Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G17730.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Gm045461 |
not found in 237aa |
AT3G17730.1 |
1st_1st |
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Ia |
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not found in 237aa |
AT3G17730.1 |
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II |
Gm031664 |
not found in 654aa |
AT1G65910.1 |
not_not |
0.558232931 |
III |
Gm040487 |
not found in 600aa |
AT1G65910.1 |
not_not |
0.544176706 |
III |
Gm004950 |
not found in 584aa |
AT1G65910.1 |
not_not |
0.544176706 |
III |
Gm048662 |
not found in 631aa |
AT1G65910.1 |
not_not |
0.544176706 |
III |
Gm043243 |
not found in 175aa |
AT1G54330.1 |
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0.473895582 |
III |
Gm047190 |
not found in 302aa |
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0.453815261 |
III |
Gm012084 |
not found in 330aa |
AT4G17980.1 |
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0.415662650 |
III |
Gm028224 |
not found in 465aa |
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0.415662650 |
III |
Gm055185 |
not found in 479aa |
AT3G10480.1 |
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III |
Gm054977 |
not found in 549aa |
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III |
Gm054978 |
not found in 461aa |
AT1G34190.1 |
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0.407630522 |
III |
Gm015134 |
not found in 598aa |
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0.407630522 |
III |
Gm028468 |
not found in 560aa |
AT1G34190.1 |
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0.405622489 |
III |
Gm025772 |
not found in 358aa |
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0.405622489 |
III |
Gm010602 |
not found in 603aa |
AT1G33060.1 |
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0.405622489 |
III |
Gm004764 |
not found in 589aa |
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0.403614457 |
III |
Gm040291 |
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AT4G35580.2 |
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0.403614457 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT3G17730.1 ---------------------------------MAPVGLPPGFRFHPTDEELVNYYLKRK
gm031664_Glyma1 ---------------------------------MAPVSLPPGFRFHPTDEELVSYYLKRK
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gm025106_Glyma0 ---------------------------------MSPVGLPPGFRFHPTDEELVNYYLKRK
gm054977_Glyma2 MGEASGAGSADCFSQM-----------------MSSM---PGFRFHPTDEELVMYYLKRK
****:******: ***. *
AT3G17730.1 INGQEIELDIIPEVDLYKCEPWDLAEKSFLPSRDP-EWYFFGPRDRKYPNGFRTNRATRG
gm031664_Glyma1 INGRKIELEIIPEVDLYKCEPWDLPGKSLLPGKDL-EWYFFSPRDRKYPNGSRTNRATKS
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gm043243_Glyma1 ITGRSIELDIIAEVDLYKCEPWDLPDKSFLPSKDM-EWYFYSPRDRKYPNGSRTNRATQA
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gm025772_Glyma0 VSFQKFDMDVIREVDLNKMEPWDLQERCRIGSTPQNEWYFFSHKDRKYPTGSRTNRATNA
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gm028468_Glyma1 ICGKRLKLDVIRETDVYKWDPEDLPGQSILKTGDR-QWFFFCHRDRKYPNGGRSNRATRR
