Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G05100.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb023923 |
not found in 508aa |
AT4G05100.1 |
1st_1st |
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Ia |
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not found in 342aa |
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III |
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not found in 432aa |
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not_not |
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III |
Sb015849 |
not found in 356aa |
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not_not |
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III |
Sb031258 |
not found in 445aa |
AT1G34670.1 |
not_not |
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III |
Sb011138 |
not found in 314aa |
AT3G61250.1 |
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III |
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VPRCPDLNLDLCISPP in 216/452 |
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not found in 418aa |
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not found in 164aa |
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not found in 298aa |
AT1G66230.1 |
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VVGGIDLNLSLSPPTS in 196/215 |
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0.406374501 |
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not found in 311aa |
AT1G66230.1 |
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Sb014116 |
not found in 371aa |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb016715_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEKA-HTNKGAWTKEE-----------------
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Sb031258_Sorbi1 CQSR---------LRRAAMGR---SPCCDEN-GLKKGPWTQEE-----------------
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* : ::. :*
AT4G05100.1 DQKLIDYINIHGYGNWRTLPKN--AGLQ--------------------------------
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Sb010610_Sorbi1 DQKLLAFIEQHGHGCWRSLPAK--AGLR--------------------------------
Sb031046_Sorbi1 DAQAAAEAEAAAMAGLQHLPLDDDGGLEVQ--LLVFLLLARRADAEIEVEVGAPGHL---
Sb014116_Sorbi1 DNKLLSYITQYGTRNWRLIPKN--AGLQ--------------------------------
Sb003360_Sorbi1 DQKLVGFLLTHGHCCWRVVPKL--AGLL--------------------------------
Sb016715_Sorbi1 DQRLVAYIKAHGEGCWRSLPKA--AGLL--------------------------------
Sb027621_Sorbi1 DQKLMEYIQKHGHGSWRALPRL--AGLN--------------------------------
Sb031258_Sorbi1 DEKLLHYIQKNGHGSWRTLPRL--AGLN--------------------------------
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Sb023642_Sorbi1 EAQAAAEAEPG-------LPLH---GLHRHHGLLLLARRRRRADAEVQVEVGALERLPLA
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Sb010896_Sorbi1 DQKLVTFLLSHGHCCWRLVPKL--AGLL--------------------------------
Sb015849_Sorbi1 DQKLLAFIEEHGHGSWRALPAK--AGLQ--------------------------------
Sb005866_Sorbi1 DQKLVTFLLANGHCCWRAVPKL--AGLL--------------------------------
: :* **
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Sb009095_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWMNY-LRPD--------LKRGNFTDDDDE----II
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Sb016715_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWINY-LRPD--------LKRGNFTQEEDE----LI
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Sb023642_Sorbi1 PVAGGVVVLMMIAADRGGRRRR--RLVVL-LQPEHGALILLTVTRGRRRLERDG--YVGR
Sb023923_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------IKRGRFSFEEEE----TI
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Sb015849_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------IKRGKFSLQEEQ----TI
Sb005866_Sorbi1 ---------------RCGKSCRL-RWTNY-LRPD--------VKRGLLSSEEER----TV
. *: * * *: : * :
AT4G05100.1 IQLHSIMGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLKMGIDPVTHTPRLD-LLDISS
Sb009095_Sorbi1 IKLHALLGNKWSLIAGQLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLLSRGIDPQTHRP------LSGG
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Sb014116_Sorbi1 IKLHSVVGNRWSVIAAQLPGRTDNDVKNHWNTKLKKKLSGMGIDPVTHKSFSHLMAEIAT
Sb003360_Sorbi1 IDLHAQLGNRWSKIAAQLPGRTDNEIKNHWNTHIRKKLLRMGIDPVTHLP----------
Sb016715_Sorbi1 IKLHQILGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLIARGIDPRTHQP------ASAG
