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| Input | Putative repression domain | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| AT2G45420.1 | not found | ||||
| Ortholog | Putative repression domain | Reverse top hit | Relation | Blast score ratio | Type |
| Os012150 | not found in 275aa | AT2G45420.1 | 1st_1st | 0.534704370 | Ia |
| Os035294 | not found in 269aa | AT4G00220.1 | not_not | 0.491002570 | III |
| Sb002297 | not found in 276aa | AT2G45420.1 | 1st_1st | 0.542416452 | Ia |
| Sb001373 | not found in 270aa | AT2G45420.1 | not_1st | 0.506426735 | II |
| Sb002570 | not found in 245aa | AT3G58190.1 | not_not | 0.401028277 | III |
| Gm001445 | not found in 247aa | AT2G45420.1 | 1st_1st | 0.588688946 | Ia |
| Gm050045 | not found in 234aa | AT2G45420.1 | not_1st | 0.555269922 | II |
| Gm026684 | not found in 179aa | AT3G58190.1 | not_not | 0.408740359 | III |
| Gm052290 | not found in 213aa | AT2G42430.1 | not_not | 0.406169665 | III |
| Gm035737 | not found in 237aa | AT3G58190.1 | not_not | 0.406169665 | III |
| Gm007212 | not found in 213aa | AT2G42430.1 | not_not | 0.401028277 | III |
| Gm007213 | not found in 212aa | AT3G58190.1 | not_not | 0.401028277 | III |
| Pt016475 | not found in 246aa | AT2G45420.1 | 1st_1st | 0.611825192 | Ia |
| Pt038703 | not found in 244aa | AT2G45420.1 | not_1st | 0.604113110 | II |
| Pt018101 | not found in 179aa | AT2G45410.1 | not_not | 0.447300771 | III |
| Pt040543 | not found in 211aa | AT2G45410.1 | not_not | 0.444730077 | III |
| Pt001453 | not found in 213aa | AT2G42430.1 | not_not | 0.403598971 | III |
| Pt034009 | not found in 218aa | AT3G58190.1 | not_not | 0.403598971 | III |
| Pt039807 | not found in 223aa | AT3G58190.1 | not_not | 0.401028277 | III |
| Pt040295 | not found in 213aa | AT2G42430.1 | not_not | 0.401028277 | III |
| Pp020134 | not found in 408aa | AT3G03760.1 | 1st_not | 0.408740359 | II |
| Pp025617 | not found in 413aa | AT3G03760.1 | not_not | 0.408740359 | III |
| Pp018804 | not found in 427aa | AT3G03760.1 | not_not | 0.406169665 | III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT2G45420.1 ----------------------------MSGGGN--------------------------
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pt038703_POPTR_ ----------------------------MSTTT---------------------------
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pt038703_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp020134_Pp1s15 LAEKGKRPASQQSDEALRDRQELETWNREASREHLVSWTGSITPRDKDLDQGWKDKDQLE
