Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G12050.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os007705 |
not found in 316aa |
AT4G22810.1 |
1st_not |
0.505446623 |
II |
Os023478 |
not found in 328aa |
AT4G22810.1 |
not_not |
0.470588235 |
III |
Os018659 |
not found in 305aa |
AT4G17800.1 |
not_not |
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III |
Os010541 |
not found in 266aa |
AT4G14465.1 |
not_not |
0.411764705 |
III |
Os009537 |
not found in 336aa |
AT4G35390.1 |
not_not |
0.405228758 |
III |
Sb027062 |
not found in 595aa |
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1st_not |
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II |
Sb029863 |
not found in 559aa |
AT4G17800.1 |
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III |
Sb033333 |
not found in 547aa |
AT4G22810.1 |
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III |
Sb010951 |
not found in 328aa |
AT4G35390.1 |
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0.407407407 |
III |
Sb021820 |
not found in 440aa |
AT4G12050.1 |
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II |
Gm002179 |
not found in 300aa |
AT4G22810.1 |
1st_not |
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II |
Gm029637 |
not found in 298aa |
AT4G22810.1 |
not_not |
0.518518518 |
III |
Gm011358 |
not found in 283aa |
AT4G12050.1 |
not_1st |
0.518518518 |
II |
Gm011357 |
not found in 283aa |
AT4G12050.1 |
not_1st |
0.518518518 |
II |
Gm047008 |
not found in 287aa |
AT4G22810.1 |
not_not |
0.501089324 |
III |
Gm001449 |
not found in 288aa |
AT2G45430.1 |
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III |
Gm005962 |
not found in 310aa |
AT2G45430.1 |
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0.485838779 |
III |
Gm029807 |
not found in 250aa |
AT4G17800.1 |
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0.429193899 |
III |
Gm026406 |
not found in 270aa |
AT4G14465.1 |
not_not |
0.429193899 |
III |
Gm055489 |
not found in 267aa |
AT4G14465.1 |
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0.427015250 |
III |
Gm012067 |
not found in 276aa |
AT4G17800.1 |
not_not |
0.424836601 |
III |
Gm002022 |
not found in 250aa |
AT4G17800.1 |
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0.422657952 |
III |
Gm027914 |
not found in 280aa |
AT4G14465.1 |
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0.422657952 |
III |
Gm054095 |
not found in 268aa |
AT4G14465.1 |
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0.420479302 |
III |
Gm025903 |
not found in 270aa |
AT4G17800.1 |
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0.418300653 |
III |
Gm050287 |
not found in 268aa |
AT4G17800.1 |
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0.416122004 |
III |
Gm055277 |
not found in 295aa |
AT4G14465.1 |
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0.413943355 |
III |
Gm048588 |
not found in 302aa |
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III |
Gm038768 |
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0.405228758 |
III |
Gm005047 |
not found in 211aa |
AT4G14465.1 |
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0.405228758 |
III |
Gm047209 |
not found in 254aa |
AT4G17800.1 |
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III |
Pt011455 |
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AT4G22810.1 |
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II |
Pt028640 |
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AT4G22810.1 |
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0.594771241 |
III |
