Input
| Putative repression domain
|
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AT3G12250.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
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| Type
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Sb008905 |
not found in 468aa |
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not found in 610aa |
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not found in 320aa |
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III |
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not found in 635aa |
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III |
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not found in 711aa |
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not found in 1126aa |
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not found in 2063aa |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb021629_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb018850_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb032677_Sorbi1 ----PPTL--------EIFPSWPMSHLQQ-PYSGN-----SHSVGSTTDSSSGQNSMP--
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Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb003379_Sorbi1 ----------------------------------------------GVAITRSVDGHE-N
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Sb021629_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb028455_Sorbi1 AARPPPTL--------DIFPAWPMRSLHT-PKEC---SNVTADSTDDSESSSKNNSNHSS
Sb026152_Sorbi1 APRQEVMMVTT-----DDYSYKP---------------GLAAAPAAAAAPPPSFQQHH--
Sb018850_Sorbi1 ----------------------------------------MAYASPGTDTSTDLDTDE-K
AT3G12250.1 DLG---------------------------SDRGHMHA-AASDSSDRSKDKLDQKTLRRL
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Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb030559_Sorbi1 GQAPAAAA-----------------------------------------------AARRV
Sb003379_Sorbi1 ---------------------------------------SLPVCKVESRD---HKAQRRL
Sb023083_Sorbi1 GQHRSVAAPAGPVVPLPSNNLAKDNRNSLTKKEETSGGKGAASAGIVQERVKDPKTLRRL
Sb021629_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb028455_Sorbi1 DQLGAAA-------NMATQFDQAS------QQQQLQHKNMATSSTPRTGKPLDPKVIRRL
Sb026152_Sorbi1 --------------PLPLQLHGGDG-----GGGGGDHDKRKHGSTRKDGKLVDAKTERRL
Sb018850_Sorbi1 NQM---------------------------LELGQLVSLTASDSGNKSKDKLGQKT--SL
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Sb032677_Sorbi1 SGQRQEVLMVT---------VDDYNYEQGLGAAATT-AQIFQQHAAGQDKGLFPG---GG
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Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031426_Sorbi1 AQNREAARKSR---------LRKKAYIQQLESSKLKLAQIEQDMQRAHSQGIFL-----G
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Sb023083_Sorbi1 AQNREAARKSR---------LRKKAYIQQLETSRIRLSQLEQQVQVARVQGVFLGT---G
Sb021629_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb028455_Sorbi1 AQNREAARKSR---------LRKKAYIQQLESCKLKLSQMEQDMQRARSQGLFL-----G
Sb026152_Sorbi1 AQNREAARKSR---------LRKKAYVQQLETSRIRLQQVEHELQRARSQGLFV----GG
Sb018850_Sorbi1 VTDL-------------------MAYVEQLENSRLKLSQLEQELQRARQQGIFIPT--PG
AT3G12250.1 DQAH-STGGNGALAFDAEHSRWLEEKNRQMNELRSALNAHAGDTELRIIVDGVMAHYEEL
Sb032677_Sorbi1 GAPG--DLSSGAVIFDMEYARWLEDDTKHMTELQAVLQPQIIDANLGAIVEECMRHYDEL
