Input
| Putative repression domain
|
|
AT2G47810.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os028984 |
not found in 224aa |
AT4G14540.1 |
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III |
Os028983 |
not found in 224aa |
AT4G14540.1 |
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III |
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not found in 288aa |
AT4G14540.1 |
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III |
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AT4G14540.1 |
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AT4G14540.1 |
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AT5G47640.1 |
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AT5G47640.1 |
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AT2G37060.3 |
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AT5G47670.1 |
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III |
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AT1G09030.1 |
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AT4G14540.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Os024527_Os06t0 --------------------MEPA------------------------------------
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pt006104_POPTR_ --------------------MGTAS----------------SSTQAQL---------D--
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pt000530_POPTR_ -----MTGKGTQ---SSPIGSPSS------------------ENIS--------------
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Sb032742_Sorbi1 ------------------------SPRTPRRPCR-------SASQS---------SSPSS
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Sb003445_Sorbi1 VEPAAAVVPNEAVATDK-------APPPPTANTVI------IREQDRLMP----VANVSR
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pp036937_Pp1s83 NESGG-H---------------Y---RDQDAS---------VREQDRFLP----IANVSR
pt036929_POPTR_ ----------------------------ESSS---------KLEQDRFLP----IANVSR
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pp037985_Pp1s25 -DYGGNH---------------GSGERD-NSS---------VREQDRFLP----IANISR
Sb010924_Sorbi1 --NGAAA--QQQAPPL-------------------------IREQDRLMP----IANVIR
Sb008970_Sorbi1 GGGGGGG----------------------------------YREQDRFLP----IANISR
Sb024092_Sorbi1 ---GGPS-------------------NADFSS---------PREQDRFLP----IANVSR
pt015514_POPTR_ --------------------------------ME--------EEQDKLLP----IANVGR
Os028984_Os07t0 ---GGPS------------------NAGEYAS---------AREQDRFLP----IANVSR
pt001709_POPTR_ --------------------------------MD--------DEQDRLLP----IANVGR
Sm017738_Selmo1 -DAGG-H---------------G-GERD-NSN---------VREQDRFLP----IANISR
Os028983_Os07t0 ---GGPS------------------NAGEYAS---------AREQDRFLP----IANVSR
Sb001867_Sorbi1 ---GGPS--N---------------AGGELSS---------PREQDRFLP----IANVSR
pt044860_POPTR_ -INHSTT--NK----------FHTTT-DDISEC-------TVREQDRFMP----IANVIR
pp037984_Pp1s25 -DYGGNH---------------GSGERD-NSS---------VREQDRFLP----IANISR
pt001769_POPTR_ -GHSGES-PESPCLKS------CSSSSNNHNN---------SKEQDHFLP----IANVGR
Sm007604_Selmo1 -----------------------------------------LQRRDGIAPLEIELEWIDV
pp009279_Pp1s30 NESGG-H---------------Y---RDQDAS---------VREQDRFLP----IANVSR
pt043409_POPTR_ ----GDQ-----------------SPR-SNSN---------VREQDRFLP----IANISR
