Input
| Putative repression domain
|
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AT3G50260.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os019236 |
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III |
Pt038369 |
not found in 158aa |
AT1G46768.1 |
not_not |
0.519434628 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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gm039398_Glyma1 MEDR---DHCCSNNSTMITTTKKRTGRRSP---------TSDKLKNQHR--------EKQ
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Sb030094_Sorbi1 RDGRE-GS------------------------------------QENHA-------NAKS
Os019235_Os04t0 MQ----GEYHRSSSEDSAASAAAAAAAAAAAMAPLAAAAAAVAAKEEQAAAAAVLPLQQQ
:
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. * ::* *. ** .** *:
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:*: :.*
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Os019235_Os04t0 A------------------------AARAYDTAVFYL---RGRSARLNFPEEISSLA---
* **:*: . * ** . *.. :
AT3G50260.1 ------------------------------------------------------------
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pt016489_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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gm039398_Glyma1 AAG-----N-----------MSADSIRRK---ATQVGARVDALQTAL-------------
pt001651_POPTR_ SYG-----D-----------MSAASIRKR---ATEVGARVDAFETALN------------
Sb030094_Sorbi1 PAAPPRAPEAPPPPPPPPPPAAAACPRARGGGAPPAGAEAVAAAASV---------ER--
Os019235_Os04t0 GASEPREPDG--------GTLSAASIRKK---AIEVGSRVDALQTGMMVAPTTHHRERQK
. :* * : *
AT3G50260.1 -----VQNNKR----------RRVFSQKRDFGGG---------------LLELVDLNKL-
pt038369_POPTR_ ------HASPG----------------DNSP-A------------NRLLLSEKPDLNEY-
pt016489_POPTR_ ------HASPE----------------DNS----------------RVLLSEKPDLNKF-
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gm047356_Glyma1 -----HRQHPH-------------------------------ALPAGEFADR-VDLNKM-
gm008859_Glyma0 ------QQSSS----------------SHSANS------------SHVSSSDKPDLNEY-
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gm014043_Glyma0 ------QQSSS----------------THSISS------------SHV-SYEKPDLNEY-
gm029915_Glyma1 ----------------------------LSASC---------GGGSGDFAVRVVDLNKM-
gm011914_Glyma0 -----HRQDPH-------------------------------APPAGEFADR-VDLNKI-
gm039398_Glyma1 -----HHHAPS----------------TNS-------------------LNLKPDLNEF-
pt001651_POPTR_ -----HHHHRHHD--------DRQRNSSNSTSSND---NNETVVDSRELKSRPVDLNKV-
Sb030094_Sorbi1 -----ARQEPGSKPGAEPRELRRRVTSERASDTARLNVNDDVRYRLFPFPRRRPALQHMP
Os019235_Os04t0 HHHHHHHHHPHLQPHGEEQHHHHEQKHQRTAWSG---------------RAKNPDLNQA-
*:.
AT3G50260.1 ---PDPENLDDDLVGK-----------
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pt016489_POPTR_ ---PENSDEE-----------------
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gm011914_Glyma0 ---PEPENSDCDYWGGD----------
gm039398_Glyma1 ---PKLEELQD----------------
pt001651_POPTR_ ---PDPEDSDGDEWERSLATGGNPMGC
Sb030094_Sorbi1 LSSPSPRTYDDPS--------------
Os019235_Os04t0 ---PSPENSDAE---------------
*.
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G50260.1 |
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