Input
| Putative repression domain
|
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AT3G50260.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os023742 |
not found in 184aa |
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not found in 233aa |
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AT2G23340.1 |
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AT1G46768.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT3G50260.1 -------MDA--------------------------------------------------
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Sb030094_Sorbi1 RDGREGSQENHANAKSSCRYHCCCCCCTCLHNPQPPSAGPQVRASEREREKRQRLQQPAK
gm029915_Glyma1 -------MEG-EG--------------------------------------------RRR
pt038369_POPTR_ -------ME-----GECY------------------------------TSPSASSSTPTI
gm014043_Glyma0 -------MEE-AGLGDCC------------------------------SSNTTI---TRK
pt016489_POPTR_ -------ME-----GGCC------------------------------TSSTSTPSSTST
Os019236_Os04t0 -------MQG-E--YHRS------------------------------SSEDSAASAAAA
gm011914_Glyma0 -------MEG-EGG-----------------------------------------SATRK
pt001651_POPTR_ -------MES--GVDK--------------------------------------EMATRK
pt036987_POPTR_ -------MES--GVDK--------------------------------------DMATRK
:
AT3G50260.1 ----------------GVAVKADVAV--------KMKRERPFKGI----RMRKW-GKWVA
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Os023742_Os06t0 QPAAAAVRAPVGG--------------------RGGGGGRQYRGV----RMRKW-GKWVA
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gm047992_Glyma1 KTSRRSP--------TSDKLKNQHPC--------EKQAMKPYRGI----RMRKW-GKWVA
Sb033446_Sorbi1 PGGWRGTPLP--------SARRRSPRR---LPRFRCRPRRCWAPVVERLRRRQGTAEAAA
gm039398_Glyma1 RTGRRSP--------TSDKLKNQHR---------EKQSMKPYRGI----RMRKW-GKWVA
Sb030094_Sorbi1 AGAHAGR-VPVFQ--RGVGGRGRGSSS---SSRSRCHGSSCGR------RSRRG------
gm029915_Glyma1 EGGERET--------ATAAATRKVV---------EGADQRRYKGI----RMRKW-GKWVA
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Os019236_Os04t0 AAAAAAAMAPLAAAAAAVAAKEEQAAAAAVLPLQQQQPRRQYRGV----RMRKW-GKWVA
gm011914_Glyma0 RGKDGET--------ET---------------------TTRYKGI----RMRKW-GKWVA
pt001651_POPTR_ RGGMGS--------------------------------ERQYKGI----RMRKW-GKWVA
pt036987_POPTR_ RGGMES--------------------------------ERQYKGI----RMRKW-GKWVA
* *:
AT3G50260.1 EIREPNKRSRL------------W---------LGS------------------YSTPEA
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Os023742_Os06t0 EIREPNKRSRI------------W---------LGS------------------YSTAVA
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Sb033446_Sorbi1 EVEEEEEEGGSIAAFGCASGASGWRRSASRTSGRGSGWVPTPPPSPPRAPTTRPCSTSAA
gm039398_Glyma1 EIREPNKRSRI------------W---------LGS------------------YTTPVA
Sb030094_Sorbi1 -----EDGGGA----GCDGGG----RCGGAAAGVGA-------PAPPAAD-----AAASA
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pt016489_POPTR_ EIREPNKRSRI------------W---------LGS------------------YSTPIA
Os019236_Os04t0 EIREPHKRTRI------------W---------LGS------------------YATPVA
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pt036987_POPTR_ EIREPNKRSRI------------W---------LGS------------------YSTPVA
.. *: ::. *
AT3G50260.1 AAR---------------------------------------------------------
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pt036987_POPTR_ AAR---------------------------------------------------------
..*
AT3G50260.1 -----AYDTAVFYLRGPTATLNF-------------------------------------
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Sb030094_Sorbi1 PLAV-AVGGRA---RGRGDRPRRRWWRRRHAVRGVHPEEGHRGGVPRGRAPDRHDGAPAA
gm029915_Glyma1 -----AYDTAVFYLRGPSARLNF-------------------------------------
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gm011914_Glyma0 -----AYDTAVFYLRGPSARLNF-------------------------------------
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pt036987_POPTR_ -----AYDTAVFYLRGPSARLNF-------------------------------------
* . . **
AT3G50260.1 --------------PELL----------PCT-----SAEDMSAATIRKKATEVGAQVDAI
Os019235_Os04t0 --------------PEEISSLASLSEGGGASEPREPDGGTLSAASIRKKAIEVGSRVDAL
gm047356_Glyma1 --------------PELVAAEGPAAD--------------MSAASIRKKATEVGARVDAL
gm001918_Glyma0 --------------PELLVREGPAALV---------AGCDMSAASIRKKATEVGARVDAL
Os023742_Os06t0 --------------PDQLDGAGGGGAGAGGAE----DHRELTAAVIRKKAAEVGARVDAQ
gm008859_Glyma0 --------------PELLSQDDDV----STQQQ-----GNMSADSIRKKATQVGARVDAL
gm047992_Glyma1 --------------PELLFQDDQEEGNDSVQHG--AAAGNMSADSIRRKATQVGARVDAL
Sb033446_Sorbi1 --------------PPPSARRRPRSAPASTRST--AALALASLAAVLPLRSRCRPTIAAA
gm039398_Glyma1 --------------PELLFQDDDQEGSDSVQHG---AAGNMSADSIRRKATQVGARVDAL
Sb030094_Sorbi1 PPRAPEAPPPPPPPPPPAAAACPRARGGGAPPA--GAEAVAAAASVERARQEPGSKPGAE
gm029915_Glyma1 --------------PELLIGEGAAALT---------GGCDMSAASIRKKASE--------
pt038369_POPTR_ --------------PDLIHQEDEL--------------CDVSAASIRKKATEVGAKVDAL
gm014043_Glyma0 --------------PELLSQDDDV----STQQQ-----GKMSADSIRKKATQVGARVDAL
pt016489_POPTR_ --------------PDLIYQEDEL--------------RDVSAASIRKKATEVGAKVDAL
Os019236_Os04t0 --------------PEEISSLASLSEGGGASEPREPDGGTLSAASIRKKAIEVGSRVDAL
gm011914_Glyma0 --------------PELLAAEGPAASD---------A--VMSAASIRKKATEVGARVDAL
pt001651_POPTR_ --------------PEFLAGENFSCGG---------SYGDMSAASIRKRATEVGARVDAF
pt036987_POPTR_ --------------PEVLAAEGFGGGG---------SCGDMSAASIRKRATEVGAHVDAI
* : : .
