Input
| Putative repression domain
|
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AT4G02670.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Gm038189 |
not found in 480aa |
AT3G13810.1 |
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III |
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III |
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III |
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not found in 475aa |
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0.484702093 |
III |
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not found in 455aa |
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III |
Gm040933 |
not found in 455aa |
AT3G13810.1 |
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III |
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III |
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0.478260869 |
III |
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III |
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III |
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III |
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III |
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0.460547504 |
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0.457326892 |
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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:***
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**:** * *****:****************: : : :::.*:*** .*.**...**
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**********: ****:***:*::*** ***:****** * ** ::*:****.:***:*:
AT4G02670.1 FITHRAFCDALAEESARLHS----------------------------------------
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*:** ***
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gm034301_Glyma1 ----LPLVNNIVKDNPN-----------------------------------L----QLI
gm003166_Glyma0 ----SPIFA---------TGGR-----------------------------------QYA
gm040933_Glyma1 --GPGPTLLPP-----------------------------------------------YQ
gm007760_Glyma0 ----FNYLQDS-------KNGGLI------------------------------------
gm001789_Glyma0 ----SSIFG---------TGRQERR--------------------------------QYA
gm052792_Glyma1 ----FNYLQDS-------ENGGLI------------------------------------
gm044710_Glyma1 ----SPIFA---------TGGQ-----------------------------------QYV
gm053099_Glyma1 ----INMLV---------ENGLL-------------------------------------
gm053468_Glyma2 -----NLFNLPFLSNR--------------------------------------------
gm033012_Glyma1 ----NNLYLSN-------------------------------------------------
gm021853_Glyma0 ----LPT-----------------------------------------------------
gm053467_Glyma2 SANNTNLFNLSFFPNTN-ASGSIINDQFSNMTGVT------NNNQGTAT--------LYS
gm054309_Glyma2 -------FSLPFLSNNT-SNAS-FSEHFNNANGGGGNNNNNNNNEGTNY--------FAT
gm055623_Glyma2 -----NMFE---------ENGLHL------------------------------------
gm018549_Glyma0 -----NFFNLPFLSNP--------------------------------------------
gm031006_Glyma1 ----NNLYLSS-------------------------------------------------
gm040934_Glyma1 --GPGPTLLPP-----------------------------------------------YQ
gm035950_Glyma1 ----ASIYNNS--------------------------------------------EGQNK
gm028313_Glyma1 PP-NSNLFNLSFFP-------------------------------------------IKN
gm013956_Glyma0 ----FNLFI---------L-----------------------------------------
gm008769_Glyma0 ----TPLYL---------SNNDPL---------------------------------HYT
gm003165_Glyma0 ----SPIFA---------TGGR--------------------------------------
gm018548_Glyma0 SANNTNLFNLSFFPNTN-TSGSIINDQFSNISG-G------NNNQGTAT--------LYS
gm029103_Glyma1 -------FNLPFLSSNT-ANAS-FSEHFNNANGGG---NNNNNNEGTNY--------FAT
