Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G26620.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Gm005177 |
not found in 154aa |
AT2G30130.1 |
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II |
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not found in 165aa |
AT2G30130.1 |
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0.549019607 |
III |
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not found in 153aa |
AT2G30130.1 |
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III |
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AT2G30130.1 |
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III |
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not found in 170aa |
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III |
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AT1G31320.1 |
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0.529411764 |
III |
Gm021573 |
not found in 177aa |
AT1G31320.1 |
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III |
Gm042027 |
not found in 170aa |
AT1G31320.1 |
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0.525490196 |
III |
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not found in 172aa |
AT2G30130.1 |
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0.525490196 |
III |
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0.513725490 |
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AT3G27650.1 |
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III |
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III |
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III |
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AT5G63090.4 |
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0.498039215 |
III |
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III |
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III |
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AT5G66870.1 |
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III |
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III |
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0.4 |
III |
Gm004301 |
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AT3G03760.1 |
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0.4 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT3G26620.1 -----------------------------------------MNPK---------------
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gm001445_Glyma0 -----------MSINSSCS-------------ISGGSSSGGNNNSSGG------------
gm009557_Glyma0 -----------------MS------------------SS--NSP----------------
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AT3G26620.1 ------------------------RCAACKYLRRRCPKDCVFSPYFPPND-PQKFACVHR
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gm030990_Glyma1 --------------PPPPPTVVMSPCAACKILRRKCAEKCVLAPYFPPTE-PAKFTIAHR
gm055039_Glyma2 SPSQGSPSAAPPSPPPPPPPVVVSPCAACKILRRRCVEKCVLAPYFPPTD-PLKFTIAHR
gm011722_Glyma0 ------------------------------------MPDCIFAPYFPPEE-PHKFANVHK
