Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G15270.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Gm037008 |
not found in 138aa |
AT2G33810.1 |
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not found in 138aa |
AT2G33810.1 |
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III |
Gm033819 |
not found in 185aa |
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0.445614035 |
III |
Gm018912 |
not found in 146aa |
AT2G33810.1 |
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III |
Gm052112 |
not found in 359aa |
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0.438596491 |
III |
Gm037412 |
not found in 187aa |
AT3G15270.1 |
not_1st |
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II |
Gm036360 |
not found in 142aa |
AT2G33810.1 |
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III |
Gm018555 |
not found in 1019aa |
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III |
Gm016104 |
not found in 173aa |
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0.428070175 |
III |
Gm053471 |
not found in 1009aa |
AT1G20980.1 |
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0.428070175 |
III |
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NEEGGTLSLKLGGHAS in 119/687 |
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III |
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NEEGGTLSLKLVSGST in 116/936 |
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NDGAGSLNLNLGGQVY in 96/953 |
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III |
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III |
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NDGAGSLNLNLGGQVY in 113/1032 |
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NDGAGSLNLNLGGQVY in 113/1032 |
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III |
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not found in 333aa |
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0.403508771 |
III |
Gm000900 |
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AT1G27370.4 |
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0.4 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT3G15270.1 -----------MEGQ-----------------RTQRRGYLKDKA----------------
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.
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gm041507_Glyma1 -----------------------E-E------------------------DEYEEEEEEE
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:
AT3G15270.1 -GPST----DRVPSRLCQVDRCTVNLTEAKQYYRRHRVCEVHAKASAATVAGVRQRFCQQ
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gm041507_Glyma1 -GSKA--GGSVPPS--CQVDGCSADLSEAKPYHRRHKVCEYHAKAPAVLIGDQHQRFCQQ
* * .* *: **:** *:*:. . : . ******
AT3G15270.1 CS--------RFHELPEFDEAKRSCRRRLAGHNERRRKISGDS-FGEG------------
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gm041507_Glyma1 CS--------RFHELSEFDDSKRSCRRRLAGHNERRRKNASEY-HEL-------------
** *** : ***:.***** *** **.**** .
AT3G15270.1 ------------------------------------------------------------
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gm036360_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm036360_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm018555_Glyma0 YFSSDSSNPAEERSPSSSPPIVEMQFDLQDGARGLKPESISSGRGVNANKEASQSHSSNI
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gm053471_Glyma2 YFSSDSSNPAEERSPSSS-PVVEMLFDLQGGARGLKPESISSGREVIANKEASQSHSSNI
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gm036360_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm002653_Glyma0 LVTSSLDYP---------------------------------------------------
gm037412_Glyma1 ---SGYKFF---------------------------------------------------
gm041507_Glyma1 ------------------------------------------------------------
AT3G15270.1 ------------------------------------------------------------
gm037008_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm004368_Glyma0 ----------LTWQGGSDTPSEFFLQGSGSS-----------------------------
gm000900_Glyma0 -----------------------FTQT---------------------------------
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gm042640_Glyma1 DFPHALRSQILNWLSHSPTEIESYIRP-GCIMLTIYLRLENSAWEELCYNLGPSL-RKLA
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gm007026_Glyma0 ----------LSWHGNSETSSDLFLQ--GSV-----------------------------
gm042639_Glyma1 DFPHALRSQILNWLSHSPTEIESYIRP-GCIMLTIYLRLENSAWEELCYNLGPSL-RKLA
gm036360_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm002653_Glyma0 DFPLVLRAQILDWLSHSPTDMESYIRP-GCIVLTIYLRQAEALWEELCYDLTSSLNRLLD
gm037412_Glyma1 -----------------------HIR----------------------------------
gm041507_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm037412_Glyma1 --------------------------------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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