fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
Input Putative repression domain
AT3G23220.1 not found
Ortholog Putative repression domain Reverse top hit Relation Blast score ratio Type
Os034953 not found in 131aa AT5G43410.1 1st_not 0.462365591 II
Sb008747 not found in 180aa AT2G44840.1 1st_not 0.462365591 II
Gm041538 not found in 183aa AT5G47220.1 1st_not 0.494623655 II
Pt042320 not found in 138aa AT3G23230.1 1st_not 0.516129032 II
Pt034947 not found in 138aa AT3G23220.1 not_1st 0.510752688 II
Pt038866 not found in 150aa AT3G23220.1 not_1st 0.494623655 II
Pp038034 not found in 479aa AT4G17500.1 1st_not 0.456989247 II
Sm008677 not found in 234aa AT4G17500.1 1st_not 0.451612903 II
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.

CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)


AT3G23220.1     ----------------------MERIESYNTNEM-----K--------------------
pt042320_POPTR_ ----------------------MDGDRT-KSKDGGGEV-K--------------------
gm041538_Glyma1 ----------------------MGSNKTYEEEESTVLFSH--------------------
pt038866_POPTR_ ----------------------MDHPNIGKVNQKGEEI-R--------------------
pp038034_Pp1s25 MNIFSFASTKRGRGLLEGKDTGLDFTKTEEVLQQAQQASKETFNSQFLNCDQLAALASKT
pt034947_POPTR_ ----------------------MDEDKT-KSKDEGGEV-K--------------------
Os034953_Os09t0 ----------------------MDHHHQ-QQQQEGELVAK--------------------
Sb008747_Sorbi1 ----------------------MGMGTSLSLASAAAAA----------------------
Sm008677_Selmo1 ----------------------MES----PVAAAWQPSPK--------------------
                                      :                                     

AT3G23220.1     ------------------------------------------------------------
pt042320_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm041538_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pt038866_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp038034_Pp1s25 FPSNELVSACETSPTSLHSTGRTLLKRSRSVENAHFEEQKKPCHRAWVLSNQLRHSLGPN
pt034947_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Os034953_Os09t0 ------------------------------------------------------------
Sb008747_Sorbi1 -----------------HGHGQYL------------------------------------
Sm008677_Selmo1 ---------------------------------------LSPC-----------------
                                                                            

AT3G23220.1     ------------------------------------------------------------
pt042320_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm041538_Glyma1 -----------------------------------------SQTQT--------------
pt038866_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp038034_Pp1s25 FAETIGQVVKKEAGLATTSSRLDWSSQTPPYVKSLAQGCVAKQATTWPSSSPTDPNSAVV
pt034947_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Os034953_Os09t0 ------------------------------------------------------------
Sb008747_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sm008677_Selmo1 -----------------------WGS---------------KRINT--------------
                                                                            

AT3G23220.1     ------------------------------------------------------------
pt042320_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm041538_Glyma1 ------------------------EL------LPFNENDPQDMVIYQVLNEA---NALTN
pt038866_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp038034_Pp1s25 HTREESRLWSDWQNQSSGGGAAPSQLHERATQFPLNENDSEETALCQVLL---GAGKTP-
pt034947_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Os034953_Os09t0 ------------------------------------------------------------
Sb008747_Sorbi1 ---------------------------------PLNEDDSLEMVLFDVLREASGSAAAPT
Sm008677_Selmo1 --------------------GIPNHL------FFLNENDSEEMPLYGLLKEA--------
                                                                            

AT3G23220.1     ------------------------------------------------------------
pt042320_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm041538_Glyma1 TFLPQRLHQPQ-------LCLEPTRNI---------------------------------
pt038866_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp038034_Pp1s25 ---PPAKPSPV-------MRAQPRRHAFPEAAAMGFFKREQPGNLPSSINLIVSSTAPRG
pt034947_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Os034953_Os09t0 ------------------------------------------------------------
Sb008747_Sorbi1 TYQPPASSLPT-------LK---------KALASGAAARKGGGG-----GVGCSSRA---
Sm008677_Selmo1 ATRHPFDSAPTKIEAIQDVKPEP-----PVAVAMAAAAAPPAAVAPVQ------------
                                                                            