Sb008905_Sorbi1 DQPQ-STSGNGALAFDMEYARWLEEHNKHVNELRAAVNAHAGDNDLRGIVDSIMAHYDEI
Sb024379_Sorbi1 -------TFKGALTFDIEYARWLEDQNKQINELRTAVNAHASDSDLRLIVDGIMAHYDEI
Sb031426_Sorbi1 GAPG-ANSSSGAAMFDVEYARWLDDHGRRMAELHGALHAHLPDGDLRAIVDDTLTHHDEL
Sb030559_Sorbi1 GAGEAGDGAAGGAAVARAGGAAAGARRRRAGALRRAVPGQGAGGAVR-------------
Sb003379_Sorbi1 DHGG-STG--GALAFDLEYARWLDEHQHHMNDLRVALSAQIGDDDLGVLVDGVMLHYDEM
Sb023083_Sorbi1 EQPGFSSAPSPAAVFDVEYGRWVEEHSKLMFQLRAALSEHLADEQLQSFVNGGMAQHEEL
Sb021629_Sorbi1 -------ASKGAMTFDLEYSRWQEDQNKQMNELRTAVNAHASDSDLRLIVDGIMAHYDEI
Sb028455_Sorbi1 GGTG-ANTSSGAAMFDVEYARWLDDHSRRLAELNGALHAHLADGDLRAIVDDALTHHDEL
Sb026152_Sorbi1 CSAA-GDMSSGAAMFDMEYARWLDDDSKRLAELRAGLQAQLLDGNLGLIVEECMQHYDEL
Sb018850_Sorbi1 DQPN-STTENGALAFDMDYARWQDDHNKQINELRAALNAHASDDDLRHMIDSIMAYYSEA
. . . : *. : : . :
AT3G12250.1 FRIKSNAAKNDVFHLLSGMWKTPAERCFLWLGGFR-SSELLKLLANQLEP-MTERQVMGI
Sb032677_Sorbi1 FHLRAMLARSDVFHLMTGLWATTAERCFLWMGGFR-PSEILKMLIPQLDP-LTEPQLLGM
Sb008905_Sorbi1 FRLKGVAAKADVFHVLSGMWKTPAERCFMWLGGFR-SSELLKLLAGHLEP-LTDQQLVGI
Sb024379_Sorbi1 FKVKGVAAKADVFHILSGMWKTPAERCFLWLGGFR-PSELLKLLANHLEP-LTEQQMLGL
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Sb030559_Sorbi1 -------------------------RLLRAVGGVAGPRGAVLPLDRRVPP-LRAAQGAGA
Sb003379_Sorbi1 FRLKGVATRTDVFHVLSGMWMSPAERFFMWLGGFR-SSELLKVVARQVEPQLTEQQLVGI
Sb023083_Sorbi1 LNLKGAMARADVFHLLSGVWVSPAERCFLWLGGFR-PSEVIKVMLKHVEP-LSEGQILGI
Sb021629_Sorbi1 FRLKGIAAKADVFHILSGMWKTPAERCFLWLGGFR-SSELLKLLVNQLEP-LTEQQLMGL
Sb028455_Sorbi1 FQLKAMAAKSDVFHLITGVWTTPAERCFLWMGGFR-PSDLLKTLLPQLDP-LTEQQVIGI
Sb026152_Sorbi1 FQLKAALARSDVFHLLTGAWATAAERCFFWMGGFR-PSELLKILIPQLDP-LTEQQLLGI
Sb018850_Sorbi1 FRLKRVAAKADAFHVLSGMWKTPVERCFMWFGGLR-PSEILKLLASHLEP-LTEQQLASI
* : .**. . : : :: * : * .
AT3G12250.1 NSL----------QQTSQQAEDALSQGMESLQQSLADTLS--------------------
Sb032677_Sorbi1 YNL----------QRSSEQTEEALGQGLQQLHQSLADAVG--------------------
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Sb024379_Sorbi1 NNL----------QQSSQQAEDALSQGMEALQQSLAETLAGSLG----------------
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Sb026152_Sorbi1 CNL----------QQSSEQAEEALAQGLHQLHQSLADTVA--------------------
Sb018850_Sorbi1 YSL----------QQSSEQAEEDLSQGVRALQQSVAETLA--------------------
: :. * :.: .* .:
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Sb021629_Sorbi1 SQQAEDALSQGMEALQQSLAETLAGSLGPSGSSGNVANYMGQMAMAMGKLGTLENFLRQL
Sb028455_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb026152_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb018850_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb031426_Sorbi1 ---------------------------------------------GGSLI------DDTN
Sb030559_Sorbi1 AARR-----RRRVRGAADGQRRRQARRPRRLRG------------QGGPSPAADAAEHAQ
Sb003379_Sorbi1 ---------------------------------------------AAAPAAPGPSASAAD
Sb023083_Sorbi1 ------------------------------------------------------APDVAP
Sb021629_Sorbi1 LVNQLEPLTEQQLMGLSNLQQSSQQAEDALSQGMEALQQSLAETLAGSLGPSGSSGNVAN
Sb028455_Sorbi1 ---------------------------------------------GGSLI------DDAN
Sb026152_Sorbi1 ---------------------------------------------TGTLN-----DGAAT
Sb018850_Sorbi1 ---------------------------------------------SGSLCPAGSSGNAAD
:
AT3G12250.1 ----YMGQMAMAMGQLGTLEGFIRQADNLRLQTLQQMLRVLTTRQSARALLAI-------
