Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G48590.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os006607 |
not found in 259aa |
AT1G56170.2 |
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III |
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AT1G56170.2 |
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III |
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AT1G56170.2 |
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III |
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not found in 136aa |
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0.583617747 |
III |
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not found in 249aa |
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III |
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III |
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AT1G56170.2 |
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III |
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AT1G56170.2 |
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III |
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AT1G08970.2 |
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0.634812286 |
III |
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AT1G08970.2 |
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III |
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT3G48590.1 ------------------------------------------------------------
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: . :. ::. * . : : . * : *
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pp036539_Pp1s31 IAGAITRGDIFDFLVDIVPR-----------DEL-------------KEED-LG-VPWSG
gm027778_Glyma1 IAAAITRTDIFDFLVDIVPR-----------EDL-------------KDEV-LASMPRGD
gm055597_Glyma2 IAAAITRTDIFDFLVDIVPR-----------EDL-------------KDEV-LASMPRGT
Os030536_Os08t0 VEAVIKKTDIFDFLVDIITD-----------DKM-------------KDDG---------
pp005481_Pp1s37 IAGAITRGDIFDFLVDIVPR-----------DEL-------------KEEE-TA-VPWS-
pt001546_POPTR_ IAAAITRTDIFDFLVDIVPR-----------EDL-------------KDEV-LASIPRGT
Sm021821_Selmo1 VAGAISRADIFDFLVDIVPR-----------EEL-------------KVTF-LS-T----
pt036437_POPTR_ IAAAISRTDVFDFLVDIIPR-----------DEL-------------KEEG-LG-VTKAT
pt042230_POPTR_ IAAAITRTDIFDFLVDIVPR-----------EDL-------------KDEV-LASVPRGS
gm021377_Glyma0 IASAISKTDVFDFLEDIVPR-----------D--------------------VG-IPRSS
pp036538_Pp1s31 IAGAITRGDIFDFLVDIVPR-----------DEL-------------KEED-LG-VPWSG
Sb015279_Sorbi1 IAAAITRTDIYDFLVDIIPR-----------DEM-------------KEEG-LG-LPRVG
pp005482_Pp1s37 IAGAITRGDIFDFLVDIVPR-----------DEL--------------------------
gm036665_Glyma1 IASSISRADVFDFLIDTVPRP---------LENIL------------DQQGFVG-LP---
pp005616_Pp1s15 IAGAITRGDIFDFLVDIVPR-----------DEL-------------KEED-LG-VPWSG
Sb030598_Sorbi1 VTAALASTEVFDFLVADSST-----------DNKP------------KGNG-EG-LPPPT
gm053118_Glyma1 IAAAITRTDIFDFLVDIVPR-----------EDL-------------KDEV-LASIPRGT
pp036540_Pp1s31 IAGAITRGDIFDFLVDIVPR-----------DEL-------------KEED-LG-VPWSG
Os031976_Os08t0 IAAAIARTEVFDFLVDIVPR-----------DEA-------------KDAE-AAAAVAAG
gm036664_Glyma1 VASAISRTDVFDFLVDIVSGH----------NKIM------------EQQGFVG-IPRIG
pt014120_POPTR_ IAAAITRTDIFDFLVDIVPR-----------EDM-------------KDEV-LASIPRGT
pt034313_POPTR_ IAAAITRTDIFDFLVDIVPR-----------EDL-------------KDEV-LASVPRGS
Sm020043_Selmo1 IAAAVTRTDIFDFLVDIVPR-----------EDV-------------KDEA-LG-VSRSA
