Input
| Putative repression domain
|
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AT2G42380.2 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os003920 |
not found in 265aa |
AT3G58120.1 |
1st_not |
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not found in 330aa |
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III |
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not found in 456aa |
AT3G58120.1 |
1st_not |
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II |
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not found in 437aa |
AT2G42380.2 |
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II |
Sb027055 |
not found in 464aa |
AT3G58120.1 |
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not found in 340aa |
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II |
Gm033491 |
not found in 330aa |
AT3G58120.1 |
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not found in 320aa |
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not found in 302aa |
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II |
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not found in 335aa |
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not found in 308aa |
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Ia |
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not found in 331aa |
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III |
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not found in 533aa |
AT2G42380.2 |
1st_1st |
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Ib |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Os003920_Os01t0 ------------------------------MAQLPPKIP-VAAP-------G--------
Sb025822_Sorbi1 -------GRSRARRGAHCCWRA-----RARMAQLPPRIP-TAV-----------------
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gm016485_Glyma0 ------------------------------MAQLPPKIP-NMTPNWPDFSS---------
::***: *
AT2G42380.2 ----------S-------QKLS-PFSTPTAT------------AVATATTT--------V
gm033491_Glyma1 ---------LH-------QKM--PSLQTTSS----------------------------N
pp019022_Pp1s16 RTNIPSRVGNH-------KRT--PSAG------FPPKS----------------------
Sb027055_Sorbi1 --------QDH---------W--SAAGA--------------------------------
Os003920_Os01t0 -------HHQH---------W--ASAG-------------------------------GA
Sb025822_Sorbi1 ---------HH---------W--PEGG-------------------------------QH
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gm034510_Glyma1 ----------H-------QRV--PSMANFNP--------------TTSTTTI--VTTTTP
Os000963_Os01t0 -------HHHHAAHGHHHQRS--PSMGAFLAAPLPPFPL---PPPAPANGGAQQQQQQQQ
gm034315_Glyma1 ---------HQ-------QKMQLPPLNNNGTITNNYHQ--------------------HN
pt029642_POPTR_ ----------H-------QTMSNYFSNAAAT--------------------------MEN
Sb024526_Sorbi1 -------HHHH--HHQQQQRS--PSVGTFLAAPMPPPPLH-HPPP-------------QQ
gm037387_Glyma1 ----------H-------QRV--PSMANFNP--------------TTSTTT----ATTTP
pt012497_POPTR_ ----------H-------KKL--PITGIMET--SPPRD-----DIITAIVT---------
gm016485_Glyma0 ---------PH-------QKM--PSLKTMSP----------------------------N
AT2G42380.2 Q-NPSWVDEFLDFSAS---RRGNHRRSISDSIAFL----EAPTV----------------
gm033491_Glyma1 Q-NPSWVDEILEFSVA---RRGAPRRSVSDSVTFL----EAPLL-----DHHHCKGGSVV
pp019022_Pp1s16 --QLNWTDGVVDAPESISLKRGAHRRSASESMAFMDGTNFAKMVDDNVTEEDHESRSVAS