gm041169_Glyma1 ----------------------MSPCAACKILRRRCAEKCVLAPYFPLTE-PSKFTTAHR
gm033025_Glyma1 -------------TPPSPPTVVMSPCAACKILRRRCAEKCVLAPYFPPTE-PAKFTIAHR
gm001871_Glyma0 -------------------------CAACKFLRRKCTQECVFAPYFPPDN-PQRFAYVHK
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gm031502_Glyma1 -------------------------CASCKLLRRRCSKDCIFAPYFPSDD-PRKFSIVHK
gm039067_Glyma1 -----------------------SSCAACKFLKRRCIPNCIFAPYFRSDE-CKKFAKVHK
gm005195_Glyma0 -----------------------SSCAACKFLKRRCIPNCIFAPYFRSDE-CKKFAKVHK
gm037952_Glyma1 ----------------------MIPCAACKILRRRCAEKCVLAPYFPPTE-PAKFTTAHR
gm048484_Glyma1 -----------------------SSCAACKLLKRRCIPNCIFAPYFRSDE-CKKFAKVHK
gm050795_Glyma1 -------------------------CAACKFLRRKCMPDCIFAPYFPPEE-PHKFANVHK
gm010185_Glyma0 -------------------------CAACKFLRRKCLPGCIFAPYFPPEE-PQKFANVHK
gm048790_Glyma1 -------------------------CASCKLLRRRCSKECIFAPYFPSDD-PRKFAIVHK
gm051875_Glyma1 --------PIVGSSP-------ATPCGACKFLRRKCIGGCIFAPYFCTDQGAAKFAAVHK
gm015213_Glyma0 ----------------------ITPCAACKLLRRRCAQECPFSPYFSPHE-PQKFASVHK
gm042948_Glyma1 -------------------------CAACKFLRRKCQPECAFAPYFPPDQ-PQKFANVHR
gm052290_Glyma1 -------------------------CGACKFLRRKCAADCIFAPYFCSEQGPARFAAIHK
gm051368_Glyma1 -------------------------CAACKFLRRKCMPDCIFSPYFPPEE-PQKFANVHK
gm004301_Glyma0 AQTQD--EAMVESSP-------TTPCGACKFLRRRCVEGCIFAPHFGTDQGAAKFAAVHK
gm010535_Glyma0 ----------------------ITPCAACKLLRRRCAQECPFSPYFSPHE-PQKFASVHK
gm044124_Glyma1 -------------------------CAACKFLRRKCMPDCIFAPYFPPEE-PQKFANVHK
gm005177_Glyma0 -------------------------CASCKLLRRRCTKDCIFAPYFPSDD-PQKFAIVHK
gm021573_Glyma0 -------------------------CAACKLLRRRCTRDCVFAPYFPADE-PQKFGSVHK
gm001445_Glyma0 -----------------------SPCGACKFLRRKCMPGCIFAPYFDSEEGATHFAAVHK
gm009557_Glyma0 -------------------------CAACKIQRRKCTQECVFAPYFPPDN-PQRFAYVHK
gm042027_Glyma1 -------------------------CAACKLLRRRCAQDCVFAPYFPADE-PQKFANVHK
gm001872_Glyma0 -------------------------CAACKFLRRKCTQECVFAPYFPPDN-PQRFAYVHK
gm039058_Glyma1 -------------------------CASCKLLRRRCTKDCTFAPYFPSDD-PQKFAIVHK
gm048472_Glyma1 -------------------------CASCKLLRRRCTKDCIFAPYFPSND-PQKFALVHK
gm046469_Glyma1 -------------------------CAACKFLRRKCMPGCIFAPYFPPEE-PQKFANVHK
:. :
AT3G26620.1 IYGAGNVSKMLQQLPDQTRAEAVESLCFEAKCRVDDPVYGCVGIIHLLKTQIQKTQNELA
gm019156_Glyma0 VFGASNVNKMLQDLAEHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQIDVLQTQLA
gm043189_Glyma1 VFGASNVNKMLKELPEHQRSDAVSSMVYEAKARVRDPVYGCVGAISSLQQQVDVLQTQLA
gm040422_Glyma1 VFGASNVSKMLMEVPEGQRADAANSLVYEANLRLRDPVYGCMGAISALQQQVQTLQAELN
gm047411_Glyma1 LFGYLHVRTIL-------------SSGEHPAVRVRAP---CVWR-WQRRKHAQHHKAKVA
gm007212_Glyma0 VFGASNVSKLLLHIPAHDRCEAVVTITYEAQARIRDPVYGCVSHIFALQQQVARLQAQLM
gm005046_Glyma0 IYGASNVSKLLSHLPIQNRSDAAVTISYEALARMQDPIYGCVAHIYALQHQVASLQEEID
gm028397_Glyma1 VFGASNIIKFLQELPESQREDAVSSMVYEANARIRDPVYGCAGAICQLQKQVSELQAQLA
gm051367_Glyma1 IFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQRQVIRLQKELD
gm031876_Glyma1 VFGASNVSKILIEVPEEQREDTVNSLAYEAEARLRDPVYGCIGAIALLQRKMVELQHDLV