AT3G50260.1 GATV----------------VQNNKR------------------RRVFSQK----RD---
Os019235_Os04t0 QTGMMVA---PTTHHRERQKHHHHHHHHHPHLQPHGEEQHHHHEQKHQRTAWSG------
gm047356_Glyma1 HRQ-----------------HPHALP----------------------------------
gm001918_Glyma0 QATL----------------HHHYVPP-----------------RQLLSGG-GG------
Os023742_Os06t0 HSVVGAAAPVPL--------QPPQPPPPQ---------------RR--------------
gm008859_Glyma0 QTAL----------------QQSSSS---------------------HSAN---------
gm047992_Glyma1 QTAL----------------HHHAS-----------------------STN---------
Sb033446_Sorbi1 PRTP----------------------------------------TSTGSPP----R----
gm039398_Glyma1 QTAL----------------HHHAP-----------------------STN---------
Sb030094_Sorbi1 PREL----------------------------------------RRRVTSE----R----
gm029915_Glyma1 ----------------------------------------------LLSASCGG------
pt038369_POPTR_ QTAL----------------HASPGD---------------------NSPA---------
gm014043_Glyma0 QTAL----------------QQSSST---------------------HSIS---------
pt016489_POPTR_ QTAV----------------HASPED---------------------NS-----------
Os019236_Os04t0 QTGMMVA---PTTHHRERQKHHHHHHHHHPHLQPHGEEQHHHHEQKHQRTAWSG------
gm011914_Glyma0 HRQ-----------------DPHAPP----------------------------------
pt001651_POPTR_ ETAL----------------NHHHHR--------------HHDDRQRNSSNSTSSNDNNE
pt036987_POPTR_ ETAL----------------NHHHHHHHH----------LHHDDRQRNSNNSSSSNDNNE
AT3G50260.1 --FGGGLL---ELVDLN------------------------KLPDPENLDDDLVGK----
Os019235_Os04t0 ---------RAKNPDLN------------------------QAPSPENSDAE--------
gm047356_Glyma1 ----AGEF-ADR-VDLN------------------------KMPEPENSDCDYWDRD---
gm001918_Glyma0 ---GSGDF-PVRVVDLN------------------------KMPEPESSDCE-WDVN---
Os023742_Os06t0 ---------RTKNPDLN------------------------REPTPDTSDDE--------
gm008859_Glyma0 ----SSHVSSSDKPDLN------------------------EYPKPED------------
gm047992_Glyma1 ----S--L----KPDLN------------------------EFPKLESLQD---------
Sb033446_Sorbi1 ---------TPQTT----SDFVVVLLLPHPSTTLLVLR---QNYSPKG------------
gm039398_Glyma1 ----SLNL----KPDLN------------------------EFPKLEELQD---------
Sb030094_Sorbi1 ---------ASDTARLNVNDDVRYRLFPFPRRRPALQHMPLSSPSPRTYDDPS-------
gm029915_Glyma1 ---GSGDF-AVRVVDLN------------------------KMPEPESSDCE-WNVN---
pt038369_POPTR_ ----NRLL-LSEKPDLN------------------------EYPENCDEE----------
gm014043_Glyma0 ----SSHV-SYEKPDLN------------------------EYPKPED------------
pt016489_POPTR_ -----RVL-LSEKPDLN------------------------KFPENSDEE----------
Os019236_Os04t0 ---------RAKNPDLN------------------------QAPSPENSDAE--------
gm011914_Glyma0 ----AGEF-ADR-VDLN------------------------KIPEPENSDCDYWGGD---
pt001651_POPTR_ TVVDSREL-KSRPVDLN------------------------KVPDPEDSDGDEWERSLAT
pt036987_POPTR_ TVVDSREL-KPRPVDLN------------------------KVPDPEDSDGDEWKRS---
AT3G50260.1 -------
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Os023742_Os06t0 -------
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gm047992_Glyma1 -------
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Sb030094_Sorbi1 -------
gm029915_Glyma1 -------
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gm014043_Glyma0 -------
pt016489_POPTR_ -------
Os019236_Os04t0 -------
gm011914_Glyma0 -------
pt001651_POPTR_ GGNPMGC
pt036987_POPTR_ -------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G50260.1 |
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