Input
| Putative repression domain
|
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AT2G37060.3 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os021976 |
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AT4G14540.1 |
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AT4G14540.1 |
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III |
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not found in 224aa |
AT4G14540.1 |
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0.495774647 |
III |
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AT4G14540.1 |
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AT3G53340.1 |
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not found in 174aa |
AT2G37060.3 |
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0.616901408 |
II |
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AT5G47640.1 |
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AT2G47810.1 |
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0.540845070 |
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AT4G14540.1 |
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AT4G14540.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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pt000530_POPTR_ ------------MTG-K------GTQSSPIG----------------SPSSENIS-----
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pt044860_POPTR_ ------------MDR-GGFHGYRKHANTSSEINMRLAEINH---------STTNKF----
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. *
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:. . : :*: :*
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:. . :
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gm028165_Glyma1 G-----------DGSARPDQV---------------------------------GLAGQ-
pp036937_Pp1s83 G-----------DQQGGKE---------------SNQGGM------GS-MGMAGGINGM-
pt000530_POPTR_ E-----------DQLSPTN----------------------------------HGTVGTH
pp037985_Pp1s25 G-----------ESSSGKK-----------------------------------------
pt044860_POPTR_ ----------LMKTRNSN--------------NNNNVDQY------GTLMAGAGAAYAPA
gm019720_Glyma0 EQ--------RLHQ-HQQNHNN--------NHDENNNQPF--------------------
pt035615_POPTR_ G-----------DGSSKREAV--------------------------------GGLPAQ-
Sm017738_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm007396_Glyma0 G-----------DSSAKRDVQ-----------------------------------PSP-
Os021976_Os05t0 ------------------------------------------------------------
pt041090_POPTR_ G-----------DGSSKRDAV--------------------------------GGLPGQ-
Os004570_Os01t0 ------------------------------------------------------------
pt017365_POPTR_ E-----------EKD--DSSKY--------------------------------------
pt035613_POPTR_ G-----------DGSSKREAV--------------------------------GGLPAQ-
Sb032742_Sorbi1 G-----------DGSIKKDA-----------------------------LGHVGGSSSA-
pt041815_POPTR_ N-----------NTSIADQEKE--------------------------------------
Sb008970_Sorbi1 G-----------EGSIKKD-------------AISSHGGT------SS------------
pp009281_Pp1s30 G-----------DQQGGKE---------------GSQGVM------GS-MGMSGGMNGM-
Sm007604_Selmo1 G---------SLDGGMDNRRSPR-------------------------------------
Sb001867_Sorbi1 G-----------SNTAVQHQQQGDV----VQRGAANAGGY------AG-Y---GGAPGA-
pp009283_Pp1s30 G-----------DQQGGKE---------------GSQGVM------GS-MGMSGGMNGM-
AT2G37060.3 ------------------NGQFS------------------QL-AHQG------------
Sb026432_Sorbi1 ---------------------------------------S--------------------
gm028166_Glyma1 ------------------NAQ---------------------L-VHQGSLNYIGLQV---
pt035614_POPTR_ ------------------NAQ---------------------F-ALQGSMNYISPQVILS
pt004980_POPTR_ ------------------GGNVYGG-----MQS--------SM-MMMGHHPL--------
pp009279_Pp1s30 ------------------NGTMNGN-----MHGHGIPV-SMQM-LQQSYG----------
pp037984_Pp1s25 ------------------EGS---G-----MVSPGV-----QM-VQQG------------
pt029632_POPTR_ ------------------GAE-----------------------GFSGYV----------
gm004139_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm048942_Glyma1 ------------------GGI---------------------M-MHQGHV----------
gm023734_Glyma0 ------------------HGH----------------A-TPMMTMMMGHQP---------
Os009649_Os02t0 PHPPPHHHAFHQLMP-PHHG-QYAP-PYD-MYGG-----EHGMAAYYGG-----------
pt035616_POPTR_ ------------------NAQ---------------------F-ALQGSMNYISPQVILS
Sb024092_Sorbi1 ------------------GGS--------------------GMIMMMGQPMYG-------
Sb015253_Sorbi1 ------------------AGH-----------DGAADA-DAHVGLMMGGASSV-------
gm007397_Glyma0 ----------------SPNAQL----------------------AHQGSF----------
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gm045576_Glyma1 YH--------------HHNG-------------------------YFGA-----------