gm026861_Glyma1 ----ASIYNNS--------------------------------------------EGQNK
gm007417_Glyma0 ----ASMY--S--------------------------------------------ESQNK
gm017012_Glyma0 ----GPTLAA------------------------------------------------YQ
gm037940_Glyma1 ------LYQS--------------------------------------------------
gm033471_Glyma1 ----LPIGNS--------------------------------------------------
gm033917_Glyma1 ------LYPS--------------------------------------------------
AT4G02670.1 TAAL---------------------------STPPTAA---LSATALLQKATSLSSTTFG
gm027752_Glyma1 -AAG----------------------------SP---H---MSATALLQKAAQMGATL--
gm039540_Glyma1 TSSS---------------------------SSP---H---MSA-ALLQKASQIGETVS-
gm040932_Glyma1 TA-------------------------------P---H---MSATALLQKASQMGATMSK
gm008040_Glyma0 --------------------------------SP---H---MSATALLQKAAEMGATVNS
gm037604_Glyma1 S-VP------------SLYSSQHQS--HQA-SSA---N---MSATALLQKAAQVGTTS--
gm055099_Glyma2 VSSP----HVG-SSFSSIFGNS-----MENVSSP---H---MSATALLQQAAQMGSTTTT
gm055100_Glyma2 VSSP----HVG-SSFSSIFGNS-----MENVSSP---H---MSATALLQQAAQMGSTTTT
gm016509_Glyma0 SAIP------------SWYSSQHQPQHQQACPSA---N---MSATALLQKAAQIGATS--
gm038189_Glyma1 TA-------------------------------P---H---MSATALLQKAAQMGATMSK
gm034301_Glyma1 S-VP------------SLYSSQHQS--HQT-TSA---N---MSATALLQKAAQIGTTS--
gm003166_Glyma0 SSSP----------------------------HP---A---MSATALLQKAAQMGAAA--
gm040933_Glyma1 TA-------------------------------P---H---MSATALLQKASQMGATMSK
gm007760_Glyma0 -AA-----------------------------SA---Q---MSATALLQKAAQMGATA-S
gm001789_Glyma0 -PPP----------------------------QP---A---MSATALLQKAAQMGAAA--
gm052792_Glyma1 -AA-----------------------------SA---Q---MSATALLQKAAQMGATA-S
gm044710_Glyma1 SSPP----------------------------QP---A---MSATALLQKAAQMGAAA--
gm053099_Glyma1 --------------------------------SP---H---MSATALLQKAAQMGATV--
gm053468_Glyma2 -------------------------------------------------------AINSN
gm033012_Glyma1 ------------S-----------------IQNPP--HHHYMSATTLLQKAVQMGSTR--
gm021853_Glyma0 -----------------------------------------------------------K
gm053467_Glyma2 TNSPVNSNQVG---LSSLFGNSSV---QQDNMSP---H---MSATALLQKAAQMGSTTTT
gm054309_Glyma2 SSAP------------SLFSNS-----VNASALS---H---MSATALLQKAAQMGATTSN
gm055623_Glyma2 -AAG----------------------------SP---H---MSATALLQKAAQMGATV--
gm018549_Glyma0 ----------------------------------------------LLQKAAQMGSTSSS
gm031006_Glyma1 ------------S----------------DIQNPPPHHHHYMSATTLLHKAVQMGSSR--
gm040934_Glyma1 TA-------------------------------P---H---MSATALLQKASQMGATMSK
gm035950_Glyma1 NSKP---------------------------ASP-------MSATALLQKAAQMGSTR--
gm028313_Glyma1 ESSP----HAG-SSFSSIFGNS-----IENASSS---H---MSATALLQQAAQMGSTTTT
gm013956_Glyma0 --------------------------------QP--------------HKAAQMG--A--
gm008769_Glyma0 -ASP----------------------------QP---A---LSATALLQKAAQMG--A--
gm003165_Glyma0 --------------------------------HH---C---IAA-----------EGS--
gm018548_Glyma0 TNSPVSNNHVGNSSLSSLFGNSSV---QQDNMSP---H---I------------------
gm029103_Glyma1 SSAP------------SLFSNSAN---ANANALS---H---MSATALLQKAAQMGATSSN
gm026861_Glyma1 NSKP---------------------------ASP-------MSATALLQKAAQMGSTR--
gm007417_Glyma0 NSNS---------------------------TSP-------MSATALLQKAAQMGSTR--
gm017012_Glyma0 TVP-----------------------------NP---H---MSATALLQKAAQMGATMSR
gm037940_Glyma1 -------------------------------------H---------------MEPTR--
gm033471_Glyma1 S-VP------------SLYCSQHQP--QQTCSSA---N---MSATALLQKAAQIGATS--
gm033917_Glyma1 -------------------------------------H---------------MESAR--
AT4G02670.1 GGGQTRSIGHHRHLTNVN------------EFLG----VDRVM----------------M
gm027752_Glyma1 --------------------------TEKSTF------ATNMA-----------------
