Input
| Putative repression domain
|
|
AT3G53340.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os021976 |
not found in 129aa |
AT4G14540.1 |
1st_not |
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II |
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AT4G14540.1 |
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III |
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not found in 224aa |
AT4G14540.1 |
not_not |
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III |
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not found in 110aa |
AT3G53340.1 |
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II |
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AT4G14540.1 |
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III |
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AT4G14540.1 |
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AT4G14540.1 |
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AT3G53340.1 |
not_1st |
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II |
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AT3G53340.1 |
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II |
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not_not |
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III |
Gm028165 |
not found in 174aa |
AT2G37060.3 |
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0.729838709 |
III |
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AT5G47640.1 |
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AT5G47640.1 |
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AT4G14540.1 |
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AT5G47670.1 |
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AT2G13570.1 |
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AT4G14540.1 |
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AT5G47670.1 |
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AT2G47810.1 |
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AT1G09030.1 |
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II |
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AT3G53340.1 |
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II |
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AT3G53340.1 |
1st_1st |
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not found in 182aa |
AT3G53340.1 |
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AT3G53340.1 |
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II |
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AT3G53340.1 |
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AT4G14540.1 |
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AT4G14540.1 |
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AT1G09030.1 |
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AT1G09030.1 |
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not found in 177aa |
AT4G14540.1 |
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0.701612903 |
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Pp036936 |
not found in 218aa |
AT4G14540.1 |
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Pp018837 |
not found in 218aa |
AT4G14540.1 |
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Pp009284 |
not found in 218aa |
AT4G14540.1 |
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Pp009283 |
not found in 218aa |
AT4G14540.1 |
not_not |
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Pp009282 |
not found in 218aa |
AT4G14540.1 |
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Pp009281 |
not found in 218aa |
AT4G14540.1 |
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Pp009280 |
not found in 218aa |
AT4G14540.1 |
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Pp009279 |
not found in 218aa |
AT4G14540.1 |
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Pp038018 |
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AT4G14540.1 |
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Pp007159 |
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AT4G14540.1 |
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not found in 115aa |
AT5G47640.1 |
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II |
Sm017738 |
not found in 125aa |
AT4G14540.1 |
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III |
Sm007604 |
not found in 195aa |
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AT5G47670.1 |
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III |
Sm020598 |
not found in 88aa |
AT2G13570.1 |
not_not |
0.439516129 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb026432_Sorbi1 -----------------------LK---GPGGG--VVGAVHGGA---EHEMT-------G
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gm045576_Glyma1 -----------------------ME-T-G---------GFHGYRKLPNTTAGLKLSVSDM
AT3G53340.1 -GGDQSPRS------LN----------------VREQDRFL---------PIANISR---
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. :.. : : : . :
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Sm007604_Selmo1 -------------------------------------------SLDGGMD----------
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pp038018_Pp1s25 -----------------------------NPYMQAQ-------MMTSGN-----------
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pp009283_Pp1s30 ----------------------------QQSY---------------GQ------QAPPG
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pt036929_POPTR_ -------NAGLYSLGTEVTA---------KSY---------------GQ------NTRFL
pt035613_POPTR_ ----------------------------SMNYIS--------------------------
gm055621_Glyma2 --------------------------------RS----------YTQGLV-TEFNKPIME
Sm020206_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm055239_Glyma2 ------------------------------------------------------------
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pp009279_Pp1s30 ----------------------------QQSY---------------GQ------QAPPG
Os004570_Os01t0 ------------------------------------------------------------
pp037984_Pp1s25 -----------------------------NPYMQAQ-------MMNPGN-----------
pp018837_Pp1s46 ----------------------------QQSY---------------GH------QSPLG
gm012840_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pp009284_Pp1s30 ----------------------------QQSY---------------GQ------QAPPG
pt006104_POPTR_ ------------------------VDQFGAM----------------AGV-GAYAPAFHV
Os028983_Os07t0 ----------------------------SAGY---------------AQ------PPP--
gm052458_Glyma1 --------------------------SQGVSY--------------TISQ----------
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pt035614_POPTR_ ----------------------------SMNYIS--------------------------
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Sm018351_Selmo1 -----------------------------------------------GE-----------
pp009280_Pp1s30 ----------------------------QQSY---------------GQ------QAPPG
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pp036936_Pp1s83 ----------------------------QQPY---------------AQ------QAPPG
pt035615_POPTR_ ----------------------------SMNYIS--------------------------
pt014326_POPTR_ ----------------------QIPEPTILEFRF----------L---------------
pp007159_Pp1s14 -----------------------PAELMLHSY---------------GNE-----PSPEM
gm028166_Glyma1 ----------------------------SLNYIG--------------------------
pt035616_POPTR_ ----------------------------SMNYIS--------------------------