Pt039340 |
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AT4G22810.1 |
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III |
Pt017143 |
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AT2G45430.1 |
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III |
Pt032727 |
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AT4G17800.1 |
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0.424836601 |
III |
Pt000774 |
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AT1G20900.1 |
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III |
Pt034782 |
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AT4G14465.1 |
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0.422657952 |
III |
Pt009910 |
not found in 298aa |
AT4G17800.1 |
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III |
Pt035739 |
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AT3G55560.1 |
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III |
Pt001435 |
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III |
Pt037731 |
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AT2G42940.1 |
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0.411764705 |
III |
Pt042069 |
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AT3G04570.1 |
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III |
Pt015327 |
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AT4G14465.1 |
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0.407407407 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT4G12050.1 ------------------------------MDPV---------QS-----HGS-------
pt039340_POPTR_ ------------------------------MDPV---------AA-----HG--------
gm048588_Glyma1 -------------------------------------------MA-NRWWAG--------
Sb033333_Sorbi1 PAAPSSIGTNARSLARPCARPRTRVAGRATMDPA---------VA-AAAAHGGGHHF---
Sb021820_Sorbi1 ----------LRDYCLLIISPRVVF-----IYGY-ENSRAGKSVA-GRQCGGRGDGEPRR
Sb010951_Sorbi1 ------------------------------MPGM-DPGGG----GSSRYFH---------
pt015327_POPTR_ -------------------------------------------MA-NRWWTG--------
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pt017143_POPTR_ ------------------------------MDPV---------SA-----HG--------
gm029807_Glyma1 ------------------------------MAGL-DLS-----TA-SPFV-Q--------
pt042069_POPTR_ -------------------------------------------MA-NRWWAG--------
gm005962_Glyma0 ------------------------------MDPV---------AA-----QG--------
gm029637_Glyma1 ------------------------------MDPI---------TA-----HG--------
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Os010541_Os02t0 ------------------------------------------------------------
pt001435_POPTR_ ------------------------------MAG-----------DSERI-----------
gm025903_Glyma0 ------------------------------MAGI-DLG-----SA-SHFVHH--------
gm050287_Glyma1 ------------------------------MAGI-DLG-----SA-SHFVHH--------
Os009537_Os02t0 ------------------------------MAGM-DPGGGGAGAGSSRYFH---------
pt011455_POPTR_ ------------------------------MDPV---------TA-----HG--------
Os018659_Os04t0 ------------------------------MAGL-DLG-----TAATRYVHQ--------
gm055277_Glyma2 ------------------------------MGPS-KHHML-ATVA-NPWWTG--------
pt035739_POPTR_ -------------------------------------------MA-NRWWAG--------
pt034782_POPTR_ ----------------------MKRVQRERLRAT-DHSTI---LA-NPWWTG--------
gm005047_Glyma0 -------------------------------------------MA-NRWWAG--------
gm038768_Glyma1 ------------------------------MFGE--------------------------
gm027914_Glyma1 -------------------------------------------MA-NRWWTG--------