pp009284_Pp1s30 ------------------NGTMNGN-----MHGHGIPV-SMQM-LQQSYG----------
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gm041932_Glyma1 -------------------GH----------------A-TPMM-IMMGHQ----------
Sb010924_Sorbi1 PGPPHHGHGHGFLMPHPQGGSHYLPYPYEPTYGG-----EHAMAAYYGGA----------
pt043913_POPTR_ ------------------GGNMYVG-----MQS--------SM-AMMGHHHYQH------
Os028984_Os07t0 ------------------MGQ---P-----MYGSP-PA-S-----SAGYA----------
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pt043409_POPTR_ ------------------NAQ---------------------V---KWSFMLLSYCHFLF
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Sm018351_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm019625_Glyma0 FH--------------HHNG-------------------------YFGA-----------
gm028165_Glyma1 ------------------NAQ---------------------L-VHQGSLNYIGLQV---
pp036937_Pp1s83 ------------------NGTMNGN-----MHGHGIPV-SMQM-MQQPYA----------
pt000530_POPTR_ ETN-------------KVNGTLT------------DP--STEM----------------D
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pt044860_POPTR_ FHVSHHHH------P-HHHG-------------------------FFGG-----------
gm019720_Glyma0 ------------------NGAYA----------------SSNL-ISQPP-YVPT------
pt035615_POPTR_ ------------------NAQ---------------------F-ALQGSMNYISPQVILS
Sm017738_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm007396_Glyma0 ------------------NAQ---------------------L-AHQGSF----------
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Sb032742_Sorbi1 ----------------AQGGDSKLT-----AKTGDGSIKKDAL-GHVGGSSSAA------
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pp036936_Pp1s83 ---QQAPPGMIYSPHQMMPQYQMPM--------------------------------QSG
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gm045576_Glyma1 ------------------------------AMPMGT--------------YVREAPPNTA
pp009284_Pp1s30 ---QQAPPGMMYSPHQMMPQYQMPM--------------------------------QSG
gm026530_Glyma1 --------------------------------------------------------YENN
gm024076_Glyma0 ------------------------------------------------------VDHNNK
gm055239_Glyma2 ------------------------------------------------------------
gm041932_Glyma1 -----------------QQQHQGHV------YGSG---------------------TTTG
Sb010924_Sorbi1 -----------------------------AAYAPGNGG------------GSGDGSGSSG
pt043913_POPTR_ -------------------RHPGNM------YG-----------------------PGGG
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gm026833_Glyma1 ------SQGVNYTNS---------------------------------------------
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Os013460_Os03t0 -------PPPPPQQQQQQ-HHHMAMGGR-GGFGHHPG------------GGGGGSSSSSG
Os005512_Os01t0 ----------------------------------------------------NAMDRSTD
Os030323_Os08t0 -----------------------------VGYNAGAGSTTTAFYAPAATAASGNKAYCGG
pt043409_POPTR_ LVNQRTSLSLFYSAK------LLAT-----LS----------------------------
pt016647_POPTR_ -------------------HHQGHV------YG------------------------AGG
pt036929_POPTR_ L----------------------------QSFNAG-----------LYSLGTEVTAKSYG
gm023182_Glyma0 ---YGSA---GF--------HQVAG----------GA------------IKGGPAYPGPG
Sb019135_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
pp009280_Pp1s30 ---QQAPPGMMYSPHQMMPQYQMPM--------------------------------QSG
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pt043410_POPTR_ ------SQGVSYGNSNSQAPHMMVP-----MQS------------------------NE-
pp038018_Pp1s25 ----------GYNPYM---QAQM-M--------------------------------TSG
Os022924_Os05t0 ------------------------------------------------------------
Sm018351_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm019625_Glyma0 ------------------------------AMPMGT--------------YVRETPPNAA
gm028165_Glyma1 ------------QPQ-----HLVMP----SMQG------------------------HE-
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pt000530_POPTR_ L----------------------------QSFNNG-----------LYSLGTEVTAKSYG
pp037985_Pp1s25 ----------GYNPYM---QAQM-M--------------------------------NPG
pt044860_POPTR_ ------------------------------A-PIGAGY-----------MTMRDANSNAS
gm019720_Glyma0 ---DQK-FSLPFSPNSI--QNQLRQ-----------------------------------
pt035615_POPTR_ LF--LSLLSLSYTHT-----HT--------------------------------------
Sm017738_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm007396_Glyma0 ------SQNVTYPNSQGQ--HMMVP-----MQG------------------------PE-
Os021976_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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Os004570_Os01t0 ------------------------------------------------------------
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Sb032742_Sorbi1 -------------------QGMGQQ----GAYNQGMGY--------MQPQMGQQGAYNQG
pt041815_POPTR_ ----------------------------------------------------SSSSYRNN
