Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G15270.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os028209 |
not found in 216aa |
AT1G53160.1 |
1st_not |
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II |
Os015713 |
not found in 969aa |
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not_not |
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III |
Os015714 |
not found in 657aa |
AT3G60030.1 |
not_not |
0.410526315 |
III |
Os015712 |
not found in 739aa |
AT3G60030.1 |
not_not |
0.410526315 |
III |
Os018350 |
not found in 360aa |
AT1G27370.4 |
not_not |
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III |
Os032080 |
AHFSGELELALQGNGP in 382/417 |
AT2G42200.1 |
not_not |
0.4 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT3G15270.1 ----------------------MEGQRT-------------QRRGYLKDKATVSNLVEEE
Os015714_Os03t0 MEAARVGAQSRHLYGGGLGEPDMDRRDKRLFGWDLNDWRWDSDRFVATPVPAAEASGLAL
Os032080_Os08t0 -------------------------------------------MEMASGGGAAAAAGGGV
Os028209_Os07t0 ----------------------MDRKDK-------------ARKNFSSSSSSSAASMAAL
Os015713_Os03t0 MEAARVGAQSRHLYGGGLGEPDMDRRDKRLFGWDLNDWRWDSDRFVATPVPAAEASGLAL
Os018350_Os04t0 -----------------------------------------------------------M
Os015712_Os03t0 MEAARVGAQSRHLYGGGLGEPDMDRRDKRLFGWDLNDWRWDSDRFVATPVPAAEASGLAL
AT3G15270.1 MENGMDGEEEDGG---------------------------------DEDKR---------
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Os032080_Os08t0 GGSGGGG---GGG---------------------------------DEHRQLHG----LK
Os028209_Os07t0 AAAAAAG---DGGA---------------ALPSP-----------MEEDKK---------
Os015713_Os03t0 NSSPSSS-EEAGAASVRNV-----------------------NARGDSDKR---------
Os018350_Os04t0 EGNGCGG---SGATP-RGVVGMHWAPVVTSPPSPQPPFLPPAPCRPDVQMQQQGGLTCLK
Os015712_Os03t0 NSSPSSS-EEAGAASVRNV-----------------------NARGDSDKR---------
. *. : . :
AT3G15270.1 --KKVMER---------------------------VRGPSTDRVPS--------------
Os015714_Os03t0 --KRVVVIDDDDVEDDELVENGGGSLSLRIGGDAVAHGAGVG------------GGADEE
Os032080_Os08t0 FGKKIYFED------AAAAAGGGGTGSG--SGSASAAPPSSSSKAA--------GGG---
Os028209_Os07t0 --PRLVASS------LAPVAGGGGGGSS--SSAAVAAGASSSSSSSSVAAAARRGAG---
Os015713_Os03t0 --KRVVVIDDDDVEDDELVENGGGSLSLRIGGDAVAHGAGVG------------GGADEE
Os018350_Os04t0 LGKRPCFW------------GGDGAGQ-------VAQGSGGG------------GGG---
Os015712_Os03t0 --KRVVVIDDDDVEDDELVENGGGSLSLRIGGDAVAHGAGVG------------GGADEE
: . .. .