Sb027055_Sorbi1 --------EFLGFAAA---RRGAHRRSASDSAAFLE---VVPMD-----DV------IGG
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Sb025822_Sorbi1 GAAAAWADDFAEFAAS---RRGAHRRSLSDSVAFVE---VAPAD----------------
pt015533_POPTR_ Q-NPSWVDEFLDFSLT---RRGTHRRSVSDSIAFLE---EAPTML----EECRSTGAPGL
gm034510_Glyma1 P-PPSWVDEFLDFSSA---RRGAHRRSASDSITFL----ETPFL-----EECRTG-----
Os000963_Os01t0 H-QPSWVDEFLDFSAT---KRGAHRRSVSDSVAFLD-----PVS-----D----------
gm034315_Glyma1 Q-NPSWVDEFLDFSSA---RRGVHRRSVSDSITYL----DSPV---------KCGGNK--
pt029642_POPTR_ H-QPCWVDEFLDFTST---RRGSHRRSISDCITFIET-TNMPSLV---EDQCHDNNNSSS
Sb024526_Sorbi1 Q-QPSWVDEFLDFSAA---KRGAHRRSVSDSVAFLE---AGP-G-----D----------
gm037387_Glyma1 P-PPSWVDEFLDFSSA---RRGAHRRSASDSITFL----EAPFL-----DECRAG-----
pt012497_POPTR_ --NPSWVDEFLGFSST---RRGTHRRSVSDSIAFRE---EAPTI----------------
gm016485_Glyma0 Q-NPSWVDEFLEFSAA---RRGAHRRSVSDSITFL----EAPLL-----DHHHCKGGSVG
. . : :** *** *:. ::
AT2G42380.2 ---SIEDHQ--------FDRFDDEQFMSMFTDD---DNLHSNPSH------INNKNNNV-
gm033491_Glyma1 GGGG-GNNE--------FERFDDEQFMSMFSDEA--SG--------------NNNNNNTM
pp019022_Pp1s16 IHSECGSLD--------FDRLDEDQLISMFDDD---AKLHRKPQHHQQLFTRNVSANNPG
Sb027055_Sorbi1 GGSGSAGDD--------FDRLDDEQLMSMFSDVDA-------P-----------------
Os003920_Os01t0 GAGG----E--------FDRLDDDQLMSMFPDE---------------------------
Sb025822_Sorbi1 GAAG----E--------FDRLDDDQLMSMFPDEA--------------------------
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gm034510_Glyma1 -----------------FDRLDEDQLISMFSDDI--AVAAL-PP----------------
Os000963_Os01t0 DNAGVGAHD--------FDRLDDDQLMSMFSDDLQ-------PP----------------
gm034315_Glyma1 -NNNNNENE--------FDKFDDEQFMSMFTDEVVLSGVPLPP-----------------
pt029642_POPTR_ CNNNHSSSNALISANLGFDKLDDDQLMSMFSHD---MSLSLPP-----------------
Sb024526_Sorbi1 GNAGVGAHD--------FDRLDDDQLLSMFSDDLQ-------PP----------------
gm037387_Glyma1 -----------------FDRLDEDQLISMFSDDI--AAASLPPP----------------
pt012497_POPTR_ ------STD--------FDKFDDEQLMSMFNDDI--SNAVAAPN----------------
gm016485_Glyma0 GGGGSGDNE--------FERFDDEQFMSMFSDEA--SGNNNNNNN------NNNNNNNTM
*:::*::*::*** .
AT2G42380.2 ---------------GP-------TGSSSNTSTP-S--N--SFNDDNKELP-PSDHNMNN
gm033491_Glyma1 --------------MAH-------TLSSSNPSTP-SDHN--SINDEKEMENKEEE--EKK
pp019022_Pp1s16 GTSGSDTWASERSQTPP-------STKQSESATP-SDSN--SVSD---------------
Sb027055_Sorbi1 -----------------------------------------AVSDGAGER----------
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Sb025822_Sorbi1 ------------------------AAGGGSSSAL-GSENGGS-SDSDGDKR---------
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Os000963_Os01t0 ---------------PP---QQQPAAPAASASSP-SDHN--SMNDEKQDK----------
gm034315_Glyma1 ---------------PT-------TLSSSNPSSP-YDQN--FINDEKEKKEEEEEHHHHH
pt029642_POPTR_ --------------------------SSSNPSTP-SDQN--SKNDEKPSKP-TDQHHHQE
Sb024526_Sorbi1 ---------------PPPTTTTAQAAPVASSSSP-SDHN--SINDEKTDR----------
gm037387_Glyma1 ---------------PP-------LSSASNPSSPASDQN--S-SEEKPMEM---------
pt012497_POPTR_ --------------------------SSSTPSSP-SDHN--SINDEKEAIVVASKHKQQQ
gm016485_Glyma0 --------------MEN-------ALSSSNPSTP-SDHN--SINDEKEMNNKEEE--GKK
.:
AT2G42380.2 NINNNY---------NDEV------------QSQCKME------PE--DGTASNNNSGDS
gm033491_Glyma1 QLKNES---------EDED------------KSQCKQEI--TQLPNNDDSNNTSNANATC
pp019022_Pp1s16 -VSNEDPKGGFGKY-KSEPDV----------QSSGDLEGGTQTLSK------GELQQALA
