Input
| Putative repression domain
|
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AT4G02670.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
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| Type
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Gm007167 |
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AT4G02670.1 |
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III |
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III |
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not found in 475aa |
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III |
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not found in 455aa |
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0.484702093 |
III |
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not found in 455aa |
AT3G13810.1 |
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III |
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III |
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III |
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III |
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AT5G44160.1 |
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III |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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:****
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*:** * *** *:******:*********: : : :::.*:*** .*.**...***
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:** ***
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gm033012_Glyma1 DMFG----PQT---QFVNYRY-PEA-SF--GGGNANL-SV----LPPHGLKQEQEENKQH
gm016509_Glyma0 --ISNNSNN-----QELT--------------TSTTT-SL--------PL----------
gm039540_Glyma1 NLLTSEIPSWL-------------------TSPTVVEEAI--------LL----------
gm040933_Glyma1 ----GFRPPWI-------------------GQPSPS------------------------
gm052250_Glyma1 TFHNPTL----------------------------SS-----------LLQQQQP-----
gm003165_Glyma0 --FSDLI-------RAMGP---PEHPADQISGP-SSE-AI--------SL----------
gm053468_Glyma2 PFFL-QESN-----QTYH-----D----------SNK-PF-QGLI---QLSD---LNN--
gm003166_Glyma0 --FSDLI-------RAMGP---PEHPADQISGP-SSE-AI--------SL----------
gm018549_Glyma0 PFFM-QEPN-----QTYH-----D----------SNK-PF-QGLI---QLSD---LNN--
gm054309_Glyma2 PFFMSSEPN-----QTYHH---PD----------QNK-PFQQGLM---QLSD--HLNNNS
gm040934_Glyma1 ----GFRPPWI-------------------GQPSPS------------------------
gm034301_Glyma1 --LSTNGSH-----QELT----------------STA-SL--------PL----------
gm021853_Glyma0 N-VRTEMPPWL-------------------GPPAATK-TL--------IL----------
gm033471_Glyma1 --ISNSSNN-----QELT------------TNTTTTT-SL--------PI----------
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gm007167_Glyma0 SFHNPTL----------------------------SS-----------FLQQQQQGQQPN
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AT4G02670.1 ------------------LFIE-PS-----------------------------------
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gm008040_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm003165_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm053468_Glyma2 ------------------------------------------------------------
gm003166_Glyma0 ------------------QYASSSP-----------------------------------
gm018549_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm040934_Glyma1 -----PGPTLLPP------YQTA-------------------------------------
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gm021853_Glyma0 ------LPT---------------------------------------------------
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gm007167_Glyma0 ---------------GNLHVAAAAP----------------------------------A
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AT4G02670.1 -TAALSATALLQKATSLSSTT---------------FGGG--------------------
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gm029103_Glyma1 ALSHMSATALLQKAAQMGATSSN-------------GTAS-LLK-------------SFG
gm040932_Glyma1 --PHMSATALLQKASQMGATM---------------SKTGSMIGTHQQQAHVS-ANAALN
gm017012_Glyma0 -NPHMSATALLQKAAQMGATM---------------SRSGSTPAMTGPHHHAHVSHFGLN
gm053467_Glyma2 MSPHMSATALLQKAAQMGSTTTTN---------------------------------ELG
gm007417_Glyma0 STSPMSATALLQKAAQMGSTR---------------STNPSIFS------------GSFG
gm033917_Glyma1 H---------------MESAR-------------ILSDNNNSAF----------DNSNFG
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gm026861_Glyma1 PASPMSATALLQKAAQMGSTR---------------STNPSIFS------------GSFG
gm007760_Glyma0 -SAQMSATALLQKAAQMGATA-SN------------SINSPMM---QK---------GFV
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gm035950_Glyma1 PASPMSATALLQKAAQMGSTR---------------STNPSIFS------------GSFG
gm008040_Glyma0 -SPHMSATALLQKAAEMGATVNSN------------SNNNSMMMSGEK---------SFI
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gm054309_Glyma2 ALSHMSATALLQKAAQMGATTSN------------GGTAS-LLK-------------SFG
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gm021853_Glyma0 -------------------------------------KQSLTPHTCQPQH----------
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gm001789_Glyma0 -QPAMSATALLQKAAQMGAAA----------------TNASFLR-------------GLG
gm038189_Glyma1 --PHMSATALLQKAAQMGATM---------------SKTGSMIRTHQQQAHVS-ANAALN
gm037604_Glyma1 SSANMSATALLQKAAQVGTTS---------------SDPSSLFH------------GSIG
gm007167_Glyma0 TSSYMSATALLQKAATVGAAA---------------ITGPV-------------------
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AT4G02670.1 ----------G-----------------QTRSIGHH------------------RHLTN-
gm028313_Glyma1 T----NNSSKA-----------------------------------------ENDHHHN-
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gm007417_Glyma0 V----MSSSST-----------------QSTSLNSNIANQSCDQLN-QAFQNFNATSSS-
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gm044710_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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AT4G02670.1 --VNEFL----------------------------------------------------G
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AT4G02670.1 VDRVMMT---------------------------------------------S-ASSSEY
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gm052250_Glyma1 IGTV-----------------------------------------------------SQL
gm003165_Glyma0 LGL------------------------------------------------PC-EDGGS-
gm053468_Glyma2 ------------------------------------------------------------
gm003166_Glyma0 LGL------------------------------------------------PC-EDGGS-
gm018549_Glyma0 --------------SGFEAYD------------------------------H--HGGMN-
gm054309_Glyma2 SSIFE---------DGFEAYE------------------------------HS-NNNSN-
gm040934_Glyma1 VS-PSLLHHI---IDSF-SSP---------------------------------FEGTSF
gm034301_Glyma1 SSSVL----------------------------------------------TS--HWSEA
gm021853_Glyma0 ----KLLQ----------FSP------------------------------SA-FEGTPF
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gm004033_Glyma0 TET------------------------------------------------------THL
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gm052792_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm001789_Glyma0 LGL------------------------------------------------PC--DSSS-
gm038189_Glyma1 VS-PSLLHHV---INSFSSSP---------------------------------FEGT-F
gm037604_Glyma1 SSSVL----------------------------------------------TTSHHGSEA
gm007167_Glyma0 IGTV-----------------------------------------------------SQL
gm055623_Glyma2 VGMNG--------VDMFNAI-----LDQSKALSKIMEQ-NNRSSSGG----PT-NGGSN-
AT4G02670.1 DQLVV-------D---------------------------GFTSTW-QKA---DRLTR-D
gm028313_Glyma1 ---------------------------------------VNFGGS--------DKLTL-D
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