Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G37060.3 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os028984 |
not found in 224aa |
AT4G14540.1 |
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III |
Os028983 |
not found in 224aa |
AT4G14540.1 |
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0.495774647 |
III |
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not found in 288aa |
AT4G14540.1 |
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III |
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AT4G14540.1 |
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III |
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III |
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III |
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III |
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AT4G14540.1 |
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AT4G14540.1 |
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AT5G47640.1 |
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III |
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III |
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AT5G47640.1 |
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0.501408450 |
III |
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III |
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AT2G47810.1 |
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III |
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III |
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III |
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AT3G53340.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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pt016647_POPTR_ ------------MAD-S------------------DN-----------------------
pt001769_POPTR_ ------------MED-E------------------NHKNGTD----------------GH
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pp009279_Pp1s30 ------------MAD-SY----------------GHN-AGSP-----------------E
pp009280_Pp1s30 ------------MAD-SY----------------GHN-AGSP-----------------E
pp009281_Pp1s30 ------------MAD-SY----------------GHN-AGSP-----------------E
pt036929_POPTR_ ------------MTG-KR---------------TQISPIGSP-----------------L
pt044860_POPTR_ ------------MDR-GGFHGY---------RKHANTSSEINMRLAEINH---------S
Sb015253_Sorbi1 ------------MKS-RKGYGHQGHLLSPVGSPPSDNESGAVAAAA---------TAGGG
pp009282_Pp1s30 ------------MAD-SY----------------GHN-AGSP-----------------E
gm055239_Glyma2 ------------MSD-A---------------------PPSP------------------
pt035615_POPTR_ ------------MAD-N---------------------PTSP-----------------A
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gm005596_Glyma0 ------------MAE-S------------------DNDSGGA------------------
pt043913_POPTR_ ------------MAD-S------------------DNESGEQN-----------------
gm024076_Glyma0 ------------MED-S---------------------IG--------------------
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Os004570_Os01t0 ------------MAD-A-----------------GHDESGSP-----------------P
gm019625_Glyma0 ------------MET-GGFHGY---------RKLPNTTSGLKLSVSDMNMNMRQQQVASS
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pt041815_POPTR_ ------------MVD-N---------------------VG--------------------
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pt036929_POPTR_ S------------ENISES--------SSKLEQDRFL---------PIANVSR------I
pt044860_POPTR_ TTNKF--------HTTT-DDI----SECTVREQDRFM---------PIANVIR------I
Sb015253_Sorbi1 GGCGSSVGYC-----GGGGG------ESPAKEQDRFL---------PIANVSR------I
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pt043913_POPTR_ -------------NSNTNYS-----TETSPREQDRLL---------PIANVSR------I
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gm019625_Glyma0 DQNCSN-------HSAA-GEE----NECTVREQDRFM---------PIANVIR------I
pt006104_POPTR_ DGNAP--------HGRQ-DDI----NECTVREQDRFM---------PIANVIR------I
pt041815_POPTR_ --------------AGASSD-----DGGVKLEQDRLL---------PIANVGR------I
gm023182_Glyma0 -------------HNGGKG------SEMSPREQDRFL---------PIANVSR------I
Sb024092_Sorbi1 NA-----------------------DFSSPREQDRFL---------PIANVSR------I
Os030323_Os08t0 GGCGSSAGYV--VYGGGGGG------DSPAKEQDRFL---------PIANVSR------I
. *
AT2G37060.3 MKRGLPANGKIAKDAKEIVQECVSE---------------FISFVT--------------
pp009284_Pp1s30 MKKALPSNAKISKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
gm026530_Glyma1 MKQILPPNAKISKEAKETMQESVSE---------------FISFVT--------------
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pt043409_POPTR_ MKKALPANGKIAKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
pt035616_POPTR_ MKKALPANGKIAKDAKDTVQECVSE---------------FISFVT--------------
gm041932_Glyma1 MKKALPANAKISKEAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
pp037984_Pp1s25 MKKALPANAKIAKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
gm023734_Glyma0 MKKALPANAKISKEAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
pp036937_Pp1s83 MKKALPSNAKISKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
Os028984_Os07t0 MKRALPANAKISKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
pp036936_Pp1s83 MKKALPSNAKISKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
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Sb026432_Sorbi1 VALELAVLVEVPAHGVDVVVEAEGAEGPADVVAVDGLALLLVALVG--------------
pp009283_Pp1s30 MKKALPSNAKISKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
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pt035614_POPTR_ MKKALPANGKIAKDAKDTVQECVSE---------------FISFVT--------------
pp038018_Pp1s25 MKKALPANAKIAKDAKETVQECVSE---------------FISFITKLEGDTMVRKH---
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Sm007604_Selmo1 --------LEIELEWIDVVLESQRPHRPEEIIAIDGLALLALALVR--------------
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Os013460_Os03t0 MKKALPANAKISKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
Sb032742_Sorbi1 AKRVTSARGRSGRPSTATT--CCGP---------------WPHWGL-----RTTLNHSRC
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Sb001867_Sorbi1 MKKALPANAKISKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
Sm017738_Selmo1 MKKALPANAKIAKDAKETVQECVSE---------------FISFIT--------------
gm007397_Glyma0 ------------------------K---------------FLEF----------------
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gm004139_Glyma0 MKQILPPNAKISKEAKETMQECVSE---------------FISFVT--------------
Os005512_Os01t0 MKQILPPNAKISKEAKETMQECVSE---------------FISFVT--------------
Sb010924_Sorbi1 MRRVLPAHAKISDDAQETIQECVSE---------------YISFIT--------------
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*.:.. . : :*: :* :. .
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:
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pp009280_Pp1s30 ----NGMN-GTMNGNMHGHGIPVSMQMLQQSYGQQAPPGM--MYS--------PHQM---
pp009281_Pp1s30 ----NGMN-GTMNGNMHGHGIPVSMQMLQQSYGQQAPPGM--MYS--------PHQM---
pt036929_POPTR_ ---------YSLGTEVTAKS----------------------------------------
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pp037985_Pp1s25 ----N----------------P---------------------YM--------QAQM---
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Os004570_Os01t0 ------------------------------------------------------------
gm019625_Glyma0 -------------------------------AFVPPPFH--------------HHNG---
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Sb024092_Sorbi1 GGGGSGMI-MMMGQPMYGGSPPAA-------SGYPQPP---------------HHQM---
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pp009279_Pp1s30 |
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pp009280_Pp1s30 |
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pp009281_Pp1s30 |
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pt036929_POPTR_ |
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pt044860_POPTR_ |
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gm055239_Glyma2 |
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pt029632_POPTR_ |
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gm005596_Glyma0 |
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gm024076_Glyma0 |
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pp037985_Pp1s25 |
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pt004980_POPTR_ |
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Os004570_Os01t0 |
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pt041815_POPTR_ |
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gm023182_Glyma0 |
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Sb024092_Sorbi1 |
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Os030323_Os08t0 |
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