AT3G23220.1     ----------------YRGVRKRPWGKYAAEIRDSARHGARVWLGTFNTAEDAARAYDRA
pt042320_POPTR_ ----------------YRGVRKRPWGKFAAEIRDSTRHGARVWLGTFNTAEEAARAYDRA
gm041538_Glyma1 ------------TKKHYRGVRRRPWGKYAAEIRDSARHGARIWLGTFQTAEEAAMAYDRA
pt038866_POPTR_ ----------------YRGVRRRPWGKFAAEIRDSTRHGARLWLGTFNTAEEAARAYDGA
pp038034_Pp1s25 SYIQASLPKVVRSIPHYRGVRQRPWGKFAAEIRDSARQGARVWLGTFDTAEQAAMAYDAA
pt034947_POPTR_ ----------------YRGVRKRPWGKFAAEIRDSARQGARVWLGTFSTAEEAARAYDRA
Os034953_Os09t0 ----------------YRGVRRRPWGKFAAEIRDSSRHGVRVWLGTFDTAEEAARAYDRS
Sb008747_Sorbi1 ----AHAPKAATTGRHYRGVRRRPWGKYAAEIRDPARHGARLWLGTFATAEEAAAAYDRA
Sm008677_Selmo1 ---PASQPR-----RQYRGVRRRPWGKFAAEIRDSTKQGARIWLGTFETAEEAAIAYDQA
                                *****:*****:******.:::*.*:***** ***:** *** :

AT3G23220.1     AFGMRGQRAILNFP---------------------HEYQMM----------------KDG
pt042320_POPTR_ AYAMRGHLAILNFS---------------------NEYPNMAGSA-----SVGSS--GST
gm041538_Glyma1 AFKMRGSKALLNFPAEIVAA---------------TELSFNNTNS------------NNH
pt038866_POPTR_ AYSMKGPLAILNFP---------------------GEYPKTKVDS-----DITSSSISSS
pp038034_Pp1s25 AFKMRGCRALLNFPLQATLPTLPPSPCKTEENTLKSETSSTSANSTTEVLDMGSVK-AES
pt034947_POPTR_ AYAMRGHLAVLNFP---------------------NEYPNMAGNA-----SVGSS--SST
Os034953_Os09t0 AYSMRGANAVLNFP----------------------------ADA-----HIYARQLHNN
Sb008747_Sorbi1 AFRMRGAKALLNFP----------------------------------------------
Sm008677_Selmo1 AFKMRGRRALLNFPLRLATPA-AAAAARAE-----SSSPESSVTS-----AIESQK-ERT
                *: *:*  *:***.                                              

AT3G23220.1     PNGSHENAVASSSSGYRG--GGGGDDGREVIEFEYLDDSLLEELLDYG--ERSNQDNCND
pt042320_POPTR_ PYFSSGYSGPSSSSPSML---------REVFEFECLDDKLLEEMLEQE--EKKSKKN---
gm041538_Glyma1 DAVSDSSAGSSCTNNSVQL-------------------------------NRNQSESCTS
pt038866_POPTR_ PLSSSSSSSASSSSMSQNAERSGIGRGKEVFEIEYLDDKLLEDLLDFE--EENNPNG---
pp038034_Pp1s25 PFSLPSAASTTAADPETT---------PVALELQDLDTDFLEDLLSNSHPELDSRPTSSL
pt034947_POPTR_ PFSSSGYPGSSSSSSSTQ---------QEVFEFECLDDKLLEELLEQE--EKRSKKT---
Os034953_Os09t0 NAAAGSSSSSSAAAAAAR---------PPPIEFEYLDDHVLQEMLRDH--TTNK------
Sb008747_Sorbi1 PAVAGCGNAATATAEQAA----GVT-------------------------EAK-------
Sm008677_Selmo1 RKRARDSSLSQSSSKRQA---------PLVVEIQEPDVDYMEQLLSGL------------
                         . .:                                               