Sb032677_Sorbi1 ----YTALMALALDRLDTLESFYRQADSLRQQTLHQMRRILTTRQTARCFLSI-------
Sb008905_Sorbi1 ----YMGQMAMAMGKLGTLENFLRQADNLRLQTLQQMQRILTTRQSARALLAI-------
Sb024379_Sorbi1 ----YMGQMAMAMGKLGTLENFLRQADNLRQQTLHQMQRILTIRQASRALLAI-------
Sb031426_Sorbi1 --MSFMGQMALALGKLSNLEGFVIQADNLRQQTLHQMHRILTVRQAARCFLAI-------
Sb030559_Sorbi1 DPDAAAGGAGPA------------RARGLRP-------------AAARAQLALGGAPAGA
Sb003379_Sorbi1 SVTNYMGQMAVAMSKLATVENFLRQADLLRQQTLKQVHRILTTRQAARALLVV-------
Sb023083_Sorbi1 --ATFMGHMSLAMNKVAAMESFVMQADGLRQQTLHKLHHILTTRQAARCLLAI-------
Sb021629_Sorbi1 ----YMGQMAMAMGKLGTLENFLRQADNLRQQTLHQMQRILTIRQAARALLAI-------
Sb028455_Sorbi1 --MSFMSQMALALGKLANLEGFVIQADNLRQQTLHQMHRILTVRQAARCFLAI-------
Sb026152_Sorbi1 --PNYMNIMAVAIDKLACLENFYQQADNLRQQTLHQMRRILTTRQAARCFLSI-------
Sb018850_Sorbi1 ----CSGQMAVAVGKLGTLESFLQEADDLRRRILEQMQHILTTRQSARALLAI-------
. * .* ** ::*. * :
AT3G12250.1 ----------------HDYSSRLRALSSL-----WLARPRE-------------------
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Sb031426_Sorbi1 ----------------GEYHNRLRALSSL-----WVSRPREI--------LGADEG----
Sb030559_Sorbi1 GVSVTEHPRDGDGDGDGEEEAALQARARVVGFGCRPGRPAEQ--------GCGGQCLSLL
Sb003379_Sorbi1 ----------------SDYFSRLRALSSL-----WLTRPTD-------------------
Sb023083_Sorbi1 ----------------ADYFHRLRALSTL-----WVARPRQ------------DDG----
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Sb026152_Sorbi1 ----------------GEYYSRLRALSNL-----WASRPRDN--------FIGTESLS--
Sb018850_Sorbi1 ----------------SDYLSRLRALSSL-----WIARPRE-------------------
: *:* : : **
AT3G12250.1 -------------------------------------
Sb032677_Sorbi1 --------PATGTTSEQAALRPYNHQSQ-QFPGF---
Sb008905_Sorbi1 -------------------------------------
Sb024379_Sorbi1 -------------------------------------
Sb031426_Sorbi1 ---------NCGEISIAA------QASQSQFSSF---
Sb030559_Sorbi1 SFQLCIWYSGTGNRRVLLLALRMKPESSNGVTVTAVN
Sb003379_Sorbi1 -------------------------------------
Sb023083_Sorbi1 --------PGLQ-------------------------
Sb021629_Sorbi1 -------------------------------------
Sb028455_Sorbi1 ---------NCEEISIAA------QPSQSQFSAF---
Sb026152_Sorbi1 --------PTATELQALH------HQQQNQFTGF---
Sb018850_Sorbi1 -------------------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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Sb008905_Sorbi1 |
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Sb024379_Sorbi1 |
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Sb031426_Sorbi1 |
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Q |
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Q |
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Sb030559_Sorbi1 |
S |
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E |
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Sb003379_Sorbi1 |
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Sb023083_Sorbi1 |
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Sb021629_Sorbi1 |
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Sb028455_Sorbi1 |
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Sb026152_Sorbi1 |
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Q |
Q |
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Sb018850_Sorbi1 |
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