Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G27650.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Gm050795 |
not found in 131aa |
AT3G27650.1 |
1st_1st |
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AT3G27650.1 |
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II |
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AT3G27650.1 |
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II |
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not found in 144aa |
AT3G27650.1 |
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II |
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0.555932203 |
III |
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not found in 189aa |
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III |
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AT1G65620.4 |
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AT3G27650.1 |
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AT5G66870.1 |
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0.491525423 |
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AT3G27650.1 |
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II |
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AT1G31320.1 |
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AT2G30130.1 |
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III |
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AT1G31320.1 |
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III |
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AT1G31320.1 |
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AT1G31320.1 |
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0.457627118 |
III |
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AT1G07900.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT3G27650.1 --MPKRETKKIKPSQEVIKEGPFLVAIHL--------------KGIYMSNYT--------
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AT3G27650.1 -----------------------NSPCAACKFLRRKCTSDCVFAPYFPPEE-PTKFANVH
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gm009557_Glyma0 -----------------------NSPCAACKIQRRKCTQECVFAPYFPPDN-PQRFAYVH
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gm005177_Glyma0 -----------------------NSPCASCKLLRRRCTKDCIFAPYFPSDD-PQKFAIVH
* ::*** . : :* *
AT3G27650.1 RIFGASNVSKILHEVAPHQREDAVNSLAYEAEARLKDPVYGCVGAISVLQRQVLRLQREL
gm044124_Glyma1 KIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQRQVIRLQKEL
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gm001337_Glyma0 KIFGACNVSKLQNEVQPYQREDAVNSLAYEAEAWIEDPVYGCVGAISVL-LKVQILHQHR
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gm050795_Glyma1 KIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARIKDPVYGCVGAISVLQKQVLRLQKEL
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gm028397_Glyma1 RVFGASNIIKFLQELPESQREDAVSSMVYEANARIRDPVYGCAGAICQLQKQVSELQAQL
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gm009557_Glyma0 KVFGASNVAKLLNELNAAQREDAIKSLAYEAEARLRDPVYGCVGLISILQHRLKQLQSEL
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gm053637_Glyma2 KVFGASNVNKMLQDLPEHQRGDAVSSMVYEANARVRDPVYGCVGAISSLQQQIDVLQTQL
gm005177_Glyma0 KVFGASNVSKMLQELPVHQRADAVSSLVYEANARVRDPVYGCVGAISYLQNQVSELQMQL
::***.*: *: .: :* :: ::.*** :.** :: :: .
AT3G27650.1 EETNADLMRYAGC-----------------------------------------------
gm044124_Glyma1 DATSADLIR---------------------------------------------------
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gm001337_Glyma0 ERTFVQM-----------------------------------------------------
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gm001871_Glyma0 NNAKKELATYIGPQAIQGIPAPMLQQHPNNPFPGAMYGNMPTATAAVHGGQLVIRDAQPA
gm042027_Glyma1 ALAQAEVAHLRARQNR----------------CFSHHGLRPTS---------------PT
gm011722_Glyma0 DATNADLIRYSACNEI------------------------PNTTT---------------
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gm037952_Glyma1 AKAQAEVVNMQFQQANL-VA----------------------------------------
gm051367_Glyma1 DATNADLIRYT-CNEM------------------------PTT-----------------
gm010535_Glyma0 NAVRGEILKYKLREANM-IP------------SS-HVAMLPSSGAVSIA-------APP-
gm019156_Glyma0 AVAQAEAVHLRVRQTA----------------SLYS----PTS---------------PT
gm030990_Glyma1 AKAQGELVNMQLQQANL-VA----------------------------------------
gm033025_Glyma1 AKAQAELVNMQIQQANL-VA----------------------------------------
gm001872_Glyma0 NNAKKELATYIGPQAIQGIPAPMLQQHPNNPFPGAMYGNMPTATAAVHGGQLVIRDAQPA
gm028397_Glyma1 AKAQAEVVNMQCQQANL-VA----------------------------------------
gm042948_Glyma1 YCAKSELSRYQNLSTT------------------------TNLSS---------------
gm005195_Glyma0 AIAKDRLARYATAAATA------------------------TTTP---------------
gm039058_Glyma1 AVAQAEILCIQM-E------------------------HEPVM---------------P-
gm021573_Glyma0 ALAQAEVVHMRMRQFS----------------PPS-EQQQPSVL--------------PE
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gm009557_Glyma0 HRAKKELASYVGPQAM--LPPP------------------------------------PP
gm052290_Glyma1 MQVKAQLAQNLVESRNI-------ESNHQWTGNNNSVSGQPMNHPFCPTY------MNPI
gm039067_Glyma1 AIAKDRLARYTAAATTA------------------------TAT----------------
gm053637_Glyma2 AVAQAEAVHLRVRQAA----------------SLYS----PTS---------------PT
gm005177_Glyma0 AVAQAEILCIQM-E------------------------HEPVM---------------PA
AT3G27650.1 ------------------------------------------------LGGE-------T
gm044124_Glyma1 -------------------------------------------------GGSSLGQS---
gm046469_Glyma1 G------------LAS------------FHHVPQRQFSARFG--NELASG--FYRHQSTT
gm015213_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm001337_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm031502_Glyma1 TQLVDQD-----------------------------------------------DKSM--
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gm050795_Glyma1 -------------------------------GGRSRIGDI--------------------
gm040422_Glyma1 DS----------------------------------------------SQGLSQPHAH--
gm011192_Glyma0 G------------LAS------------FHQVPQRQFSARFG--NE-ASG--FYRHQS-A
gm036494_Glyma1 ------------------TCLVLVLFFPRDQHQQQQVVRSFD-------AGNNYDASL--
gm043189_Glyma1 ASNASSENL--------------------------------------------YHSSR--
gm010185_Glyma0 ------------------------------QIPQRSFSAGFGNNNESASGGEFYRPSP--
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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