gm039540_Glyma1 --------------------------------SA----PSQAM----------------L
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gm008040_Glyma0 N--------------SNNNS--MMMSGEK-SFIN----VTSMA-----------------
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gm055099_Glyma2 T-------------T-NCSS--LLR-----GMCT----NNGCKA----------------
gm055100_Glyma2 T-------------T-NCSS--LLR-----GMCT----NNGCKA----------------
gm016509_Glyma0 ----------------SDPS--WLG-----SLGL----KCG-------------------
gm038189_Glyma1 TGSMIRTHQQQAHVS-ANAA--L-------NLSS----RDHQM----------------N
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gm003166_Glyma0 ----------------TNAS--LLR-----GLGI----VSSSP----------------L
gm040933_Glyma1 TGSMIGTHQQQAHVS-ANAA--L-------NLSS----RDHQM----------------T
gm007760_Glyma0 N--------------SINSP--MM---QK-GFVG----GTTTGP----------DHVSFT
gm001789_Glyma0 ----------------TNAS--FLR-----GLGI----VSSSA-----------------
gm052792_Glyma1 N--------------SINSP--MM---QK-GF----------------------------
gm044710_Glyma1 ----------------TNAS--LLR-----GF----------------------------
gm053099_Glyma1 N--------------SNNNS--MMSSDEK-SFI-----VTSMA-----------------
gm053468_Glyma2 NYSEEHNSTLL--KGPISS-----------------------------------------
gm033012_Glyma1 -------------I-SDN------------VFGS----IVGTTN----------------
gm021853_Glyma0 QSLTPHTCQPQH--------------------CC----RKQLR----------------W
gm053467_Glyma2 N-----------------------------ELGM----RSSME-----------------
gm054309_Glyma2 --------------GGTAS---LLK-----SFGS----ASSSS--GGGGSK--------L
gm055623_Glyma2 --------------------------TEK-TF------VTNMA-----------------
gm018549_Glyma0 NHNIINNNTTN--NNPSASS--ILR-----SLAS----KSDQRQLGGG------------
gm031006_Glyma1 -------------LMNDN------------VFGS----ILGTTT----------------
gm040934_Glyma1 TGSMIGTHQQQAHVS-ANAA--L-------NLSS----RDHQM----------------T
gm035950_Glyma1 ---------------STNPS--IFSG----SFGV----INSPS----------------S
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gm029103_Glyma1 ---------------GTAS---LLK-----SFGS----ASSSS--GGGSKSEQQHRVPPL
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gm033471_Glyma1 ----------------SDPS--WLG-----SLGL----KCG-------------------
gm033917_Glyma1 -------------ILSDNNNSAFDNS----NFGF--------------------------
AT4G02670.1 TSASSSE----------------------------YDQLVV-------------------
gm027752_Glyma1 --PPSFGVLQQHHHHQQPNGQPFTNQYMHSGHH-HQQQEVNI--------STQY-S-F-G
gm039540_Glyma1 VRP----------------------------------HLLL-------------------
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gm008040_Glyma0 --PPSYGI---------------MNPNMHNG-----QQDL-----------SQY-N-F-I
gm037604_Glyma1 ------------------------NSPGQDG------------------------NKF-C
gm055099_Glyma2 -------------------------ENDHHHN----LQGLM----------------N-S
gm055100_Glyma2 -------------------------ENDHHHN----LQGLM----------------N-S
gm016509_Glyma0 -----------------------NNSQGQDGNN----------------------NKY-S
gm038189_Glyma1 PTP----------------------------------HDLL-----------PFGNNK-A
gm034301_Glyma1 ------------------------NSPGQDG------------------------NKF-C
gm003166_Glyma0 DSTSSGQQN-----------------VLQWGH----QQQL-----------EPE-SGS-V
gm040933_Glyma1 PTL----------------------------------HGLV-----------PFGNKA-V
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gm001789_Glyma0 -STSSVQQD-----------------NLQWGH----QPV------------EPE-S-A-S
gm052792_Glyma1 -----------H-----------NNSYDHFSP----QPDLS--------------S-M-A
gm044710_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm053099_Glyma1 --PPSYGI---------------MNHNMHNG-----QQDL-----------SQY-N-F-N
gm053468_Glyma2 ------------------------------------------------------------