AT3G15270.1 ------------------------------RLCQVDRCTVNLTEAKQYYRRHRVCEVHAK
Os015714_Os03t0 DRNGKKIRVQGGSPSG--------------PACQVEGCTADLTGVRDYHRRHKVCEMHAK
Os032080_Os08t0 -------RGGGGKNKGKGVAAAAPPPPPPPPRCQVEGCGADLSGIKNYYCRHKVCFMHSK
Os028209_Os07t0 -------RAGGGAPSGGGGG----------PRCQVERCGVDLSEAGRYNRRHKVCQTHSK
Os015713_Os03t0 DRNGKKIRVQGGSPSG--------------PACQVEGCTADLTGVRDYHRRHKVCEMHAK
Os018350_Os04t0 -------GGGGSADQGKRKEKAATAVPVV-PRCQVEGCDITLQGVKEYHRRHKVCEVHAK
Os015712_Os03t0 DRNGKKIRVQGGSPSG--------------PACQVEGCTADLTGVRDYHRRHKVCEMHAK
***: * * * **:** *:*
AT3G15270.1 ASAATVAGVRQRFCQQCSRFHELPEFDEAKRSCRRRLAGHNERRRKISGDSFGE------
Os015714_Os03t0 ATTAVVGNTVQRFCQQCSRFHPLQEFDEGKRSCRRRLAGHNRRRRKTRPEVAVGGSAFTE
Os032080_Os08t0 APRVVVAGLEQRFCQQCSRFHLLPEFDQGKRSCRRRLAGHNERRRRPQTPLASRYG----
Os028209_Os07t0 EPVVLVAGLRQRFCQQCSRFHELTEFDDAKRSCRRRLAGHNERRRKSAADTAH-------
Os015713_Os03t0 ATTAVVGNTVQRFCQQCSRFHPLQEFDEGKRSCRRRLAGHNRRRRKTRPEVAVGGSAFTE
Os018350_Os04t0 APRVVVHGTEQRFCQQCSRFHVLAEFDDAKKSCRRRLAGHNERRRRSNASEAMAR-----
Os015712_Os03t0 ATTAVVGNTVQRFCQQCSRFHPLQEFDEGKRSCRRRLAGHNRRRRKTRPEVAVGGSAFTE
. . * . *********** * ***:.*:**********.***:
AT3G15270.1 ----------------------GSGRR---------------------------------
Os015714_Os03t0 DKISSYLLLGLLGVCANLNADNAEHLRGQELISGLLRNLGAVAKSLD---PKELCKLLEA
Os032080_Os08t0 ----------------RLAASVGEHRRFRSF-------------TLDFSYPRVPSSVRNA
Os028209_Os07t0 ----------------------GENCR---------------------------------
Os015713_Os03t0 DKISSYLLLGLLGVCANLNADNAEHLRGQELISGLLRNLGAVAKSLD---PKELCKLLEA
Os018350_Os04t0 ----------------------GSAHP---------------------------------
Os015712_Os03t0 DKISSYLLLGLLGVCANLNADNAEHLRGQELISGLLRNLGAVAKSLD---PKELCKLLEA
..
AT3G15270.1 ------------------------------G------------FSGQ-------------
Os015714_Os03t0 CQSMQDGS--NAGTSETANALVNTAVAEAAGPSNSKMPFVNGDQCGLASSSVVPVQSKSP
Os032080_Os08t0 WPAIQPGDRISGGIQWHRNVAPHGHSSAVAGYGAN-------TYSGQGSSSSGP-----P
Os028209_Os07t0 ------------------------HADQDAG-----------------------------
Os015713_Os03t0 CQSMQDGS--NAGTSETANALVNTAVAEAAGPSNSKMPFVNGDQCGLASSSVVPVQSKSP
Os018350_Os04t0 ------------------------HGMPVLGHG---------------------------
Os015712_Os03t0 CQSMQDGS--NAGTSETANALVNTAVAEAAGPSNSKMPFVNGDQCGLASSSVVPVQSKSP
*
AT3G15270.1 --------------------------------------------------LIQ-----TQ
Os015714_Os03t0 TVATP-DPPACKFKDFDLNDTYGGMEGFEDGYEGSPTPAFKTTDSPNCPSWMHQDSTQSP
Os032080_Os08t0 VFAGPNLPPG------------GCLAGV-----GAA------TDSSCALSLLS-----TQ
Os028209_Os07t0 ------------------------------------------------------------
Os015713_Os03t0 TVATP-DPPACKFKDFDLNDTYGGMEGFEDGYEGSPTPAFKTTDSPNCPSWMHQDSTQSP
Os018350_Os04t0 ------FPP------------------Y-----GLP------TSSAGALSLLSS-ARATG
Os015712_Os03t0 TVATP-DPPACKFKDFDLNDTYGGMEGFEDGYEGSPTPAFKTTDSPNCPSWMHQDSTQSP
AT3G15270.1 ER-----NRV-------------DRKLPM-TNSSFK------------------------
Os015714_Os03t0 PQTSGNSDSTSAQSLSSSNGDAQCRTDKI-VFKLFEKVPSDLPPVLRSQILG-WLSSSPT
Os032080_Os08t0 PW-----DTTTHSAAA-----SHNQAAAMSTTTSFDGN-----PVAPSAMAGSYMAPSP-
Os028209_Os07t0 ------------------------------------------------------------
Os015713_Os03t0 PQTSGNSDSTSAQSLSSSNGDAQCRTDKI-VFKLFEKVPSDLPPVLRSQILG-WLSSSPT
Os018350_Os04t0 PWLMPTPDISARSSAALDELIAENRAALL-SWQFFSD-----------------------
Os015712_Os03t0 PQTSGNSDSTSAQSLSSSNGDAQCRTDKI-VFKLFEKVPSDLPPVLRSQILG-WLSSSPT
AT3G15270.1 --------R-------------P-------------------------------------
Os015714_Os03t0 DIESYI--R-------------PGCIILTVYLRLVESAWKELSDNMSSYLDKLLNSSTGN