Sb008970_Sorbi1 ---NQ---GMGY------------M--------------------------------QPQ
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Sm007604_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Sb001867_Sorbi1 ---QQQPPPPPPSQQQQQ-QHHMAMGGR-GGFGHQGG------------GGGGGSSSSSG
pp009283_Pp1s30 ---QQAPPGMMYSPHQMMPQYQMPM--------------------------------QSG
AT2G37060.3 TD----------------------------------------------------------
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pt035616_POPTR_ ----------------------------------EKDF----------------------
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Sb015253_Sorbi1 EGSTKVMEF----EGIAGEE-------ENGGVQRGRGFANNHLHGAVQW-----------
gm007397_Glyma0 --------------------------------MQGPE-----------------------
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gm045576_Glyma1 SSHHHHHHHHHHARGISNA-------------HEPNARSI--------------------
pp009284_Pp1s30 -GN------------------------------QPRGV----------------------
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gm024076_Glyma0 LGP------------------------------RTNSTPLN-------------------
gm055239_Glyma2 ------------------------------------------------------------
gm041932_Glyma1 SAS------------------------------SARTR----------------------
Sb010924_Sorbi1 GSASHTPQG---SGGFEHPHPFA---------YK--------------------------
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Os030323_Os08t0 DGS-RVMEF----EGIIVA-----------------------LYTA--WRMLLYCPFSLP
pt043409_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt016647_POPTR_ FHH------------------------------QGNSRAND------------------P
pt036929_POPTR_ QNT-RFLGY---QESSMIVELR---------RISMKSYVCS-FNT---------------
gm023182_Glyma0 SNA-----------------------------GRPR------------------------
Sb019135_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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pt043410_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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Os022924_Os05t0 ------------------------------------------------------------
Sm018351_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm019625_Glyma0 SSHHHH--------GISNA-------------HEPNARSI--------------------
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pp036937_Pp1s83 -GN------------------------------QPRGV----------------------
pt000530_POPTR_ ENT-RLLGY---QENFMAGDFNMNRIGENGDRNSERARAAQ-LYHGVRW-----------
pp037985_Pp1s25 -NY------------------------------QVQHY----------------------
pt044860_POPTR_ SSH---------SAALANVEAFA--------QHQ--------------------------
gm019720_Glyma0 ---------------------------------QEQIDSVG------HWYE---------
pt035615_POPTR_ ----------------------------------EKDF----------------------
Sm017738_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm007396_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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pt041090_POPTR_ LTK-----------------------------CLAKN-----------------------
Os004570_Os01t0 ------------------------------------------------------------
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pt035613_POPTR_ ----------------------------------EKDF----------------------
Sb032742_Sorbi1 MGY-----------------------------MQPQYHNGD-ISN---------------
pt041815_POPTR_ QGI------------------------------RM-------------------------
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Sm007604_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Os022924_Os05t0 ------
Sm018351_Selmo1 ------
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gm028165_Glyma1 ------
pp036937_Pp1s83 ------
pt000530_POPTR_ ------
pp037985_Pp1s25 ------
pt044860_POPTR_ ------
gm019720_Glyma0 ------
pt035615_POPTR_ ------
Sm017738_Selmo1 ------
gm007396_Glyma0 ------
Os021976_Os05t0 ------
pt041090_POPTR_ ------
Os004570_Os01t0 ------
pt017365_POPTR_ ------
pt035613_POPTR_ ------
Sb032742_Sorbi1 ------
pt041815_POPTR_ ------
Sb008970_Sorbi1 ------
pp009281_Pp1s30 ------
Sm007604_Selmo1 ------
Sb001867_Sorbi1 ------
pp009283_Pp1s30 ------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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Sb008970_Sorbi1 |
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pp009281_Pp1s30 |
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Sm007604_Selmo1 |
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Sb001867_Sorbi1 |
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pp009283_Pp1s30 |
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G |
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AT2G37060.3 |
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Sb026432_Sorbi1 |
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