Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G14540.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os004570 |
not found in 110aa |
AT3G53340.1 |
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III |
Os022924 |
not found in 143aa |
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0.594202898 |
III |
Os005512 |
not found in 177aa |
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III |
Os009649 |
not found in 254aa |
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0.565217391 |
III |
Os024527 |
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III |
Os005511 |
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III |
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not found in 167aa |
AT3G53340.1 |
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III |
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AT2G47810.1 |
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not found in 135aa |
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AT5G47670.1 |
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III |
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III |
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AT5G47640.1 |
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0.753623188 |
III |
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not found in 193aa |
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III |
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III |
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AT3G53340.1 |
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0.655797101 |
III |
Gm026833 |
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AT3G53340.1 |
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III |
Gm028165 |
not found in 174aa |
AT2G37060.3 |
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0.637681159 |
III |
Gm055239 |
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III |
Gm004139 |
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AT2G47810.1 |
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III |
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not found in 226aa |
AT5G47670.1 |
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III |
Gm026530 |
not found in 145aa |
AT2G47810.1 |
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III |
Gm024076 |
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AT2G47810.1 |
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0.557971014 |
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not found in 152aa |
AT2G13570.1 |
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III |
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III |
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not found in 181aa |
AT5G47670.1 |
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0.514492753 |
III |
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not found in 150aa |
AT1G09030.1 |
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III |
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not found in 98aa |
AT2G47810.1 |
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III |
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not found in 89aa |
AT2G47810.1 |
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0.452898550 |
III |
Gm006581 |
not found in 197aa |
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Pt043410 |
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AT3G53340.1 |
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Pt041090 |
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Pt035616 |
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Pt035614 |
not found in 182aa |
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AT2G47810.1 |
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AT5G47670.1 |
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AT1G09030.1 |
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III |
Sm020206 |
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AT5G47670.1 |
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III |
Sm020598 |
not found in 88aa |
AT2G13570.1 |
