Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G50700.1 |
AIVPHGLGLGLPCGGE at 368/452 in AT3G50700.1 |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Gm044710 |
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III |
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III |
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III |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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::**.*** ***.:**:****.:*
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:*****:** * *** ********:*********: : .: :*:.*:*** :****:.
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:************:.********:*::*** ***:****** * ***:**:*.** :***
AT3G50700.1 RDSFITHRAFCDALAEENARSHHSQSKKQNPE------ILTRKNPVPNPV-PAPVDTESA
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:*.*********.*::*
AT3G50700.1 KI-----------------------------------KS-----SSTLTIKQS-------
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AT3G50700.1 --------------------SIEPISLGLST-------SHGSSFL--GSNRFHA------
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AT3G50700.1 ----QPAMSATALLQKAAQMGAASS---------------GGSLL----HGLGIVSS---
gm017012_Glyma0 TVP-NPHMSATALLQKAAQMGATMSRSGSTPAMTGPH--HHAHVS---HFGLNLSSRED-
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gm044710_Glyma1 ---PQPAMSATALLQKAAQMGAAAT---------------NASLL----RGFA-------
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gm052250_Glyma1 TS---AYMSATALLQKAATVGAA-AITGP-------------------------------
gm026861_Glyma1 NSKPASPMSATALLQKAAQMGST-------------R-STNPSIF---SGSFGVINSPS-
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AT3G50700.1 -----------------------------------TSTSIDAIVPHGL------GLGLPC
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:
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* *:**:
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gm052792_Glyma1 --------------------------------------RNWI-RN------------RIF
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gm007167_Glyma0 ------FGFLGTTTAPETWWN----------C----
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gm052250_Glyma1 -------GKIGNTTLP--------------------
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gm004033_Glyma0 ------FGFLGTTTGPEYWGNLSIDMCKYRICFLNI
gm035950_Glyma1 ------------------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G50700.1 |
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