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gm001445_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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pp018804_Pp1s35 PTERGKRVASQESDASLRDSQKLETWNREP----LVSWTGSVSTSDKDLDQGWKEKDQLE
Os012150_Os03t0 ------------------------------------------------------------
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pt040295_POPTR_ -------------------SS---------------------------------------
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Sb001373_Sorbi1 -------------------SSVLGA-SAGAGGGGSSS-------------------SVPS
Os035294_Os10t0 -------------------SSVVVS-AS--GSGSGGG------------------GGGGG
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gm007212_Glyma0 -------------------SAS--------------------------------------
pt034009_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp018804_Pp1s35 NWEQHLGDR-NPRGSEILSAHNLDS-DKEQGATDSAAAGSTDRECAGALDNSMRYTSASA
Os012150_Os03t0 ------------------ASSALGG-GG--GGGGSGG-------------------GGGG
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pt016475_POPTR_ -----------------------GGGGGGGGGGPCGACKFLRRKCVPGCIFAPYFDSEQG
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pt040543_POPTR_ -------------------------ASANNGSGPCGACKFLRRKCVKGCIFAPYFDPDQG
gm035737_Glyma1 -----------------------------GSGSPCGACKFLRRKCVRGCVFAPYFCHEQG
Sb002570_Sorbi1 -----------------------------GFGSPCGACKFLRRKCVRGCVFAPYFCHEQG
pt039807_POPTR_ -----------------------------GSGSPCGACKFLRRKCVRGCVFAPYFCHEQG
gm050045_Glyma1 -----------------------GGGSSSGTGSPCGACKFLRRKCVSGCIFAPYFDSEQG
pt018101_POPTR_ -------------------------AGANNGSGPCGACKFLRKKCVKGCIFAPYFDPDQG
pt038703_POPTR_ -----------------------AGGSSGGGGGPCGACKFLRRKCVPGCIFAPYFDSEQG
pp020134_Pp1s15 -RARTLG---AQDYSGRRNTS--GYNSSMSSGAPCGACKFLRRKCVRGCIFAPYFSAEQG
pt001453_POPTR_ ---------------------------GTGTGSPCGACKFLRRKCASDCIFAPYFCSEQG
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Sb001373_Sorbi1 -----------------------GGVGCGGGGPPCGACKFLRRKCVTGCIFAPYFDSEQG
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pt034009_POPTR_ ---------------------------MTGLGSSCGACKFLRRKCTSECVFAPYFCYDQA
pp018804_Pp1s35 VRARNLG---AQDYSGRRNAR--GYHSSMSSGAPCGACKFLRRKCVRGCIFAPYFSAEQG
Os012150_Os03t0 -----------------------PSGGGGGGGGPCGACKFLRRKCVSGCIFAPYFDSEQG
Sb002297_Sorbi1 -----------------------SGGGGGGGGGPCGACKFLRRKCVSGCIFAPYFDSEQG
. . .********::* *:***** : .
AT2G45420.1 SAYFAAVHKVFGASNVSKLLLHIPVHRRSDAVVTICYEAQARIRDPIYGCVAHIFALQQQ
gm026684_Glyma1 ATHFAAIHKVFGASNVSKLLAHLPVSDRCEAAVTISYEAQARLQDPIYGCVSHIFALQQQ
pt016475_POPTR_ AAHFAAVHKVFGASNVSKLLLHIPVHKRLDAVVTICYEAQARLRDPVYGCVAHIFALQQQ