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Sb031258_Sorbi1 LHLHSVLGNKWSAIATHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKRLIQMGFDPMTHRPRTDFFAALPQ
Sb011138_Sorbi1 VQLHAIVGNKWSMIAAQLPGRTDNEIKNYWNTHLKKQLRRMGLDEPPPGP----------
Sb023642_Sorbi1 VLVDGAVCHRVDPPAQQLP-------------------------PDVRVP-----VVLDL
Sb023923_Sorbi1 IQLHSILGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHAPRLD-LLDLSA
Sb010896_Sorbi1 IDLHAQLGNRWSKIAARLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLKKMGIDPVTHRP----------
Sb015849_Sorbi1 IQLHALLGNRWSAIATHLPNRTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGIDPVTHK-------SLSG
Sb005866_Sorbi1 IDLHEQLGNRWSKIASQLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLRKMGIDPVTHKP----------
. : . . * :**
AT4G05100.1 ILSSSIY-----------NSSH-------HHHHHHQQHM--------------NMSRLMM
Sb009095_Sorbi1 AAAGSGL---------TTSSTAG---FPAQAPAPTRPA------------------RPVI
Sb010610_Sorbi1 SAAGAGA---------GARYRA-------AAHLNHTASW--------------ESARLEA
Sb031046_Sorbi1 VVRPPRE--------------------------PRGDERPLV---------AEEAVQLDD
Sb014116_Sorbi1 TLAPPQV---------AHLAEAALGCFKDEMLHLLTKKRPTDFPSPAVPP---DMATIAG
Sb003360_Sorbi1 LQEPPAPPPPPPPPPEQEPDD--------QEEEPQQQEQ--------------QAGKLMQ
Sb016715_Sorbi1 AVAPAPG---------AAASAA--------APSSHRQHG--------------D-DKAAA
Sb027621_Sorbi1 LIALANL----------------------R---QLVEQRPWDDHTARIQVEAVQAAKLQC
Sb031258_Sorbi1 LIALAAL----------------------RQHLQLGDQQ--------------QAAKLQY
Sb011138_Sorbi1 ----------------AAGSPAA----------RHMAQW--------------ETARLQA
Sb023642_Sorbi1 VVRPSRQ--------------------------PSSDQGPFV---------AEEAVELDD
Sb023923_Sorbi1 LLKPAAA---AYYPTQADLDTL-------RALEPLANYP--------------DLLRLAS
Sb010896_Sorbi1 LAQPLAP--------------------------PLTQQP--------------RLVRFLQ
Sb015849_Sorbi1 TLTGTTN---------NKSAKA-------AASLSHMAQW--------------ESARLEA
Sb005866_Sorbi1 LHQPASP----PPLTRQEQDT--------GGGSPEKEEK--------------EKEKAVV
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Sb009095_Sorbi1 IIPPNVMFARPAPSEDGHSSSGGSTDAPR--CPDL------NLDLDLS-VGPPCSP----
Sb010610_Sorbi1 -------------------------------EARLA----REAKLRAI-VSPPPAPA---
Sb031046_Sorbi1 -------------------------------EVVLVGGEVAALEVGAEVVDPAEAA----
Sb014116_Sorbi1 ---GSGAGALGAPPCGFPAPPQTDDTIER-----------IKLGLSRAIMSEPGAPPGKQ
Sb003360_Sorbi1 E--GGAGEDDVAPMVQPHET---------------------------I-MAPPPPP----
Sb016715_Sorbi1 VVRSSGCSSRDS-SGDDDSTSGSSV--PH--QHQLV---VGGIDLNLS-LSPPTSQ----
Sb027621_Sorbi1 L--QNLLQSAASIATSPSSSSINTNTIPSDLE---------QIGL----LSPPQMS----
Sb031258_Sorbi1 L--QSLLQSAATTISS------------SDTEA-------PALGLGAICCSPPQ------
Sb011138_Sorbi1 -------------------------------EARLSL------------LATASSSSGAT
Sb023642_Sorbi1 -------------------------------ELVLLFREVAALEVGAEVVDPPEAA----
Sb023923_Sorbi1 -----TLLSSGPPAIGDHHQ--NGQLLPWILQAQMAQ--QAAAAMAQQ-VAPPPQQQ---
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb015849_Sorbi1 -------------------------------EARLA----RESKIRTA-TPTPTALH---
Sb005866_Sorbi1 ---------AATPSVG-HETFCADEVL-------------MAHLLDDI-VLPPP------
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Sb009095_Sorbi1 ---PKTPAAAVT------------------TPTSQQQ------------------EMQRA
Sb010610_Sorbi1 PGPGTGPAFISG----------------LESPTSTLSF-------------------SES
Sb031046_Sorbi1 -------ALAAAHQSGRL---------GQRPPAPFAVR-----------------ADVRH
Sb014116_Sorbi1 QQPPWAPADVTEGLAGMY---------ATYNPATHAQEEF----------RYDNGAVPEY
Sb003360_Sorbi1 -----TTAASNCG---------------------------------------------SA
Sb016715_Sorbi1 ---PSSPAAAN-------------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 -SLSTLPSPSFLESISGQDIAAAGQLPDIQIPSSFFE---------QQP----TSNDANQ
Sb031258_Sorbi1 --LTTTPLDSCTAPVSSS-----------LLPCTFPE---------AAPPVSSEEDEANN
Sb011138_Sorbi1 ATATTAAATTSASSSSTVDLKA-----CCAKPADIFLRLWSSD-------IGDSFRRSRK
Sb023642_Sorbi1 -------ALAAAQEAGGL---------GQRAPATLAVR-----------------LDVRH
Sb023923_Sorbi1 AE-QFMQAGAACQMPDLVHM--------NSNPTTVQQ------------------QLAAA
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb015849_Sorbi1 AQPTNVPASAASPCLDVLHGWQGAKI-DLESPTSTLTFTGSNSGMLPTP-RTNRLEVSES
Sb005866_Sorbi1 -------ATSNSGL---------------TNDTT-----------------------ASS
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Sb009095_Sorbi1 TICLC-------------------YHLGVRSGDACSC----------KTAASPAGFRFL-
Sb010610_Sorbi1 AQLFANAPPHDTHG------T--------PRHALTPP----------RS-----------