gm008069_Glyma0 IAAAITRTDIFDFLVDIVPR-----------EDL-------------KDEV-LASIPRGT
gm021542_Glyma0 IAAAISRNDVFDFLVDIIPR-----------DEL-------------KEEG-LG-ITKAT
pp005480_Pp1s37 IAGAITRGDIFDFLVDIVPR-----------DEL-------------KEEE-TA-VPWS-
Os025982_Os06t0 IAAAITRTDMYDFLVDIVPR-----------DDL-------------KEEG-VG-LPRAG
Sb004169_Sorbi1 IAAAITRTDIYDFLVDIVPR-----------DEM-------------KEDG-VG-LPRAG
Sb023436_Sorbi1 RRRGPRR--VRPGLRDVHPRAHPPRLGARRGEQAPHASEVRHCRCHRPHRG-VR-LPRGH
gm036666_Glyma1 LVSAISQTASFDFLDDIMPK-----------D--------------------AG-LPRTS
* . :
AT3G48590.1 M-----------------------VVAPTA-SGVPY---Y---YPP----------MGQP
pt000315_POPTR_ IPV---------------------VGSPAD---LPY---Y---YVPQ------HP-VGPP
Os034147_Os09t0 IPRP-------------------AAGVPAT-DPLAY---Y---YVPQQ------------
pp016894_Pp1s40 MP----------------------VGSPVS-----YEGVY---YVPTPQGPVPQPAMVSP
Os006607_Os02t0 LPP--------------------NVGGAAD--TYPY---Y---YVPAQ----QGP-----
Sb031239_Sorbi1 RAAGRGQGSRLRRRHG-------TSRDPAP-RRRPAR------HRPHG------------
pp036539_Pp1s31 VP-----------------------GIPAE--GVQYGGMY---YPPMPGQPMHHP-MGAP
gm027778_Glyma1 VP----------------------VTGPPE--ALPY---C---YMPP-------QQVGAA
gm055597_Glyma2 VP----------------------VTGPAE--ALPY---C---YIPPQ----HAQQVGAA
Os030536_Os08t0 ------------------------MGSQAASMVSPY------------------------
pp005481_Pp1s37 -------------------------GGGGE--QVQYGGMF---YPSMPPQSVHYP-MGAP
pt001546_POPTR_ MP----------------------VGGPVD--ALSY---C---YMPPP----HAPQVGAP
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pt036437_POPTR_ IP----------------------VGPPAD---LPY---Y---YVPQ------HP-VGPP
pt042230_POPTR_ LP----------------------VGGPAD--ALPY---Y---YMPPQL----APQVSAP
gm021377_Glyma0 IAQNF------------------DLSMPPH-QNVTYPP-Y---YVP--------------
pp036538_Pp1s31 VP-----------------------GIPAE--GVQYGGMY---YPPMPGQPMHHP-MGAP
Sb015279_Sorbi1 LPP--------------------AMGAPADHSSYPY---Y---YVPAQ----QVP-----
pp005482_Pp1s37 ------------------------------------------------------------
gm036665_Glyma1 -----------------------TSTVPTP-LNDAC---Y---HNPPPQA--LVP--GNP
pp005616_Pp1s15 V--------------------------PAD--GVQYGGMY---YPPMPGQPI-HP-MRAP
Sb030598_Sorbi1 TAKD---------------------------DDDSYGDYYWDDYSPP-----WSPEPPSP
gm053118_Glyma1 MP----------------------VAGPAD--ALPY---C---YMPPQ----HASQVGAA
pp036540_Pp1s31 VP-----------------------GIPAE--GVQYGGMY---YPPMPGQPMHHP-MGAP
Os031976_Os08t0 IPHP-------------------AAGLPAT-DPMAY---Y---YVQPQ------------
gm036664_Glyma1 -----------------------TALTPTE--NVPY---Y---QMPPHQS--LVP--GPP
pt014120_POPTR_ MP----------------------VGGPVD--ALPY---C---YMPHP----HAPQVGTP
pt034313_POPTR_ LP----------------------VGGPPD--ALPY---Y---YMPHQL----APQVSAP
Sm020043_Selmo1 L-----------------------------------------------------P-IGAP
gm008069_Glyma0 MP----------------------VAGPAD--ALPY---C---YMPPQ----HPSQVGAA
gm021542_Glyma0 IPL---------------------VGSPAD---MPY---Y---YVPPQ-----HPVVGPP
pp005480_Pp1s37 -------------------------GGGGE--QVQYGGMF---YPSMPPQSVHYP-MGAP
Os025982_Os06t0 LPP---------------------LGVPAD--SYPYG--Y---YVPQQ----QVP-----
Sb004169_Sorbi1 LPP---------------------MGAPAD--AYPY---Y---YMQQQ----QVP-----
Sb023436_Sorbi1 RSARRRKG---RRRGGRRSCCGCCCRDPAS-CRGSTG------HRPPR------------
gm036666_Glyma1 IAS----------------------------TENAY---L---NMPPQQN----------
AT3G48590.1 A------------------------------------------------GPG----GMMI