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0.416666666 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT4G14540.1 -----------------------MADS------------DNDSG-----GHKDGGNAS--
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pt001769_POPTR_ -----------------------MED------------ENHKNG-----TDGHSGESPES
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Os005511_Os01t0 MSRDLNFSGFNQLGRLQPMQGLPRASSSSTSAS---RDRDGGDG--------DGGGGGVT
pt014326_POPTR_ -----------------------MDD----------------------------------
gm007396_Glyma0 -----------------------MADGPASP----------GGG-----SHESG-DHSPR
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gm005596_Glyma0 -----------------------MAESD-----------NDSGG-----AQNAGNSGN--
gm028165_Glyma1 -----------------------MSDAPASP------------------SHESGGEQSPR
gm019412_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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Sm020206_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm012959_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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Sb026432_Sorbi1 -------------------------------------LKGPGGGVVG--AVHGGAEHEMT
pt043410_POPTR_ ----------------------MAAEAPASP----------GGG-----SHESG-DQSPR
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pt001709_POPTR_ -----------------------MD-----------------------------------
pt006104_POPTR_ -----------------------MGTAS----------SSTQAQL-----DGNAPHGRQ-
Sb003445_Sorbi1 -----------------------MNPQSPKTSAPCTLPVEPAAAVVP--NEAVATDKAPP
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gm055239_Glyma2 -----------------------MSDAPPSP------------------THESGGEQSPR
Os024527_Os06t0 -----------------------MEP-----------------------AFPNGGAAAPP
gm045576_Glyma1 -----------------------METGGFHGYR---KLPNTTAGLKLSVSDMNM---RQQ
gm006581_Glyma0 -----------------------MADS-----------DNDSGG-----AHNSGKGGK--
gm048942_Glyma1 -----------------------MADSD-----------NDSGG-----AHNAGKG----
gm028166_Glyma1 -----------------------MSDAPASP------------------SHESGGEQSPR
gm027754_Glyma1 -----------------------MDQ----------------------------------
pt035613_POPTR_ -----------------------MADNPTSP----------AAG-----SHESGGEQSPR
AT4G14540.1 -----------------------------TREQDRFLPIANVSRIMKKAL--------PA
Sb008970_Sorbi1 ----------GG-----------------YREQDRFLPIANISRIMKKAV--------PA
gm042284_Glyma1 ---------------------------------------------MKRIL--------PQ
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pt041090_POPTR_ ----------SG-----------------VREQDRYLPIANISRIMKKAL--------PA
gm045775_Glyma1 ---------------------------------------------MKQIL--------PP
Os004570_Os01t0 ----------SG----------------GVREQDRFLPIANISRIMKKAV--------PA
Sm020598_Selmo1 ------------------------------KDKDRHLPIANIGKIMKRVL--------PD
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gm004139_Glyma0 -------------E--------------VIKEQDRLLPIANVGRIMKQIL--------PP
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Sb019135_Sorbi1 -----------------------------GKEQDRFLPIANIGRIMRRAV--------PE
pt044860_POPTR_ ----------------FHTTT-DDISECTVREQDRFMPIANVIRIMRKML--------PP
Sb010924_Sorbi1 A-------PPL------------------IREQDRLMPIANVIRIMRRVL--------PA
gm024076_Glyma0 -------------N--------------IIKEQDRLLPIANVGRLMKQIL--------PQ
Os005512_Os01t0 -------------E--------------IIKEQDRLLPIANVGRIMKQIL--------PP
gm006497_Glyma0 -----------------------------VREQDQYMPIANVIRIMRRIL--------PA
gm019720_Glyma0 ----------------------------SNKEQDRFLPIANVGRIMKKVI--------PP
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Sb009278_Sorbi1 -----------------------------VRHDNNLLPIANVGRIMKDAL--------PP
gm026530_Glyma1 -------------G--------------VIKEQDRLLPIANVGRIMKQIL--------PP
Os009649_Os02t0 A-------APA------------------IREQDRLMPIANVIRIMRRVL--------PA
gm052458_Glyma1 ----------SN-----------------VREQDRYLPIANISRIMKKAL--------PA
gm055621_Glyma2 ------------------------------DVQDRALPIANVGRIMKQIL--------PP
pt041815_POPTR_ -------------G--------------VKLEQDRLLPIANVGRIMKQIL--------PA
pt001769_POPTR_ PCLKS-CSSSSN-N---HN---------NSKEQDHFLPIANVGRIMKKEI--------PG
pt035614_POPTR_ ----------SG-----------------VREQDRYLPIANISRIMKKAL--------PA
