Input
| Putative repression domain
|
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AT3G19510.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os024229 |
not found in 792aa |
AT3G19510.1 |
1st_1st |
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Ib |
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not found in 1847aa |
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Ib |
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not found in 633aa |
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Pt022003 |
not found in 934aa |
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Ib |
Sm015126 |
not found in 615aa |
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1st_1st |
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Ib |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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. .
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Sm015126_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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* . .
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*
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Sm015126_Selmo1 ---------------------------RTRDQEEPCS----SS-----RAEAEREARRRR
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*: . .:
AT3G19510.1 T------------------------------------------------MNKG-------
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Sb025794_Sorbi1 KGGAISKTDSPKIGVRVLRSASAKKNEACSEPVNDSTSAEPTVTKRRICKPSK-------
Sm015126_Selmo1 K------------------------------------------------KMRGTPIGHCV
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.
AT3G19510.1 QVREDDEYTRIKKKLRYFLNRINYEQSLIDAYSLEGWKGSSLEKIRPEKELERATKEILR
Os024229_Os06t0 GGTPKDDYLMIRKRVRYVLNRMNYEQSLIQAYASEGWKGQSLEKIRPEKELERAKVEILR
gm054548_Glyma2 EEGITDQFSRIRSHLRYLLNRISYENSLIDAYSGEGWKGYSMEKLKPEKELQRAKSEILR
Sb025794_Sorbi1 DRSPKKDYLKICQRVRYILNRMNYQQTFIQAYASEGWKGQSVEKIRPEKELERAKEEILQ
Sm015126_Selmo1 SNADATATAKIMKQVKYYFNSMKLEQSFIDAYANDGWKGQSREKVRPEKELERATAKILG
pt022003_POPTR_ KNIVADEYSKIRAHLRYLLNRMSYEQSLITAYSGEGWKGLSLEKLKPEKELQRATSEITR
* :::* :* :. ::::* **: :**** * **::*****:**. :*
AT3G19510.1 RKLKIRDLFQHLDTLCAEGSLPESLFDTDGEISSEDIFCAKCGSKDLSVDNDIILCDGFC
Os024229_Os06t0 CKSRIREAFRNLDSLLSEGKLDESMFDSAGEISSEDIFCAACGSKDVTLKNDIILCDGIC
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Sb025794_Sorbi1 CKLRIREAFRNMDSLLSKGKLEESLFDSAGEISSEDIFCAVCGSKDVTLQNDIILCDGAC
Sm015126_Selmo1 WKLKIRKAVQELDKMCLEGSILDSAFDADGQLDYQEIFCAKCHSHEAEVDNDIILCDGFC
pt022003_POPTR_ RKVKIRDLFQHIDSLCSEGRFPSSLFDSEGQIDSEDIFCAKCGSKDLNADNDIILCDGAC
* :**. .:.:*.: :* : .* **: *::. ::**** * *:: .******** *
AT3G19510.1 DRGFHQYCLEPPLRKEDIPPDDEGWLCPGCDCKDDSLDLLNDSLGTKFSVSDSWEKIFPE
Os024229_Os06t0 DRGFHQYCLNPPLLAEDIPQGDEGWLCPACDCKIDCIDVLNELQGVKLSIHDSWEKVFPE
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Sb025794_Sorbi1 DRGFHQNCLNPPLLTEDIPPGDEGWLCPACVCKADSIDALNELQGSKLSIHDSWEKVFPE
Sm015126_Selmo1 NRGFHQKCLNPPLATEDIPPGDEGWMCPICDCKSDCASFLNDHLGTDFDVEMSWEKFFPE
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:***** ** *** **** .****:** * ** *. . :*: * .:.: :**:.***
AT3G19510.1 AAAALVGGGQNLD-----CDL--PSDDSDDEEYDPDCLND----NENDEDGSDDNEESEN
Os024229_Os06t0 AASFL-NGSKQIDA----SDL--PSDDSADNDYDP-TLAQGHKVDEEKSSGEDGGEGLDS
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Sm015126_Selmo1 AV----EGSNTIVADDAVQDL--PSEDSDDDDYDP--------------DNKDKEQEKLA
pt022003_POPTR_ AAATA--SGQKLD-----HNFGPSSDDSDDNDYEP--------------DGPDIDKKSQE
*. .: : :: .:. *.: : . *
AT3G19510.1 EDGSSDETEFTSASDEMIESFKEGKDIMK--DVMALPSDDSEDDDYDPDAPTCDD--DKE
Os024229_Os06t0 DDSSSEDSESSEKEKS------KTSQNGRTVDDLGLPSEDSEDGDFDPAGPDSDKEQNDE
gm054548_Glyma2 DESSSDESEYASASEKL-----EGGSHED--QYLGLPSEDSDDGDYDPDAPDVDCKVNEE
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Sm015126_Selmo1 NGKGAKANEAGEEQDQ------AGDDDDE--------SDDSGGDD---------------
pt022003_POPTR_ EESSSDESDFTSASDEF-----KAPPDGK--EYLGLSSDDSEDDDYDPDAPVLEEKLKQE
.. *:** ..*
AT3G19510.1 -----SSNSDCTSDTEDLETSFKGDETNQQAEDT----PLEDPGRQTSQLQG--------
Os024229_Os06t0 SNSDQSDESDFTSDSDDFCAEIAKS----CGQDEI-SGPSSSQIRTVDRTDGSGFDGEPN
gm054548_Glyma2 -----SSSSDFTSDSEDLAA---------AFEDNT-S-PGQDGGINSSKKKGKVGK--LS
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Sm015126_Selmo1 -----SGGGD-GSDSDDGTTDLSGEEPLSAAEED------EDEKEKEGDEEGGGSKKDSD
pt022003_POPTR_ -----SSSSDFTSDSEDLAATINGD--GLSLEDEC-HMPIEPRGVSNGRKSKFDGKKMQS
* .* **::* : :: . . .