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gm055185_Glyma2 VSGKSFRFDAISEVDIYRSEPWDLADKSRLKTRDQ-EWYFFSALDKKYGNGGRMNRATSK
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gm048662_Glyma1 INGRKIELEIIHEVDLYKCEPWDLPGKSLLPGKDL-EWYFFSPRDRKYPNGSRTNRATKS
gm025106_Glyma0 INGQEIELDIIPEVDLYKCEPWELAEKSFLPSRDP-EWYFFGPRDRKYPNGFRTNRATRA
gm054977_Glyma2 ICGKRLKLDVIHETDVYKWDPEDLPGQSILKTGDR-QWFFFCHRDRKYPNGGRSNRATRR
: . * *. : :* :: . : :*:*: *:** .* * ****
AT3G17730.1 GYWKSTGKDRRVTSQSRA--IGMKKTLVYYKGRAPQGIRTDWVMHEYRLDDKDCD----D
gm031664_Glyma1 GYWKATGKDRKVNSQSRA--IGMKKTLVYYRGRAPHGCRTGWVMHEYRLDETQCE----T
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gm025772_Glyma0 GFWKATGRDKCIRNSFKK--IGMRKTLVFYKGRAPHGQKTDWIMHEYRLEDGNDP----Q
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gm054978_Glyma2 GYWKATGKDRNVICNSRS--VGVKKTLVFYAGRAPSGERTDWVMHEYTLDEEELK----R
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gm055185_Glyma2 GYWKATGNDRPVRHDQRT--VGLKKTLVFHSGRAPDGKRTNWVMHEYRLVEEELERAGTG
gm040291_Glyma1 GYWKATGKDRKIKSGSTL--IGMKKTLVFYTGRAPKGKRTNWVMHEYRPTLKELE----G
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gm010602_Glyma0 GYWKATGKDRKIKSGTIL--IGMKKTLVFYTGRAPKGNRTNWVMHEYRPTLKELD----G
gm048662_Glyma1 GYWKATGKDRKVNSESRA--IGMKKTLVYYRGRAPHGCRTGWVMHEYRLDETQCE----T
gm025106_Glyma0 GYWKSTGKDRRVSCQSRP--IGMKKTLVYYRGRAPQGIRTDWVMHEYRLDDKECE----D
gm054977_Glyma2 GYWKATGKDRNVICNSRS--VGVKKTLVFYAGRAPSGERTDWVMHEYTLDEEELK----R
*:**:* * :****:: **** * :*.*:****
AT3G17730.1 PSSLQ-DSYALCRVFKK-------------------------------------------
gm031664_Glyma1 NSGLQ-DAYALCRVFKKTAVIPPKVG----------------------------------
gm015134_Glyma0 TNPGQ-NPYVLCRLFKKHDESLEVSHCDEAEQTASTPV-----A--YSTEEIQSDLAVVA
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gm043243_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm028224_Glyma1 SSQPQ-DAYVLCRVFHKNNIGPPNGQRY----------------APFIEEEWDDASGMVP
gm025772_Glyma0 GSANE-DGWVVCRVFKKKNLFKIENE----------------------------------
gm012084_Glyma0 TPCFQ-GGFALCRVIKKNVKASVSQGEHKGKRAGSSSINGSDTSVKFSSE---------P
gm047190_Glyma1 TPCFQ-GGFALCRVIKKNEKA---------------------------------------
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gm054978_Glyma2 CQGVK-DYYALYKVYKKSGPGPKNGEQY---------------GAPFNEEEW--------
gm045461_Glyma1 TTGLQ-DTYALCRVFKK-------------------------------------------
gm004950_Glyma0 NSGLQ-DSYALCRVVKKTAVIPPKVG----------------------------------
gm055185_Glyma2 SCQPQKDAYVLCRVFHKNNIGPPNGQRY----------------APFIEEEWDDASGMVP
gm040291_Glyma1 TNPGQ-NPYVLCRLFKKQDESLEASNGDDVERTASTPT-----TANYCPDEIQSDSALVP
gm004764_Glyma0 TNPGQ-NPYVLCRLFKKQDESLEASNGDDVDRTASTPM-----TANYSPDEIQSDSALVP
gm010602_Glyma0 TNPGQ-NPYVLCRLFKKHDESLEVSHCDEAEPTASTPV-----AAYYSTEEIQSDLAVVA
gm048662_Glyma1 NSGLQ-DAYALCRVCKKTAVIPPKVG----------------------------------
gm025106_Glyma0 TTGLQ-DTYALCRVFKK-------------------------------------------
gm054977_Glyma2 CQGVK-DYYALYKVYKKSGPGPKNGEQY---------------GAPFNEEEW--------
AT3G17730.1 ---------------------NG----------ICSELESE-------------------
