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Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT4G14550.1 ------------------------------------------------------------ pt033721_POPTR_ --------------MA-------------------------------------------- gm028045_Glyma1 ------------------------------------------------------------ Os041779_Os12t0 --------------MAA------------------------------------------- gm007181_Glyma0 --------------MEV------------------------------------------- pt001265_POPTR_ --------------MEV------------------------------------------- pt039463_POPTR_ --------------MEV------------------------------------------- Sb031861_Sorbi1 LDEHLPRHVADEHPVAV----------------------------------------LVL gm055369_Glyma2 --------------MTAKQTKQHYNRKRTQSEREGSYSHKEKNFQRGESKRVLLFLFYIY pt001264_POPTR_ --------------MEV------------------------------------------- AT4G14550.1 -------------------------MNLKETELCLGL-----P-----------GGTETV pt033721_POPTR_ -------------TATVLGTEMA-DLNYKETELCLGL-----P--------GAVGVKNEV gm028045_Glyma1 -------------MTTMLTNEHGLSLNLKETELCLGL-----P-----------GGGSEV Os041779_Os12t0 ------------------------DLAFEATELRLGL-----P--------GGGGDGDAA gm007181_Glyma0 ------------------GLNKKENMGFEETELRLGL-----P--------GNVGGTGTE pt001265_POPTR_ --------------------EKGTKMRFEETELRLGL-----P--------GNGGGGTEG pt039463_POPTR_ --------------------EKGTKMGFEETELRLGL-----P--------GNGGGAE-- Sb031861_Sorbi1 VGRH--------------------VLGAVEQIHQLALVHAVHP------LRPTASNGEGA gm055369_Glyma2 LGAKLCEFIDKPEMATMLTKEHG--LNLKETELCLGL-----PGGGGGGGGGGGGGGGEV pt001264_POPTR_ --------------------EKGTKMRFEETELRLGL-----P--------GNGGGGTEG : *.* * . AT4G14550.1 ESP-AKSGVGNKRGFSE------------TVDLKLNLQS---------NKQ--GHVDLNT pt033721_POPTR_ ETPNKATG---KRGFAE------------TVDLKLNLQA----------KE--GVMDLNE gm028045_Glyma1 ETP-RATG---KRGFSE------------TVDLKLNLQT----------KE-----DLNE Os041779_Os12t0 AAA-ARSS-SGKRGFAE------------TIDLKLKLEPAAAAVDDDDDKE-EAAAD--D gm007181_Glyma0 EVL------IRKRGFSETETETEEDESATTVDLMLNLSS----------KEAAAAADPTD pt001265_POPTR_ GEF------ARKRGFSE------------TVDLKLNLSS----------KE--GGIDP-N pt039463_POPTR_ GEM------VRKRGFSE------------TVDLKLKLSS----------KE--SGADP-N Sb031861_Sorbi1 EHLLERLG----------------QLLVALVHLEVHLAQV---------RR-AVQAHLHE gm055369_Glyma2 ETP-RATG---KRGFSE------------TVDLKLNLHS----------KE-----DLNE pt001264_POPTR_ GEF------ARKRGFSE------------TVDLKLNLSS----------KE--GGIDP-N :.* ::* :. . AT4G14550.1 NGA--------------------------PKEKTFL----------------KDPSKPPA pt033721_POPTR_ NIKN--I---------------------ASKDKNHLPADT-----------IKDPAKPPA gm028045_Glyma1 NLKN--V----------------------SKEKTLL----------------KDPAKPPA Os041779_Os12t0 REKKVDIVGADNDDASPPAAAAAGGMKRSPSQSSVVTAA-------------ADPEKPRA gm007181_Glyma0 KHKT--L----------------------PKEKTLLP---------------ADPAKPPA pt001265_POPTR_ HEKT-------------------------QREKNLLA---------------TDPAKPPA pt039463_POPTR_ HEKTSSL----------------------QREKNLLA---------------TDPAKPPA Sb031861_Sorbi1 RRTTASC----------------------RRRRGLVGVFAAAGALVGLHGHDVLPERPDR gm055369_Glyma2 NLKN--V----------------------SKEKTLL----------------KDPAKPPA