|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT3G23050.1 ------------------------------------------------------------ pt030401_POPTR_ MYSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMENISEKLS pt001265_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt001264_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt002787_POPTR_ ---MA--------------------------------YESD------------------- pt005605_POPTR_ -MSMP--------------------------------LEHDYIGISSEVSSMENTSG--- pt015737_POPTR_ ---MT------------------------------------------------------- pt039463_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt033721_POPTR_ -MATA------------------------------------------------------- pt011954_POPTR_ MSSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMEKISDKLS pt002101_POPTR_ ---MT------------------------------------------------------- pt028468_POPTR_ -MSPE---------------------------NGSNLLESD------------------- pt039771_POPTR_ -MSPPLLGVVEEEGHSNVTLLASPASAESACLNGLELKERNYMGL-SDCSSVDS------ AT3G23050.1 --------------------MIGQLM-------NLKATELCLGLPGGA---EAVESPAKS pt030401_POPTR_ SSSTSSSTLSTEEKNNSSSSNSNNNNKNNNTSLNMKETELRLGLPGS-------QSPERK pt001265_POPTR_ -----------------------ME-VEKGTKMRFEETELRLGLPGNGGGGTEGGEFAR- pt001264_POPTR_ -----------------------ME-VEKGTKMRFEETELRLGLPGNGGGGTEGGEFAR- pt002787_POPTR_ --------------------------------LNLKATELRLGLPGS-------DEPEKP pt005605_POPTR_ -------------------TDTINISTTASKGLNLKATELRLGLPGS-------DSPERG pt015737_POPTR_ -------------------SIMGAE-PEKYSMINFEETELRLGLPGGIGNGND-GEVAKS pt039463_POPTR_ -----------------------ME-VEKGTKMGFEETELRLGLPGNGGGAE--GEMVR- pt033721_POPTR_ -------------------TVLGTEMAD----LNYKETELCLGLPGAVGVKNEVETPNKA pt011954_POPTR_ S---SSSTLSTEENIN---SNSNSNSNSTNTSLNLKETELRLGLPGY-------QSPERK pt002101_POPTR_ -------------------SIMGAETADTYSMINYEETELRLGLPGGASNGND-GEAAKG pt028468_POPTR_ -----------------------------AANVSFKETELTLGLPGE------------- pt039771_POPTR_ -------------------SAVSAASDERKTSLNLKATELRLGLPGS-------QSPERN : *** ***** AT3G23050.1 AV-----------------------------------GSKRGFSETVD------------ pt030401_POPTR_ PTVPAAGVSLVGKD----IDTNNTNAYSLIPVKNLVSGAKRVFSDAIDGSTGKWVFSG-- pt001265_POPTR_ ---------------------------------------KRGFSETVD------------ pt001264_POPTR_ ---------------------------------------KRGFSETVD------------ pt002787_POPTR_ STTPSV--------------RSNKRASP-------------------------------- pt005605_POPTR_ NENQQLGFSL-----------NNNNSKD----KSFVSGARRGFSVAIHGGSANWVFSGNA pt015737_POPTR_ N-------------------------------------GKRGFSETVD------------ pt039463_POPTR_ ---------------------------------------KRGFSETVD------------ pt033721_POPTR_ T-------------------------------------GKRGFAETVD------------ pt011954_POPTR_ LTLPAAGVSLFGKD----IDTNNTNGYPLRPLKNLVSGTKRGFSDAIVGSSGKWVFSGSN pt002101_POPTR_ N-------------------------------------GKRGFSETVD------------ pt028468_POPTR_ ----SRGLALIEKT-----------------------SGKRGFLETVD------------ pt039771_POPTR_ HELSLLSSALLDEKPFFPLHPSNDGHYS-STQKNVVSGNKRVFSDAMDEFSESKFLSN-- AT3G23050.1 ----------LMLNLQ-----------------------------SNKEGSV-DL----K pt030401_POPTR_ -------------------------------GDNGNPQKSRVAGPAKK-----DVAQ--S pt001265_POPTR_ ----------LKLNLS-----------------------------S-KEGGI-DPNH--E pt001264_POPTR_ ----------LKLNLS-----------------------------S-KEGGI-DPNH--E pt002787_POPTR_ -----------------------------------------------------EISE--E pt005605_POPTR_ GSDPN-------FSLR---------------GAN-----------SGKE----GFPH--S pt015737_POPTR_ ----------LKLNLS-----------------------------T-KESGK-GGDE--E pt039463_POPTR_ ----------LKLKLS-----------------------------S-KESGA-DPNH--E pt033721_POPTR_ ----------LKLNLQ-----------------------------A-KEGVM-DLNENIK pt011954_POPTR_ GSEVDLGKGAILFSPR---------------GDNGNSQKSCVAGPAKKD----DVAQ--S pt002101_POPTR_ ----------LKLNLS-----------------------------T-KETGKDGSDQ--E pt028468_POPTR_ ------------LNLG-------------------------------RSSNV-DSDH--N pt039771_POPTR_ -SEVN-----AMLSPRPSPNMGLKPGMLENLGVQQAKVKEIVAPKAGQERP--HAAN--E . AT3G23050.1 NVSAVPKEKT------TLK--DPSKPPAKAQVVGWPPVRNYRKNMMTQQKTSSGA----- pt030401_POPTR_ PKP-VQEKNSQV-AAANEN---SSAPAAKTQVVGWPPIRSFRKNTMASS----------- pt001265_POPTR_ KT---QREKNLL-----AT--DPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNMLA------------- pt001264_POPTR_ KT---QREKNLL-----AT--DPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNMLA------------- pt002787_POPTR_ SRS---KGSSSV-SSNVENGERDSAPPAKAQVVGWPPIRSYRKNCLQP------------ pt005605_POPTR_ SKPVVQENKSQV-DGANTNG-HGAAPASKAQVVGWPPIRSFRKNTMASH----------- pt015737_POPTR_ K---VMKEKTVAPP--AST--DPAKPPAKAQVVGWPPIRSFRKNVMA------------- pt039463_POPTR_ KTSSLQREKNLL-----AT--DPAKPPAKAQVVGWPPVRSFRKNMLA------------- pt033721_POPTR_ NIAS--KDKNHL-PADTIK--DPAKPPAKAQVVGWPPVRSYRKNVLAQKNASEEGFRAQV pt011954_POPTR_ PKP-VQEKISQV-AAANEN---SSAPAAKAQVVGWPPIRSFRKNTMASS----------- pt002101_POPTR_ KV--VMKEKTVA-P--RPN--DPAKPPSKAQVVGWPPIRSFRKNVMA------------- pt028468_POPTR_ KYS--GESETDV-----PN--TAKPPAAKAQVVGWPPVRAYRKNAMK------------- pt039771_POPTR_ TRP--------L-RNSSAN--NSSAPAPKAQVVGWPPIKSFRKNSLAT------------ . *..*:*******:: :*** : AT3G23050.1 ---------------EEASSEKAGNFGGGAA--GAGLVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKSYQ pt030401_POPTR_ --------------LAKNNEDVDGK---SGY--GYLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTYGNYL pt001265_POPTR_ --------------VQKSSTDQESTDKVPGG--NATFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYH pt001264_POPTR_ --------------VQKSSTDQESTDKVPGG--NATFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYH