Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G05100.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb010610 |
not found in 342aa |
AT5G15310.1 |
not_not |
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III |
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not found in 432aa |
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III |
Sb015849 |
not found in 356aa |
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not_not |
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III |
Sb031258 |
not found in 445aa |
AT1G34670.1 |
not_not |
0.452191235 |
III |
Sb011138 |
not found in 314aa |
AT3G61250.1 |
not_not |
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III |
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VPRCPDLNLDLCISPP in 216/452 |
AT4G34990.1 |
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III |
Sb023642 |
not found in 418aa |
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not found in 164aa |
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Sb003360 |
not found in 298aa |
AT1G66230.1 |
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VVGGIDLNLSLSPPTS in 196/215 |
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not_not |
0.406374501 |
III |
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not found in 311aa |
AT1G66230.1 |
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Sb014116 |
not found in 371aa |
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III |
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APRCPDLNLDLDLSVG in 194/269 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb027621_Sorbi1 -------QEASRAKGGCRQVVS------------LLPNPTCT-------T-----LPPVP
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Sb014116_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb023642_Sorbi1 VGDGNYREKERRQNGATRESSREDVPRAQILTFFFLPYLSFTHSLLRIFTYEANQIRIIQ
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Sb031258_Sorbi1 CQSR---------LRRAAMGR---SPCCDE-NGLKKGPWTQEEDEKLLHYIQKNGHGSW-
Sb016715_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEK-AHTNKGAWTKEEDQRLVAYIKAHGEGCW-
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Sb010610_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEKEAGLKKGPWTPEEDQKLLAFIEQHGHGCW-
Sb031046_Sorbi1 ---KEKNSAAGHFDRSYGHGRLIHSLHLEA-SEVEHAGPEPQEAVVAVAAAAAAPGGSFL
Sb027621_Sorbi1 FH--------------LSMGR---SPCCDE-NGLKKGPWTPEEDQKLMEYIQKHGHGSW-
Sb010896_Sorbi1 ------------------MGR---QPCCEK-VGLKKGPWTAEEDQKLVTFLLSHGHCCW-
Sb003360_Sorbi1 ------------------MGR---QPCCDK-VGMKKGPWTAEEDQKLVGFLLTHGHCCW-
Sb014116_Sorbi1 ------------------MGR---IPCCEK-DSVKRGQWTPEEDNKLLSYITQYGTRNW-
Sb023642_Sorbi1 ARCKKKNKKG---EITEGETR---SFHLEA-SEVEHGGPESEE----VAALAV---GALG
* : ::. :* :
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Sb010610_Sorbi1 ----------------RSLPAK--AGLR--------------------------------
Sb031046_Sorbi1 DAQAAAEAEAAAMAGLQHLPLDDDGGLEVQ--LLVFLLLARRADAEIEVEVGAPGHL---
Sb027621_Sorbi1 ----------------RALPRL--AGLN--------------------------------
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Sb003360_Sorbi1 ----------------RVVPKL--AGLL--------------------------------
Sb014116_Sorbi1 ----------------RLIPKN--AGLQ--------------------------------
Sb023642_Sorbi1 EAQAAAEAEPG-------LPLH---GLHRHHGLLLLARRRRRADAEVQVEVGALERLPLA
:* **
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Sb015849_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------IKRGKFSLQEEQ----TI
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Sb031046_Sorbi1 ---------------NDGRRHRLDRLMLWRLRCDGGV--------GFVGLERDGGDGAGA
Sb027621_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------IKRGKFTQEEEQ----TI
Sb010896_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------LKRGLLSEEEEA----LV
Sb003360_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------LKRGLLSDDEER----LV
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Sb023642_Sorbi1 PVAGGVVVLMMIAADRGGRRRR--RLVVL-LQPEHGALILLTVTRGRRRLERDG--YVGR
. *: * * *: : * :
AT4G05100.1 IQLHSIMGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLKMGID-----PVTHTPRLDL-
Sb005866_Sorbi1 IDLHEQLGNRWSKIASQLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLRKMGID-----PVTHKP-----
Sb009095_Sorbi1 IKLHALLGNKWSLIAGQLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLLSRGID-----PQTHRP-----
Sb031258_Sorbi1 LHLHSVLGNKWSAIATHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKRLIQMGFD-----PMTHRPRTD--
Sb016715_Sorbi1 IKLHQILGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLIARGID-----PRTHQP-----
Sb011138_Sorbi1 VQLHAIVGNKWSMIAAQLPGRTDNEIKNYWNTHLKKQLRRMGLDEPPPGPAAGSPAAR--
Sb015849_Sorbi1 IQLHALLGNRWSAIATHLPNRTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGID-----PVTHKS-----
Sb010610_Sorbi1 IQLHALLGNRWSSIATHLPKRTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGID-----PVTHKPRADL-
Sb031046_Sorbi1 GVGDGAVRDGVDAPAKQLP--PDVRVPVVLDLVVRPPREPRGDE----RPLVAEEAVQLD
Sb027621_Sorbi1 LQLHSVLGNKWSAIAKHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKKLIQMGFD-----PMTHRPRTD--
Sb010896_Sorbi1 IDLHAQLGNRWSKIAARLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLKKMGID-----PVTHRP-----
Sb003360_Sorbi1 IDLHAQLGNRWSKIAAQLPGRTDNEIKNHWNTHIRKKLLRMGID-----PVTHLP-----
Sb014116_Sorbi1 IKLHSVVGNRWSVIAAQLPGRTDNDVKNHWNTKLKKKLSGMGID-----PVTHKS-----
Sb023642_Sorbi1 VLVDGAVCHRVDPPAQQLP--PDVRVPVVLDLVVRPSRQPSSDQ----GPFVAEEAVELD
. : . . * :** .* : : :: . : * .