Sb027055_Sorbi1 --AGDA----------AQL----------MDVGDA-EDGMAASSPA----------GARA
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Sb025822_Sorbi1 -VGGTS----------AGGTIAGNGNACDGEQNEA-GDAQAPATGQ----------AAAA
pt015533_POPTR_ KVRDEN----------DEG------------QNLSEWET-PSTVPS-------ATNPAIT
gm034510_Glyma1 --------GAG-----------------------TRRRLPPSPPPA--------------
Os000963_Os01t0 ---GET----------DEA------------QSEC--DGATPGQPA----------SPAT
gm034315_Glyma1 QLKNEA----------DEV------------ESQCKQEI--MQLPN--------DTNTCS
pt029642_POPTR_ EGNTEQQQAAVAKTEPGEV------------ESSCKQEPHQPPLPT-----------SSN
Sb024526_Sorbi1 ---GEA----------EEA------------QSKCHGDATADAAPA----------SAAP
gm037387_Glyma1 --------A-----------------------------LDAAPQPS----------AIAT
pt012497_POPTR_ KVRNEN----------DEG------------QSPSEWET-PTTVPT-------ATDPAAT
gm016485_Glyma0 QVKNESE--------EDED------------ESQCKQEI--TQLPNNDDSKNNSNANATC
AT2G42380.2 S-GNRILDPKRVK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
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pp019022_Pp1s16 G-LDSSLDPKRAK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
Sb027055_Sorbi1 A-ADGVADPKRVK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
Os003920_Os01t0 SPTELIRDPKRVK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
Sb025822_Sorbi1 S-TELIRDPKRVK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
pt015533_POPTR_ S-NENKIDPKRVK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
gm034510_Glyma1 --LKSLLIPRGSKVQKLINYVSPIMSLIPLFLSSYFNLTLQILANRQSAQRSRVRKLQYI
Os000963_Os01t0 V------DPKRVK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
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pt029642_POPTR_ N-GDTINDPKRVKS--------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
Sb024526_Sorbi1 V------DPKRVK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
gm037387_Glyma1 C-TETVVDPKRVK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
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gm016485_Glyma0 S-SEKITDPKRVK---------------------------RILANRQSAQRSRVRKLQYI
*: * :*******************
AT2G42380.2 SELERSVTSLQAEVSVLSPRVAFLDHQRLLLNVDNSALKQRIAALSQDKLFKD-AHQEAL
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pp019022_Pp1s16 SELERSVTALQSEVSTMAPQVAFFEHRRAVLNVDNNTIKQKMAALAQGQRFKD-AHIEAL
Sb027055_Sorbi1 SELERSVTSLQMEVSALSPRVAFLDHQRSLLTVGNSHLKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
Os003920_Os01t0 SELERSVTTLQNEVSVLSPRVAFLDQQRTILTVGNSHLKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
Sb025822_Sorbi1 SELERSVTTLQNEVSVLSPRVAFLDQQRTILTVGNSHLKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
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gm034510_Glyma1 SELERSVTTLQTEVSALSPRVAFLDHQRLILNVDNSALKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
Os000963_Os01t0 SELERSVTSLQTEVSALSPRVAFLDHQRSLLTLGNSHLKQRIAALAQDKIFKDGGTEEGD
gm034315_Glyma1 SELERSVTSLQAEVSVLSPRVAFLDHQRLLLNVDNSALKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
pt029642_POPTR_ SELERSVTTLQTEVSALSPRVAFLDHQRLILNVDNSALKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
Sb024526_Sorbi1 SELERSVTSLQTEVSALSPRVAFLDHQRSLLTLGNSHLKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
gm037387_Glyma1 SELERSVTTLQTEVSALSPRVAFLDHQRLILNVDNSALKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