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pp036936_Pp1s83 NESGG-H---------------Y---RDQDAS---------VREQDRFLP----IANVSR
gm041932_Glyma1 ---GG-HTGNASG-------------SNEFSG---------CREQDRFLP----IANVSR
Sm020206_Selmo1 ------------------------------------------REQDRFMP----IANVIR
gm021297_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pp009282_Pp1s30 NESGG-H---------------Y---RDQDAS---------VREQDRFLP----IANVSR
pt014326_POPTR_ --------------------------------MD-------DDKQDQLLP----IANVGR
pt035614_POPTR_ ---GGEQ-----------------SPR---SG---------VREQDRYLP----IANISR
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pt043913_POPTR_ ---GE-Q--NNSNT-----------NYSTETS---------PREQDRLLP----IANVSR
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Os022924_Os05t0 GGGGGGG------------V---------------------GKEQDRFLP----IANIGR
gm055621_Glyma2 --------------------------------MD-------QDVQDRALP----IANVGR
gm053423_Glyma2 -----------------------------------------VREQDQYMP----IANVIR
gm023734_Glyma0 ---GG-HTGNASG-------------SNELSG---------CREQDRFLP----IANVSR
pt016647_POPTR_ ---GG-H--NAVS---------------ELSA---------K-EQDRFLP----IANVSR
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Sb019135_Sorbi1 CGGGGG-----------------------------------GKEQDRFLP----IANIGR
Sb009278_Sorbi1 -----------------------------------------VRHDNNLLP----IANVGR
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gm028166_Glyma1 ---GGEQ-----------------SPRGSLSGA--------AREQDRYLP----IANISR
Os024527_Os06t0 FPNGGAA-----------------APPPPMAAEQLPPAAAVVREQDRLMP----IANVIR
gm019720_Glyma0 ---------NHQNHS--------------------------NKEQDRFLP----IANVGR
pp009283_Pp1s30 NESGG-H---------------Y---RDQDAS---------VREQDRFLP----IANVSR
gm028165_Glyma1 ---GGEQ-----------------SPRGSLSGA--------AREQDRYLP----IANISR
gm026833_Glyma1 ----GEH-----------------SPR---SN---------FREQDRFLP----IANISR
gm055239_Glyma2 ---GGEQ-----------------SPRGSSSG---------AREQDRYLP----IANISR
pp009281_Pp1s30 NESGG-H---------------Y---RDQDAS---------VREQDRFLP----IANVSR
pp038018_Pp1s25 -EYGGNH---------------GGGDRD-NSS---------VREQDRFLP----IANISR
gm052458_Glyma1 ----GEH-----------------SPR---SN---------VREQDRYLP----IANISR
pt006104_POPTR_ -GNAPHG--RQ----------------DDINEC-------TVREQDRFMP----IANVIR
pt004980_POPTR_ ---GG-Q--NNSNT-----------NYS-ETS---------SREQDKLLP----IANVSR
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Os013460_Os03t0 ---GGPS--NY--------------AGGELSS---------PREQDRFLP----IANVSR
Os004570_Os01t0 -RSGG------------------------------------VREQDRFLP----IANISR
pt035615_POPTR_ ---GGEQ-----------------SPR---SG---------VREQDRYLP----IANISR
gm005596_Glyma0 --GGA-Q--NAGN----------SGNLSELSP---------R-EQDRFLP----IANVSR
gm045576_Glyma1 -MNM-----RQQVASSD-----HSAATGEENEC-------TVREQDRFMP----IANVIR
pt029632_POPTR_ ---GG-Q--NPTS-------------TNELFS---------PREMDRFLP----VANVSR
pt035616_POPTR_ ---GGEQ-----------------SPR---SG---------VREQDRYLP----IANISR
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gm007396_Glyma0 ----GDH-----------------SPR---SN---------VREQDRYLP----IANISR
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. . . . . * :..
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: : . : : *.