gm012067_Glyma0 ------------------------------MAGL-DLG-----SA-SRFV-Q--------
gm047209_Glyma1 ------------------------------MAGL-DLG-----SA-SRFV-Q--------
gm011357_Glyma0 ------------------------------MDPI---------SA-----HG--------
gm002022_Glyma0 ------------------------------MAGL-DLG-----TA-SRFV-Q--------
gm054095_Glyma2 ------------------------------------------------------------
pt028640_POPTR_ ------------------------------MDPV---------TA-----HG--------
Sb027062_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
gm055489_Glyma2 -------------------------------------------MA-NRWWTG--------
gm026406_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm047008_Glyma1 ------------------------------MDPI---------SA-----HG--------
Sb029863_Sorbi1 ---------------------------QKSMAGL-DLG-----TAATRYVHQ--------
gm002179_Glyma0 ------------------------------MDPI---------TA-----HG--------
pt009910_POPTR_ ------------------------------MAGL-DLG-----TT-SRYVHQ--------
Os023478_Os06t0 ------------------------------MDP----------VT-AAAAHGGGHHHH--
pt037731_POPTR_ ------------------------------MAGAADLTFP--SLGSERI-----------
pt000774_POPTR_ ------------------------------MAGF-E---G----NNSRYVHGQN------
gm001449_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pt032727_POPTR_ ------------------------------MAGL-DLG-----TT-SRYVHQ--------
AT4G12050.1 -------QSSLPPPFHA-RD-------FQL--HL-----------QQQQQH-QQQ-HQQQ
pt039340_POPTR_ --------RPLPPPFHT-RD-------FHL--------------------H-QFQ-HQQQ
gm048588_Glyma1 -------NVGMI-----------------------------------------------R
Sb033333_Sorbi1 ----------AQP-----------VAPF---HHPFGGLGGHHHHLFPGQQHPAFQHFQEQ
Sb021820_Sorbi1 PLAAAGPSPRLRP--------------LPR-------------RRGPRQQR---------
Sb010951_Sorbi1 --------QLLRP-----------------------------------QQQ-QQP-----
pt015327_POPTR_ -------QVGLPG-----MD----------------------------------------
gm011358_Glyma0 --------HSLPPPFHT-RD-------LHL-HH-------------QQQQH-QFQ-SLNQ
pt017143_POPTR_ --------RPLPPPFHT-RD-------FHL--------------------H-QFQ-HHQQ
gm029807_Glyma1 -------SLH-RP------D-------F----------------------N--------Q
pt042069_POPTR_ -------NVAMSG-----GDPVSSIPSLHL---------------RNLEEE-STPPGSNR
gm005962_Glyma0 --------RPLPPPFLT-RD-------LHLHPH-----------------H-QFQPHHNN
gm029637_Glyma1 --------HSLPPPFHTARD-------LHL-HH-------------QQQQH-QFH-SLQ-
Os007705_Os02t0 --------HHLPPPFNT-RD-------FH--HH------------LQQQQH-QLH-----
Os010541_Os02t0 --------MGLPE-----QP----------------------------------------
pt001435_POPTR_ ------------------MER---------------------------------------
gm025903_Glyma0 -------RLQ-RP------D-------LED-------------------DE--------N
gm050287_Glyma1 -------RLE-RP------D-------LED-------------------DE--------N
Os009537_Os02t0 --------HLLRP-----------------------------------QQP-SPL-----
pt011455_POPTR_ --------HSLPPPFHT-RD-------FQLHHH------------QQQQQH-QFH-HQQQ
Os018659_Os04t0 -------LHHLHP------D-------LQL-------------------QH-SYAK---Q
gm055277_Glyma2 -------QGGLSG-----VD----------------------------------------
pt035739_POPTR_ -------NVAMRG-----VDPVSSSPSLHL---------------GNLEED-STPPGLNR
pt034782_POPTR_ -------QVGLPG-----LD----------------------------------------
gm005047_Glyma0 -------NV---------------------------------------------------
gm038768_Glyma1 ------------------MDR---------------------------------------
gm027914_Glyma1 -------SVGLE------------------------------------------------
gm012067_Glyma0 -------NLH-LP------D-------LHL-------------------QQ-NYQQ---P
gm047209_Glyma1 -------NLH-RP------D-------LHL-------------------QQ-NFQQHQDQ
