|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT3G04730.1 ------------------------------------------------------------ pt042254_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt033721_POPTR_ --------------------------------------------M--------------- pt001265_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt001264_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt011954_POPTR_ MSSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMEKISDKLS pt039463_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt030401_POPTR_ MYSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMENISEKLS pt039771_POPTR_ -MSPPLLGVVEEEGHSNVTLLASPASAESACLNGLELKERNYMGL-SDCSSVDS------ pt005605_POPTR_ -MSMP--------------------------------LEHDYIGISSEVSSMENTSG--- AT3G04730.1 -------------------------------MINFEATELRLGLPGG------------- pt042254_POPTR_ -------------------MTTSVLGTER-TDLNYKETELCLGLPGAVG----------- pt033721_POPTR_ -------------------ATATVLGTEM-ADLNYKETELCLGLPGAVG----------- pt001265_POPTR_ ------------------------MEVEKGTKMRFEETELRLGLPGN------------- pt001264_POPTR_ ------------------------MEVEKGTKMRFEETELRLGLPGN------------- pt011954_POPTR_ S---SSSTLSTEENIN---SNSNSNSNSTNTSLNLKETELRLGLPGYQSPERKLTLPAAG pt039463_POPTR_ ------------------------MEVEKGTKMGFEETELRLGLPGN------------- pt030401_POPTR_ SSSTSSSTLSTEEKNNSSSSNSNNNNKNNNTSLNMKETELRLGLPGSQSPERKPTVPAAG pt039771_POPTR_ -------------------SAVSAASDERKTSLNLKATELRLGLPGSQSPERNHELSLLS pt005605_POPTR_ -------------------TDTINISTTASKGLNLKATELRLGLPGSDSPERGNENQQLG : : *** ***** AT3G04730.1 ---------------NHGGEMAGK-----NNGKRGFSETVD-------------LKLN-- pt042254_POPTR_ --------------AKNEVETPNK-----ATGKRGFAETVD-------------LKLN-- pt033721_POPTR_ --------------VKNEVETPNK-----ATGKRGFAETVD-------------LKLN-- pt001265_POPTR_ ---------------GGGGTEGGE-----FARKRGFSETVD-------------LKLN-- pt001264_POPTR_ ---------------GGGGTEGGE-----FARKRGFSETVD-------------LKLN-- pt011954_POPTR_ VSLFGKD----IDTNNTNGYPLRPLKNLVSGTKRGFSDAIVGSSGKWVFSGSNGSEVDLG pt039463_POPTR_ ---------------GGGAE--GE-----MVRKRGFSETVD-------------LKLK-- pt030401_POPTR_ VSLVGKD----IDTNNTNAYSLIPVKNLVSGAKRVFSDAIDGSTGKWVFSG--------- pt039771_POPTR_ SALLDEKPFFPLHPSNDGHYSSTQ-KNVVSGNKRVFSDAMDEFSESKFLSN---SEVN-- pt005605_POPTR_ FSL-----------NNNNSKD----KSFVSGARRGFSVAIHGGSANWVFSGNAGSDPN-- :* *: :: AT3G04730.1 -----LSS------------------------------TAMDSVSKVDL-ENMK------ pt042254_POPTR_ -----LQ--------------------------------AKEGV--MDLNENIKNITSKD pt033721_POPTR_ -----LQ--------------------------------AKEGV--MDLNENIKNIASKD pt001265_POPTR_ -----LS--------------------------------SKEGG--IDPNHEKT---QRE pt001264_POPTR_ -----LS--------------------------------SKEGG--IDPNHEKT---QRE pt011954_POPTR_ KGAILFSPR---------------GDNGNSQKSCVAGPAKKDDVA-----QSPKP-VQEK pt039463_POPTR_ -----LS--------------------------------SKESG--ADPNHEKTSSLQRE pt030401_POPTR_ ------------------------GDNGNPQKSRVAGPAKK-DVA-----QSPKP-VQEK pt039771_POPTR_ ---AMLSPRPSPNMGLKPGMLENLGVQQAKVKEIVAPKAGQE-----------RPHAANE pt005605_POPTR_ -----FSLR---------------GAN-----------SGKEGFP-----HSSKPVVQEN AT3G04730.1 ---------E-KVVKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNVMS--------------GQKP----- pt042254_POPTR_ KNHLPAVTIK-DPAKPPAKAQVVGWPPVRSYRKNVMA----------------------- pt033721_POPTR_ KNHLPADTIK-DPAKPPAKAQVVGWPPVRSYRKNVLAQKNASEEGFRAQVVGWPPLRSYR pt001265_POPTR_ KNLLA----T-DPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNMLA----------------------- pt001264_POPTR_ KNLLA----T-DPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNMLA----------------------- pt011954_POPTR_ ISQVAAANEN--SSAPAAKAQVVGWPPIRSFRKNTMASS--------------------- pt039463_POPTR_ KNLLA----T-DPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNMLA----------------------- pt030401_POPTR_ NSQVAAANEN--SSAPAAKTQVVGWPPIRSFRKNTMASS--------------------- pt039771_POPTR_ TRPLRNSSAN-NSSAPAPKAQVVGWPPIKSFRKNSLATT--------------------- pt005605_POPTR_ KSQVDGANTNGHGAAPASKAQVVGWPPIRSFRKNTMASH--------------------- *..*:*******::*:*** :: AT3G04730.1 ----TTGDATEGN--DKTSGSSGATSSASACATVAYVKVSMDGAPYLRKIDLKLYKTYQD pt042254_POPTR_ -----QKNASEEG--EK--ASTGGSSA-------AFVKVCMDGAPYLRKVDLKMYRSYQE pt033721_POPTR_ KNVLTQKNASEEG--DK--ASTGGSSA-------AFVKVCMDGAPYLRKVDLKMYKSYQE pt001265_POPTR_ ----VQKSSTDQESTDK---VPGGNAT--------FVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYHE pt001264_POPTR_ ----VQKSSTDQESTDK---VPGGNAT--------FVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYHE pt011954_POPTR_ ----LVKNNEDVE------GKSGYGCL--------YVKVSMDGAPYLRKVDLKTYSNYLE pt039463_POPTR_ ----VQKSSTDQE-CEK---VPGGNAT--------FVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYQE pt030401_POPTR_ ----LAKNNEDVD------GKSGYGYL--------YVKVSMDGAPYLRKVDLKTYGNYLE pt039771_POPTR_ -----SKNTEEVD------GKAGPGAL--------FIKVSMDGAPYLRKVDLRNYSAYQE pt005605_POPTR_ ----LSKNDDGAE------VKSGSGCL--------YVKVSMDGAPYLRKVDLKTFGSYME . .* ::**.*********:**: : * : AT3G04730.1 LSNALSKMFSSFTIGNYGPQGM--KDFMNESKLIDLLNGSDYVPTYEDKDGDWMLVGDVP pt042254_POPTR_ LSDALAKMFSSFTMGNYGAQGM--IDFMNESKLMDLLNSSEYVPSYEDKDGDWMLVGDVP pt033721_POPTR_ LSDALAKMFSSFTMGNYGAQGM--IDFMNESKLMDLLNSSEYVPSYEDKDGDWMLVGDVP pt001265_POPTR_ LSDALGKMFSSFTIGNCGSHGM--KDFLNESKLIDLLNGTDYVPTYEDKDGDWMLVGDVP pt001264_POPTR_ LSDALGKMFSSFTIGNCGSHGM--KDFLNESKLIDLLNGTDYVPTYEDKDGDWMLVGDVP pt011954_POPTR_ LSSALEKMFSCFTIGQCGSHGLRGQDGLTESRLKDILHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVP pt039463_POPTR_ LSDALGKMFSSFTIGNCGSHGL--KDFLNESKLIDLLNGTDYVPTYEDKDGDWMLVGDVP pt030401_POPTR_ LSSALEKMFGCFTIGQCGSHGLAARDGLTESCLKD-LHGSEYVLTFEDKDGDWMLVGDVP pt039771_POPTR_ LSSALEKMFSCFTIGQYGSHGAPGREMLSESKLKDLLHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVP pt005605_POPTR_ LSSALEKMFSCFTIGQCGSHVVPGQDGLSESRLMDLLHGSEYVLTYEDKDNDWMLVGDVP **.** ***..**:*: *.: : :.** * * *:.::** ::****.********* AT3G04730.1 WEMFVDSCKRIRIMKGSEAIGLAPRALEKCKNRS-- pt042254_POPTR_ WEMFVNSCKRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKSRT-- pt033721_POPTR_ WEMFVDSCKRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKSRT-- pt001265_POPTR_ WDMFVESCKRLRIMKGTEATGLGNEYTA-------- pt001264_POPTR_ WDMFVESCKRLRIMKGTEATGLAPRAMEKCKNRSFK pt011954_POPTR_ WDMFTNSCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKNRN-- pt039463_POPTR_ WDMFVESCKRLRIMKGTEATGLAPRAMEKCKNRSYK pt030401_POPTR_ WDMFTDSCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKNRN-- pt039771_POPTR_ WEMFIETCKRLRIMKSSDAIGLAPRAMEKCKNRN-- pt005605_POPTR_ WKMFTDSCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKSRN-- *.** ::*:*:****.::* **. .
|