AT3G23220.1     ANR--------------------
pt042320_POPTR_ -----------------------
gm041538_Glyma1 STG--------------------
pt038866_POPTR_ -----------------------
pp038034_Pp1s25 ASYEGCLSFFPDLDGSVSPALLA
pt034947_POPTR_ -----------------------
Os034953_Os09t0 -----------------------
Sb008747_Sorbi1 -----------------------
Sm008677_Selmo1 -----------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G23220.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M E R I E S Y N T N E M - - - - - K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt042320_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M D G D R T - K S K D G G G E V - K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
gm041538_Glyma1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M G S N K T Y E E E E S T V L F S H - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt038866_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M D H P N I G K V N Q K G E E I - R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pp038034_Pp1s25    M N I F S F A S T K R G R G L L E G K D T G L D F T K T E E V L Q Q A Q Q A S K E T F N S Q F L N C D Q L A A L A S K T
pt034947_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M D E D K T - K S K D E G G E V - K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os034953_Os09t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M D H H H Q - Q Q Q Q E G E L V A K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008747_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M G M G T S L S L A S A A A A A - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sm008677_Selmo1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M E S - - - - P V A A A W Q P S P K - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT3G23220.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt042320_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
gm041538_Glyma1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt038866_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pp038034_Pp1s25    F P S N E L V S A C E T S P T S L H S T G R T L L K R S R S V E N A H F E E Q K K P C H R A W V L S N Q L R H S L G P N
pt034947_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os034953_Os09t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008747_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - H G H G Q Y L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sm008677_Selmo1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L S P C - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT3G23220.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt042320_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
gm041538_Glyma1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S Q T Q T - - - - - - - - - - - - - -
pt038866_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pp038034_Pp1s25    F A E T I G Q V V K K E A G L A T T S S R L D W S S Q T P P Y V K S L A Q G C V A K Q A T T W P S S S P T D P N S A V V
pt034947_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os034953_Os09t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008747_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sm008677_Selmo1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - W G S - - - - - - - - - - - - - - - K R I N T - - - - - - - - - - - - - -
 
AT3G23220.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt042320_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
gm041538_Glyma1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E L - - - - - - L P F N E N D P Q D M V I Y Q V L N E A - - - N A L T N
pt038866_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pp038034_Pp1s25    H T R E E S R L W S D W Q N Q S S G G G A A P S Q L H E R A T Q F P L N E N D S E E T A L C Q V L L - - - G A G K T P -
pt034947_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os034953_Os09t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008747_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P L N E D D S L E M V L F D V L R E A S G S A A A P T
Sm008677_Selmo1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G I P N H L - - - - - - F F L N E N D S E E M P L Y G L L K E A - - - - - - - -
 
AT3G23220.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt042320_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
gm041538_Glyma1    T F L P Q R L H Q P Q - - - - - - - L C L E P T R N I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt038866_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pp038034_Pp1s25    - - - P P A K P S P V - - - - - - - M R A Q P R R H A F P E A A A M G F F K R E Q P G N L P S S I N L I V S S T A P R G
pt034947_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os034953_Os09t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008747_Sorbi1    T Y Q P P A S S L P T - - - - - - - L K - - - - - - - - - K A L A S G A A A R K G G G G - - - - - G V G C S S R A - - -
Sm008677_Selmo1    A T R H P F D S A P T K I E A I Q D V K P E P - - - - - P V A V A M A A A A A P P A A V A P V Q - - - - - - - - - - - -
 