Sb031046_Sorbi1 QAVVLLLGPRALVRVRLLAARRP------PHR--------------------PASCLA--
Sb014116_Sorbi1 VLGGAGAGGDADQG-----------TSMWSHQSMYSGSSG------TEAAPRPMAA----
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Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 HSDFTPK--SSVEGENG------------TPKTLLL-----------SENSLPPL-----
Sb031258_Sorbi1 HQQQQTAGLSSSYGGLG------------SADDVFACHGG------SSSSSLPPL-----
Sb011138_Sorbi1 TAAAAPAVPALLPPAPVV---------VKRKQDAMMIK---------QEAQAPLLGPVGD
Sb023642_Sorbi1 EAVVLLLGPRALVGVRLLAARRP------PHDGGVVVRSAGRAPNQSDAATLPAAFLV--
Sb023923_Sorbi1 HQDMAAAACHSMQP---------------PNNTGYEV----------DSLDVPALMQMV-
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb015849_Sorbi1 NSVMWHQRSDELEG------EENDWQ-IFSKHQVLEL----------DS-----------
Sb005866_Sorbi1 PDSSSSSSSSSSSS---------------P--SSY-------------SASVPAAASSSG
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Sb009095_Sorbi1 ------RPLEEGQY----------------------------------------------
Sb010610_Sorbi1 ------YEEAFGELQPQQQRFGDAAA--PGFVLAGVLLDSSVA-----------------
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Sb014116_Sorbi1 ----------------------------LPEKGNDSVGSSGGG------------GGG--
Sb003360_Sorbi1 ------TGVEATEW--PEPVYLFGMDGIMDAGWAGLFPST---------------GAGAG
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Sb027621_Sorbi1 ------TDFPISNLG-------------------DACGASSCD------------GSS--
Sb031258_Sorbi1 ------TDLSDAHAGSLLQ---------VDGSMRSATASSSFG------------GGSS-
Sb011138_Sorbi1 DSSAASNETEVAEALEEYQMFLDFAG-------------------EELGLFHGRHGGFS-
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Sb023923_Sorbi1 ------QAADASNL----------------QQWSSTVTSSSNNNNNN----NNNVGSGVS
Sb010896_Sorbi1 --------IESIERFSIEMVYKFV------------------------------------
Sb015849_Sorbi1 ------KEREDDFIGCEEPWFSGMAG--VGSGFTSMLFDVSNE-----------------
Sb005866_Sorbi1 ----GSSGADDGEW--PE--WPQVMEWPESTMWLDDVVTT---------------GPATA
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Sb009095_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb031046_Sorbi1 ----RRLR-----RA----------------------GRGASSAIGLEN-----------
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Sb003360_Sorbi1 GCFGL---GGVDPF--------------DQYPGV---GVGGAGFDQDDGHWM--------
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 -----------IPFP-SWPEL--F---DEQF-----------------------------
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Sb011138_Sorbi1 ---------LFPPLD-VLAEA----SLDTAFK----------------------------
Sb023642_Sorbi1 LLLLLRVRSRCEPRP----------------------KLG--------------------
Sb023923_Sorbi1 TPSS-------SPV----ARL----NHSTSTTTTTYGGASASTSNDAAAAAALFNMQLSE
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb015849_Sorbi1 -------------------------HDASECWGESNNGHTEHSNQASDEEDKNYWNGVLD
Sb005866_Sorbi1 WEFE-------DPFVITYQRIDLFDDHDDQQ----------ETWNNDDGRVELF------
AT4G05100.1 YSFDVNGFLQFQ------------------------
Sb009095_Sorbi1 ----I-------------------------------
Sb010610_Sorbi1 M---VNSSMSSSSSSLTSDAVTDPAMYLPAAAAAEF
Sb031046_Sorbi1 ------------------------------------
Sb014116_Sorbi1 LPDELTNHMV--------------------------
Sb003360_Sorbi1 ------------------------------------
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 ----ICEFV---------------------------
Sb031258_Sorbi1 ----ITDFL---------------------------
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Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------
Sb015849_Sorbi1 M---VNSELTPQSPPLV-------------------
Sb005866_Sorbi1 ------------------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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Sb003360_Sorbi1 |
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Sb016715_Sorbi1 |
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Sb027621_Sorbi1 |
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Sb031258_Sorbi1 |
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Sb011138_Sorbi1 |
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Sb023642_Sorbi1 |
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Sb023923_Sorbi1 |
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Sb010896_Sorbi1 |
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Sb015849_Sorbi1 |
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Sb005866_Sorbi1 |
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