AT3G19510.1 -----DAILESDVGLDDGPAGVSRRRNVERLDYKKLYDEEYDNVPTSSSDDDDWDKTARM
Os024229_Os06t0 AENSNLAFMETELE-QDMVLPISSKRQVERLDYKKLYNEAYGKASSDSSDDEEWY-----
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Sb025794_Sorbi1 EENHNNAFM-------DMELPVSSRRQVEPLDYKKLYDEAYEEESSNSSDEEEWS-----
Sm015126_Selmo1 E--------------------VSGKRRRRDVDYRKLHDEMFGV-------EYEWAEAFQS
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:* :*. :**:**:: ::
AT3G19510.1 GKEDSESEDEGDTVPLKQSSNAE-------DHTSKKLIRKSKRADKKDTLEM-------P
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Sm015126_Selmo1 -----------------------------EDEDYGPLKRPRKQRSERKTDRN------EQ
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: * .:
AT3G19510.1 QEGPG-------------EN------GGSGEIEKSSSSACKQTDPKTQRLYISFQENQYP
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Sm015126_Selmo1 NQDHG-------------EN-----QDGF------SDKSKRIPPEAVQRLRVAFDRDQLP
pt022003_POPTR_ NVSPA-------------KSYVGASLSGSSGKSVRPSAYKKLGEAVTQRLYSYFRENQYP
: .. .* . : *:* * .: *
AT3G19510.1 DKATKESLAKELQMTVKQVNNWFKHRRWSINSKPLVSEENVEKLK---------------
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Sb025794_Sorbi1 SRETKVNLSEELGLTFNQVSRWFSSTRHYSRVASAKKEMHPDSHISENNDST-TVDRMQA
Sm015126_Selmo1 SRDSKEAIAKELGLSYRKVDVWFKNVRTQALKKAKSDEAENQTLLTQVGQAELKLEDLK-
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.: :* :::** :: .:* ** * . .
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Sm015126_Selmo1 -----RAME-------------------AVRH----------------------------
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:
AT3G19510.1 ----------------------ECETSVAGSSK---------------------------
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Sm015126_Selmo1 -----------------------------------GKRLVYM------------------
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Sb025794_Sorbi1 NQRSITSWNTSYESGVFTSPVTTSREDGPPGYGPGENQENDSTSCELRMFTSPTTISREV
Sm015126_Selmo1 -------------------PVA-------------EVVEQGGTN----------------
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:
AT3G19510.1 --------------EKPTNTG---------------------------------------
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Sb025794_Sorbi1 GPPGYELIGK----NKGNDTSWTTNYQQGVFTSPKTISREACPPGFGSGENQGNGTPWYM
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Sb025794_Sorbi1 SSKQRAFTSPSFTSPTTISREVGLPGYGQENQGNGASWNMSYEQGVFMSPTDISREVGPP
Sm015126_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sb025794_Sorbi1 GYGPAENQGNTTSWISTGNKQRMFTASTIPNEVGLPGYSPVGIQGTGGSRSMNLEAFPPG
Sm015126_Selmo1 ---------------------------------------PL-------------------
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AT3G19510.1 ----------------------------SRKRRRK-------------
Os024229_Os06t0 -------------------------LENSDEARRKAVQRELRKMKTGR
gm054548_Glyma2 ----------------------------SNASRQ--------------
Sb025794_Sorbi1 YGPGENHLGGASGSVINPQARSQESVEFSDETRRKAIQRELRRRQKFR
Sm015126_Selmo1 ------------------------------------------------
pt022003_POPTR_ ----------------------------TPKSRR--------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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