pt000315_POPTR_ --------------------------------------------------------GMIM
Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
pp016894_Pp1s40 AMM----------------------------------------------G------NQMF
Os006607_Os02t0 -------------------------------------------------GS-----GMMY
Sb031239_Sorbi1 -----LLL----------------------------------------------------
pp036539_Pp1s31 --------------------------------------------------------EMMV
gm027778_Glyma1 --------------------------------------------------------GVMM
gm055597_Glyma2 --------------------------------------------------------GVMM
Os030536_Os08t0 -----------------------TS------------------------GGM----GFSF
pp005481_Pp1s37 --------------------------------------------------------DVMV
pt001546_POPTR_ --------------------------------------------------------GMIM
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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gm021377_Glyma0 --------------------------------------------------------AMVT
pp036538_Pp1s31 --------------------------------------------------------EMMV
Sb015279_Sorbi1 -------------------------------------------------GA-----GMMY
pp005482_Pp1s37 --------------KVCF--------------------------KNLR--------GVMI
gm036665_Glyma1 Y-----------------------------------------------------------
pp005616_Pp1s15 --------------------------------------------------------RMMV
Sb030598_Sorbi1 DLR-----------------------------------------------------NVTC
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pp036540_Pp1s31 --------------------------------------------------------EMMV
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gm036664_Glyma1 Y------------------------------------------------GSS----GMVV
pt014120_POPTR_ --------------------------------------------------------GMIM
pt034313_POPTR_ --------------------------------------------------------GMTV
Sm020043_Selmo1 --------------------------------------------------------DMQY
gm008069_Glyma0 --------------------------------------------------------GVIM
gm021542_Glyma0 --------------------------------------------------------GMIM
pp005480_Pp1s37 VSIYWFVLESREYSKKCFSCCTQTATEIGIGLVISTRILHSWKEKLLRKGSSLREHALLL
Os025982_Os06t0 -------------------------------------------------GA-----GIAY
Sb004169_Sorbi1 -------------------------------------------------GP-----GMVY
Sb023436_Sorbi1 -----LLLC--------------AS-------------------------------AVMY
gm036666_Glyma1 -----------------------VA-------------------------------GLPY
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pt000315_POPTR_ G-NP---VDQAA-TYGAQQPRPP-----------MAFMPWPQP---------QPQQPQQR
Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
pp016894_Pp1s40 GARP-AMAMDPTAMYHPQQQQPQRPPMQYMQQQAPMQQMWPQ--------QTTQMPPTQH
Os006607_Os02t0 G----G-----------QQGHPV-------------TYVWQQPQ------EQQEEAPEEQ
Sb031239_Sorbi1 --RP---AAVTN-----LASLPWSLCGFYL-------------------VN---------
pp036539_Pp1s31 G-QP---GMPPN-PQMMYQP-PP-----------AAFAPEQQ------------QQQQQQ
gm027778_Glyma1 GNKP---VMDP---YA-QQTHPYN----------MAPQLWPQ----------PPPPPEQQ
gm055597_Glyma2 GNKP---VMDP---YA-QQSHPYN----------MAPQMWPQL--------LPPPPPEQQ
Os030536_Os08t0 DLYP-------------NQHHLA--------------YMWPPQE------QQEQWPPQEQ
pp005481_Pp1s37 V-QSTMPSNQPS-LYAANQQ--------------------------------GDMQ----
pt001546_POPTR_ G-KH---VMDPA-MYA-QQSHPY-----------MAQHMWPQ-------------GSEQQ