gm011357_Glyma0 --------HSLPPPFHT-RD-------LHL-HH-------------QQQQH-QFQ-SLNQ
gm002022_Glyma0 -------SLH-RP------D-------F----------------------N--------Q
gm054095_Glyma2 ------------------------------------------------------------
pt028640_POPTR_ --------HSLPPPFHT-RD-------FQL-HH------------QQQQQH-QFH-HQQQ
Sb027062_Sorbi1 -------------------DNLL----INM------------------RNHMQFR-----
gm055489_Glyma2 -------SVGLE------------------------------------------------
gm026406_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm047008_Glyma1 --------HSLPPPFHT-RD-------LHL-HHQ-----------QQQQQH-QFQ-SLNQ
Sb029863_Sorbi1 -------LHHLHP------D-------LQL-------------------QH-SYAK---Q
gm002179_Glyma0 --------HSLPPPFHAGRD-------LHL-H---------------QQQH-QFH-SLQ-
pt009910_POPTR_ -------LHH-RP------D-------LQL-------------------QH--------Q
Os023478_Os06t0 ------HHFGAPP-----------VAAFH--HHPFHHGGGAH---YPA----AFQQFQEE
pt037731_POPTR_ ------------------MDR---------------------------------------
pt000774_POPTR_ ------HNNLLRP-----------------------------------ELH-LIQ-----
gm001449_Glyma0 ----------MP-----------------IIPH-----------------H-QFQPHHNH
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AT4G12050.1 QQQQFFLHHHQQPQRNLDQD--HEQQGGSI-L----------------NR------S-IK
pt039340_POPTR_ Q----------------NSE--DEQSGNGN-L----------------NR------G-QK
gm048588_Glyma1 E----------QELM-ENSN--NNNNNNNA-------TTTTPTNSSNSNTNANTN---TN
Sb033333_Sorbi1 Q---------------RQLELLGAGGGVPGGVNK--QELGVGGDD--SNNTINSA-G---
Sb021820_Sorbi1 ----------------QQQQ--RRGRRVAPACRRR---------------------GGGR
Sb010951_Sorbi1 -----------SPLS-PNSH--VKMEHHHKMS---------------PDKSPV---G---
pt015327_POPTR_ -----------------------TSTSSSSPMKK--PDLGISMSN--NNREATESGA-GK
gm011358_Glyma0 A-----------------TE--DENSGSSG--------------------------A-QK
pt017143_POPTR_ Q----------------NSE--DEQSGNGD-L----------------NR------G-QK
gm029807_Glyma1 Q---------------HDSG--EDAKQ---------------------------------
pt042069_POPTR_ L----------GPRR-EQNF--IDTNTNSPKT----TTTTTATAPSAQNQSQN-------
gm005962_Glyma0 Q----------------NTE--DE-AGNGR--------------------------G-QK
gm029637_Glyma1 -------------------E--DEQSGSSGGL----------------NLA-----A-HK
Os007705_Os02t0 ----------------LKTE--DDQGGGTPGVF--------------GSR------G-TK
Os010541_Os02t0 ------------------------SGSSGPK-----AELPVAKEP---EASPT-GGA-AA
pt001435_POPTR_ ----------------NQES--EKGHDRRPNMEAI-------------------------
gm025903_Glyma0 Q---------------QDQD--NNLND---------------------------------
gm050287_Glyma1 Q---------------QDQD--NNLNN---------------------------------
Os009537_Os02t0 -----------SPLS-PTSH--VKME-HSKMS---------------PDKSPV---G---
pt011455_POPTR_ Q----------------NSE--DEQSGSSSGL----------------NK------S-LK
Os018659_Os04t0 H---------------EPSD--DDPNGSGGGG----------------NSN-----G-GP
gm055277_Glyma2 -----------------------HPGTHSPGLGKRPSDLGISENSGGHNR----------
pt035739_POPTR_ L----------GPRR-EQDF--TDTNTSSPK------TTTTATPPSTQNQ----------
pt034782_POPTR_ ------------------------SSSNSPSLGKINRELSINETS---NRS-------GG
gm005047_Glyma0 ------------PVR-PNEQ--DDGDNN-----------PTPTNSGNSNTNVNA------
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gm027914_Glyma1 --------------------------NSGHSMKK--PDLGFSM----NESTVT-----GN
gm012067_Glyma0 R---------------HKRD--SEEQETPPNP-----------------GT-----ALAP
gm047209_Glyma1 Q---------------HQRD--LEEQKTPPNH-----------------RM-----G-AP
gm011357_Glyma0 A-----------------TE--DENSGSSG--------------------------A-QK
gm002022_Glyma0 Q---------------QESE--EDAK----------------------------------