Os005511_Os01t0 ----------------------------MTNGQDNLLPIANVGRIMKDGL--------PP
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gm007396_Glyma0 ----------SN-----------------VREQDRYLPIANISRIMKKAL--------PA
pt035616_POPTR_ ----------SG-----------------VREQDRYLPIANISRIMKKAL--------PA
gm005596_Glyma0 ------------------------LSELSPREQDRFLPIANVSRIMKKAL--------PA
gm028165_Glyma1 G-------SLSG----------------AAREQDRYLPIANISRIMKKAL--------PP
gm019412_Glyma0 ---------------------------------------------MKQIL--------PP
pt015514_POPTR_ ------------------------------EEQDKLLPIANVGRIMKQIL--------PP
Sm020206_Selmo1 ------------------------------REQDRFMPIANVIRIMRKVL--------PA
gm012959_Glyma0 ---------------------------------------------MKKVI--------PP
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Sb026432_Sorbi1 GCGAG---TGAG-G--------RGGTRVVVSAWSGSAPARGCGRGGAVALELAVLVEVPA
pt043410_POPTR_ --------SNSN-----------------VREQDRFLPIANISRIMKKAL--------PA
gm019625_Glyma0 V-------ASSDQNCSNHSAA-GEENECTVREQDRFMPIANVIRIMRKIL--------PP
pt001709_POPTR_ ------------------------------DEQDRLLPIANVGRMMKKIL--------PP
pt006104_POPTR_ ----------------------DDINECTVREQDRFMPIANVIRIMRKIL--------PS
Sb003445_Sorbi1 P-------PTAN-TV-------------IIREQDRLMPVANVSRIMRQVL--------PP
pt043409_POPTR_ --------SNSN-----------------VREQDRFLPIANISRIMKKAL--------PA
gm055239_Glyma2 G-------SSSG-----------------AREQDRYLPIANISRIMKKAL--------PP
Os024527_Os06t0 PPMAAEQLPPAA-A--------------VVREQDRLMPIANVIRIMRRVL--------PP
gm045576_Glyma1 V-------ASSD-----HSAATGEENECTVREQDRFMPIANVIRIMRKIL--------PP
gm006581_Glyma0 ---------------------------VLPRELDRFLPIANVSRIMKKAL--------LA
gm048942_Glyma1 -------------------------SEMSPREQDRFLPIANVSRIMKKAL--------PA
gm028166_Glyma1 G-------SLSG----------------AAREQDRYLPIANISRIMKKAL--------PP
gm027754_Glyma1 ------------------------------DEQDRALPIANVSRIMKQIL--------PP
pt035613_POPTR_ ----------SG-----------------VREQDRYLPIANISRIMKKAL--------PA
:
AT4G14540.1 NA---KISKDAKETVQECVS---------EFISFITGEASDKCQREKRKTINGDDLLWAM
Sb008970_Sorbi1 NG---KIAKDAKETLQECVS---------EFISFVTSEASDKCQKEKRKTINGDDLLWAM
gm042284_Glyma1 NA---KISKEAKETMQECVS---------EFISFVTSEASEKCRKERRKTVNGDDICWAL
pt017365_POPTR_ NA---KISKEAKETMQECVS---------EFISFVTGEASDKCHKEKRKTVNGDDICWAL
pt041090_POPTR_ NG---KIAKDAKDTVQECVS---------EFISFVTSEASDKCQKEKRKTINGDDLLWAM
gm045775_Glyma1 NA---KISKESKETMQECVS---------EFISFVTSEASEKCRKERRKTVNGDDICWAL
Os004570_Os01t0 NG---KIAKDAKETLQECVS---------EFISFVTSEASDKCQKEKRKTINGEDLLFAM
Sm020598_Selmo1 NS---KMTKDAKDLVQECVS---------EFICFVTGIAADRCTKEKRKTINGDDILKAL
Os022924_Os05t0 NG---KIAKDSKESVQECVS---------EFISFITSEASDKCLKEKRKTINGDDLIWSM
gm004139_Glyma0 NA---KISKEAKETMQECVS---------EFISFVTGEASDKCHKEKRKTVNGDDICWAL
gm053423_Glyma2 HA---KISDDAKETIQECVS---------EYISFITAEANERCQREQRKTVTAEDVLWAM
Sb019135_Sorbi1 NG---KIAKDSKESIQECVS---------EFISFITSEASDKCMKERRKTINGDDIIWSL
pt044860_POPTR_ HG---KISDDAKETIQECVS---------EFISFITSEANERCQREQRKTITAEDVLYAM
Sb010924_Sorbi1 HA---KISDDAQETIQECVS---------EYISFITGEANERCQREQRKTITAEDVLWAM
gm024076_Glyma0 NA---KISKEAKETMQECVS---------EFISFVTSEASEKCRKERRKTVNGDDICWAL
Os005512_Os01t0 NA---KISKEAKETMQECVS---------EFISFVTGEASDKCHKEKRKTVNGDDVCWAF
gm006497_Glyma0 HA---KISDDAKETIQECVS---------EYISFITAEANERCQREQRKTVTAEDVLWAM
gm019720_Glyma0 NG---KISKDAKETVQECVS---------EFISFVTGEASDKCQREKRKTINGDDVIWAI
gm026833_Glyma1 NG---KIAKDAKETVQECVS---------EFISFVTSEASDKCQREKRKTINGDDLLWAM
Sb009278_Sorbi1 QA---KISKHAKETIQECAT---------EFVGFVTGEASERCRRERRKTINGDDICHAM
gm026530_Glyma1 NA---KISKEAKETMQESVS---------EFISFVTGEASDKCHKEKRKTVNGDDICWAL
Os009649_Os02t0 HA---KISDDAKETIQECVS---------EYISFITGEANERCQREQRKTITAEDVLWAM
gm052458_Glyma1 NG---KIAKDAKETVQECVS---------EFISFITSEASDKCQREKRKTINGDDLLWAM
gm055621_Glyma2 SA---KISKEGKQLMQECVT---------EFISFVTGEASDKCHKENRKTVNGDDICWAL
pt041815_POPTR_ NA---KISKEAKETMQECAS---------EFISFVTGEASEKCRKERRKTVNGDDVCWAM
pt001769_POPTR_ NG---KISKDAKETVQECVS---------EFISFVTGEASDKCQREKRKTINGDDIIWAI
pt035614_POPTR_ NG---KIAKDAKDTVQECVS---------EFISFVTSEASDKCQKEKRKTINGDDLLWAM
Os005511_Os01t0 QA---KISKRAKETIQECAT---------EFISFVTGEASERCRRERRKTVNGDDVCHAM