pt002787_POPTR_ ----------------KKNDQVD------GA--G-MYVKVSVDGAPYLRKIDLKVYKSYP pt005605_POPTR_ --------------LSKNDDGAEVK---SGS--GCLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTFGSYM pt015737_POPTR_ --------------VQKNSNDNGEKSGSSGT--GVAFVKVSMDGAPYLRKVDLKLYKSYQ pt039463_POPTR_ --------------VQKSSTDQE-CEKVPGG--NATFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKTYQ pt033721_POPTR_ VGWPPLRSYRKNVLTQKNASEEGDKASTGGS--SAAFVKVCMDGAPYLRKVDLKMYKSYQ pt011954_POPTR_ --------------LVKNNEDVEGK---SGY--GCLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTYSNYL pt002101_POPTR_ --------------VQKNSNDEGEKASSSGTTGTAAFVKVSMDGAPYLRKVDLKLYKSYR pt028468_POPTR_ ---------------------------------SCKYVKVAVDGAPYLRKVDLEMYNSYQ pt039771_POPTR_ --------------TSKNTEEVDGK---AGP--GALFIKVSMDGAPYLRKVDLRNYSAYQ :**.:********:**. : * AT3G23050.1 DLSDALAKMFSS--FTMGNYGAQGMI--DFMNESKLMN--LLNSSEYVPSYEDKDGDWML pt030401_POPTR_ ELSSALEKMFGC--FTIGQCGSHGLAARDGLTESCLKD---LHGSEYVLTFEDKDGDWML pt001265_POPTR_ ELSDALGKMFSS--FTIGNCGSHGMK--DFLNESKLID--LLNGTDYVPTYEDKDGDWML pt001264_POPTR_ ELSDALGKMFSS--FTIGNCGSHGMK--DFLNESKLID--LLNGTDYVPTYEDKDGDWML pt002787_POPTR_ ELLKALENMFK---LTIGEYSEN-----EG-----------YNGSEFAPTYEDKDGDWML pt005605_POPTR_ ELSSALEKMFSC--FTIGQCGSHVVPGQDGLSESRLMD--LLHGSEYVLTYEDKDNDWML pt015737_POPTR_ ELSDALGKMFSS--FTIGNCGSQGMK--DFMNESKLID--LLNGSDYVPTYEDKDGDWML pt039463_POPTR_ ELSDALGKMFSS--FTIGNCGSHGLK--DFLNESKLID--LLNGTDYVPTYEDKDGDWML pt033721_POPTR_ ELSDALAKMFSS--FTMGNYGAQGMI--DFMNESKLMD--LLNSSEYVPSYEDKDGDWML pt011954_POPTR_ ELSSALEKMFSC--FTIGQCGSHGLRGQDGLTESRLKD--ILHGSEYVLTYEDKDGDWML pt002101_POPTR_ ELSDALGKMFSS--FTIGNCGSQGTK--DFMNESKLID--LLNSSEYVPTYEDKDGDWML pt028468_POPTR_ QLLNALQDMFSCFSFTI----------RNYLNERTIMEQEVNNGVEYVPTYEDKDGDWMM pt039771_POPTR_ ELSSALEKMFSC--FTIGQYGSHGAPGREMLSESKLKD--LLHGSEYVLTYEDKDGDWML :* .** .** :*: : :. ::. ::****.***: AT3G23050.1 VGDVPWEMFVESCKRLRIMKGSEAVGLAPRAMEKYCKNRS-- pt030401_POPTR_ VGDVPWDMFTDSCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEK-CKNRN-- pt001265_POPTR_ VGDVPWDMFVESCKRLRIMKGTEATGLGNEYTA--------- pt001264_POPTR_ VGDVPWDMFVESCKRLRIMKGTEATGLAPRAMEK-CKNRSFK pt002787_POPTR_ VGDVPWDMFISSCKRLRIMKGSEARGLG-------C------ pt005605_POPTR_ VGDVPWKMFTDSCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEK-CKSRN-- pt015737_POPTR_ VGDVPWEMFVDSCKRLRIMKGSEAIGLAPRAVEK-CKNRI-- pt039463_POPTR_ VGDVPWDMFVESCKRLRIMKGTEATGLAPRAMEK-CKNRSYK pt033721_POPTR_ VGDVPWEMFVDSCKRLRIMKGSEAIGLAPRAMEK-CKSRT-- pt011954_POPTR_ VGDVPWDMFTNSCRRLRIMKGSEAIGLAPRAMEK-CKNRN-- pt002101_POPTR_ VGDVPWGMFVDSCKRLRIMKGSEAIGLAPRAVEK-CKNRS-- pt028468_POPTR_ LGDVPWKMFVESCKRLRLMKSSEATGFAPRTPSK-CSSSS-- pt039771_POPTR_ VGDVPWEMFIETCKRLRIMKSSDAIGLAPRAMEK-CKNRN-- :***** ** .:*:***:**.::* *:.
|