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Sm017738_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sm007604_Selmo1 ------------DPAHVGDGE------------E--------------------------
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gm027754_Glyma1 -------------DKKV-------------------------------------------
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Sb010924_Sorbi1 M-LPHHH-----HHHDMQMHAAMY--GGTVPPAPGPPHHGHGHGFLMPHPQ----GGSHY
Sb008970_Sorbi1 -------------HGGTSSSSN---------------------------------QLVQH
Sb024092_Sorbi1 ------------PVGGYGMYGGAGG--GGSG-----------MIMMMGQPMYGGSPPAAS
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pt001709_POPTR_ ------------------------------------------------------EESNHE
Sm017738_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os028983_Os07t0 ---SHHHQDASRNNGGYGMYGGGGG-----------------MIMMMGQPMYGSPPASSA
Sb001867_Sorbi1 -----HQQQGDVVQRGAANAGGYAGYGGAPGA--AG------MMMMMGQPMYGSPQQQQP
pt044860_POPTR_ -------------NNNVDQYGTLM--AGAGAAYAPAFHVSHHHH-------------PHH
pp037984_Pp1s25 --------------GSGMVSPGV----------------------QMVQQGG--------
pt001769_POPTR_ -----------------------------------------------------SSQQHHQ
Sm007604_Selmo1 -----------------------------------------------------SLLLFHR
pp009279_Pp1s30 ------------VMGSMGMSGGMNGMNGTMNGNMHGHGI-P-VSMQMLQQSYG--QQAPP
pt043409_POPTR_ ----------------------------------PGPNA----------------QV--K
gm019625_Glyma0 ------------------EYATL------ATAFVPPPF--H-----------------HH
pt041090_POPTR_ ---------------------------------LPGQNA----------------QFAFQ
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gm021297_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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pt014326_POPTR_ ------------------------------------------------------EESNHT
pt035614_POPTR_ ---------------------------------LPAQNA----------------QFALQ
gm012959_Glyma0 ---LQQH---------------------------------------------------HN
pt035613_POPTR_ ---------------------------------LPAQNA----------------QFALQ
pt043913_POPTR_ ------------VVNSGNPGGGFGG--GGGGNMYVGMQS---SMAMMGHHHY---QHRHP
pt043410_POPTR_ ----------------------------------PGPNA----------------QISHQ
Os022924_Os05t0 ---------------------------GDPGSSFEGM-----------------------
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pt016647_POPTR_ --------------GANST-GGGGG--GFNGGGGQGMYG---GMMMMGHH--------HQ
gm027754_Glyma1 --------------------------------------------------------TRDK
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Os024527_Os06t0 ------------------------GYPVAMSSALPAPHV-------------------HV
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pp009283_Pp1s30 ------------VMGSMGMSGGMNGMNGTMNGNMHGHGI-P-VSMQMLQQSYG--QQAPP
gm028165_Glyma1 ---------------------------------LAGQNA----------------QLVHQ
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pp009281_Pp1s30 ------------VMGSMGMSGGMNGMNGTMNGNMHGHGI-P-VSMQMLQQSYG--QQAPP
pp038018_Pp1s25 --------------GSNIVSPGV----------------------QMVQQGG--------
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pt035616_POPTR_ ---------------------------------LPAQNA----------------QFALQ
pp007159_Pp1s14 ------------------------------------------------------ELMLHS
gm048942_Glyma1 -------------NATNSA---------YESPSYAAA---P-GGIMM-----------HQ
gm007396_Glyma0 ----------------------------------PSPNA----------------QLAHQ
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Sb010924_Sorbi1 L--------------------------------PY-PYEPTYGGEHAMAAY-----YGGA
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Sb024092_Sorbi1 G----------------------------------------YPQP--PHH----------
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Os028984_Os07t0 G----------------------------------------YAQPPPPHHH--------H
pt001709_POPTR_ SKQ---------------------------------PKQPIEAPN------------NGV
Sm017738_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os028983_Os07t0 G----------------------------------------YAQPPPPHHH--------H
Sb001867_Sorbi1 P-------------------------------------------PPPPSQQ-----QQQQ
pt044860_POPTR_ --------------------------------------HGFFGGA---------------
pp037984_Pp1s25 -----------------------------------------YN----PYM----------
pt001769_POPTR_ L--------EQEQ-------------------NMIPPYTSIYSSSALMSQ----------
Sm007604_Selmo1 G--------------------------VIP-----------------PTGFVVRVWAALR