gm007213_Glyma0 VTHFAAIHKVFGASNVSKLLAHLPVSDRCEATVTISYEAQARLQDPIYGCVAHIFALQEQ
pt040543_POPTR_ TAHFAAVHKVFGASNASKLLLRIPTHKRLDAVVTLCYEALTRVRDPVHGCVGHIFTLQQQ
gm035737_Glyma1 ATHFAAIHKVFGASNVSKLLAHLPVSDRCEAAVTISYEAQARLQDPIYGCVSHIFALQQQ
Sb002570_Sorbi1 AAHFAAIHKVFGASNVSKLLAHLPLADRPEAAVTISYEAQARLRDPIYGCVAHIFALQQQ
pt039807_POPTR_ AQHFAAIHKVFGASNVSKLLAHLPVSDRSEAAVTISYEAQARLQDPIYGCVSHIFALQQQ
gm050045_Glyma1 TSHFAAVHKVFGASNVSKLLLSIPVHRRLDTVITICYEAQSRIRDPVYGCVAHIFALQQQ
pt018101_POPTR_ TAHFAAVHKVFGASNASKLLLRIPAHKRLDAVVTLCYEALARVRDPVYGCVGHIFTLQQQ
pt038703_POPTR_ AAHFAAVHKVFGASNVSKLLLHIPAHKRPDAVVTICYEAQARLRDPVYGCVAHIFALQQQ
pp020134_Pp1s15 AAKFAAVHKVFGASNVAKLLLHIPAPRRGDAVLTISYEAQARLSDPVYGCVATIFALQQQ
pt001453_POPTR_ PARFAAIHKVFGASNVSKLLLHVPVAERCEAVVTIAYEAQARIRDPVYGCVAHIFALQQQ
pt040295_POPTR_ TARFAAIHKVFGASNVSKLLLHVPVADRYEAVVTIAYEAQARIRDPVYGCVAHIFSLQQQ
gm001445_Glyma0 ATHFAAVHKVFGASNISKLLLNIPVHKRLDAVVTICYEAQARLRDPVYGCVAHIFALQQQ
pp025617_Pp1s26 AAKFAAVHKVFGASNVAKLLLHIPTPRRCDAVLTISYEAQARLSDPVYGCVATIFSLQQQ
Sb001373_Sorbi1 AAHFAAVHKVFGASNVSKLLLQIPPHKRLDAVVTVCYEAQARIRDPVYGCVSHVFALQQQ
Os035294_Os10t0 AAHFAAVHKVFGASNVSKLLQQIPAHRRLDAVVTICYEAQARLRDPVYGCVAHIFHLQHQ
gm052290_Glyma1 PARFAAIHKVFGASNVSKLLLHIPAHDRCEAVVTIAYEAQARIRDPVYGCVSHIFALQQQ
gm007212_Glyma0 PARFAAIHKVFGASNVSKLLLHIPAHDRCEAVVTITYEAQARIRDPVYGCVSHIFALQQQ
pt034009_POPTR_ AAHFAAVHKVFGASNVSKLLLHLPVHNRGDAAITISYEALARMRDPIYGCVAHIFALQQQ
pp018804_Pp1s35 AAKFAAVHKVFGASNVAKLLLHIPAPRRNDAVLTISYEAQARLSDPVYGCVATIFALQQQ
Os012150_Os03t0 AAHFAAVHKVFGASNVSKLLLQIPAHKRPDAVVTICYEAQARLRDPVYGCVAHIFALQQQ
Sb002297_Sorbi1 AAHFAAVHKVFGASNVSKLLLQIPAHKRLDAVVTICYEAQARLRDPVYGCVAHIFALQQQ
***:******** :*** :* * ::.:*: *** :*: **::***. :* **.*
AT2G45420.1 ----------VVNLQAEVSYLQAHLASLE--------------------LP----QPQTR
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gm007213_Glyma0 ----------VVNLQAQLAYLREQAGQIYLNASATENPNEKLLGKPTT-FP----QDLQS
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gm035737_Glyma1 ----------VVNLQAQLAYLKEQAAQSCLDGSINENPSEKLFEKSSSALP----QDLQS
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pt039807_POPTR_ ----------VVNLQAQLASLKEQAAQSFLNGSATTNPNDKYYGKPS--YP----QELQS
gm050045_Glyma1 ----------LVSLQAELSYLHGHLAQME--------------------LP----QPSP-
pt018101_POPTR_ ----------VLNLQAELAFIQAHLSTLQR-------------------LP----QPQP-
pt038703_POPTR_ ----------VVNLQAELSYLQAHLAAME--------------------VP----SPPP-
pp020134_Pp1s15 ----------VASLQAELAMVQTQLADRNTH------------------LQQQHHQQQRM
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pt040295_POPTR_ ----------VACLQAQLMQVKAQLA----------------------------------
