Input
| Putative repression domain
|
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AT3G26620.1 |
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|
Ortholog
| Putative repression domain
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| Type
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Gm048472 |
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III |
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Get alignment file
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Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT3G26620.1 ------------------------------------------------------------
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gm051875_Glyma1 SK----------PIVGSSP-------ATP--CGACKFLRRKCIGGCIFAPYFCTDQGAAK
:
AT3G26620.1 FACVHRIYGAGNVSKMLQQLPDQTRAEAVESLCFEAKCRVDDPVYGCVGIIHLLKT-QIQ
gm052290_Glyma1 FAAIHKVFGASNVSKLLLHIPAHDRCEAVVTIAYEAQARIRDPVYGCVSHIFALQQ-QVA
gm047411_Glyma1 VAGV----GGEDVG-----IPGRGTCEG-------PCAWVRGPHTGV----------GRE
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gm042027_Glyma1 FANVHKVFGASNVNKMLQDLPMHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQ-QID
gm039067_Glyma1 FAKVHKVFGASNVSKILVEVPEEQREDTVNSLAYEAEARLRDPVYGCIGAIALLQR-KMV
gm030990_Glyma1 FTIAHRVFGASNIIKFLQELPESQRADAVTSMVYEASARIRDPVYGCAGAICQLQK-QVN
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gm001337_Glyma0 FANMHKIFGACNVSKLQNEVQPYQREDAVNSLAYEAEAWIEDPVYGCVGAISVLLKVQIL
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gm033025_Glyma1 FTIAHRVFGASNIIKFLQELPESQRADAVTSMVYEASARIRDPVYGCAGAICQLQK-QIN
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gm048472_Glyma1 FALVHKVFGASNVSKMLQELPAHQRGDAVSSLVYEAHARVRDPVYGCVGAISHLQN-QVS
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gm039058_Glyma1 FAIVHKVFGASNVSKMLQELPVHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGCVGAISYLQN-QVS
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gm001871_Glyma0 FAYVHKVFGASNVAKLLNELSAAQRDDAVKSLAYEAEARLRDPVYGCVGLISVLQH-KLR
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gm053637_Glyma2 FANVHKVFGASNVNKMLQDLPEHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQ-QID
gm005195_Glyma0 FAKVHKVFGASNVSKILVEVPEEQREDTVNSLAYEAEARLRDPVYGCIGAIALLQR-KMV
gm051368_Glyma1 FANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQR-QVI
gm031502_Glyma1 FSIVHKVFGASNISKMLQELPIHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGCVGAISYLQN-QVS
gm001872_Glyma0 FAYVHKVFGASNVAKLLNELSAAQRDDAVKSLAYEAEARLRDPVYGCVGLISVLQH-KLR
gm042948_Glyma1 FANVHRIFGASNVTKLLNDLHPHQREDAVNSLAYEAEMRLRDPVYGCVGVISLLQH-QLR
gm011192_Glyma0 FANVHKIFGASNVTKLLNELLPHQREDAVNSLAYEAEARVRDP------------R-QVQ
gm037952_Glyma1 FTTAHRVFGASNIIKFLQELPESQRADAVASMVYEAGARIRDPVYGCAGAICHLQK-QVN
gm048484_Glyma1 FAKVHKVFGASNVSKILIEVPEEQREDTVNSLAYEAEARLRDPVYGCIGAIALLQR-KMV
gm043189_Glyma1 FDSVHKVFGASNVNKMLKELPEHQRSDAVSSMVYEAKARVRDPVYGCVGAISSLQQ-QVD
gm051875_Glyma1 FAAVHKVFGASNVSKLLSNIPANRRHEAATSISYEAQARLSDPVYGCVSTILALQQ-QVV
. *. :: : : . : .*
AT3G26620.1 KTQNELAKTQAEIA----------------------------------------------
gm052290_Glyma1 CLQAQLMQVKAQLAQN-LVESRNIESNHQWTGNNNSVSGQPMNHP------------FCP
gm047411_Glyma1 SSQGERGPCQG-------------------------------------------------
gm028397_Glyma1 ELQAQLAKAQAEVVNM-QCQQANL------------VALICM----------EMSQSQEQ
gm040422_Glyma1 TLQAELNAIRAEILKY-KYREAAS------------IISSQHVALVSSAD--AISIAAIP
gm005046_Glyma0 SLQEEIDALGNLVANS-SVSVVNC----------GSVQATINSNNGTQFNI-LQHDATRT
gm004301_Glyma0 TLQAELAMLQTQL-----MNSRFAYA--------SALQTTQLQQPNMNTG------ALQP
gm051367_Glyma1 RLQKELDATNADLIRY---T-CNE------------MPTT--------------------
gm010535_Glyma0 SLQAELNAVRGEILKY-KLREANM------------IPSS-HVAMLPSSG--AVSIAAPP
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gm046469_Glyma1 RLQKELDAANADLLRY---S-YTD------------ITPASL------------------
gm044124_Glyma1 RLQKELDATSADLIR---------------------------------------------
gm041169_Glyma1 ELQAQLAKAQAEVVNM-QLQQANL------------VALICM----------EMAQTQTP
gm036494_Glyma1 QLQMDLYCAKSELSR---------------------------------------------
gm001337_Glyma0 HQHRERTFVQM-------------------------------------------------
gm048790_Glyma1 QLQMQLAVAQAEILCI-QMQQQEP------------TLATQLVDQDDKSM--LLSVNNNY
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gm001445_Glyma0 SLQAELSYLQGH------------------------LATLELPQP--------------P
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gm009557_Glyma0 QLQSELHRAKKELASYVGPQAM--------------LPPP--------------------
gm048472_Glyma1 ELQMQLAVAQAEILCI-QMQQEPL------------MPNPEMEDPDQKSY--LLQNE---
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: :
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gm001872_Glyma0 YEHQQQQEFLRFSGGFDVGSASSAGGFSQVSPAAASADQLSPSLALGSFDNAYHMQQPQQ
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gm001872_Glyma0 EEPHHHHHHPHHIPLEAQLLLPPQQKQQTH--------HESQL-------PLHQQHSDNE
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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gm001872_Glyma0 |
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gm042948_Glyma1 |
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gm011192_Glyma0 |
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gm037952_Glyma1 |
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gm048484_Glyma1 |
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gm043189_Glyma1 |
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