Input
| Putative repression domain
|
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AT3G27650.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb007259 |
not found in 268aa |
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not found in 308aa |
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not found in 207aa |
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not found in 217aa |
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AT2G40470.1 |
not_not |
0.410169491 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb018652_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb008940_Sorbi1 -------------------------------------SSARWTSTS------------RE
Sb000645_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb018408_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb032270_Sorbi1 --DELGKKIKRESAAERMTAAAR-------------------------------------
Sb021740_Sorbi1 ASRSNDRSVMDYGNASTGSTAAP----EQYNYCRSVSPPSRVS----SCSP-----PPPP
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Sb032110_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT3G27650.1 --------------NYTN------------------------------------------
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Sb032270_Sorbi1 ---------------------------------AGAG-----------PGSAL-NTITPC
Sb021740_Sorbi1 ---------------------------------------------------------SPC
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: *
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Sb018408_Sorbi1 ASCKLLRRRCTKDCIFAPFFPADDPHKFAIVHKVFGASNVSKMLQ-----ELPVQQRGDA
Sb032270_Sorbi1 AACKLLRRRCAQECPFSPYFSPLEPHKFAAVHKVFGASNVSKMLL-----EVHESQRADT
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Sb018652_Sorbi1 AACKFLRRKCQPDCVFAPYFPPDNPQKFVHVHRVFGASNVTKILN-----ELHPYQREDA
Sb007259_Sorbi1 AACKFLRRKCLPGCVFAPYFPPEEPQKFANVHKVFGASNVTKLLN-----ELLPHQREDA
Sb032110_Sorbi1 A-----------------YVP----------HR----NQLNGLLQRHGRLRCGRGRGHGA
* :.. *: .:: :* .:
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Sb007259_Sorbi1 VSSLAYEAEA----------RVKDPVYGCVGAISVLQRQVHRLQKELDAAHAELLRYACG
Sb032110_Sorbi1 VTSFVATAGGGGGGGAEPVRRVQDPP-------PPLRRPLRA-GSLLPAHRAPQVRHR--
..*:. * *::** *: *
AT3G27650.1 ------------------------------------------------------------
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Sb018408_Sorbi1 ------------------------M-----------------------------------
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Sb021740_Sorbi1 QHA-------------------NLLA----------------------------------
Sb026254_Sorbi1 AAAASASTAAPNGPQ----------AMAEFIGNAMPNG----------------AHNFIN
Sb018652_Sorbi1 AAAAAEAASVGVGSHGDAAAG---MAAVDFIGNAVANDC---------------TQNFIN
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Sb032270_Sorbi1 VG---ARAATLA------------------------------AAAAAAAVGP--------
Sb021740_Sorbi1 ----------------------------LFCVEMANRR----------------------
Sb026254_Sorbi1 IGHS-AALGSLG---GSATVFGQEQ---FANAQMLSRSYDGEPIARLGING---------
Sb018652_Sorbi1 VGHSTAAAASIS---GAGGGFMQQQDSFGASVQMLARSYEGGAAARVGMNGG--------
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Sb032110_Sorbi1 -------------------------------APCLRRQQH--HQAPPGAAGG---APCGR
AT3G27650.1 --------GC--------------------------------------------------
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Sb018408_Sorbi1 -------GGGPN-----------------VDDVVV--------------------PPPSS
Sb032270_Sorbi1 -------VASS------------------SSSSAVYAAAA-----------------ASS
Sb021740_Sorbi1 -------GGNQQ-------------------------------------------QHPSS
Sb026254_Sorbi1 ----------GY-------EFGYSTAMG--GSGAV------------------------S
Sb018652_Sorbi1 -------GGSGYG------GFAYSSAMGVVGHGGIV----------------------SA
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AT3G27650.1 ------------------------------------------------------------
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Sb032270_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb018652_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb007259_Sorbi1 DS----------------------------------------------------------
Sb032110_Sorbi1 LD-----------------------------------------MSSINPCTAPTTANCAL
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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Sb032110_Sorbi1 |
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C |
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A |
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T |
A |
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C |
A |
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AT3G27650.1 |
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Sb008940_Sorbi1 |
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Sb000645_Sorbi1 |
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V |
V |
D |
Q |
P |
S |
M |
D |
D |
A |
H |
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S |
Y |
Sb020619_Sorbi1 |
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Sb018408_Sorbi1 |
G |
G |
A |
A |
S |
A |
G |
A |
M |
G |
E |
T |
T |
A |
L |
K |
R |
E |
S |
L |
W |
T |
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Sb032270_Sorbi1 |
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Sb021740_Sorbi1 |
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H |
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A |
Q |
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W |
T |
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Sb026254_Sorbi1 |
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K |
S |
C |
Q |
V |
T |
D |
V |
K |
K |
R |
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K |
K |
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C |
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Sb018652_Sorbi1 |
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Sb007259_Sorbi1 |
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S |
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Sb032110_Sorbi1 |
F |
V |
N |
A |
I |
N |
A |
Q |
V |
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