Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G33810.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Pt020564 |
not found in 148aa |
AT1G53160.1 |
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II |
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AT1G53160.1 |
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III |
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not found in 193aa |
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III |
Pt036762 |
not found in 202aa |
AT3G15270.1 |
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III |
Pt017695 |
not found in 408aa |
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III |
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NNEVGSLNLKLGEQVY in 115/1035 |
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III |
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AT3G60030.1 |
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0.584905660 |
III |
Pt034156 |
NDAAGSLNLKLGGQVY in 115/1030 |
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III |
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III |
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DRETGGLSLKLGGERD in 117/1004 |
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III |
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not found in 398aa |
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not found in 328aa |
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III |
Pt026319 |
not found in 561aa |
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III |
Pt037928 |
not found in 325aa |
AT1G02065.1 |
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III |
Pt028644 |
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SVDDDGLGLNLGGSLT in 71/1044 |
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III |
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AT1G69170.1 |
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III |
Pt011192 |
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III |
Pt026508 |
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III |
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III |
Pt010743 |
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AT5G50570.2 |
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AT2G33810.1 |
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0.433962264 |
II |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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AT2G33810.1 LRELS-------------------------------------------------------
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pt035879_POPTR_ IGCDTEAA-------------------------------------------------ESA
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pt038008_POPTR_ LAWDI-----------------------WELNTSRFDLVDSNNTTAAAGITT--NT-TTA
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pt036762_POPTR_ IRMVM-------------------------------------------------------
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pt026319_POPTR_ MSCDLKNQ------------------CNFEYN---FLA-------------------SGS
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pt028644_POPTR_ ----------------------------------------------------------LA
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pt011192_POPTR_ ASKTNPSDYNKEELVKAKATDTSPTLE--------ASVGSGDQLLGLKLGKRTYFEDACA
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pt017695_POPTR_ PDPHLMCLKLGKRHYFENSTSNNNH---SNHPVS-DRHEVG--GFSI-------------
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pt036762_POPTR_ EDEFFESNKKKKVVVTA---------------------AAA-------------------
pt041897_POPTR_ ELE-----KRRRVVFVEDENLNN---------------EVG--SLNLKLG--EQVYPLMD
pt009486_POPTR_ TADGFPGVIIRKDLTRVESTENIPSLG--------ASASSGEPVIGLKLGKRMYFEDICT
