Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G02670.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Sb022090 |
not found in 676aa |
AT5G66730.1 |
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II |
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not found in 498aa |
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0.471819645 |
III |
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not found in 747aa |
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III |
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not found in 935aa |
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III |
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not found in 533aa |
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III |
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb010447_Sorbi1 --------------------------------------------------MPVV------
Sb008185_Sorbi1 HHQQEF-------------LQAEAAA-AADRESSMSNLTSSANAAPAAAAVPPPPAAG--
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Sb022090_Sorbi1 ---------FC--ESEDSGMEVETT--PTTAVSS----------SGGAAQLPPPGP----
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Sb001226_Sorbi1 AEEEPNKAAGTKRKRSQPGNP----DPGAEVIALSPRTLVATNRFVCEICNKGFQRDQNL
Sb027913_Sorbi1 -----------KKKRNLP-------DPDAEVIALSPKTLLATNRFVCEVCNKGFQREQNL
Sb010447_Sorbi1 -----------KKRRGHPGIL----DADVEVVALSPKTLLATNRYICEVCHKGFQRDQNL
Sb008185_Sorbi1 ---------NNKRKRSLPGNP----DPEAEVVALSPATLMATNRFVCEICGKGFQRDQNL
Sb024000_Sorbi1 EQEAVP--APVKKKRNLPGTP----DPDAEVIALSPGTLLATNRFVCEVCGKGFQRDQNL
Sb029787_Sorbi1 -----------KKKRTMP-------DPDAEVIALSPKTLLATNRFVCEVCNKGFQREQNL
Sb009276_Sorbi1 ---PPT----VKKKRSLPGTP----DPSAEVIALSPRTLMATNRFVCEICHKGFQRDQNL
Sb022090_Sorbi1 ---------PAKKKRALPGMP----DPDAEVIALSPKTLLATNRFVCEICNKGFQRDQNL
:. .**:**** :*:****::**:* *****:***
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Sb008185_Sorbi1 QLHRRGHNLPWKLKQRGT------------GKEA-QRKKVYVCPEASCVHHDPARALGDL
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Sb022090_Sorbi1 QLHRRGHNLPWKLRQRSG-------------KEA--RKRVYVCPEPSCVHHDPSRALGDL
***********:*::: :::**:*** * ** :******
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Sb008185_Sorbi1 TGIKKHFFRKHGEKKWKCDKCSKKYAVHSDWKAHSKICGTREYKCDCGTIFSR-------
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Sb029787_Sorbi1 TGIKKHFCRKHGEKKWKCDKCSKRYAVQSDWKAHSKICGTREYRCDCGTLFSR-------
Sb009276_Sorbi1 TGIKKHYCRKHGEKKWKCERCAKRYAVHSDWKAHAKVCGTREYKCDCGTVFSR-------
Sb022090_Sorbi1 TGIKKHFCRKHGEKKWKCDKCSKKYAVQSDWKAHVKTCGSREYRCDCGTLFSR-------
******: ******:* * :* * ***::* *** * **:::*:**** :*:*
AT4G02670.1 ------KDTFITHRAFCDALAEES--AR---LHSTSSSNL-------TNPNPN---FQGH
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Sb010432_Sorbi1 ------KDSFITHRAFCDALAEDN--SRAN------------------------------
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Sb031033_Sorbi1 ------RDSFITHRAFCDALAQES--AR---VPPIG------AGMY-G---TG---GMAL
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Sb001226_Sorbi1 ------KDSLLTHRAFCDALAEES--ARL--LAAANNS----------------------
Sb027913_Sorbi1 ------RDSFITHRAFCDALAQES--AR---LPPPGLTA---SHLY-GATSAA---NMGL
Sb010447_Sorbi1 ------KDSFITHRAFCDALAEDN--SKVN------------------------------
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Sb009276_Sorbi1 ------RDSFVTHRAFCDALAQEN--NKL--SQPMNMA----------------------
Sb022090_Sorbi1 ------RDSFITHRAFCDALAEESAKARVE-APPA-------------------------
:*:::******.** .:. :
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Sb006374_Sorbi1 ------------GLSGTVA--QM----HGF-ADQAGQSS---------------S-----
Sb001226_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb027913_Sorbi1 ------------SLSQVGS-HLA----STLGADAHSHH--QDLLRL------GGG-----
Sb010447_Sorbi1 --------------------H---------------------------------------
Sb008185_Sorbi1 --------------------H------P-L---------------LFSP-----------