Os032080_Os08t0 ----WTGSRGHEGGGRSVAHQLP-------------------------------------
Os028209_Os07t0 --------RSHQGTGNP-----P-------------------------------------
Os015713_Os03t0 DIESYI--R-------------PGCIILTVYLRLVESAWKELSDNMSSYLDKLLNSSTGN
Os018350_Os04t0 --------RQPPPAGRPTGRS-PG-------------------------------SETAG
Os015712_Os03t0 DIESYI--R-------------PGCIILTVYLRLVESAWKELSDNMSSYLDKLLNSSTGN
* *
AT3G15270.1 -------------QIR--------------------------------------------
Os015714_Os03t0 FWASGLVFVMVRHQIA------------FMH---NGQLMLDRPLA-----NSAHHYCKIL
Os032080_Os08t0 ------------HEVSLDEVHPGP----SHHAHFSGELELALQ-------GNG-------
Os028209_Os07t0 ------------FQIR--------------------------------------------
Os015713_Os03t0 FWASGLVFVMVRHQIA------------FMH---NGQLMLDRPLA-----NSAHHYCKIL
Os018350_Os04t0 GWHA-------HLQAR-----PPPPGAGGQHENQSGHVTLDLMQATTAAGGSGAPF----
Os015712_Os03t0 FWASGLVFVMVRHQIA------------FMH---NGQLMLDRPLA-----NSAHHYCKIL
:
AT3G15270.1 ------------------------------------------------------------
Os015714_Os03t0 CVRPIAA--PFSTKVNFRVEGLNLVSDSSRLICSFEGSCIFQEDTDNIVDDVEHDDIEYL
Os032080_Os08t0 ---PAPA--P-------RIDP--------------GSGSTFDQ-TSNTMD----------
Os028209_Os07t0 ------------------------------------------------------------
Os015713_Os03t0 CVRPIAA--PFSTKVNFRVEGLNLVSDSSRLICSFEGSCIFQEDTDNIVDDVEHDDIEYL
Os018350_Os04t0 --RPVPARPP-------KEGG--------------DAGCTSDAWTPSPME----------
Os015712_Os03t0 CVRPIAA--PFSTKVNFRVEGLNLVSDSSRLICSFEGSCIFQEDTDNIVDDVEHDDIEYL
AT3G15270.1 ------------------------------------------------------------
Os015714_Os03t0 NFCCPLPSSRGRGFVEVEDGGFSNGFFPFIIAEQDICSEVCEL-----------------
Os032080_Os08t0 ------------------------------------------------------------
Os028209_Os07t0 ------------------------------------------------------------
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Os018350_Os04t0 ------------------------------------------------------------
Os015712_Os03t0 NFCCPLPSSRGRGFVEVEDGGFSNGFFPFIIAEQDICSEVCELESIFESSSHEQADDDNA
AT3G15270.1 ------------------------------------------------------------
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Os028209_Os07t0 ------------------------------------------------------------
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Os018350_Os04t0 ------------------------------------------------GARVV-------
Os015712_Os03t0 RNQALEFLNELGWLLHRANIISKQDKVPLASFNIWRFRNLGIFAMEREWCAVTKLLLDFL
AT3G15270.1 ------------------------------------------------------------
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Os018350_Os04t0 ------------------------------------------------------------
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AT3G15270.1 ------------------------------------------------------------
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Os018350_Os04t0 ------------------------------------------------------------
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Os015713_Os03t0 NMVEKKINKHLGKGHVVLGVPSSIHPVITDGVKPGEVSLEIGMTVPPPAPSCNACSRQAL
Os018350_Os04t0 ------------------------------------------------------------
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Os015713_Os03t0 MYPNSTARTFLYRPAMLTVMGIAVICVCVGLLLHTCPKVYAAPTFRWELLERGPM
Os018350_Os04t0 -------------------------------------------------------
Os015712_Os03t0 -------------------------------------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G15270.1 |
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