pt026319_POPTR_ NINPFV--VTPNSFSLEDESTSRLS---STAMDS-DCRVSA--FIDLNLGRFGDPRDVQN
pt016591_POPTR_ ELE-----KRRRVVVIDDDNLND--------------RETG--GLSLKLG--GE-RDAGN
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pt031248_POPTR_ DDE-----KKKGAGVM--------------------------------------------
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pt018004_POPTR_ DFV----------NRLYRRSRPLDPGSSSNAPR----------CQAEGCNADLTHAKHYH
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pt036762_POPTR_ ----------AGGGRRVS----SGGGGGMRC------------CQVEKCTANLTDAKQYH
pt041897_POPTR_ --------EDAKSGKKTKV-----TMTASNRAV----------CQVEDCRADLSNAKDYH
pt009486_POPTR_ TSTA---------KSSSSSIVSTSCTATTKRSRASYPSTQSPRCQVEGCNLDLKSAKDYH
pt026319_POPTR_ CRRIPKSTSIVSPSKSSAPPRRHRAGMNSHTAY----------CQVYDCNKDLSSSKEYH
pt016591_POPTR_ --------WEGSIGKKTKL-----VGSGLSRAV----------CQVEDCGVDLSNAKDYH
pt041356_POPTR_ -----------LPGKKRVRV----ARAGSSIAR----------CQVPGCETDISELKGYH
pt009487_POPTR_ TSTA---------KSSSSSIVSTSCTATTKRSRASYPSTQSPRCQVEGCNLDLKSAKDYH
pt028644_POPTR_ -KY----------KDPGGSLMESSSSGSSKRARTPNNATLVPSCLVDGCTSDLSKCRDYH
pt031248_POPTR_ ------------HGKRGT------GSGGASPPS----------CQVEKCGANLTDAKRYH
* . * : : **
AT2G33810.1 KRHKVCQFHAKAPHVRISGLHQRFCQQCSRFHALSEFDEAKRSCRRRLAGHNERRRKSTT
pt040977_POPTR_ KRHKVCEVHSKTPQVIVDGNEQRFCQQCSRFHLLVDFDDGKRSCRKRLAGHNERRRKPQL
pt037928_POPTR_ RRHKVCEFHSKASTVIAAGLTQRFCQQCSRFHILSEFDNGKRSCRKRLADHNRRRRKSHQ
pt000952_POPTR_ RRHKVCEVHSKATKALVGKQMQRFCQQCSRFHPLTEFDEGKRSCRRRLAGHNRRRRKTQP
pt024951_POPTR_ RRHKVCEFHAKAPFAPVNGLQQRFCQQCSR------------------------------
pt023544_POPTR_ RRHKVCELHSKTPQVTIGGQKQRFCQQCSRFHSLEEFDEGKRSCRKRLDGHNRRRRKPQP
pt010743_POPTR_ RRHKVCELHSKSRQVFIKGQEQRFCQQCSRFHSLGEFDEGKRSCRKRLDGHNRRRRKSQP
pt009485_POPTR_ RRHRICEKHSKSPKVIVAGMERRFCQQCSRFHELSEFDDKKRSCRRRLSDHNARRRRPQP
pt035879_POPTR_ KRHKVCEVHTKTPQVIVNGNEQRFCQQCSRFHLLVEFDDGKRSCRKRLAGHNERRRKPQF
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pt025879_POPTR_ RRHKVCEVHAKSPAVVVAGLRQRFCQQCSRFHELLEFDETKRSCRRRLAGHNERRRKNTA
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pt032908_POPTR_ RKHRVCESHSKCQKVIVAGLERRFCQQCSRFHGLSEFDEKKKSCRRRLSDHNARRRK-QP
pt034157_POPTR_ RRHKVCDVHSKASMALVGNVMQRFCQQCSRFHVLQEFDEGKRSCRRRLAGHNKRRRKTHP
pt020564_POPTR_ KRHKVCEFHAKASSVLVNGVEQRFCQQCSRFHDLSEFDDSKRSCRRRLAGHNERRRKSSS
pt018004_POPTR_ RRHKVCEFHSKASTVIAAGLTQRFCQQCSRFHLLSEFDNGKRSCRKRLADHNRRRRKSHQ
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pt041897_POPTR_ RRHKVCNAHSKASKALVGNVMQRFCQQCSRFHVLQEFDEGKRSCRRRLAGHNKRRRKTHP
pt009486_POPTR_ RRHRICEKHSKSPKVIVAGMERRFCQQCSRFHELSEFDDKKRSCRRRLSDHNARRRRPQP
pt026319_POPTR_ KRHKVCEVHSRTAKVIVNGIEQRFCQQCSRFHLLAEFDDGKRSCRKRLAGHNERRRKPQV
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pt031248_POPTR_ RRHKVCEVHAKSPAVVVAGLRQRFCQQCSRFHELVEFDETKRSCRRRLAGHNERRRKSTA
::*::* : . :*:****.:
AT2G33810.1 D-----------------------------------------------------------
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pt037928_POPTR_ VNQENQ------------------------------------------------------
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pt035879_POPTR_ GTLSVK---PHK-------------LLHPF------------------------------
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AT2G33810.1 ------------------------------------------------------------
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pt039458_POPTR_ ILSVKPIAITASERAEFLIKGVNLSRPATRLLCAVEGNYMVQENRQEVMDGVDSF--KGH
pt038233_POPTR_ LILVSPVAVIGGQETSLQLKGRNLTGPGTKIHCTYMGGY----TSKEVTDSSSPG--SMY
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pt034157_POPTR_ ISSITPIAVSLSERTQFVVRGFNIVRPVTRVLCAVEGKYLVQETCYDLMDGAATM--NEH
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pt034156_POPTR_ ISSITPIAVSLSERTQFVVRGFNIVRPVTRVLCAVEGKYLVQETCYDLMDGAATM--NEH
pt036762_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt041897_POPTR_ ISSITPIAVSLSERTQFVVRGFDIAQPMTRLLCAVEGKYLVQETCYDLMDGADTM--NEL
