Input
| Putative repression domain
|
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AT4G06746.1 |
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|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
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| Type
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Os023742 |
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Os023742_Os06t0 -------MDRR-----EATVFLPPPPPPQPTQPQQQPAAAAVRAPVGGR-----------
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Os019236_Os04t0 -------MQGEYH-RSSSEDSAASAAAAAAAAAAAMAPLAAAAAAVAAKEEQAAAAAVLP
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Sb033446_Sorbi1 -LLPNQPGGWRGTPLP------SARRRSPRRLPRFRCRPRRCWAPVVERLRRRQGTAEAA
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gm047356_Glyma1 ------TTRYKGI-------------------------------------RMRKW-GKWV
* * *:
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.. *: :.
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*..* * .
AT4G06746.1 FPEEVFKDGNGGEG----------------------------------------------
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*
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Os019236_Os04t0 -------------------------ASEPREPDGGTLSAASIRKKAIEVGSRVDA-----
gm047992_Glyma1 --------------------------SVQHGAAAGNMSADSIRRKATQVGARVDA-----
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gm029915_Glyma1 --------------------------------GGCDMSAASIRKKASE------------
gm047356_Glyma1 ------------------------------------MSAASIRKKATEVGARVDA-----
: : .
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pt001651_POPTR_ -------FETAL-------------NHHHHR-------------HHDDRQRNSSNSTSSN
Sb033446_Sorbi1 ----PRTPTSTGS-----------------------------------------------
Os019236_Os04t0 -------LQTGMMVAPTTHHRERQKHHHHHHHHHPHLQPHGEEQHHHHEQKHQRTAWSG-
gm047992_Glyma1 -------LQTAL-------------HHHAS----------------------STN-----
pt016489_POPTR_ -------LQTAV-------------HASPED--------------------NS-------
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gm047356_Glyma1 -------LHRQ--------------HPHALP-----------------------------
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Sb033446_Sorbi1 -------------PPRTPQTT----SDFVVVLLLPHPSTTLLVLR---QNYSPKG-----
Os019236_Os04t0 -------------RAKNPDLN---------------------------QAPSPENSDAE-
gm047992_Glyma1 --------S--L----KPDLN---------------------------EFPKLESLQD--
pt016489_POPTR_ ---------RVL-LSEKPDLN---------------------------KFPENSDEE---
gm029915_Glyma1 -------GSGDF-AVRVVDLN---------------------------KMPEPESSDCE-
gm047356_Glyma1 --------AGEF-ADR-VDLN---------------------------KMPEPENSDCDY
:
AT4G06746.1 --------------
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pt001651_POPTR_ WERSLATGGNPMGC
Sb033446_Sorbi1 --------------
Os019236_Os04t0 --------------
gm047992_Glyma1 --------------
pt016489_POPTR_ --------------
gm029915_Glyma1 WNVN----------
gm047356_Glyma1 WDRD----------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT4G06746.1 |
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