gm031664_Glyma1 ----------DQHYVNVLSHANQ----------MTSDQSSSI------------------
gm015134_Glyma0 GS-PSQVTEDDKHQAMIPAHSEEAISNVVTPVVCRSDRYDACHAPNQIVLP---------
gm040487_Glyma1 -----------GHYVNVPN-ANK----------ITSDQSSS-------------------
gm043243_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm028224_Glyma1 GADPGDNRS-FAHQPHVEGKSGV----------LCAEG----------------------
gm025772_Glyma0 ----GGSTHKPDHQINNSSNTNA-------------------------------------
gm012084_Glyma0 FSNSGDASSQASHLNKESRYSSP----------ITSPYNVA-------------------
gm047190_Glyma1 ----------MSHSATLSRYSSP----------ITSPYNVA-------------------
gm028468_Glyma1 --------------------ADDDI--------VDFNINSAD------------------
gm054978_Glyma2 --------------------ADDDI--------VDFNINSAD------------------
gm045461_Glyma1 ---------------------NG----------ICSDIEEQ-------------------
gm004950_Glyma0 ----------EHHYVNVPN-ANQ----------ITSDHSSS-------------------
gm055185_Glyma2 GADHVDNRS-FAHQPRVEGNGDVVIE-----VLICCQSQVELLVHVSHKLPSCLLFMIAL
gm040291_Glyma1 AS-SSQVTEDDKPLPVISENSEEAISNIITPGDIHSDECDAPDAQYQIVEP---------
gm004764_Glyma0 AS-SSQVTEDDKPLPVISENSEEAISNIITPGEIHSDGCNAPDAQDQIVEP---------
gm010602_Glyma0 GS-PSQVTEDDKHQSMIPAHSEEAISNVVTPVDRRTDGYDACDAQNQIELP---------
gm048662_Glyma1 ----------DQHYVNVPSHVNQ----------ITSDQSSSI------------------
gm025106_Glyma0 ---------------------NG----------ICSDIEEQ-------------------
gm054977_Glyma2 --------------------ADDDI--------VDFNINSAD------------------
AT3G17730.1 ------------------------------------------------------------
gm031664_Glyma1 -------DIELYSEGRGEV----LESSNYLMPWDTC--------PSPNINIGS-SLNINI
gm015134_Glyma0 -------TAEEFQPLN---Y---YDPRNELL----------------DDKLFSPVLA---
gm040487_Glyma1 --------IELYSEGRHED----LDSSNYLMSMDIC---------SPC-NMGNDQTSLTI
gm043243_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm028224_Glyma1 -RNGALQDTQSFNKAPFDVNKLPIETQNLLA---VCKRESMAEYPSPEKDDNN-------
gm025772_Glyma0 ---------RSYRENHYLLHQQ-QNPRN-----------------SSGLELDKPELAL--
gm012084_Glyma0 -------PMGEYNQASVE-----TNPSNFWI--------------SPDMILDS-------
gm047190_Glyma1 -------PMGEFNQASVET----TNPSNFWI--------------SPDMILDS-------
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gm045461_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm004950_Glyma0 --------IEIYPEGRGED----LDSTNYFMPVDAC---------SPH-NMGN-ETSLTI
gm055185_Glyma2 PQNQQPIDTQSFNKAPFDVNKLPIETQNLLA------------------DDNN-------
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gm010602_Glyma0 -------TAEEFQPLNFDIY---YDPRSELL----------------DGKLFSPVLA---
gm048662_Glyma1 -------DIEIYSEGRGEV----LESSNYLMPWDTC--------PSPNINIGS-ALNINI
gm025106_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm054977_Glyma2 ------------QEAPNDV----ADNVNVPL-------------PFLDDEINN-------
AT3G17730.1 ------R-----------------------------------------------------
gm031664_Glyma1 NGG--TKRDNNNNNIGTWSHFLSSEDLLNLPTSTSSFPNYGSMSYPP-----SKVD--IA
gm015134_Glyma0 -------------------HIQ------------PEF------HYQA----NIESDDWYG
gm040487_Glyma1 NSG-MTR------DLEKWSHFSSQDPLFSLPTS-SSFSNFGAIAYPP-----SKVD--IA