AT4G05100.1 ---LDISSILSSSIYNSSHHHHHH--HQQHMN--MSRL-----------MMSDGNHQPL-
Sb005866_Sorbi1 ------------------------------------------------------LHQPAS
Sb009095_Sorbi1 ----LSGGAAAGSGLTTSSTAGFP------------------------------AQAPAP
Sb031258_Sorbi1 -----FFAALPQLIALAALRQHLQLGDQQ--------------QAAKLQYLQSLLQSAAT
Sb016715_Sorbi1 ----ASAGAVAPAPGAAASAA-----------------------------------APSS
Sb011138_Sorbi1 --------------------------HMAQWE--TARLQAEA----RLSLLATASSSSGA
Sb015849_Sorbi1 -----LSGTLTGTTNNKSAKAAASLSHMAQWE--SARLEAEA-RLARESKIRTATPTPTA
Sb010610_Sorbi1 ---GASSGSAAGAGAGARYRAAAHLNHTASWE--SARLEAEA-RLAREAKLRAIVSPPPA
Sb031046_Sorbi1 DEVVLVGGEVAALEVGAEVVDPAEAAALAAAHQ-SGRL----------------GQRPPA
Sb027621_Sorbi1 -----FFAALPQLIALANLR---QLVEQRPWDDHTARIQVEAVQAAKLQCLQNLLQSAAS
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------LAQPLA
Sb003360_Sorbi1 ------------------------------------------------------LQEPPA
Sb014116_Sorbi1 -----FSHLMAEIATTLAPPQVAHLAEAA-------------LGCFKDEMLHLLTKKRPT
Sb023642_Sorbi1 DELVLLFREVAALEVGAEVVDPPEAAALAAAQE-AGGL----------------GQRAPA
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Sb009095_Sorbi1 TRPA---RPVII--------------------------------------IPP-------
Sb031258_Sorbi1 TISS-----------------------SDTEAPALGLGA---------ICCSP-------
Sb016715_Sorbi1 HRQHGDDKAAAV--------------------------------------VRS-------
Sb011138_Sorbi1 TATATTAAATTSAS---------SSSTVDLKA----------------CCAKPAD-----
Sb015849_Sorbi1 LHAQPTNVPASAASPCLDVLHGWQGAKIDLESPTSTLTFTGSNSGML-----P-----TP
Sb010610_Sorbi1 PAPGPGTGPAFISG---------------LESPTSTLSF--SESAQLFANAPPHDTHGTP
Sb031046_Sorbi1 PFA----------------------VRADVRHQAVVL---------L---LGPRAL----
Sb027621_Sorbi1 IATSPSSSSINTNT-----------IPSDLE--QIGL-------------LSP-------
Sb010896_Sorbi1 P-----------------------------------------------------------
Sb003360_Sorbi1 PPP-----------------------------------------------PPP-------
Sb014116_Sorbi1 DFPSPA-------------------VPPDMATIAGGSGA-GA------LGAPPCGFPAPP
Sb023642_Sorbi1 TLA----------------------VRLDVRHEAVVL---------L---LGPRAL----
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Sb016715_Sorbi1 ---------------SGCSSRDS-SGDDDSTSGSSV---------------PHQHQL---
Sb011138_Sorbi1 ------------IFLRLWSSDIGDSFRRSRKTAAAA---------------PAVPAL---
Sb015849_Sorbi1 RT-NRLEVSE---SNSVMWHQRSDELEGEENDWQIF---------------SKHQVLELD
Sb010610_Sorbi1 R------------------HALTPPRSYEEAFGELQ---------------PQQQR----
Sb031046_Sorbi1 ------------VRVRLLAARRPPHR----------------------------------
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Sb010896_Sorbi1 ---------------------------------------------------PLTQQPRLV
Sb003360_Sorbi1 -----------------------PPPEQEPDDQEEE---------------PQQQEQQAG
Sb014116_Sorbi1 QTDDTIERIKLGLSRAIMSEPGAPPGKQQQPPWAPADVTEGLAGMYATYN-PATHAQEEF
Sb023642_Sorbi1 ------------VGVRLLAARRPPHDGGVVVRSAGRA--------------PNQSDA---
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Sb009095_Sorbi1 ---------------------------------NLDLDLSVGPPCSPPKTPAAAVTTPTS
Sb031258_Sorbi1 -----------TTTPLDSCTAPV---SSS-----------LLPCTFPEAAPPVSSEEDEA
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------VVGGIDLNLSLSPPTSQPSSPAAAN-----
Sb011138_Sorbi1 -------------LP---------P------------------------APVVVKRKQDA
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Sb010610_Sorbi1 --------FGDAAAPGF-------------VLAGVLLDSSVAGADQQRFAASSTDASVSV