AT3G23220.1     - - - - - - - - - - - - - - - - Y R G V R K R P W G K Y A A E I R D S A R H G A R V W L G T F N T A E D A A R A Y D R A
pt042320_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - Y R G V R K R P W G K F A A E I R D S T R H G A R V W L G T F N T A E E A A R A Y D R A
gm041538_Glyma1    - - - - - - - - - - - - T K K H Y R G V R R R P W G K Y A A E I R D S A R H G A R I W L G T F Q T A E E A A M A Y D R A
pt038866_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - Y R G V R R R P W G K F A A E I R D S T R H G A R L W L G T F N T A E E A A R A Y D G A
pp038034_Pp1s25    S Y I Q A S L P K V V R S I P H Y R G V R Q R P W G K F A A E I R D S A R Q G A R V W L G T F D T A E Q A A M A Y D A A
pt034947_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - Y R G V R K R P W G K F A A E I R D S A R Q G A R V W L G T F S T A E E A A R A Y D R A
Os034953_Os09t0    - - - - - - - - - - - - - - - - Y R G V R R R P W G K F A A E I R D S S R H G V R V W L G T F D T A E E A A R A Y D R S
Sb008747_Sorbi1    - - - - A H A P K A A T T G R H Y R G V R R R P W G K Y A A E I R D P A R H G A R L W L G T F A T A E E A A A A Y D R A
Sm008677_Selmo1    - - - P A S Q P R - - - - - R Q Y R G V R R R P W G K F A A E I R D S T K Q G A R I W L G T F E T A E E A A I A Y D Q A
 
AT3G23220.1     A F G M R G Q R A I L N F P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H E Y Q M M - - - - - - - - - - - - - - - - K D G
pt042320_POPTR_    A Y A M R G H L A I L N F S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N E Y P N M A G S A - - - - - S V G S S - - G S T
gm041538_Glyma1    A F K M R G S K A L L N F P A E I V A A - - - - - - - - - - - - - - - T E L S F N N T N S - - - - - - - - - - - - N N H
pt038866_POPTR_    A Y S M K G P L A I L N F P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - G E Y P K T K V D S - - - - - D I T S S S I S S S
pp038034_Pp1s25    A F K M R G C R A L L N F P L Q A T L P T L P P S P C K T E E N T L K S E T S S T S A N S T T E V L D M G S V K - A E S
pt034947_POPTR_    A Y A M R G H L A V L N F P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N E Y P N M A G N A - - - - - S V G S S - - S S T
Os034953_Os09t0    A Y S M R G A N A V L N F P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A D A - - - - - H I Y A R Q L H N N
Sb008747_Sorbi1    A F R M R G A K A L L N F P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sm008677_Selmo1    A F K M R G R R A L L N F P L R L A T P A - A A A A A R A E - - - - - S S S P E S S V T S - - - - - A I E S Q K - E R T
 
AT3G23220.1     P N G S H E N A V A S S S S G Y R G - - G G G G D D G R E V I E F E Y L D D S L L E E L L D Y G - - E R S N Q D N C N D
pt042320_POPTR_    P Y F S S G Y S G P S S S S P S M L - - - - - - - - - R E V F E F E C L D D K L L E E M L E Q E - - E K K S K K N - - -
gm041538_Glyma1    D A V S D S S A G S S C T N N S V Q L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N R N Q S E S C T S
pt038866_POPTR_    P L S S S S S S S A S S S S M S Q N A E R S G I G R G K E V F E I E Y L D D K L L E D L L D F E - - E E N N P N G - - -
pp038034_Pp1s25    P F S L P S A A S T T A A D P E T T - - - - - - - - - P V A L E L Q D L D T D F L E D L L S N S H P E L D S R P T S S L
pt034947_POPTR_    P F S S S G Y P G S S S S S S S T Q - - - - - - - - - Q E V F E F E C L D D K L L E E L L E Q E - - E K R S K K T - - -
Os034953_Os09t0    N A A A G S S S S S S A A A A A A R - - - - - - - - - P P P I E F E Y L D D H V L Q E M L R D H - - T T N K - - - - - -
Sb008747_Sorbi1    P A V A G C G N A A T A T A E Q A A - - - - G V T - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E A K - - - - - - -
Sm008677_Selmo1    R K R A R D S S L S Q S S S K R Q A - - - - - - - - - P L V V E I Q E P D V D Y M E Q L L S G L - - - - - - - - - - - -
 
AT3G23220.1     A N R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt042320_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
gm041538_Glyma1    S T G - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pt038866_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
pp038034_Pp1s25    A S Y E G C L S F F P D L D G S V S P A L L A
pt034947_POPTR_    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os034953_Os09t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008747_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sm008677_Selmo1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
0