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pt036437_POPTR_ G-KP---VDQAA-AYEAQQPQPP-----------VALMPWLQ------------TQPQQQ
pt042230_POPTR_ G-KP---VVDQA-FYG-QQSRPY-----------VPQQIWPQ----------QTQQPPED
gm021377_Glyma0 G-RP---IPDQN-HHG-----P--------------------------------------
pp036538_Pp1s31 G-QP---GMPPN-PQMMYQP-PP-----------AAFAPEQQ------------QQQQQQ
Sb015279_Sorbi1 G----G-----------QQGQPM-------------TYMWQKPQ------VPEEEPSEEQ
pp005482_Pp1s37 I-HR---SQNLL-VWG--------------------------------------------
gm036665_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pp005616_Pp1s15 G-QP---AVPPN-PQMMYQS-PL-----------AVLAPEQQ------------QQPQQQ
Sb030598_Sorbi1 D-DP---------RYY-TYIHDY-----Y---------------------SL--------
gm053118_Glyma1 G-KP---VMDPN-MYA-QQSHPY-----------MAPQMWPQ-------------PPDQR
pp036540_Pp1s31 G-QP---GMPPN-PQMMYQP-PP-----------AAFAPEQQ------------QQQQQQ
Os031976_Os08t0 ------------------------------------------------------------
gm036664_Glyma1 G-MPVH-----------YQNHPG----------LQTPTMGPTPN------------PQNS
pt014120_POPTR_ G-KP---VTDPA-MYA-QQSHPY-----------MAQHMWPQ-------------GPEQQ
pt034313_POPTR_ G-KP---VVDQS-LYG-QQSRPY-----------VAQQIWPQ----------QTPQPPED
Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm008069_Glyma0 G-KP---VMDPN-MYA-QQ-----------------------------------------
gm021542_Glyma0 G-KPI-GAEQAT-LYSTQQPRPP-----------VAFMPWPHTQ------PLQQQPPQHQ
pp005480_Pp1s37 I-YH---SSQVF-SFGESSA--------------------------------FTPKPVSL
Os025982_Os06t0 G----G-----------QQGHP--------------GYLWQDPQ------EQQEEPPAEQ
Sb004169_Sorbi1 G----A-----------QQNHPV-------------TYLWQEPQ------EQQGQAPEEQ
Sb023436_Sorbi1 HHRP---VIVS-------------------------------------------------
gm036666_Glyma1 D-AP-------------TMAFPN----------------------------LNHHAPN--
AT3G48590.1 GNLDGQG----------
pt000315_POPTR_ QSDT-------------
Os034147_Os09t0 -----------------
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Os006607_Os02t0 HSLPESS----------
Sb031239_Sorbi1 -----------------
pp036539_Pp1s31 MQ---------------
gm027778_Glyma1 QSSPDQ-----------
gm055597_Glyma2 QSSPDQ-----------
Os030536_Os08t0 QEQKQKQDSDGGGQDE-
pp005481_Pp1s37 -----------------
pt001546_POPTR_ QSPSDH-----------
Sm021821_Selmo1 -----------------
pt036437_POPTR_ QSDP-------------
pt042230_POPTR_ S----------------
gm021377_Glyma0 -----------------
pp036538_Pp1s31 MQ---------------
Sb015279_Sorbi1 QQQSP------------
pp005482_Pp1s37 -----------------
gm036665_Glyma1 -----------------
pp005616_Pp1s15 LY---------------
Sb030598_Sorbi1 -----------------
gm053118_Glyma1 QSSPEH-----------
pp036540_Pp1s31 MQ---------------
Os031976_Os08t0 -----------------
gm036664_Glyma1 SRDSDS-----------
pt014120_POPTR_ QSPSDQ-----------
pt034313_POPTR_ S----------------
Sm020043_Selmo1 -----------------
gm008069_Glyma0 -----------------
gm021542_Glyma0 QTDS-------------
pp005480_Pp1s37 ILLVYISRVCFVAKVKF
Os025982_Os06t0 QSD--------------
Sb004169_Sorbi1 QSLHESG----------
Sb023436_Sorbi1 -----------------
gm036666_Glyma1 -----------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G48590.1 |
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Sb004169_Sorbi1 |
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Sb023436_Sorbi1 |
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gm036666_Glyma1 |
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