gm033012_Glyma1 -----------------------RNNNNDNNTN-LEVQKL-----------NELVSME-A
gm021853_Glyma0 TPPPQQQ-----------------------------QQQLL-------------------
gm053467_Glyma2 -------------------------DDEHSNH----LRGLM----------------N-S
gm054309_Glyma2 VNAANYVSGMFGGNNH-------VNE-QSNSN----LQDLM----------------N-S
gm055623_Glyma2 --PPSFGVLQQ--HHQQPNGQPFMNQYMHSG---QQQQDVNI--------SAQYNS-F-G
gm018549_Glyma0 --AGNYAT-------------------IFNNS----VQEMM----------------D-I
gm031006_Glyma1 -----------------------TNSNN-NNVV-VEVQKL-----------NELVSVEAA
gm040934_Glyma1 PTL----------------------------------HGLV-----------PFGNKA-V
gm035950_Glyma1 QTTS-------------------LNNN--NNGG------------------------A-A
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gm013956_Glyma0 --SSSFGKDEG-----------------------------------------QE-N-H-P
gm008769_Glyma0 -SSSSFGKDEGFNIN--------ATTTLQWNG----QV-------------KQE-N-H-P
gm003165_Glyma0 PSSRAWHCV-----------------IVTFRF----HLV------------------G-T
gm018548_Glyma0 -------------------------------H----LRGLL----------------N-S
gm029103_Glyma1 VNAANYVGGMFGG-NH-------VNEQQSNSN----LQDLM----------------N-S
gm026861_Glyma1 QTTS-------------------LNNN--NNNGD-----------------------A-A
gm007417_Glyma0 QSTS-------------------LNSNIANQSCDQLNQAFQN--------FNATSSSS-A
gm017012_Glyma0 TTPSTTTTNANTAT--------------------VFSHGLLS--------SSPLGNKA-A
gm037940_Glyma1 -----------------------NNNNRYNNNV-VEIQKLFKQGNQAVENFNHMVNSQ-A
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gm033917_Glyma1 ------------------------NNNRHNNNV-VEIQKLFRQGNQLAENFNHIVNSQ-A
AT4G02670.1 ------------------------------------------------------------
gm027752_Glyma1 SA-NGM-GGGS-------------------VGMNG--------VDMFNAI-----LDQSK
gm039540_Glyma1 ---------------------------------QQQVH-----------VP---------
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gm008040_Glyma0 -A-NGVVDGGS-----------------NGMGMSG--------LDMFNAI-----LDQSK
gm037604_Glyma1 GM-YGS-----------------------SSVL-TTSHHGS-------------------
gm055099_Glyma2 IA-NG------------------------NTSLFGSMQGNENNLCGF-------------
gm055100_Glyma2 IA-NG------------------------NTSLFGSMQGNENNLCGF-------------
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gm003166_Glyma0 AA-AGL-----------------------GLGL---------------------------
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gm007760_Glyma0 ----GVSGGGAFINQLFHKGQEISQVFDTNTTMNG--------VGMFSQMPMGSEHNHNQ
gm001789_Glyma0 VP-AGL-----------------------GLGL---------------------------
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gm044710_Glyma1 ---AGL-----------------------GLGL---------------------------
gm053099_Glyma1 -A-NGMVDGGSN----------------NGMGMGG--------LDMFNAI-----LDQSK
gm053468_Glyma2 ------------------------------------------------------------
gm033012_Glyma1 GC-NNNLGG--------------------G------------------------------
gm021853_Glyma0 ----------------------------------KLLQ----------FSP---------
gm053467_Glyma2 FV-NGN-----------------------NLGQF--------------------------
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gm018549_Glyma0 --------------------------------------------SGFEAYD---------
gm031006_Glyma1 GCTNNNLGG--------------------GYLLNDSNNSNS-----FVVVN---------
gm040934_Glyma1 PA-VGN-----------------------GVS-PSLLHHI---IDSF-SSP---------
gm035950_Glyma1 MM-LAS-----------------------NTSTA---AANA--ND-FSSLR---------
gm028313_Glyma1 IA-NG------------------------NTSF---------------------------
gm013956_Glyma0 VV-DNL-----------------------GLGL---------------------------
gm008769_Glyma0 VV-DNL-----------------------GLGL---------------------------
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gm018548_Glyma0 LA-NGN-----------------------NLGQY--------------------------