Sb031046_Sorbi1 --------------PASCLAFRFRF-----------------------------------
Sb027621_Sorbi1 -----------STLPSPSFLESI---SGQDIAAAGQLPDIQIPSSFFEQQP----TSNDA
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Sb003360_Sorbi1 KLMQEGGAGEDDVAPMVQPHET-----------------IMAPPPPPTTAASNCG-----
Sb014116_Sorbi1 R-------YDNGAVP--------------------------------EYVLGGAGAGGDA
Sb023642_Sorbi1 -----------ATLPAAFLVLPFGS-----------------------------------
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Sb005866_Sorbi1 T-----------------------ASSPDSSSSSSSSSSSSP--SSYSA---------SV
Sb009095_Sorbi1 QQQE--------------------MQRATICLCYHLGVRSGDACSCKTA---------AS
Sb031258_Sorbi1 NNHQQQQTAGLSSSYGGLGSADDVFACHGGSSSSSLPPLTDLSDAHAGSLLQVDGSMRSA
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb011138_Sorbi1 MMIKQEAQAPLLGPVG------------DDSSAASNETEVAEALEEYQMFLDFAG-----
Sb015849_Sorbi1 NQASDEEDK---------NYWNGVLDMVNSELTPQSPPLV--------------------
Sb010610_Sorbi1 SEQQEEEDK---------GYWSSILNMVNSSMSSSSSSLTSDAVTDPAM---------YL
Sb031046_Sorbi1 ------------------------------------------------------GYRF--
Sb027621_Sorbi1 NQHSDFTPK--SSVEGENGTPKTLLL-----SENSLPPLTDFPISNLG----------DA
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb003360_Sorbi1 -------------------------SAAVSSASAGSASVVSPSCSSSSA---------SA
Sb014116_Sorbi1 DQGTSMWSH---------------QSMYSGSSGTEAAPRPMAALPEKGN---------DS
Sb023642_Sorbi1 ------------------------------------------------------RRRFSS
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Sb031046_Sorbi1 --------AVWSGG---------------RRLR-----RA--------------------
Sb027621_Sorbi1 CGA-----SSCDGSS--IPFPSW--------------PEL--------------------
Sb010896_Sorbi1 -----------------IESIERF------------SIEMVYKFV---------------
Sb003360_Sorbi1 PAV------------TGVEATEW--------------PEPVYLFGMDGIMDAGWAGLFPS
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Sb015849_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb010610_Sorbi1 -------------------------F----------------------------------
Sb031046_Sorbi1 -GRGAS---SAI--------GLEN------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 -----------F---D-------EQFICEFV-----------------------------
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb003360_Sorbi1 TGAG---AGGCF---GL---GGVDPF--------------DQYPGVGVGGAGFDQDDGHW
Sb014116_Sorbi1 GGKGGSDMSGLF-GSDCVLWDLPDELTNHMV-----------------------------
Sb023642_Sorbi1 -KLG--------------------------------------------------------
AT4G05100.1 ---
Sb005866_Sorbi1 ELF
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Sb003360_Sorbi1 M--
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Sb023642_Sorbi1 ---
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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Sb016715_Sorbi1 |
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Sb011138_Sorbi1 |
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Sb015849_Sorbi1 |
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Sb010610_Sorbi1 |
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Sb031046_Sorbi1 |
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Sb027621_Sorbi1 |
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Sb003360_Sorbi1 |
M |
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Sb014116_Sorbi1 |
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Sb023642_Sorbi1 |
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