pp009279_Pp1s30 G--------------------------------------MMYS----PHQM--------M
pt043409_POPTR_ W--------------SFMLLSYCHFLFLVN---QRTSLSLFYSAK---------------
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pp036936_Pp1s83 G--------------------------------------MIYS----PHQM--------M
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Sm020206_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm021297_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm019720_Glyma0 N--------NHDE-------------------NNNQPFNGAYASSNLISQ----------
pp009283_Pp1s30 G--------------------------------------MMYS----PHQM--------M
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gm055239_Glyma2 ------------------------------------------------------------
pp009281_Pp1s30 G--------------------------------------MMYS----PHQM--------M
pp038018_Pp1s25 -----------------------------------------YN----PYM----------
gm052458_Glyma1 G--------------SF-------------------SQGVSYTISQ--------------
pt006104_POPTR_ --------------------------------------HGFFG-----------------
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Os021976_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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pt000530_POPTR_ ---------------SFNNGLYSLGTEVTA---------KSY------------------
Os013460_Os03t0 P-------------------------------------------PPPPQQQ-----QQQH
Os004570_Os01t0 ------------------------------------------------------------
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gm045576_Glyma1 --------------------------------------NGYFGAA---------------
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pp007159_Pp1s14 Y------------------------------GNEPSPEMMYYLHHMRP------------
gm048942_Glyma1 G--------------------------------------HVY------------------
gm007396_Glyma0 G--------------SF-------------------SQNVTYPNSQ-----------GQ-
AT2G47810.1 ------------------------------------------------------------
Sb032742_Sorbi1 -------------MGYMQPQMGQ---------QGAYNQGMGY--------MQPQYHNGDI
gm006497_Glyma0 -----PSSQG----FYRDDA---------------SSSGSEQ------------------
gm012840_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Os009649_Os02t0 --MYAPGSGG-------DGS---------------GSSGSGG--------------AGTP
Sb015253_Sorbi1 ---LMMGGASSV-VGFGAGGGAAASYYTATAARKAYGAGEGSTKVMEFEGIAGEEENGGV
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gm023182_Glyma0 -------GSA----GF-------------------HQVAGGAIKG----GPAYPGPGSNA
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Sb010924_Sorbi1 -AAYAPGNGG----GSGDGS---------------GSSGGSASHT-----PQG---SGGF
Sb008970_Sorbi1 -------NQG---MGYMQPQ---------------YHNGDT-------------------
Sb024092_Sorbi1 -QMVM-GGKGG---AYG------------------H---GGG----------SSSSPSGL
pt015514_POPTR_ EFRILDKGNGS---SFTNPS----------------------------------------
Os028984_Os07t0 HQMVM-GGKG----AYG------------------HGGGGGG----------GPSPSSGY
pt001709_POPTR_ EFRVLEKGNSS---SFTNPS----------------------------------------
Sm017738_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os028983_Os07t0 HQMVM-GGKG----AYG------------------HGGGGGG----------GPSPSSGY
Sb001867_Sorbi1 HHMAM-GGRG----GFG------------------HQGGGGG---------GGSSSSSGL
pt044860_POPTR_ -----PIGAGY--MTMRDAN---------------SNASSSH--------------SAAL
pp037984_Pp1s25 -QAQM-MNPG----NY--------------------------------------------
pt001769_POPTR_ PPSFMVADHKTYPLPFSPNSI-----------------------------------QKHL
Sm007604_Selmo1 RAWVIRHGAALQ--SFSSSLRGSL--------------------------------DGGM
pp009279_Pp1s30 PQYQMPMQSG----GN--------------------------------------------
pt043409_POPTR_ --LLAT-LS---------------------------------------------------
gm019625_Glyma0 ----MPMGT-----YVRETP---------------PNAASSHHHH-------------GI
pt041090_POPTR_ -HIFNPGLIGKT--GLTKCL----------------------------------------
pp036936_Pp1s83 PQYQMPMQSG----GN--------------------------------------------
gm041932_Glyma1 -------GSGT-----------------------------------------TTGSASSA
Sm020206_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm021297_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pp009282_Pp1s30 PQYQMPMQSG----GN--------------------------------------------
pt014326_POPTR_ EFRFL-------------------------------------------------------
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gm012959_Glyma0 -PPYVPTDQKFS-LTFSPNSI-----------------------------------QSQL