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Sm020598_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sb010924_Sorbi1 GHGH---------GFLMPH------PQGGSHYLPY-PYEPT-YGGEHA--MAAYYGGA-A
Sb024092_Sorbi1 GY-----------PQP-------------PHHQMVMGGKGGAYGH---------------
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Sm018351_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pp009280_Pp1s30 MM--------YSPHQMM------------PQYQMPM------------------------
pt043409_POPTR_ -------------------------------LLATLS-----------------------
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Sb015253_Sorbi1 -------------TKVME------------------------FEGIA-------------
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pt035615_POPTR_ -------------PQVILSLFLSLLSLSYTHTHT--------------------------
pt014326_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp007159_Pp1s14 MYYL---------HHMRPP-----------------------Y-----------------
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pt035616_POPTR_ -------------PQVILSLFLSLLSLSYTHTHT--------------------------
gm045576_Glyma1 -H----------------------------HH------NGY-FGAA--------------
AT3G53340.1 ---------------------GTE------------------------------------
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Os022924_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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Sm007604_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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gm004139_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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pt029632_POPTR_ --GG-----------AGDSL-GRL-------------------------R----------
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pt015514_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Sb019135_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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pt000530_POPTR_ --NGDRN---------------SE-------------------------RARAAQLYHGV
pt001769_POPTR_ -------------PFSPNSIQKHL-------------------QHQ--DKVDPVE-----
pt001709_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp038018_Pp1s25 ------------------------------------------------------------
pt004980_POPTR_ -------------------------------------------------RPK--------
gm045775_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sb008970_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb003445_Sorbi1 AFVDAGGS--QHVGFHDDEASSST-------------------ENPPAGRPGSH------
pt041090_POPTR_ ---------------------GKTGLTKC------------------LAKN---------
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Os021976_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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Os024527_Os06t0 GEASSRGG-----CSAADEGSSSS--------SASPAPVGPNYE----------------
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Os005512_Os01t0 ------------------------------------------------------------
gm024076_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm021297_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Os013460_Os03t0 --PGGGGG-----GSSSSSGHGRQ------------------------NRGA--------
gm007396_Glyma0 ------------------------------------------------PE----------
gm023182_Glyma0 --GAIKGG-----PAYPGPG-SNA------------------------GRPR--------
Sb026432_Sorbi1 -------------CVS--------------------------------------------
Os028984_Os07t0 --GGGGGG-----GPSPSSGYGRQ------------------------DRL---------
gm019720_Glyma0 -------------PFSPNSIQNQL-------------------------RQQEQIDSVG-
pp009282_Pp1s30 -----------------QSG-GNQ------------------------PRGV--------
pp009283_Pp1s30 -----------------QSG-GNQ------------------------PRGV--------
gm026833_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm005596_Glyma0 -------G-----PTYPAPG-----------------------------RPR--------
pt036929_POPTR_ -----RI---------------SM-------------------------KSYVCSFNT--
pt035613_POPTR_ ------------------------------------------------EKDF--------
gm055621_Glyma2 ---------------SSNSGN---------------------------------------
Sm020206_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm055239_Glyma2 ------------------------------------------------------------
Sb001867_Sorbi1 --GGGGGG-----GSSSSSGLGRQ------------------------DRA---------
pp009279_Pp1s30 -----------------QSG-GNQ------------------------PRGV--------
Os004570_Os01t0 ------------------------------------------------------------
pp037984_Pp1s25 ------------------------------------------------------------
pp018837_Pp1s46 -----------------QSG-SNQ------------------------SRGL--------
gm012840_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pp009284_Pp1s30 -----------------QSG-GNQ------------------------PRGV--------
pt006104_POPTR_ -------------------GSSH---------AAALANVEAFAQHK--------------
Os028983_Os07t0 --GGGGGG-----GPSPSSGYGRQ------------------------DRL---------
gm052458_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pt041815_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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Sb032742_Sorbi1 ---------------------SN-------------------------------------
Os009649_Os02t0 MYAPGSGG-----DGSGSSGSGG---------AGTPQTVNFEHQHPFGYK----------
gm048942_Glyma1 --GAIKGG-----PVYPGPG-SNA------------------------------------
gm031085_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sm020598_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm007397_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm006497_Glyma0 ---PSSQG--FYRDDASSSGSEQ---------------VHAYMFHLVS------------
pt017365_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm041932_Glyma1 ---------------TTGSA-SSA-------------------------RTR--------
Sm017738_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm019412_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Sb010924_Sorbi1 AYAPGNGG--GSGDGSGSSGGSASHTPQG---SGGFEHPHPFAYK---------------
Sb024092_Sorbi1 -----GGG-----SSSSPSGLGRQ------------------------DRL---------
pp037985_Pp1s25 ------------------------------------------------------------
Sm018351_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pp009280_Pp1s30 -----------------QSG-GNQ------------------------PRGV--------
pt043409_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm012959_Glyma0 -------------TFSPNSIQSQL-------------------------RQQDQIDS---
gm028165_Glyma1 ---------------------GHE------------------------------------
Sb015253_Sorbi1 --GEEENG-----GVQRGRGFANNHL------HGAVQW----------------------
pp036936_Pp1s83 -----------------QSG-GNQ------------------------PRGV--------
pt035615_POPTR_ ------------------------------------------------EKDF--------
pt014326_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp007159_Pp1s14 ------------------------------------------------------------
gm028166_Glyma1 ---------------------GHE------------------------------------
pt035616_POPTR_ ------------------------------------------------EKDF--------
gm045576_Glyma1 --MPMGT---YVREAPPNTASSHHHHHHHHHHARGISNA-----HEPNARSI--------
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gm045576_Glyma1 ----
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G53340.1 |
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pp007159_Pp1s14 |
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