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AT2G33810.1 ------------------------------------------------------------
pt040977_POPTR_ -------------------------DDRNFCNT------------TTFHELAGASHSS--
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pt000952_POPTR_ DEIN----------------------------------MADASICKELRLLESEFDEKAK
pt024951_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt023544_POPTR_ ------------------------------SSGASSHSMFCDRLATQVQDSD--------
pt010743_POPTR_ -------------------------REIGLSD------MMQPDLNSPAQSL---------
pt009485_POPTR_ --------------------------------------MEQASLESRVHSL---------
pt035879_POPTR_ -------------------------EDLTISNT-----------ATTINELAGVSHSS--
pt011192_POPTR_ --------------------------------------TEQQSNDPQVHTL---------
pt038008_POPTR_ ------------------------------SSAALRELIAEHRAAIPARQL---------
pt034721_POPTR_ HQLYKILTHC--IEPNLLGPLFIEVENESGLSNFIPVLIGDRDVCFEMKIIQQRFDVSHS
pt025879_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt026508_POPTR_ ------------------------------SSGASSHSMFCDRL-TQIQDSD--------
pt017695_POPTR_ ------------------------------SSAALRELIAEHRTAILSRQL---------
pt039458_POPTR_ DEVQCVNFSC--SIPMVTGRGFIEIEDHGFSSSFFPFLVAEEDVCSEIRMLEGVLE-TET
pt038233_POPTR_ DEINVGGFKIHGPSPSILGRCFIEVEN-GFKGNSFPVIIADASICKELRLLESEFDENAV
pt032908_POPTR_ --------------------------------------TEQPSTDSQVHTL---------
pt034157_POPTR_ GKPQCLNFQC--SVPNFVGRGFIEIEDHSLSSSFFPFIVAEPEVCSEIRTLEDAIQVAET
pt020564_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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pt041897_POPTR_ DKPQYLNFQC--SVPNFVGRGFIEVEDHGLSSSFFPFIVAEPEVCSEIRMLEDAIQVAET
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pt026319_POPTR_ DE------------------------------------FAAFDAASTIQELSGITASG--
pt016591_POPTR_ DEVQCVNLSC--SIPTLTGRGFIEIEDHGFSSSFFPFLVAEEDVCSEIRMLEGALEFTET
pt041356_POPTR_ HQLYKILTHC--NEPNLLGPAFIEVENESGLSNYIPILIGDTEICSEMKIIQQRFDASHS
pt009487_POPTR_ --------------------------------------MEQASLESRVHSL---------
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AT2G33810.1 ------------------------------------------------------------
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pt036762_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt041897_POPTR_ VAACRDGAENVLDALTDDPGLVGIDAWKRARDSTGLTPYD---Y-----ACLRGHYSYIH
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pt026319_POPTR_ ----------SMDQI------IGV--SSQVSSSTGV-PNK---FPSWVTSSVKGS----H
pt016591_POPTR_ IAAGKDGSEDVLDALTEDPGMVGIVAWKNARDSTGFSPED---Y-----ARLRGHYSYIH
pt041356_POPTR_ ------GKEN---------------------------------------NCISGSCCG--
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pt038233_POPTR_ LVARKLADKRN--GQISVAI--------------------GNEI-EQAALEQEHVTISQF
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pt041897_POPTR_ LIQRKINKKSES-GNVVLDI---PSSLVD----CNSKQKDGNELPKVTSLHTEKIKMKAT
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pt026319_POPTR_ LGPMPIPENSHV---VNFDI---TDGVYH---GFNAKDHFGSE--DDTTIDL--------
pt016591_POPTR_ LVQKK-SKRQVV-GHVVLDI---PSNLSNSNIAINEKQNEGLT----SGFEIGHTELRPI
pt041356_POPTR_ ------NNKESV-ALSTENLEQRPNGVLGVM--GNSNFTVRSD--EFPLLTKDVVMRMNL
pt009487_POPTR_ -------------NQFS-------------------------------------------
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pt039458_POPTR_ --QGNCKLCSQKVVYGI-------ASRSQLYRPAMLSMVAIAAVCVC-------------
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pt041356_POPTR_ VNERPKKSC-----------GLVFSNRVLKYRPSFYVIALIAVCFGVCAI-----VLHPH
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AT2G33810.1 -----------------------------------------------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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