gm043243_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm028224_Glyma1 -----CK------------HMD---------------------DYPS-----PQTD--NP
gm025772_Glyma0 -------------------------------------------HYPP-------------
gm012084_Glyma0 -----SK------------------------------------DYPP-----LQNA--VA
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gm028468_Glyma1 ----IIRGILDDELVLDQQHVN------------------GYPDFPQVVSEETQST--VV
gm054978_Glyma2 ----IIREILDDELVLDQQHVN------------------GYPDFPQVVSEETQST--VV
gm045461_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm004950_Glyma0 NSGIMTR------DHEKWSHFSSQDPLFSLPT--SSFSKFGAIAYPP-----SKVD--IA
gm055185_Glyma2 -----CK------------HMD---------------------DYPS-----PQTD--NP
gm040291_Glyma1 -------------------HFP------------ADF------YYQA----NNQSE----
gm004764_Glyma0 -------------------HFP------------TDF------YYQA----NNQSE----
gm010602_Glyma0 -------------------HIQ------------PEF------HYQA----NIESDGRYG
gm048662_Glyma1 NGG--TR----DNNIGTWSHFL-AEDLPNLPTSASSFPNYGSMSYPP-----SKVD--IA
gm025106_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm054977_Glyma2 ----IIREILDDELVLDQQHVN------------------GYPDFPQVVSEETQST--VV
AT3G17730.1 -----------------------------------------QLQTGQCSFTTAS------
gm031664_Glyma1 LECARMQHRFTMPPLEVQ--------------QDFPQVGISELKMAQASASNMCGGSRNN
gm015134_Glyma0 LQYGTNET-------------NMSDFLNSVVNWDQVSFEDLNCQQQSYPLFNVKDSVLSS
gm040487_Glyma1 LECARMQHRFVMPPL--------------------------ELKMAQASGSMQ--GSCRT
gm043243_Glyma1 ----------------------------------VPGATLSSL-----------------
gm028224_Glyma1 KPFSQIYKR--------------------------------RRHNLNSNNSHVSGDSIRT
gm025772_Glyma0 ------------------------------P----------HLQNPPYS-----------
gm012084_Glyma0 ECFPRYDLPSVMAPWQ-------------------------SLEHPETSSSLS-------
gm047190_Glyma1 ECFPRYDLPSVMAPWQ-------------------------SLEHPETSSSLS-------
gm028468_Glyma1 DQFSEA----VMFPEPVRITQPSNQFFDAQPSFDFNQPVTSHLHVSEASEVTSASSIKAK
gm054978_Glyma2 DQFSED----VMLPEPVRISHPSCQFFDAQPSFDFNRPVTSHLHVSETSEVTSASNIKTK
gm045461_Glyma1 ---------------------------------------------GQCSISLIE------
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gm055185_Glyma2 KPFSQIYKR--------------------------------RRHNLNSNNSNVSGDSVRT
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gm010602_Glyma0 LQYGTNET-------------NMSDFLNSVVNWDQVPFEDPNCQQQSYPLFNVKDNILNS
gm048662_Glyma1 LECARMQHRFTMPPLEV---------------QDFPQVGISELKMAQASGSNMCGGSRNN
gm025106_Glyma0 ---------------------------------------------GQCNISLIE------
gm054977_Glyma2 DQFSED----VMLPEPVRISHPSCQFFDAQPSFDFNRPVTSHLHVSETSEVTSASNIKTK
AT3G17730.1 -----------MEEI-----------N--------SNNNNNYN-----------------
gm031664_Glyma1 ETD-------ILQEILSAF----------------GANENNYAPPHESDFTFMVGTNYNH
gm015134_Glyma0 DLDS------ELAIMTCMHAGSA------------EGPNNGRK-P------LVITSEFRS
gm040487_Glyma1 ETD-------ILQEILSVAQVSQELINQSSYSQDWGG-NDNYA-PREDDFTFM-------
gm043243_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm028224_Glyma1 SQD-------PCSSTITTAATALPTTNAA------AGTATNTA-PKKHFLSALV--EFSL
gm025772_Glyma0 --------LFQSQPLLQTQK------------------------P-------MV-YDYSY
