Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G48590.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os012186 |
not found in 246aa |
AT5G63470.2 |
1st_not |
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II |
Os006607 |
not found in 259aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
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III |
Os025982 |
not found in 250aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
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III |
Os031976 |
not found in 205aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
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III |
Os034147 |
not found in 136aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.583617747 |
III |
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not found in 249aa |
AT1G56170.2 |
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III |
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AT5G63470.2 |
1st_not |
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not found in 253aa |
AT1G56170.2 |
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Sb004169 |
not found in 255aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.604095563 |
III |
Sb031239 |
not found in 365aa |
AT5G63470.2 |
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III |
Sb023436 |
not found in 328aa |
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III |
Sb030598 |
not found in 231aa |
AT1G56170.2 |
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III |
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not found in 229aa |
AT3G48590.1 |
1st_1st |
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Ia |
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AT3G48590.1 |
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II |
Gm010282 |
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AT3G48590.1 |
not_1st |
0.819112627 |
II |
Gm053118 |
not found in 294aa |
AT1G08970.2 |
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III |
Gm008069 |
not found in 303aa |
AT1G08970.2 |
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0.634812286 |
III |
Gm027778 |
not found in 237aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.624573378 |
III |
Gm021542 |
not found in 271aa |
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not_not |
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III |
Gm055597 |
not found in 263aa |
AT1G08970.2 |
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III |
Gm021377 |
not found in 205aa |
AT1G08970.2 |
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III |
Gm036665 |
not found in 209aa |
AT1G08970.2 |
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III |
Gm036664 |
not found in 243aa |
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III |
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AT1G54830.3 |
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III |
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Ia |
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not found in 237aa |
AT3G48590.1 |
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II |
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not found in 266aa |
AT1G56170.2 |
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III |
Pt042230 |
not found in 226aa |
AT1G08970.2 |
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III |
Pt034313 |
not found in 258aa |
AT1G08970.2 |
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III |
Pt014120 |
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AT1G08970.2 |
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III |
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AT1G08970.2 |
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0.607508532 |
III |
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1st_not |
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AT1G56170.2 |
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AT1G56170.2 |
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Pp013243 |
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Pp036539 |
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AT1G56170.2 |
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Pp005482 |
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AT1G56170.2 |
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AT1G56170.2 |
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Sm020043 |
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Sm021821 |
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AT5G63470.2 |
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0.535836177 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT3G48590.1 ------------------------------------------------------------
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Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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pp013245_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
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Sb023436_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
gm008069_Glyma0 MRRNRSHSFCSSTSLSEVLDSQCLRSAASSFREEKDTLVSFSHGACVILEHCIRGPFFIP
gm021377_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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Sb023436_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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gm021377_Glyma0 ------MDQ----------------------------------NQHGQPTQEA-------
Os025982_Os06t0 ------MEP----------------------------------SSQPQPAIGVVAGGSQV
pp005481_Pp1s37 ------MRALAGSFNREF-----------------------AGAEVWRESL-----AAAV
gm027778_Glyma1 ------MDHQG-----------------------------HGHGHGQNPSMGVVGNGPQF
Os012186_Os03t0 ------MDNQ-------------------------------QLPYAGQPAA---------
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pp005480_Pp1s37 ------MRALAGSFNREF-----------------------AGAEVWRESL-----AAAV
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Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Os006607_Os02t0 ------MEP----------------------------------SSQPQPVMGVATGGSQA
Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
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Sm006602_Selmo1 -----------------------------------Y------------------QQMQQQ
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pp013243_Pp1s15 -----PPSSAPQM-S-HPGAVMP------L--QMHYPQAQQ-----QMMPQLGDQQMQPQ
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Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pp013244_Pp1s15 -----PPSSAPQM-S-HPGAVMP------L--QMHYPQAQ--------------QQMQPQ
pt027792_POPTR_ I-TTTPPLPPAG-----GAPSST------------------------------------P
pp005482_Pp1s37 A-MASNQHGLASL-S-SAKPQSS------AGATTTAQQSF------QQGKHQMQGQGQMN
Sb004169_Sorbi1 Y--PASAYPPAAT-V-A-APAV-------ASAGLQSAQPFQANPAHTSAQHQIVYQQAQQ
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Os030536_Os08t0 --YAVTTYQPVLM-VEPSAAAA-------FPPAPQVAPAYPVNPM-QLPEHQ---QHAIQ
pp013245_Pp1s15 -----------------------------------------------MMPQLGDQQMQPQ
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gm036664_Glyma1 ------QYQSNPM----MAPTILPT----QTYGHSLSSSYP-------RLHPYDPQ----
Sb023436_Sorbi1 ----KAPSSSSSS-SAPNPPPRLAT-------GHNPSCPRIHG-----------------
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Os012186_Os03t0 --------------AGAGAPVPG------VPGAGGPPAVP--------------------
pt034313_POPTR_ P-YGMASYQPNQM-MGPSATGSV-------QSPTQPAVLAA--ASAQLAQHQLAYQ---H
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pp036540_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
pp005480_Pp1s37 A-MASNQHGLASL-S-SAKPQSS------AGATTTAQQSF------QQGKHQMQGQGQMN
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gm010283_Glyma0 Q-AQSGPYP-GGAGGSAGAGAGA---------------------------------GAAP
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pp016894_Pp1s40 M-GTQQPYQGSQT-V--GGPDTS------PSQGGQMQGQSP-----AAYPAALAQQQQVQ
pt014120_POPTR_ G-YGTNPYQPNQM-PAASNPGSV---------PGQPA-------GAQLEQHQLAYQ---Q
pt042230_POPTR_ ------------M-MGPSATGSL-------QSPTQPAVLTA--SSAHLAQHQLAYQ---H
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pp015077_Pp1s51 M-GMQQSYQGPQS-L-GGGPETS------PSQGGQIQGQSP-----GAYPTALAQQQQAQ
pp005616_Pp1s15 -----PPSSTAQM-SPHAAPTIR------LQQQMHYPNHA---------PH---QQQQLQ
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gm015491_Glyma0 FQH--LLQQQQQQLQMFWSYQRQEIEHVN--------------DFKNHQLPLARIKKIM-
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* : :
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: : :
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: : :
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Sb021895_Sorbi1 -LVGLHDLLDP-------GQRQLVVLEVRRR------RA-LR-LLALVRPERLQLGLLLL
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Sb023436_Sorbi1 GLRDVHPRAHPPRLGARRGEQAPHASEVRHCRCHRPHRG-VR-LPRGHRSARRRKG----
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Sb015279_Sorbi1 FLVDIIPR-----------------DEM-KE------EG-LG-LP---------------
gm021542_Glyma0 FLVDIIPR-----------------DEL-KE------EG-LG-IT---------------
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*
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pp005482_Pp1s37 ------------------------------------------------------------
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pp013245_Pp1s15 ---------WTGVP----G----DG--SVPYGGIF---YPPMAGQQMHHS-MGAP-----
Sb021895_Sorbi1 EQVVVRHRRRAG-----CAG-HARH---------Y---WGSSGG---RGLAGGVG-----
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gm036666_Glyma1 ---------RTSIAST-----------ENAY---L---NMPP-----QQNVAGLP-----
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