 -------SQSLITISNDM-----PLQYPF-------------------------ANYEET
Sb029619_Sorbi1 QRAPVAVAEALDVVDQDLVLL--GRPWPLLEPHLLAARSPPHYLVLLDLLLRRVLSASAV
gm002620_Glyma0 -------TSNSWTISNELA----PPQYQF--------------------------NSVES
gm008200_Glyma0 -------SRNI-------------------NPPI------------------------AG
Sb010751_Sorbi1 -----------------------QAAFGG-AP--------------------------SS
pt042984_POPTR_ -------SSNF--LD--------DSQFPFPSPDTME---------------------RAG
gm053246_Glyma1 -------VRNI-------------------NPPI------------------------AG
pt001186_POPTR_ -------S------DFSAIGTEPQLQFPF-SPLVIE---------------------VEQ
AT2G31180.1 LIDRNSKKCSYSNSKLYN----D-D---------M-EFWFD-----------------VF
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gm028054_Glyma1 FQQGHHA---------Y-DSNFD-D-G-------M-DFWYD-----------------IF
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pt040508_POPTR_ VQATNS-------------NMYD-G---------M-DFWHN-----------------LF
gm055362_Glyma2 FQQS-HA---------Y-DSNFD-D-G-------M-DFWYD-----------------IF
Sb029619_Sorbi1 CFARLACLCR----------------G---------EVWGNAARQGEEGEACACCLPCLF
gm002620_Glyma0 FQQQSVD---------YNGSNDDHD-G-------M-DFWYD-----------------IF
gm008200_Glyma0 FYGAVSSD-------TFG-EIKD-NHGSCQLSEEM-EFWYN-----------------IY
Sb010751_Sorbi1 VTSTND----------------D-D---------M-DFWLK-----------------LF
pt042984_POPTR_ CYG-------------YGPKVDD-N---------M-EFWYN-----------------LF
gm053246_Glyma1 FYGAVSSD-------TFG-EIED-NHGSCQLSEEM-EFWYN-----------------IF
pt001186_POPTR_ VYATNS-------------NMYD-S---------T-EYWHD-----------------LF
AT2G31180.1 TSN--------RRIEEFSDIPEF--------------
Sb020839_Sorbi1 ------------QA-----------------------
gm052305_Glyma1 -------------------LLES--------------
gm007227_Glyma0 A-----------RAEEFTQLLEL--------------
gm026385_Glyma1 I-----------KSGESIELPEF--------------
gm028054_Glyma1 T-----------RTNDSIELLEF--------------
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pt040508_POPTR_ T-----------RAG---ELPELTEI-----------
gm055362_Glyma2 T-----------RTNDSIELSEF--------------
Sb029619_Sorbi1 VFGDGSTVLVAVKA-----------------------
gm002620_Glyma0 I-----------KSGESIELPEF--------------
gm008200_Glyma0 ------------SSNQGKHHETM-EI-----------
Sb010751_Sorbi1 M-----------QAGDMQNLPQI--------------
pt042984_POPTR_ I-----------KSGGIEELPVQ-YLQRYSYLADERI
gm053246_Glyma1 I-----------KSGQTS-------------------
pt001186_POPTR_ T-----------RAGGSLDLPEI--------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT2G31180.1 |
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Sb010751_Sorbi1 |
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pt042984_POPTR_ |
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Y |
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Q |
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Y |
S |
Y |
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A |
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gm053246_Glyma1 |
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pt001186_POPTR_ |
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