Sb024000_Sorbi1 ---------------------------ENVDKDKDNDKGEEE----------NED-----
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Sb009276_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb022090_Sorbi1 -----------------------------------------E----------DGS-----
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Sb031033_Sorbi1 ---NPAAQF-------------EHLMQPSTGSPAFRGAQPTS--SSSSPFYLGG-----A
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Sb008185_Sorbi1 ---PPAA----------------HVMQQQQQVDV--------------ALLQDH-----H
Sb024000_Sorbi1 ---SAVAEVEEPQRVEVVPEEPQRIPSPPPL------PQEPPTHPSPPPLPQEPPRHQSP
Sb029787_Sorbi1 ---SIAARL-------------DHLLSP-NGASAFRSPQAPP--SSASFFLNAG-----A
Sb009276_Sorbi1 ---TVASALQGQA-------APHHLAPPSSS-------------SQPEDDLDAA------
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AT4G02670.1 ------------------------------------------------------------
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Sb006374_Sorbi1 PPAAQDFSEDG--SQGSQGPLLHG-KAP-----------------FHGLMQLPEQHHQPG
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Sb008185_Sorbi1 HHHQHQEVMQP--PPQQHCNYAMKTEMPP----------WPPAMAYDHSLMLPAA-----
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Sb022090_Sorbi1 PPAPHHAEQRN-EPEANATEPVQFAPPPP-------------------QVPVPVL-SQTT
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Sb027913_Sorbi1 AG--------------GPSAS----------------------------------SAPGL
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Sb024000_Sorbi1 VALVPNLDEPEVVAVPTVTAKIEDEADQDEDTCFQEADQYKDAELEVSNLLDKDTPMPPC
Sb029787_Sorbi1 AG--------------GPGA-----------------------------------SGPSL
Sb009276_Sorbi1 -------------SDADATAANQL-------------------------------LLPPL
Sb022090_Sorbi1 VS----------------------------------------------------------
AT4G02670.1 ------------------------------------------------------------
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Sb001226_Sorbi1 ----------------------------------------------------NPNNTLFF
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Sb010447_Sorbi1 DVMANLSN---------------TLI---------------------------TRNTTLF
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Sb024000_Sorbi1 L----LPSPSEAIGTDGSSTTC-------------------GAGGSVSNSIAPSTTTNTF
Sb029787_Sorbi1 FNLGFFANNGNSSG-SSHEHASQGLMNNDQFS-----G---GAGGGGGGGGSEVSAAGIF
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AT4G02670.1 ------------------------------------------------------------
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Sb027913_Sorbi1 S--GGGNFSGG---DHQVAPGG-------------------------MY----------N
Sb010447_Sorbi1 --------------SNQMSPKDSGFPL---------------DGSASSYPYM--------
Sb008185_Sorbi1 ----------------PPQPQL--------------------------------------
Sb024000_Sorbi1 ----AGLFASA---TTSTTSQ--SRSLRDLIGVDPTFLCLAIGA-PSMFPQTSASNSGTF
Sb029787_Sorbi1 ----GGNFVGG---GDQVPPPG-------------------------LY-----------
Sb009276_Sorbi1 SGVKAG--------LDGPSSSCD----------------------PSMGG---------A
Sb022090_Sorbi1 ----GGMFAPS---SMASAPQFPERALP----VKPPSLCLATDASSSIFSAPVSTERQQF
AT4G02670.1 ----------TAALSATALLQKATSLSST-------------------TFGGGGQTR---
Sb007023_Sorbi1 AKP----TAPAADMSATALLQKAAQMGAVTSG------------------SGNAMSMPPG
Sb010432_Sorbi1 -------PMNSPYMSATALLQKAAEMGAKTSQDPI---------------SPLLLKSFPS
Sb007168_Sorbi1 -------GAASAHMSATALLQKAAQMGATLSRPSNQGQMASTHSTTTTTNAGTGAAN-AA
Sb031033_Sorbi1 SSE----TVAPPQMSATALLQKAAQMGATTSS-------------------GNVNSLLRG
Sb006374_Sorbi1 SSP----SAGLAQNSATALLMKAAQMGSTSSTA---------------HNNGTTSTLFRA
Sb001226_Sorbi1 --------HVDASITTT----------TTTGG------------------GGILTDS---
Sb027913_Sorbi1 NDP----AVMLPQMSATALLQKASQMGSSASA------------------QGG-VSVFGG
Sb010447_Sorbi1 -------SMNSPYMSATALLQKAAVIGAKTSQDPI---------------SPLLLKSFPS
Sb008185_Sorbi1 -------PAASAHLSATALLQKAAQMGATIG------------------GAGTGYTQMAG