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pp025617_Pp1s26 ----------VASLQAELAMVQAQLADRHAH------------------LQQTH-HQQRM
Sb001373_Sorbi1 VCMHMQRVHVVVNLQTELTYLQGHLSTIE--------------------LP----TPPPF
Os035294_Os10t0 ----------VAGLQSELNYLQGHLSTME--------------------LP----SPPPY
gm052290_Glyma1 ----------VACLQAQLMQVKAQLA----------------------------------
gm007212_Glyma0 ----------VARLQAQLMQVKAQLT----------------------------------
pt034009_POPTR_ ----------VASLQEEIEILENQMASLTVGVAG--------FGSSPT-IS----NPNCE
pp018804_Pp1s35 ----------VASLQAELTMMQTQLTDRNTH------------------LL----QQQRM
Os012150_Os03t0 ----------VVNLQAELTYLQAHLATLE--------------------LP----SPPPL
Sb002297_Sorbi1 ----------VVNLQAELTYLQAHLATLE--------------------LP----SPPPL
: ** :: :. :
AT2G45420.1 -----------PQPMPQPQPLFFTPPPPLAITD-----LPASV-S----PLP--------
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gm007213_Glyma0 RF-QMENSNMASQF--LPNLSTN--PSTHYYGNTNSL-MEP-N-PIG-------------
pt040543_POPTR_ -----------PPLC----------AQSHSLMS-----LSSSS-E-----VPSF------
gm035737_Glyma1 WFNQVGNSNLGPEF--LPNMCTN--LSTQHYGN-NAL-MEDLN-PIG---I---------
Sb002570_Sorbi1 YV----GSAAAEQL--G---------YGYPWCNGNGG-VAAAG-TVG---APAAQLA---
pt039807_POPTR_ WF-HSENSSTVPQL--NPNNLTN----NMPYCE-NGI-MDP-N-SMG-------------
gm050045_Glyma1 -----------PPP---PPQTTAAPPSGFSIAD-----LPPAT-VAA---VPA-------
pt018101_POPTR_ -----------PSQC----------AQSPSQTT-----LDSSS-E-----VPSF------
pt038703_POPTR_ -----------PPP---PALVT---SPPFSIAD-----LPSAS-S-----IPG-------
pp020134_Pp1s15 TMAFGASASQAAEYI-QHQHLAD--HSQLSPTSGLSMGMPGGS-SA----GPY-SRVKEE
pt001453_POPTR_ ------QNLIDSPR-INAEN--IH-HQ--WQGN-N---ISGVP-S-----FPTHP-----
pt040295_POPTR_ ------QNLIDSTR-INIEN--TH-HQ--WQGN-N---ISGVS-S-----FPSYQ-----
gm001445_Glyma0 -----------PSS---PQATTMAPPPLISIAE-----FIPSS-ALASSTVPP-------
pp025617_Pp1s26 VF-----NQPPPEYMQQHQHLGV--QTHLSPTSGLSMGMSGGT-GAV---GPYSSRVKEE
Sb001373_Sorbi1 GA--------------QNQMPM---TATFCVSN-----LPSAS-S---NIIP--------
Os035294_Os10t0 VA---GPTLAPPQP--QPLMPMTA-AANFNFSD-----LPSSS-AAN---IP--------
gm052290_Glyma1 ------QNLVESR---NIES---N-HQ--WTGN-NNS-VSGQPMN-----HPFCP-----
gm007212_Glyma0 ------QNLVESR---NIEN---N-HH--LQGN-NNN-VTGQLMN-----HPFCP-----
pt034009_POPTR_ MLFSFQQDAMNTQYYQNPQSAQLN-HSGYTTGN-Q-T-FDGQM-N-----VPLTP-----
pp018804_Pp1s35 TMAFGAQGTQAVEFL-QPQHLAD--HSQLSSTSGLSMGIPGGS-ST----GPY-TRVKAE
Os012150_Os03t0 ----------MPAP---PQMPM---PAPFSISD-----LPSST-S-----VP--------
Sb002297_Sorbi1 -----------PAP---PQMPL---PGAFSISD-----LPSST-S-----VP--------
.