gm054095_Glyma2 ------------------------------------MDLSINERSLVRERQ---------
pt028640_POPTR_ Q----------------NSE--DEQSGSSSGL----------------NK------S-LK
Sb027062_Sorbi1 ----------------RKFD--LHDTNSSKRWKK-------------RAKSLNHL-SCVC
gm055489_Glyma2 --------------------------NSGDSMKK--PDLGFSM----NESAVT-----GN
gm026406_Glyma1 ------------------------------------MDLSINERSLVRERQ-------EE
gm047008_Glyma1 A-----------------TE--DENSGSSG--------------------------A-QK
Sb029863_Sorbi1 P---------------EPSE--DDPHGSGGGGG--------------NSNN-----G-GP
gm002179_Glyma0 -------------------E--DEQSGSSGGL----------------NL------A-HK
pt009910_POPTR_ P---------------DPED--EDPNRAGDGL-----------------GS-----V-GR
Os023478_Os06t0 Q---------------QQLV---AAAAAAGGMAK--QEL---VDE--SNNTINSG-G---
pt037731_POPTR_ ----------------SQGL--EKVNNHRPSIEAI-------------------------
pt000774_POPTR_ -----------RPSSIPSSD--SRDNNNTPSP---------------PD-----------
gm001449_Glyma0 Q----------------NTE--DE-AGNGR--------------------------G-QK
pt032727_POPTR_ P---------------DPED--HDSNRAGGGLG---------------GGS-----G-GH
AT4G12050.1 MDREETSDNMDNIANTNS-------------------GSEGKEMSLHGGEGGSGGGGS--
pt039340_POPTR_ REHAEI-------ATNNN------------------NTAEGKEL------VPSSAGGE--
gm048588_Glyma1 TTEEE---------VSRD------------------NGEDQNQN-----------LGS--
Sb033333_Sorbi1 --------------SNGSGDGAV-------------AGADQQA---------GGGDGDQQ
Sb021820_Sorbi1 RRSSP---------AAGEAP----------------GVQEQAEAA------GGGDAGEPQ
Sb010951_Sorbi1 -GEAE---------AGGSGGGG----------------DQPSSSALVPVEGGSGGGGGS-
pt015327_POPTR_ EDEQE---------DERE------------------NSDEPRE-------------GA--
gm011358_Glyma0 REREE---------NSN----------------------------------NNEGAGE--
pt017143_POPTR_ REHDEI--------NNNN------------------NTVEGLEL------VPSSSGGE--
gm029807_Glyma1 ----------------------------------------------------SAEDGPH-
pt042069_POPTR_ REEQE---------DSRD------------------NTNNQES-------------GD--
gm005962_Glyma0 RDRDE---------NVGGGGGATT---------PPHGGGEGKE-------PGSEDGGG--
gm029637_Glyma1 REREE---------NNN---------------------SDGKE--------GGAGSAE--
Os007705_Os02t0 RDHDD-----DE--NSGNGHG---------------SGGDGGDLALVPPSGGGPDGAG--
Os010541_Os02t0 DHADE---------NNES------------------GGGEPRE-------------GA--
pt001435_POPTR_ ----------------------------------LVASKLPKAVP-----PISS-ARG--
gm025903_Glyma0 --------------------------------------HEGLDLI-------TPNPGP--
gm050287_Glyma1 --------------------------------------HEGLDLV-------TPNSGP--
Os009537_Os02t0 -EGDH---------AGGSGSGGVG------------GDHQPSSSAMVPVEGGSGSAGGS-
pt011455_POPTR_ RERDE---------NNNS-----------------MGNSEGKE-------LITSGSGE--
Os018659_Os04t0 YGD-----------------------------------HDG----------GSSSSGPAT
gm055277_Glyma2 EEDE-------------D------------------NRDEPKE-------------GA--
pt035739_POPTR_ -EEHE---------DSRD------------------NTNNQES-------------GD--
pt034782_POPTR_ RDEDD---------DDRD------------------TGDEAKE-------------GA--
gm005047_Glyma0 VTEDD---------ANTN------------------DGEDQNL-----------------
gm038768_Glyma1 ----------------------------------LISPKVPKAVS-----PVSSAAAE--
gm027914_Glyma1 HIGEED--------EDRE------------------NSDEPRE-------------GA--
gm012067_Glyma0 FDND-------------D------------------DKSQGLELA----------SGP--
gm047209_Glyma1 FDDD------------SD------------------DRSPGLELT----------SGP--
gm011357_Glyma0 REREE---------NSN----------------------------------NNEGAGE--
gm002022_Glyma0 -----------------------------------------------------PQDGP--
gm054095_Glyma2 EEDEE---------DERD------------------NGDEPKE-------------GA--