gm053637_Glyma2 VFGASNVNKMLQDLPEHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQIDVLQTQLA
gm023827_Glyma0 VFGASNVNKMLQDLPMHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQIDVLQTQLA
gm011192_Glyma0 IFGASNVTKLLNELLPHQREDAVNSLAYEAEARVRDP------------RQVQRLQKELD
gm036494_Glyma1 IFGASNVTKLLNDLHPHQREDAVNSLAYEAEMRLRDPVYGCVGVISLLQHQLRQLQMDLY
gm030990_Glyma1 VFGASNIIKFLQELPESQRADAVTSMVYEASARIRDPVYGCAGAICQLQKQVNELQAQLA
gm055039_Glyma2 VFGASNIIKFLQELPESQRADAVSSMVYEANARIRDPVYGCAGAICQLQKQVSELQAQLA
gm011722_Glyma0 IFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQKQVLRLQKELD
gm041169_Glyma1 VFGASNIIKFLQELPESQRADAVASMVYEAGARIRDPVYGCAGAICQLQKQVNELQAQLA
gm033025_Glyma1 VFGASNIIKFLQELPESQRADAVTSMVYEASARIRDPVYGCAGAICQLQKQINELQAQLA
gm001871_Glyma0 VFGASNVAKLLNELSAAQRDDAVKSLAYEAEARLRDPVYGCVGLISVLQHKLRQIQVELN
gm001337_Glyma0 IFGACNVSKLQNEVQPYQREDAVNSLAYEAEAWIEDPVYGCVGAISVL-LKVQILHQHRE
gm031502_Glyma1 VFGASNISKMLQELPIHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGCVGAISYLQNQVSQLQMQLA
gm039067_Glyma1 VFGASNVSKILVEVPEEQREDTVNSLAYEAEARLRDPVYGCIGAIALLQRKMVELQHDLA
gm005195_Glyma0 VFGASNVSKILVEVPEEQREDTVNSLAYEAEARLRDPVYGCIGAIALLQRKMVELQHDLA
gm037952_Glyma1 VFGASNIIKFLQELPESQRADAVASMVYEAGARIRDPVYGCAGAICHLQKQVNELQAQLA
gm048484_Glyma1 VFGASNVSKILIEVPEEQREDTVNSLAYEAEARLRDPVYGCIGAIALLQRKMVELQHDLA
gm050795_Glyma1 IFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQKQVLRLQKELD
gm010185_Glyma0 IFGASNVTKLLNELLPHQREDAVNSLAYEAEARVRDPVYGCVGAISFLQRQVQKLQKELD
gm048790_Glyma1 VFGASNISKMLQELPIHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGSVGAISYLQSQVSQLQMQLA
gm051875_Glyma1 VFGASNVSKLLSNIPANRRHEAATSISYEAQARLSDPVYGCVSTILALQQQVVSLQAELA
gm015213_Glyma0 VFGASNVSKMLMEVPECQRADAANSLVYEANVRLRDPVYGCMGAISALQQQVQSLQAELN
gm042948_Glyma1 IFGASNVTKLLNDLHPHQREDAVNSLAYEAEMRLRDPVYGCVGVISLLQHQLRQLQMDLY
gm052290_Glyma1 VFGASNVSKLLLHIPAHDRCEAVVTIAYEAQARIRDPVYGCVSHIFALQQQVACLQAQLM
gm051368_Glyma1 IFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQRQVIRLQKELD
gm004301_Glyma0 VFGASNVSKLLSNIPVNRRNEASTTISYEAQARLSDPVYGCVSTILALQQQVATLQAELA
gm010535_Glyma0 VFGASNVSKMLMEVPECQRADAANSLVYEANVRLRDPVYGCMGAISALQQQVQSLQAELN
gm044124_Glyma1 IFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQRQVIRLQKELD
gm005177_Glyma0 VFGASNVSKMLQELPVHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGCVGAISYLQNQVSELQMQLA
gm021573_Glyma0 VFGASNVNKMLQELPEHQRSDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQVDVLQTQLA
gm001445_Glyma0 VFGASNISKLLLNIPVHKRLDAVVTICYEAQARLRDPVYGCVAHIFALQQQVMSLQAELS
gm009557_Glyma0 VFGASNVAKLLNELNAAQREDAIKSLAYEAEARLRDPVYGCVGLISILQHRLKQLQSELH
gm042027_Glyma1 VFGASNVNKMLQDLPMHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQIDVLQTQLA
gm001872_Glyma0 VFGASNVAKLLNELSAAQRDDAVKSLAYEAEARLRDPVYGCVGLISVLQHKLRQIQVELN
gm039058_Glyma1 VFGASNVSKMLQELPVHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGCVGAISYLQNQVSELQMQLA
gm048472_Glyma1 VFGASNVSKMLQELPAHQRGDAVSSLVYEAHARVRDPVYGCVGAISHLQNQVSELQMQLA
gm046469_Glyma1 IFGASNVTKLLNELLPHQREDAVNSLAYEAEARVRDPVYGCVGAISFLQRQVQRLQKELD
::* :: .: : .. : * : : .