Sb024000_Sorbi1 APP------PAPHMSATALLQKATEAGATQSSSS------------FLKEFGLASSSLSS
Sb029787_Sorbi1 SDQ----ASMLPQMSATALLQKAAQMGATSST------------------NGGAASMFRG
Sb009276_Sorbi1 FSP----PGASASMSATALLQKAAEMGATAGG------------------YGVGAGF---
Sb022090_Sorbi1 APPPPPSPSPSPHMSATTLLQKAAQMGATSSSSS------------FLRGLGLDVSS-SS
. ::* :
AT4G02670.1 -------------------------------------------SIG--------------
Sb007023_Sorbi1 ALEPADI--------------------------GHHQSSDGAGGLLF-------------
Sb010432_Sorbi1 NVTTPSL-------------------------RDHMDISSGRQGYCLGNSAASSV-----
Sb007168_Sorbi1 AASNV--------------------------------PGTGAGALGFGAP----------
Sb031033_Sorbi1 LGNGGGT--------------------------LNGRPAAGAARFMAGESSSS-------
Sb006374_Sorbi1 VSFSA---------------------------------AAAAAASGQGTSRAA-------
Sb001226_Sorbi1 ------------------------------------------PVLSFG------------
Sb027913_Sorbi1 LVGSSAPS------------------------AMHARP----------------------
Sb010447_Sorbi1 NVTTPSP-------------------------RDHMDISSGSQGDSLGNSAANSI-----
Sb008185_Sorbi1 AATSA--------------------------------PGT-ASSFGLGLPGL--------
Sb024000_Sorbi1 PPSKQQPQGRIADTSTEPWQYRRNQQMEMERHQSHQRREMESSSQPWHPRSTQQMEMERH
Sb029787_Sorbi1 FVGSSSP---------------------------HVRPA---------------------
Sb009276_Sorbi1 ------------------------------------------STVGFGPMIGG-------
Sb022090_Sorbi1 PGA---------------------------------------------------------
AT4G02670.1 ----------------HHRHLTNVNEFLGV------------------------------
Sb007023_Sorbi1 --------SASSQQNATNLRLRGTDT----------------------------------
Sb010432_Sorbi1 -------GIMATEHEGSYMS--GHSNILTNTP----------------------------
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Sb031033_Sorbi1 -------RSTSQAENESQFR----------------------------------------
Sb006374_Sorbi1 -------GEGTTTSHEAHFH----------------------------------------
Sb001226_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb027913_Sorbi1 ---------PMLDQSQMHLQ----------------------------------------
Sb010447_Sorbi1 -------GIKAAEDEGSYMS--GRGNILMNTP----------------------------
Sb008185_Sorbi1 -------------QNAHHH---QQQDGAGV------------------------------
Sb024000_Sorbi1 HRNHQQREMESSSQQWHHHR--NHQQREMESSSQQWHHHRNDQQMVGLESYRSNQQMQME
Sb029787_Sorbi1 --------TPHMEQSDANLN----------------------------------------
Sb009276_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb022090_Sorbi1 ---------SSSGQPQHHHE--GAMQVSLP------------------------------
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Sb007023_Sorbi1 -------------------------------------------------TLIMSHLTAA-
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Sb001226_Sorbi1 -------------------------------------------------------LATDG
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Sb010447_Sorbi1 -----WVN--SYRPTTVPLIGLMNHPFG------------------MRAEKESSGLFSGS
Sb008185_Sorbi1 ------------------------------------------------MSAGLARTASSH
Sb024000_Sorbi1 SSSQRWLHPRSYQQQMEVDSSLQRWPHHRSNQQQMEMMERHHRSNQQQMERESRAMLSGG
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Sb007168_Sorbi1 |
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Sb031033_Sorbi1 |
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Sb006374_Sorbi1 |
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Sb001226_Sorbi1 |
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Sb027913_Sorbi1 |
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Sb010447_Sorbi1 |
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Sb008185_Sorbi1 |
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Sb024000_Sorbi1 |
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Sb029787_Sorbi1 |
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Sb009276_Sorbi1 |
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Sb022090_Sorbi1 |
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