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pt040543_POPTR_ -------------------SKLASNSNI--------------------------------
gm035737_Glyma1 -NYE--------TSG-----AMEGNNS------------------------SSFDDSSNN
Sb002570_Sorbi1 GAYG--------NGGHESLTALLGSSDYMQQSLYHAFEHAGADDDDGRQGNDAFEAAAE-
pt039807_POPTR_ -NYG--------NS----------SSSF-----------------------DSFEEASH-
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pt018101_POPTR_ -------------------TKLASSSNI--------------------------------
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pt001453_POPTR_ -NY----------INPISPQSSLDSVDL---------------------ISNNIDRGMMN
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gm001445_Glyma0 ------------------------TYDL--------------------------------
pp025617_Pp1s26 GSYQLH-----------GMQHAAHHYDI--------------------------------
Sb001373_Sorbi1 -----------------------GTVDV--------------------------------
Os035294_Os10t0 -----------------------VTADL--------------------------------
gm052290_Glyma1 -TY----------MNPISPQSSLESID-----------------------HSSINDG-MS
gm007212_Glyma0 -TY----------MNPISPQSSLESID-----------------------HSSINDG-MS
pt034009_POPTR_ -LYGWEDQDIFCNSHPRPLERLLEEVD---------------------------------
pp018804_Pp1s35 DSY-LH-----------GMQ--THLYDV--------------------------------
Os012150_Os03t0 -----------------------TTVDL--------------------------------
Sb002297_Sorbi1 -----------------------TTVDL--------------------------------
AT2G45420.1 -----AS-IFDQTT-SSSAWA--TQQR------------RFIDPRHQY------------
gm026684_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pt016475_POPTR_ -----SC-LFDPMM--QPSWSN-MQPQ------------RQMDI-RQF------------
gm007213_Glyma0 -----SM-SYDMQ----RQW--------------------GLS-----------------
pt040543_POPTR_ -----SM-HFDQLQ---------LQPQQ-----------ASAES----------------
gm035737_Glyma1 ----YSM-SYDMQT-NRRTW--------------------GFHE----------------
Sb002570_Sorbi1 -----SS-SFGAE--ESGGWRS----------------SSGYQD----------------
pt039807_POPTR_ -----SMSSFDMQT-DNLQW--------------------TYQH----------------
gm050045_Glyma1 -----SS-LFDPLG-QT-SWA--MQQ-------------RAIDL-RQY-----------L
pt018101_POPTR_ -----ST-HFDQLQ---------V--QQ-----------TSTEM----------------
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pp020134_Pp1s15 --GMPTT-SMEPAS---------MSTEQSLL--------ESLQR--------------SR
pt001453_POPTR_ MQDIQSREEFAFQS-------------------------RAKVK-RPC------------
pt040295_POPTR_ MQDIKSGEEFAFQS-------------------------CAKVK-RPY------------
gm001445_Glyma0 -----SS-LFDPMA-QTPSWA--VQP-------------RPIES-RQY-----------V
pp025617_Pp1s26 --GMASN-SLEP-----------MSTEQSLL--------ESMQK--------------SR
Sb001373_Sorbi1 -----ST-VFEPQT-QESHWVSLSQQQ------------QQVQQ-HQFNQQQSVMVGEGP
Os035294_Os10t0 -----ST-LFDPLPAAQPQWGL-YQQQQHHH--------QQLHH-HPY---------DRM
gm052290_Glyma1 MQDIQSREDFQIQA-------------------------K---E-RPYN-----------
gm007212_Glyma0 MQDIQSREDFQIQA-------------------------K---E-RPYN-----------
pt034009_POPTR_ ------KEIFTYCS-------------------------W--------------------
pp018804_Pp1s35 --GMPAT-SMEPTI---------MSTEHSLL--------ESMQR--------------FR
Os012150_Os03t0 -----SA-LFDPPP--QPQWASPLQQQQHHHHQHHH---HQQQQ-HQLRQPS-YATLARA
Sb002297_Sorbi1 -----SA-LFDPPP-QQPQWA--VQAAQPHHHHHHHQQPQQQQH-HQLRQPAPYGAPVRP
AT2G45420.1 --GVSSSSSSV-AVGLGGENSHDLQALAHELLHRQGS---------PPP---AATDHSPS
gm026684_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pt016475_POPTR_ -GGSGGSSGT--G-------GGDLQALARELLHRRGS---------PPPGFMSCSDTLAS
gm007213_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pt040543_POPTR_ -TGFYNPSEH-------GIDNEDLHELARAFASRCLP-GV----RFRPP-NSP-------
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| pp020134_Pp1s15 | S | G | G | M | G | D | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | Q | P | D | E | G | E | L | Q | A | L | A | S | L | F | R | R | K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| gm007212_Glyma0 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | N | N | D | L | G | E | L | Q | E | L | A | L | R | M | M | R | N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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