Input
| Putative repression domain
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AT3G56220.1 |
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Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
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| Type
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Os012952_Os03t0 ------------------------MMSSR---------------ERKK-AAALQEKLQIL
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gm026246_Glyma0 -------------------------MAA----------------SREKRRASLEETLQQL
: . :
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. . : ::::
AT3G56220.1 EKINNATTSEQSFR-------ESS-DP-N--P-MVTVETL----EKGFMIKVMSRKNE--
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Sb021553_Sorbi1 --LRQELPGAARLRPGSLRRARAQ-RP----P------------GHRLLRRLLPPRGCGR
gm040411_Glyma1 QELNQ-LAVAAAQK-------DIEYGPVM--P-MLKVEPQ----EEGFMIKVLSQRSC--
pt014837_POPTR_ EKLNQDVATAASFTS----------QN-F--P-TIRVEEQ----ENDFLIKVFTARNC--
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pt012554_POPTR_ ERLNQDIATAASFTG----------EN-F--P-TIRVEEQ----EDDFLIKVFTTRNC--
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Sb006945_Sorbi1 VRLKQEMACEEAEAAGA---LLKH-SS-SPSP-VVTVETLAGAGKHGFLINVLSDKSC--
gm005153_Glyma0 ERLNQEIASAETS--------SVH-NP-L--P-MVTVETL----EKGFLINVFSAKGC--
Os012952_Os03t0 VRLNQEIACAQ-DA-------LRQ-NR-------VTVETL----RHGFLVNVFSGKSC--
pt044139_POPTR_ DRLKKEIGTSSTP----------Q-NS-L--PAQVTVENL----EKGFLINVFSGKNC--
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gm026246_Glyma0 EGLNSELEIAESST-------TTQIDE-L--P-MVIVKTL----KKGFLINVLLEKNC--
:. : .:
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Sb021553_Sorbi1 RERGGQRG------RARREAGRPAGRQELLRER---------QRAG-RGVSRGQADERVS
gm040411_Glyma1 ------LGLLAFILEAFERLG-----LEVLQARASCVESFSLEAFG-IKEKNDDT-HRVD
pt014837_POPTR_ ------QGLLVFILEAFEELG-----LEVLQARVSTSDSFHLEAIA--TRENKEAEDHID
gm001328_Glyma0 ------PGMLGAILDAFEELG-----LDVLDARVSCEDTFQLEAVG--GEVRE-------
gm048450_Glyma1 ------PGLLVSILESFEEMG-----LHVLEARVTCKDTFRFHAVG--GKNEEQGDEDID
pt012554_POPTR_ ------QGLLVFILEAFEELS-----LEVLQARVSTSDSFILEAIA--TRENKEADDHID
gm048769_Glyma1 ------QGLLVFILEAFEELG-----LDVLQARVSCAHSFSLEALG-NKENNEDT-RPLD
Sb006945_Sorbi1 ------PGLLVSILEAFDELG-----LSVLQATASCADTFRLEAVG--GENQV---DNVD
gm005153_Glyma0 ------SGLLVSILEAFEEMR-----LTVLEARVSCTDTFRFQAV---GENEEQV-ETID
Os012952_Os03t0 ------PGLLVSILEAFDELG-----LSVLEATASCTDTFRLEAIG--SENLM---EKVD
pt044139_POPTR_ ------PGLLVSILEAFEELG-----LDVLDARVSCEDNFQLEAIG--GDQNQGH----D
gm049953_Glyma1 ------PGMLVSILETFEELG-----LDVLDARVSCEDSFQLEAVG--RESHKN--DSVD
gm026246_Glyma0 ------PGMLVSILEAFEELG-----LDVLDARVSCEDSFQLEAVG--RESHKN--DSVD
* : :: .
AT3G56220.1 AEAVKQAV-------------------AEAI--RTWSDSHA------------
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Sb021553_Sorbi1 THQASTCIGRTSSCPGPYVVVLR----IHELS-RDPLYASSSVPSL-------
gm040411_Glyma1 AQVVEQVV-------------------SQAI--NDWRKVTKQC----------
pt014837_POPTR_ TQVVKQVV-------------------LQGI--QKWIEVSEQE----------
gm001328_Glyma0 ---------------------------YTRI--YNV-----------------
gm048450_Glyma1 AQAVKQAM-------------------GQAI--KNWSQNADQK----------
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gm048769_Glyma1 AQLVEQVV-------------------SQAI--QNWREVSQI-----------
Sb006945_Sorbi1 EHVVKQAV-------------------LQAM--RTCSSQGCRQQQE-------
gm005153_Glyma0 AHVVKQAV-------------------VQAI--KNWSKSGDQEE---------
Os012952_Os03t0 EHVVKQAV-------------------LRAI--RSCSGSGGDHHDDDDDDDDE
pt044139_POPTR_ AQVVKQAV-------------------LQAI--HNWNEGS-------------
gm049953_Glyma1 AQVVKQAVYLFND---PYILIWLINIFLDSA--K-------------------
gm026246_Glyma0 AQVVKQAV-------------------LQAI--KNAD----------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT3G56220.1 |
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