pt012497_POPTR_ SELERCVTSLQGEVSVLSPRVAYLDHQRLLLNVDNSALKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
gm016485_Glyma0 SELERSVTSLQAEVSVLSPRVAFLDHQRLLLNVDNSALKQRIAALAQDKIFKD-AHQEAL
*****.**:** ***.::*:**:::::* :*.:.*. :**::***:*.: *** . *.
AT2G42380.2 KREIERLRQVYNQQSLTNVE-NANHLSATG------------------------------
gm033491_Glyma1 KREIERLRQVYHQQNIKKMDNNAAASPPSQ------------------------------
pp019022_Pp1s16 QKEVQRLRQLYQQQQMQQQQHLQPGLSTSTYDLQHQQFSNLELGQDESSLAAVPDIFASA
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Os003920_Os01t0 RKEIERLRQVYQQQNTK----LSGGLAADHAH----------------------------
Sb025822_Sorbi1 KKEIERLRQVYEQQNLK----MSAGAAASD------------------------------
pt015533_POPTR_ RTEIERLRQVYQQQNL-KMD-KTN------------------------------------
gm034510_Glyma1 KKEIERLRQIYHQQNLQKMNNNNNNLQQTP------------------------------
Os000963_Os01t0 REAAANLPPAKPQERGI----PTGG-----------------------------------
gm034315_Glyma1 KREIERLRQVYYQQSLKKME-NAAGS----------------------------------
pt029642_POPTR_ KKEIERLRQVYHHQNLKKMN-SSGHAAEAA------------------------------
Sb024526_Sorbi1 RKEIERLRQIYQQQSLK----SGGG-----------------------------------
gm037387_Glyma1 KKEIERLRQIYHQQNLQKM---NSNLQQTT------------------------------
pt012497_POPTR_ KREIERLRQVYHQQNL-KME-NTSP--PSA------------------------------
gm016485_Glyma0 KREIERLRQVYHQQNIKKMD-NAAGSPPSQ------------------------------
: .* ::
AT2G42380.2 ------AGATPAVDIKSSVET---------------E---QLLNVS----------
gm033491_Glyma1 ------S-PSPSPKPRCETHT---------------EKE-QLINV-----------
pp019022_Pp1s16 LGIGSETMSSGSLSPTHSRKRALP----------------HSLNTMVA-----SIW
Sb027055_Sorbi1 ------------AASMQARQELLA-------------CEGAAIR------------
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Sb025822_Sorbi1 ------HGPPP---PVRAEKELMS--------------------------------
pt015533_POPTR_ ------S-SINQNK------------------------------------------
gm034510_Glyma1 ------PTSQPQQQPMQLHHHRQQQITVSQTLGCKDNKE-QLLS------------
Os000963_Os01t0 ------RGPGP--RPRQCRPDRQRG-----------GRRGRAMPALVIGRDPDAL-
gm034315_Glyma1 --------PLPSPKPICDAQT---------------EKEAQLLNA-----------
pt029642_POPTR_ ------REQSPNHEAIQCSEN-----------------------------------
Sb024526_Sorbi1 ------EAPAPDAAPVCGDKDDMIG-----------SSEGTAAPAL----GPPS--
gm037387_Glyma1 ------PTSQPQQQPMQLHHH-QQPIAVSQPLGCKDNKE-QLLS------------
pt012497_POPTR_ ------S-STPSNDPTTPT-T---------------DKEQQLFQV-----------
gm016485_Glyma0 ------SPPSPSPKPRCETHT---------------EKE-QLINV-----------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT2G42380.2 |
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