pt014326_POPTR_ TA---RVSKEAKQRMQECAT---------EFISFVTSEASNKCRKENRKALNGDDVCWAL
gm007396_Glyma0 NG---KIAKDAKETVQECVS---------EFISFITSEASDKCQREKRKTINGDDLLWAM
pt035616_POPTR_ NG---KIAKDAKDTVQECVS---------EFISFVTSEASDKCQKEKRKTINGDDLLWAM
gm005596_Glyma0 NA---KISKDAKETVQECVS---------EFISFITGEASDKCQREKRKTINGDDLLWAM
gm028165_Glyma1 NG---KIAKDAKDTMQECVS---------EFISFITSEASEKCQKEKRKTINGDDLLWAM
gm019412_Glyma0 NA---KISKESKETMQECVS---------EFISFVTSEASEKCRKERRKTVNGDDICWAL
pt015514_POPTR_ TA---KISKEAKQTMQECAT---------EFISFVTGEASDKCHKENRKTVNGDDICWAL
Sm020206_Selmo1 HA---KISDDAKETIQECVS---------EFISFITSEANDKCQREQRKTITAEDLLWAM
gm012959_Glyma0 NG---KISKDAKETVQECVS---------EFISFVTGEASDKCQREKRKTINGDDVIWAI
pt035615_POPTR_ NG---KIAKDAKDTVQECVS---------EFISFVTSEASDKCQKEKRKTINGDDLLWAM
Sb026432_Sorbi1 HGVDVVVEAEGAEGPADVVAVDGLALLLVALVGCLAGDEADEL---------GDALLHRL
pt043410_POPTR_ NG---KIAKDAKETVQECVS---------EFISFITSEASDKCQREKRKTINGDDLLWAM
gm019625_Glyma0 HA---KISDDAKETIQECVS---------EYISFITGEANERCQREQRKTITAEDVLWAM
pt001709_POPTR_ TA---KISKEAKQTMQECAT---------EFVSFVTGEASDKCQKENRKTVNGDDICWAL
pt006104_POPTR_ HA---KISDDAKETIQECVS---------EYISFITSEANERCQREQRKTITAEDVLYAM
Sb003445_Sorbi1 YA---KISDDAKEVIQECVS---------EFISFVTGEANERCHTERRKTVASEDIVWAL
pt043409_POPTR_ NG---KIAKDAKETVQECVS---------EFISFITSEASDKCQREKRKTINGDDLLWAM
gm055239_Glyma2 NG---KIAKDAKDTMQECVS---------EFISFITSEASEKCQKEKRKTINGDDLLWAM
Os024527_Os06t0 HA---KISDDAKEVIQECVS---------EFISFVTGEANDRCHREHRKTVTAEDLVWAM
gm045576_Glyma1 HA---KISDDAKETIQECVS---------EYISFITGEANERCQREQRKTITAEDVLWAM
gm006581_Glyma0 NA---KILKYAKETVQECVS---------EFISFIIDEASDKCQREKRKATSSASKKWKE
gm048942_Glyma1 NA---KISKDAKETVQECVS---------EFISFITGEASDKCQREKRKTINGDDLLWAM
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gm027754_Glyma1 SA---KISKEGKQVMQECVT---------EFISFVTGEASDKCHKENRKTVNGDDICWAL
pt035613_POPTR_ NG---KIAKDAKDTVQECVS---------EFISFVTSEASDKCQKEKRKTINGDDLLWAM
. : . : : .: : : :. .
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* *
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gm012959_Glyma0 ------------------------HDQ-NNQPFNGAYASSNL-ISQ-------PPYVPTD
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gm019625_Glyma0 T-----------YVRETPPNAASSHHHH---------GISNA-------HEPNARSI---
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AT4G14540.1 ----------
Sb008970_Sorbi1 ----------
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Os005512_Os01t0 ----------
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Sb009278_Sorbi1 ----------
gm026530_Glyma1 ----------
Os009649_Os02t0 ----------
gm052458_Glyma1 ----------
gm055621_Glyma2 ----------
pt041815_POPTR_ ----------
pt001769_POPTR_ ----------
pt035614_POPTR_ ------EKDF
Os005511_Os01t0 ----------
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Sm020206_Selmo1 ----------
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pt035615_POPTR_ ------EKDF
Sb026432_Sorbi1 ----------
pt043410_POPTR_ ----------
gm019625_Glyma0 ----------
pt001709_POPTR_ ----------
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Sb003445_Sorbi1 ----------
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gm027754_Glyma1 ----------
pt035613_POPTR_ ------EKDF
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT4G14540.1 |
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gm048942_Glyma1 |
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gm028166_Glyma1 |
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gm027754_Glyma1 |
Y |
L |
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pt035613_POPTR_ |
N |
A |
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Q |
F |
A |
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AT4G14540.1 |
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Sb008970_Sorbi1 |
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C |
L |
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K |
N |
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Os004570_Os01t0 |
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Sm020598_Selmo1 |
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Os022924_Os05t0 |
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