Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G12250.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb007418 |
not found in 330aa |
AT3G12250.2 |
1st_not |
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II |
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not found in 468aa |
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not_not |
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III |
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not found in 316aa |
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not_not |
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not found in 610aa |
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not_not |
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III |
Sb018850 |
not found in 320aa |
AT5G06950.4 |
not_not |
0.544354838 |
III |
Sb028455 |
not found in 635aa |
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not_not |
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III |
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not found in 711aa |
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not_not |
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not found in 1126aa |
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not found in 2063aa |
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not found in 489aa |
AT1G08320.2 |
not_not |
0.409274193 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb021629_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb032677_Sorbi1 L-VSPGSMRADSGQRQEVLMV----------TVDDYNYEQGLGAAATT------------
Sb003379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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AT3G12250.1 RARQQGVFISS--SGDQAHSTGGNGALAFDAEHSRWLEEKNRQMNELRSALNAHAGDTEL
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Sb031426_Sorbi1 RAHSQGIFLGGA-----PGANSSSGAAMFDVEYARWLDDHGRRMAELHGALHAHLPDGDL
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Sb018850_Sorbi1 RARQQGIFIPT--PGDQPNSTTENGALAFDMDYARWQDDHNKQINELRAALNAHASDDDL
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Sb030559_Sorbi1 ---------GGG---AGEAGDGAAGGAAVARAGGAAAGARRRRAGALRRAVPGQGAGGAV
. . . : *. : : . :
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Sb023083_Sorbi1 QSFVNGGMAQHEELLNLKGAMARADVFHLLSGVWVSPAERCFLWLGGFR-PSEVIKVMLK
Sb024379_Sorbi1 RLIVDGIMAHYDEIFKVKGVAAKADVFHILSGMWKTPAERCFLWLGGFR-PSELLKLLAN
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Sb026152_Sorbi1 GLIVEECMQHYDELFQLKAALARSDVFHLLTGAWATAAERCFFWMGGFR-PSELLKILIP
Sb008905_Sorbi1 RGIVDSIMAHYDEIFRLKGVAAKADVFHVLSGMWKTPAERCFMWLGGFR-SSELLKLLAG
Sb032677_Sorbi1 GAIVEECMRHYDELFHLRAMLARSDVFHLMTGLWATTAERCFLWMGGFR-PSEILKMLIP
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Sb007418_Sorbi1 RSVVDKIMSHYDEIFRLKGNAAKADVFHVLSGMWKTPAERCFLWLGGFR-PSEVLKLLST
Sb018850_Sorbi1 RHMIDSIMAYYSEAFRLKRVAAKADAFHVLSGMWKTPVERCFMWFGGLR-PSEILKLLAS
Sb028455_Sorbi1 RAIVDDALTHHDELFQLKAMAAKSDVFHLITGVWTTPAERCFLWMGGFR-PSDLLKTLLP
Sb030559_Sorbi1 R--------------------------------------RLLRAVGGVAGPRGAVLPLDR
* : .**. . : :
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Sb018850_Sorbi1 HLEP-LTEQQLASIYSL----------QQSSEQAEEDLSQGVRALQQSVAETLA------
Sb028455_Sorbi1 QLDP-LTEQQVIGICNL----------QQSSQQAEEALSQGLEQLHQSLADTMA------
Sb030559_Sorbi1 RVPP-LRAAQGAGAAAEPAHGPPGGRGAQAAEHGEAAGGRAVAGHEQAAADARR------
:: * : * . : :. * :.: .* .:
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Sb024379_Sorbi1 MGKLGTLENFLRQLLANHLEPLTEQQMLGLNNLQQSSQQAEDALSQGMEALQQSLAETLA
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Sb028455_Sorbi1 -----------------------------------------------------------G
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Sb032677_Sorbi1 SPLS---DGANVA----NYTALMALALDRLDTLESFYRQADSLRQQTLHQMRRILTTRQT
Sb003379_Sorbi1 AAPAAPGPSASAADSVTNYMGQMAVAMSKLATVENFLRQADLLRQQTLKQVHRILTTRQA
Sb007418_Sorbi1 GSLSSSGSTGNVA----NYMGQMAMAMGKLGTLENFLRQADNLRLQTLQQMQRILTTRQS
Sb018850_Sorbi1 GSLCPAGSSGNAA----DCSGQMAVAVGKLGTLESFLQEADDLRRRILEQMQHILTTRQS
Sb028455_Sorbi1 GSLI---DDANMS-----FMSQMALALGKLANLEGFVIQADNLRQQTLHQMHRILTVRQA
Sb030559_Sorbi1 GGPSPAADAAEHAQDPDAAAGGAGPA------------RARGLRP-------------AA
. * .* ** :
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Sb008905_Sorbi1 ARALLAI-----------------------SDYFSRLRALSSL-----WLARPRE-----
Sb032677_Sorbi1 ARCFLSI-----------------------SEYHRRLRALSSV-----WASRPPTESS--
Sb003379_Sorbi1 ARALLVV-----------------------SDYFSRLRALSSL-----WLTRPTD-----
Sb007418_Sorbi1 ARALLVI-----------------------SDYSSRLRALSSL-----WLARPKE-----
Sb018850_Sorbi1 ARALLAI-----------------------SDYLSRLRALSSL-----WIARPRE-----
Sb028455_Sorbi1 ARCFLAI-----------------------GEYHNRLRALSSL-----WASRPREI----
Sb030559_Sorbi1 ARAQLALGGAPAGAGVSVTEHPRDGDGDGDGEEEAALQARARVVGFGCRPGRPAEQGCGG
:*. * : : *:* : : **
AT3G12250.1 --------------------------------------------------------
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Sb023083_Sorbi1 -----------------------------GPGL------------------Q----
Sb024379_Sorbi1 --------------------------------------------------------
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Sb026152_Sorbi1 -------------FIGTES---------LSP---TATELQAL---HHQQQNQFTGF
Sb008905_Sorbi1 --------------------------------------------------------
Sb032677_Sorbi1 -------VAAAAAAAGAEN---------VSPATGTTSEQAALRPYNHQSQ-QFPGF
Sb003379_Sorbi1 --------------------------------------------------------
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Sb018850_Sorbi1 --------------------------------------------------------
Sb028455_Sorbi1 -------------LVNDEG---------------NCEEISIA---AQPSQSQFSAF
Sb030559_Sorbi1 QCLSLLSFQLCIWYSGTGNRRVLLLALRMKPESSNGVTVTAV---N----------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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Sb026152_Sorbi1 |
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Sb008905_Sorbi1 |
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Sb032677_Sorbi1 |
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Sb003379_Sorbi1 |
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Sb007418_Sorbi1 |
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Sb018850_Sorbi1 |
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