pt035613_POPTR_ -HT---------------------------------------------------------
pt043913_POPTR_ ------GGASSG------------------------------------------------
pt043410_POPTR_ PHMMVP-MQSNE------------------------------------------------
Os022924_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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gm053423_Glyma2 -----PSSQG----FYRD-D---------------HNAASGS--------------GGFV
gm023734_Glyma0 -------GS---------------------------------------------GSASSA
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gm027754_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sb019135_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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gm019720_Glyma0 -PPYVPTDQKFS-LPFSPNSI-----------------------------------QNQL
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gm026833_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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pt006104_POPTR_ --------------------------------------GSSH--------------AAAL
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pt000530_POPTR_ -------GENTRLLGYQENFMAG--DFN------MNRIGENGDRN-------------SE
Os013460_Os03t0 HHMAM-GGRG----GFG------------------HHPGGGG---------GGSSSSSGH
Os004570_Os01t0 ------------------------------------------------------------
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gm045576_Glyma1 ----MPMGT-----YVREAP---------------PNTASSHHHH-----HHHHHHARGI
pt029632_POPTR_ -------GSGA---GF----------FN--------QVGGGG----------AGDSLGRL
pt035616_POPTR_ -HT---------------------------------------------------------
pp007159_Pp1s14 --------------PY--------------------------------------------
gm048942_Glyma1 -------GSA----GF-------------------HQVAGGAIKG----GPVYPGPGSNA
gm007396_Glyma0 -HMMVP-MQGPE------------------------------------------------
AT2G47810.1 -------------------
Sb032742_Sorbi1 SN-----------------
gm006497_Glyma0 --VHAYMF--HLVS-----
gm012840_Glyma0 -------------------
Os009649_Os02t0 QTVNFEHQ--HPFGYK---
Sb015253_Sorbi1 QRGRGFAN--NHLHGAVQW
Sb003445_Sorbi1 ENPPAGRPGSH--------
pp009280_Pp1s30 -QPRGV-------------
pp036937_Pp1s83 -QPRGV-------------
pt036929_POPTR_ -KSYVCSF--NT-------
gm023182_Glyma0 GRPR---------------
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Sb010924_Sorbi1 EHPHPFAY--K--------
Sb008970_Sorbi1 -------------------
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pt015514_POPTR_ -------------------
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Sb001867_Sorbi1 GRQDRA-------------
pt044860_POPTR_ ANVEAFAQ--HQ-------
pp037984_Pp1s25 -QVQHY-------------
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Sm007604_Selmo1 DNRRSPR------------
pp009279_Pp1s30 -QPRGV-------------
pt043409_POPTR_ -------------------
gm019625_Glyma0 SNA-------HEPNARSI-
pt041090_POPTR_ -AKN---------------
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Sm020206_Selmo1 -------------------
gm021297_Glyma0 -------------------
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pt035613_POPTR_ -EKDF--------------
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Os022924_Os05t0 -------------------
gm055621_Glyma2 -------------------
gm053423_Glyma2 APFDPYAN--IKRDAL---
gm023734_Glyma0 -RTR---------------
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Sb019135_Sorbi1 -------------------
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gm028166_Glyma1 -------------------
Os024527_Os06t0 ASPAPVGP--NYE------
gm019720_Glyma0 RQQEQIDSVGHWYE-----
pp009283_Pp1s30 -QPRGV-------------
gm028165_Glyma1 -------------------
gm026833_Glyma1 -------------------
gm055239_Glyma2 -------------------
pp009281_Pp1s30 -QPRGV-------------
pp038018_Pp1s25 -QVQHY-------------
gm052458_Glyma1 -------------------
pt006104_POPTR_ ANVEAFAQ--HK-------
pt004980_POPTR_ -RPK---------------
Os021976_Os05t0 -------------------
Os030323_Os08t0 -RLHA--------------
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Os004570_Os01t0 -------------------
pt035615_POPTR_ -EKDF--------------
gm005596_Glyma0 -RPR---------------
gm045576_Glyma1 SNA-------HEPNARSI-
pt029632_POPTR_ -R-----------------
pt035616_POPTR_ -EKDF--------------
pp007159_Pp1s14 -------------------
gm048942_Glyma1 -------------------
gm007396_Glyma0 -------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT2G47810.1 |
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