pt028640_POPTR_ RERDE---------SNNS-----------------MGNREGQE-------LITSGDGD--
Sb027062_Sorbi1 VRADQLLE------RRRTATGGARVPSVGCFWRQLHVAEQVRRQSLEEAWIHSAGGGELR
gm055489_Glyma2 HTGEE---------EEKE------------------NSDEPRE-------------GA--
gm026406_Glyma1 EEEEE---------DERD------------------NGDEPKE-------------GA--
gm047008_Glyma1 REREE---------NSN---------------------------------GNNEGAGE--
Sb029863_Sorbi1 YGE-----------------------------------HDG----------GSSSSGPGA
gm002179_Glyma0 REHEE---------NNNN------------------NSSDGKE-------GGGAGSGE--
pt009910_POPTR_ FSTDH---------NPDD------------------GLHQGLDLV-----ATAANSGP--
Os023478_Os06t0 --------------SNGSG------------------GEEQRQ-----------QSGEEQ
pt037731_POPTR_ ----------------------------------LMTPKLPKAVP-----PVSS-APD--
pt000774_POPTR_ ----H---------ANQTAH------------------HHPDSSAT------TSSGGGT-
gm001449_Glyma0 RDRDE---------NAGGGGGATT---------PPQGGGEGKE-------SGSGDGGG--
pt032727_POPTR_ FSTDH---------HHDD------------------GSHQGLDLV-----AAAANSGQ--
AT4G12050.1 -----------------GEQM-----------------------TRRPRGRPAGSKNKPK
pt039340_POPTR_ -----------------GE-I-----------------------TRRPRGRPAGSKNKPK
gm048588_Glyma1 -----------------H-----EGSEP-------------GSSGRRPRGRPAGSKNKPK
Sb033333_Sorbi1 Q----QQHA----------LV-----------------------MRRPRGRPAGSKNKPK
Sb021820_Sorbi1 RDALPRA----------GD-----------------------RQRRRHRGRHRGL--LPP
Sb010951_Sorbi1 -----------------GS----------------------GTPTRRPRGRPPGSKNKPK
pt015327_POPTR_ -----------------ID-I---------------------A-SRRPRGRPPGSKNKPK
gm011358_Glyma0 -----------------AE-I-----------------------TRRPRGRPAGSKNKPK
pt017143_POPTR_ -----------------GE-I-----------------------SRRPRGRPAGSKNKPK
gm029807_Glyma1 ------------H---QGDVV-----------------------GRRPRGRPAGSKNKPK
pt042069_POPTR_ -----------------HI-AH-ETIEPG-----------SGSTSRRPRGRPAGSKNKPK
gm005962_Glyma0 -----------------SD-M-----------------------GRRPRGRPAGSKNKPK
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** *. .
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.. : . . .
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gm055489_Glyma2 VAQFARRLQRGVSILSGSGTVVNVTIRQP-TA-PGA-VMALHGRFDILSLTGSFLPGP-S
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Sb029863_Sorbi1 VSTYARRRQRGVCVLSGSGVVTNVTLRQP-SAPTGA-VVTLHGRFEILSLSGSFLPPP-A
gm002179_Glyma0 VSAFARRRQRGVCIMSGTGTVTNVTLRQP-AS-SGA-VVTLHGRFEILSLAGSFLPPP-A
pt009910_POPTR_ VGNYARRRQRGICILSGAGTVTNVSIRQP-AA-AGS-IVTLHGRFEILSLSGSFLPPP-A
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: . * *
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Sb027062_Sorbi1 ARGAVSSAVWPAATRRGNQRQLVASTAA-----AATPVAVSAVLVIMLVVVALDV-----
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. * . .. *
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pt001435_POPTR_ ------------QNGRRH--------HLDIPD---------L-------Y--GMPQKL--
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pt028640_POPTR_ ------------GVGQQQQ---QPQQHQVMAE---Q--NAQL-------F-HGLPPNL--
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gm047008_Glyma1 ------------GVGQS----------QLLGG---D-ATAPL-------F-HGLPPNL--
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gm005047_Glyma0 ----------------------------------------------------
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Sb027062_Sorbi1 LLLLLLLEMVMEVAGV-----E------WWRKMVTVYGCCDRIHPLTGRIAN
gm055489_Glyma2 -----LSNG-QHLNH------E-AYSSSPW----------------------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT4G12050.1 |
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