Input
| Putative repression domain
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AT3G27650.1 |
not found |
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Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Sb018652 |
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not found in 207aa |
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not found in 217aa |
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AT2G40470.1 |
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0.410169491 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb018652_Sorbi1 -----------------------------------MAAS---------------------
Sb026254_Sorbi1 PLPPQIARSLPQS-----LTTRRRLRQVPRSSPGPVAAALHQFPGSSSEFGLVFAGDE-H
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Sb018408_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb020619_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb018652_Sorbi1 ------SASSVPVVSTGSVITVAAS-----------------------------------
Sb026254_Sorbi1 RQGSRRMASSVPAPS-GSVITVASSSSSAAAAAVCGTGSPCAACKFLRRKCQPDCVFAPY
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*
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Sb026254_Sorbi1 PCAACKFLRR-------------------KCQPDCVFAPYFPPDNPQKFVHVHRVFGASN
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Sb018408_Sorbi1 PCASCKLLRR-------------------RCTKDCIFAPFFPADDPHKFAIVHKVFGASN
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Sb008940_Sorbi1 PCAACKLLRR-------------------RCAQECPFAPYFSPHEPHKFAAVHKVFGASN
* . :: ** : .. .. * : *::
AT3G27650.1 VSKILHEVAPHQREDAVNSLAYEAEARLKDPVYGCVGAISVLQRQVLRLQRELEETNADL
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Sb032110_Sorbi1 AAVLL------RRRRLLLLLASSASGR-RQPHDGRRRALRRRRRRC--------------
Sb018652_Sorbi1 VTKILNELHPYQREDAVNSLAYEADMRLRDPVYGCVGVISILQHRLRLVQQELARATYEL
Sb026254_Sorbi1 VTKLLNELHPFQREDAVNSLAYEADMRLRDPVYGCVGVISILQHNLRQLQQDLARAKYEL
Sb032270_Sorbi1 VSKMLLEVHESQRADTANSLVYEANLRLRDPVYGCMGAILTLQQQVQALEAELATVRAEI
Sb018408_Sorbi1 VSKMLQELPVQQRGDAVSSLVYEANARMRDPVYGCVGAISFLQNQVSQLQMQLAVAQAEI
Sb000645_Sorbi1 VSKLLQEIPVQHRGDAVSSLVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQVETLQAQLALAQAEM
Sb020619_Sorbi1 VSKLLNELPQAQREDAVNSLAYEAEARLRDPVYGCVSYISVLQLRIKQVREELAAARKEL
Sb008940_Sorbi1 VSKLLLEVAEGERADAASSLVYEANLRLRDPVYGCMGAISMLQQQVNALEAELEAVRAEI
:* * :. .*. * ::* * : : .
AT3G27650.1 MRYAG--------------------------CLGG-------------------------
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Sb032110_Sorbi1 ---------CL--------------------ADAG-------------------------
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AT3G27650.1 ------------------------------------------------------------
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Sb018652_Sorbi1 -------TQNFINVGHSTAAAASISGAGGGFMQQQDSFGASVQMLARSYEGGAAARVGMN
Sb026254_Sorbi1 -------AHNFINIGHS-AALGSLGGSATVFGQEQ---FANAQMLSRSYDGEPIARLGIN
Sb032270_Sorbi1 ----------VLPSSHASQLLAASAAGRGLHAGSRPSVGARAATLAAAAA------AAAV
Sb018408_Sorbi1 SSLVVGAGGGADHRHHNHMTMAAA-------MQQQ------AMMATDDVD----AFLMQN
Sb000645_Sorbi1 SSM--SSPKTAEPEAHCNAT----------------------------------------
Sb020619_Sorbi1 QQQIMVHQHQHQHLHHQQMAAAE--------AQQQ---LAAAVEVAREQD------LMMR
Sb008940_Sorbi1 -------NRLIDDDAHATASFVAPASAP-VHVNDVVSV------VEAGQE------VAAT
AT3G27650.1 ----------ETTSAYG--GRRG-------------------------------------
Sb021740_Sorbi1 GGGSSGLFGAAYQQTFY------------------------DSDLDSATWPDH-------
Sb032110_Sorbi1 -------------------GRRG------------------ALDMSSINPCTAPTTANCA
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Sb032270_Sorbi1 GPVASS----SSSSAVY---------AAAA--ASSSTD------YSSIT-NENVPYFG--
Sb018408_Sorbi1 GAGATG--AIVPPQLIGM-GYGG---AASAG-----------------------------
Sb000645_Sorbi1 ------------PELLDM------------------------------------------
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Sb008940_Sorbi1 GGGASGM---STSSAVY---------VAEAEQPASTNH------YSSRNPSEHPAYFG--
AT3G27650.1 ------------------------------------------------------------
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Sb008940_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G27650.1 |
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Sb018652_Sorbi1 |
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Sb026254_Sorbi1 |
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AT3G27650.1 |
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