Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G33480.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os010934 |
not found in 650aa |
AT1G65910.1 |
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II |
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not found in 329aa |
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0.450881612 |
III |
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not found in 329aa |
AT1G77450.1 |
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III |
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not found in 303aa |
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III |
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not found in 425aa |
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III |
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not found in 318aa |
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III |
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III |
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III |
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AT3G04070.1 |
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0.418136020 |
III |
Os011013 |
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III |
Os036787 |
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AT4G36160.1 |
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0.413098236 |
III |
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GTANRRLMLQLSESLS in 462/729 |
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0.413098236 |
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III |
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0.405541561 |
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III |
Os001355 |
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AT5G17260.1 |
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0.400503778 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT2G33480.1 -----MEKRSS---------------------------------IKNRGVLRLPPGFRFH
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:* ** *:
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Os001355_Os01t0 PKDTELISHYLKKKIHG-QKIEYEI-IPEVDIYKHEPWDLPAKCDV----PTQD-NKWHF
*.* **: ** : : : : :* :* . .*
AT2G33480.1 FSTREAKYPNGNRSNRSTGSGYWKATGLDKQI---------GKKKLV-VGMKKTLVFYKG
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Os008987_Os02t0 FSHKDKKYPTGTRTNRATGAGFWKATGRDKPIYA--------RSCLV--GMRKTLVFYKG
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* :: ** .* *.**:: *:**:** :: : . :::**:: *
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Os005051_Os01t0 KAPKGEKTNWIMHEYRLADVDRSARKK------------------NSLR-----------
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Os037857_Os11t0 KPPKGVKTNWIMHEYRLADVDRSAAARKLSK-----------SSHNALR-----------
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:.* * :: *::***
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Os008451_Os02t0 ------------------------------------------------------------
Os039904_Os12t0 --DQHDQEPEGST-----------------VDEQLEDIHDNNSSSQQPPAPPD-----MN
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Os005051_Os01t0 AAV-----------AAA-----------------------GMVSSGGGVQRKPM------
Os028650_Os07t0 SQQ--------HATAAA-----------------------GMAGSDGAGGV---------
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Os001355_Os01t0 TEQ--------LNPAAE-----------------------PVVGVEAAPVTVAE------
AT2G33480.1 ------------------------------------------------------------
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Os037415_Os11t0 ------------------------------------------------------------
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Os008987_Os02t0 -----------------------RS----------------------------WSTTTSC
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Os023187_Os06t0 KH--------RDLTTKIQQL----------------------------------------
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Os037857_Os11t0 ----------DR--DSMPRLHTDSSGS---------------------------------
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Os036787_Os10t0 RY--------STRLAELPQL----------------------------------------
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Os034288_Os09t0 LGSSPAMPPPPP-----PPPQSI-LQAMSMP------MNQPRSTT--NQVMVTEQMIPGL
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Os004412_Os01t0 ---------------------------------------------TIL------------
Os037415_Os11t0 ------------------------------------------------------------
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Os000047_Os01t0 -------------------------------------------------G----------
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Os001355_Os01t0 ----------------------RNAFAGCSDARWNM--------ILVA-GFAIGV--AVV
AT2G33480.1 --YRENKFCLFL------------
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Os008987_Os02t0 ------------------------
Os036787_Os10t0 N-----------------------
Os008451_Os02t0 WAY---------------------
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Os017591_Os04t0 WGY---------------------
Os034288_Os09t0 ERYWPGSYQM--------------
Os001355_Os01t0 ALHIGQRLGLSQRDQQHT------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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Os001355_Os01t0 |
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