gm029103_Glyma1 FA-VGG-----------------------NSSIFE--------AGGFEAYD---------
gm026861_Glyma1 MM-LGS-----------------------NTTTTTTVAANA--NDHFSSLT---------
gm007417_Glyma0 TM-LGS-----------------------STN--------------FSSLT---------
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gm037940_Glyma1 ST-NNIIGG--------------------GFSLSS-TK----------------------
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AT4G02670.1 -------------------------------------------------------DGFTS
gm027752_Glyma1 ALSKIIEQNNNRSSSGG----TTNGGSS-------------------------------S
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gm026861_Glyma1 -----------------------HSSNSFDQLVMQVNGQL--------------QSEPVK
gm007417_Glyma0 -----------------------HSSNGFDQFMMQNN------------------VEPTQ
gm017012_Glyma0 ---------------------SAFEGTPFEDAFIQSSKKLDDD------HNLYLHDTFSK
gm037940_Glyma1 ---------------------------GLEHMVMPRIEEWESGEP----------EIMQK
gm033471_Glyma1 ---------------------EADNSAC----------ELSQMHPHKRRHVL--------
gm033917_Glyma1 ---------------------------GLEHMVMPRIEEWESGEP----------KRMEN
AT4G02670.1 TW---------QKA---DRLTR-DFLGLTG----HGGHVSVRP---------------GD
gm027752_Glyma1 AI-NNVAGSK-GSG---DVMTL-DFLGIGG------GGSGSGG---------------G-
gm039540_Glyma1 TT-TAIATTGYNIN---MASSS-AVSGM----------VIMPS---------------RE
gm040932_Glyma1 TT-TADDGARGNNN---EALTR-DFLGL----------RPLSH---------------TD
gm008040_Glyma0 GS-IEVGGTK-ESE---DVMTL-DLLGIGG------GGGGGGD---------------G-
gm037604_Glyma1 -----------NEESA-WGQTR-DFLGVGG------------------------------
gm055099_Glyma2 LS-VNFGGS--------DKLTL-DFLGVGGMMRNMS-SGGFSQ---------------RE
gm055100_Glyma2 LS-VNFGGS--------DKLTL-DFLGVGGMMRNMS-SGGFSQ---------------RE
gm016509_Glyma0 -----------NEESG-GGQTR-DFLGVGV------------------------------
gm038189_Glyma1 DE-GGGGGAGGNNN---EGLTR-DFLGL----------RHLSH---------------TD
gm034301_Glyma1 -----------NEESA-WGQTR-DFLGVGA------------------------------
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gm053099_Glyma1 DP-IEGGGTK-GSEAVNHVMTL-DLLGI---------GGGGGD---------------G-
gm053468_Glyma2 ------------------------------------------------------------
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gm031006_Glyma1 Q--LHSSLSSNNKNQQ-LGLTR-DFLGVGD------HNNSIDSIRRPFLQQDLVEFNAMG
gm040934_Glyma1 TT-TADDGARGNNN---EALTR-DFLGL----------RPLSH---------------TD
gm035950_Glyma1 -----------------NNLTR-DFLGVSG-----GGGGGGGP---------------QF
gm028313_Glyma1 ---VNFGGS--------DKLTL-DFLGVGGMMTNM--SGGFSQ---------------RE
gm013956_Glyma0 PT-TPFVGQP---------MTR-DLLGLSV------GGGATSR---------------GG
gm008769_Glyma0 PS-TPFVGQP---------MTR-DLLGLSI------GGGG-SR---------------GG
gm003165_Glyma0 TS-SMFGPKH---------TTL-DFLGLGM------AAGGTAG---------------GG
gm018548_Glyma0 LG-LCFGGS--------DKLTL-DFLGVGGMVRNMNNGGGFSQ---------------RE
gm029103_Glyma1 -S-NSVGGS--------DRLTR-DFLGVGQIVRGMSGSGGVAQ---------------RE
gm026861_Glyma1 LK-LH---SN-AVE---NNLTR-DFLGVS------GGGGGGGP---------------QY
gm007417_Glyma0 LK-LHHPGSN-SVE---HNLTR-DFLGVSG-----NGGGQVHH---------------AF
gm017012_Glyma0 TS----GAAGNNIN---EGLTR-DFLGL----------RPLSH---------------AD
gm037940_Glyma1 QQ-LRSSTSNATEEH----LTK-DFMGIG-------------------------------
gm033471_Glyma1 -----------NEESG-GGQTR-DFLGVGV------------------------------
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AT4G02670.1 MLEYAGGVAFPM-SAYDTES--HDHSFQK----AYDHLGFSGAHRM-----------
gm027752_Glyma1 --AHGNFYG----GAQQGETGAPDEVWRN---WSSKNAGFESFSTTSSI--------
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gm055100_Glyma2 --QQQHDIG-TM-SSLDHDL---------------KSAQP-NRHFGKSTLQ------
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