AT3G26620.1 KTQAEIAVA---QT----------------------------------------------
gm019156_Glyma0 VAQAEAVHL---RVRQTASLY-S----PT-----------------------------S-
gm043189_Glyma1 LAQAEVVHM---RMRQFSPLS-DQQQQPS-----------------------------VL
gm040422_Glyma1 AIRAEILKY-KYREAASIISSQHVALVSS-------------------ADAISIA---AI
gm047411_Glyma1 GVGGEDVGI------------------PG---RGTCEG--PCAWV-------------RG
gm007212_Glyma0 QVKAQLTQN-LVESRNIENNHHLQGNNNN------------------VTGQLMNHP--FC
gm005046_Glyma0 ALGNLVANS-SVSVVNCGSVQ---------------------ATI---------------
gm028397_Glyma1 KAQAEVVNM-QCQQANLVALI-CMEMSQS-----------------------------QE
gm051367_Glyma1 ATNADLIRY---T-CNEMPTT---------------------------------------
gm031876_Glyma1 IAKDRLARC---HAAATAAAT-T----TT-----------------------------TT
gm053637_Glyma2 VAQAEAVHL---RVRQAASLY-S----PT-----------------------------S-
gm023827_Glyma0 RAQAEVAHL---RVRQNRCFS-NHGLRPT-----------------------------S-
gm011192_Glyma0 AANADLLRY---S-YTDITPT-SLS---------------------------------VP
gm036494_Glyma1 CAKSELSR----------------------------------------------------
gm030990_Glyma1 KAQGELVNM-QLQQANLVALI-CMEMA-------------------------------QS
gm055039_Glyma2 KAQAEVVNM-QCQQANLVALI-CMEMSQS-----------------------------QE
gm011722_Glyma0 ATNADLIRY---SACNEIPNT-TT------------------------------------
gm041169_Glyma1 KAQAEVVNM-QLQQANLVALI-CMEMAQT-----------------------------QT
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gm001871_Glyma0 NAKKELATYIGPQAIQGIPAP-MLQQHPNNPFPGAMYGNMPTATAAVHGGQLVIRDAQPA
gm001337_Glyma0 RTFVQM------------------------------------------------------
gm031502_Glyma1 VAQTEILCI---QMQQ---------QEPT-----------------------------L-
gm039067_Glyma1 IAKDRLARY---TAAATTA---------T-----------------------------AT
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gm037952_Glyma1 KAQAEVVNM-QFQQANLVALI-CMEMAQT-----------------------------QT
gm048484_Glyma1 IAKDRLARC---HAAAAAA---------------------------------------TT
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gm051368_Glyma1 ATNADLIRY---T-CNEMPTT---------------------------------------
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gm001872_Glyma0 PQQQQQQILEAQQLAAAVAAREQQEMFRSYEHQQQQEFLRFSGGFD-VGSASSAGGFSQV
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gm048472_Glyma1 PN----------------------------------------------PEMEDPD---QK
gm046469_Glyma1 PG-----------LAS------------FHHVPQRQ----FSARFG--NELASG--FYRH
AT3G26620.1 -------------------------------------KLSQ-------------------
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gm001337_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm037952_Glyma1 ------------------------------------E-SPQ--------QSVDNFISSPS
gm048484_Glyma1 NV-----------------------------------SLPP-------------FPDFC-
gm050795_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm010185_Glyma0 SP--TTT-----------------------------YSYPY-------------SLPW--
gm048790_Glyma1 SMLLSVNN--------------------------NYEMLPQ-------------FLNFPS
gm051875_Glyma1 SN----------------F-----------------NNTPSF------------DLAMDT
gm015213_Glyma0 ---------------------------------------PPPPPPPP-PPP-PPSLPLP-
gm042948_Glyma1 SL-----------------------------------------------------LAM--
gm052290_Glyma1 ---------------------------------YMNPISPQSSLESIDHSSINDGMSMQD
gm051368_Glyma1 SP-EVTI-----------------------------Y-----------------------
gm004301_Glyma0 ST----------------F-----------------NNNPSF------------VLEMDT
gm010535_Glyma0 ---------------------------------------PPPPPPPPLPPP-SLPLPLP-
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gm009557_Glyma0 ------------------------------------------------------LLPP--
gm042027_Glyma1 SKTLD-------------------------------------------------------
gm001872_Glyma0 SPAAASADQLSPSLALGSFDNAYHMQQPQQEEPHHHHHHPHH-----IPLEAQLLLPP--
gm039058_Glyma1 SYFLQND-------------------------------LSQ-------------FLAF--
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gm037952_Glyma1 H---SSG-YQNNLNFF--------EENTNNLNS---------------------------
gm048484_Glyma1 ---------TSSSDF----------NDIFCHSSSSQ-LLGRHETVDDFNQIP--------
gm050795_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm051368_Glyma1 --------------------------------------NI--------------------
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gm009557_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm037952_Glyma1 -----------------------------------
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gm010535_Glyma0 -----------------------------------
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gm001445_Glyma0 SGGDLQALARELLHRHGSAPVVACSNPSSSYPISK
gm009557_Glyma0 -----------------------------------
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gm046469_Glyma1 -----------------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G26620.1 |
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