gm012084_Glyma0 ---------------------------------------------------------YSN
gm047190_Glyma1 ---------------------------------------------------------YSN
gm028468_Glyma1 ELDFNEDGFLEINDLIDTEPI--------------LANMENPV-------------EYQQ
gm054978_Glyma2 ELDFNEDGFLEINDLIDTEPT--------------LSNVENSV-------------EYQH
gm045461_Glyma1 -------------------------------------SSQTIT-----------------
gm004950_Glyma0 ETD-------ILQEILSVA-------------QEWGGNNDNYA-PREDDFTFMVGTNYNH
gm055185_Glyma2 SQD-------PCSSTITTAATALPTA-TV------AGTATNTA-PKKHFLSALV--EFSL
gm040291_Glyma1 DSDV------EMANMLHLQA----------------------------------------
gm004764_Glyma0 DSDV------EMTNMPHLQA----------------------------------------
gm010602_Glyma0 DLDS------ELANMTCMQAGYA------------EGAIDGRI-P------LLITSEFCS
gm048662_Glyma1 ETD-------ILQEILSVA----------------HASHD--------DFTFMVGNNYNR
gm025106_Glyma0 -------------------------------------SSQTII-----------------
gm054977_Glyma2 ELDFNEDGFLEINDLIDTEPT--------------LSNVENSV-------------EYQH
AT3G17730.1 -ND----------------------------------------YETMSPEV---------
gm031664_Glyma1 VND----------MNTMGFVDNIAWEDPNARSIEIGDLDDGFKTERMVENLRWV------
gm015134_Glyma0 TTGIPVDCGGDEQKSNVGLFQN--------------NSQRAFT-DVNIGQVYNVVDDYEQ
gm040487_Glyma1 -------------------------------------------EERMVENLRWV------
gm043243_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm028224_Glyma1 LES--------------------------------------LESKDSLASIKTP------
gm025772_Glyma0 TSD------------------------------------TPIMAKQLMTNPRDCESGSDG
gm012084_Glyma0 FNV----------------------------------------EVDFADSLSQI------
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gm028468_Glyma1 FEDG---------LSELDLFQD---------------------AQMFLRDLGPIIHETDS
gm054978_Glyma2 FEDG---------LSELDLFQD---------------------AQMFLRDLGPIIHETDS
gm045461_Glyma1 -NE----------------------------------------CETMSPDIP--------
gm004950_Glyma0 SNHG---------MSSMRYADK-TWEDANTRTIEIGDVDEEFKAERMVENLRWV------
gm055185_Glyma2 LES--------------------------------------LESKDNLASIKAP------
gm040291_Glyma1 LHDYPKEAV--EEKFNVGLFQN--------------NPQMAFSNDGPMGQVHNVANYCEQ
gm004764_Glyma0 LHNYPKEAV--EQKSNVGLFQN--------------NFQMALSNDSTMGQVHNMVNYCEQ
gm010602_Glyma0 TTGIPVDCVGDEQKSNVGLFQN--------------NSQRAFT-DVNMGQVYNVVDDYEQ
gm048662_Glyma1 VND----------MNTMGFVDK-AWEDPNARSIEIGDLDDGFKTERMVENLRWV------
gm025106_Glyma0 -NE----------------------------------------CETMSPDIP--------
gm054977_Glyma2 FEDG---------LSELDLFQD---------------------AQMFLRDLGPIIHETDS
AT3G17730.1 -----GVSSACVEEV------------------VDD-----------KDDS---------
gm031664_Glyma1 -----GMSSKNMEK-------GF--MEEQKIVPIEHISN----FQANREEN---------
gm015134_Glyma0 RGIYSAVASGNTGI----------------------------IRRHREVQNEQL------
gm040487_Glyma1 -----GMSSEDLEKVQ----CLFVQMQEQKIVPIEDISS----FQTNREEN---------
gm043243_Glyma1 -------------K-------GF--EKQKRIWQI-------------KEEN---------
gm028224_Glyma1 -----DFDVENLESSMPPSCAKF----------------------IKEMKS---------
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.
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