pt001264_POPTR_ HEKT-------------------------QREKNLLA---------------TDPAKPPA . : * :* AT4G14550.1 -KAQVVGWPPVRNYRKNV--------MANQKSGEAE------------------------ pt033721_POPTR_ -KAQVVGWPPVRSYRKNV--------LA-QKNASEEGFRAQVVGWPPLRSYRKNVLTQKN gm028045_Glyma1 -KAQVVGWPPVRSYRKNM--------MAVQKVSNEE-------------------VAEKT Os041779_Os12t0 PKAQVVGWPPVRSYRKNI--------LAVQADKGKD-----------------------A gm007181_Glyma0 -KAQVVGWPPVRSFRKNM--------LAVQKSVGEE------------------------ pt001265_POPTR_ -KAQVVGWPPVRSFRKNM--------LAVQKSSTDQ------------------------ pt039463_POPTR_ -KAQVVGWPPVRSFRKNM--------LAVQKSSTDQ------------------------ Sb031861_Sorbi1 -------WP---SHHLSLGGARLLGGVSLHGGGGDD----AALARGPLHL---------P gm055369_Glyma2 -KAQVVGWPPVRSYRKNM--------MAVQKVSTED-------------------VAEKT pt001264_POPTR_ -KAQVVGWPPVRSFRKNM--------LAVQKSSTDQ------------------------ ** ..: .: :: : : AT4G14550.1 ---------E-AMSS--GGGTVAFVKVSMDGAPY---LRKVDLKMYTSYKDLSDALAKMF pt033721_POPTR_ ASE----EGD-KAST--GGSSAAFVKVCMDGAPY---LRKVDLKMYKSYQELSDALAKMF gm028045_Glyma1 TS-----------ST--IANSGAFVKVSMDGAPY---LRKVDLTMYKSYKDLSDALAKMF Os041779_Os12t0 ADG----GGD-KSGA--GAAAAAFVKVSMDGAPY---LRKVDLKMYKSYLELSKALEKMF gm007181_Glyma0 ---------N-EKNS--SSPNASFVKVSMDGAPY---LRKVDLKMYKSYRELSDSLGKMF pt001265_POPTR_ ---------ESTDKV--PGGNATFVKVSMDGAPY---LRKVDLKMYKTYHELSDALGKMF pt039463_POPTR_ ---------E-CEKV--PGGNATFVKVSMDGAPY---LRKVDLKMYKTYQELSDALGKMF Sb031861_Sorbi1 ADGGLLRGGH-AAGVFLGGGNTVLMLVRLRRLQYGRGSRRLQLQLEV------------- gm055369_Glyma2 TS-----------ST---ANPGAFVKVSMDGAPY---LRKVDLTMYKSYKELSDALAKMF pt001264_POPTR_ ---------ESTDKV--PGGNATFVKVSMDGAPY---LRKVDLKMYKTYHELSDALGKMF . :: * : * *:::* : AT4G14550.1 SSFTMGSYGAQGMIDFMNESKVMDLLNSSEYVPSYEDK---------------------- pt033721_POPTR_ SSFTMGNYGAQGMIDFMNESKLMDLLNSSEYVPSYEDK---------------------- gm028045_Glyma1 SSFTMGNYGAQGMIDFMNESKLMDLLNSSEYVPTYEDK---------------------- Os041779_Os12t0 SSFTIGNCGSHGV-NGMNESKIADLLNGSEYVPTYEDK---------------------- gm007181_Glyma0 SSFTIGNCESQGMKDFMNESKLNDLLNSSDYVPTYEDK---------------------- pt001265_POPTR_ SSFTIGNCGSHGMKDFLNESKLIDLLNGTDYVPTYEDK---------------------- pt039463_POPTR_ SSFTIGNCGSHGLKDFLNESKLIDLLNGTDYVPTYEDK---------------------- Sb031861_Sorbi1 --------------DGLCEAP---LPGGDDRAPPFADHLSPAAGQAQTELRLLEPQVRRR gm055369_Glyma2 SSFTMGNYGAQGMIDFMNESKLMDLLNSSEYVPSYEDK---------------------- pt001264_POPTR_ SSFTIGNCGSHGMKDFLNESKLIDLLNGTDYVPTYEDK---------------------- : : *: * .. : .*.: *: AT4G14550.1 -------------DGDWMLVGDVPWPMFVESCKRLRIMKGSEAI--------GLA-PRAM pt033721_POPTR_ -------------DGDWMLVGDVPWEMFVDSCKRLRIMKGSEAI--------GLA-PRAM gm028045_Glyma1 -------------DGDWMLVGDVPWEMFVGSCKRLRIMKGSEAI--------GLA-PRAM Os041779_Os12t0 -------------DGDWMLVGDVPWEMFVESCKRLRIMKGSEAI--------GLA-PRAM gm007181_Glyma0 -------------DGDWMLVGDVPWEMFVESCKRLRIMKGKEAIG------LGLA-PRAM pt001265_POPTR_ -------------DGDWMLVGDVPWDMFVESCKRLRIMKGTEAT--------GLG-NEYT pt039463_POPTR_ -------------DGDWMLVGDVPWDMFVESCKRLRIMKGTEAT--------GLA-PRAM Sb031861_Sorbi1 HCCCRRHWPSSSPLGSRLLL--LPCFCFV--CFALLASQDEEAGWLCKCKGGGFANARGL gm055369_Glyma2 -------------DGDWMLVGDVPWEMFVESCKRLRIMKGSEAI--------GLA-PRAM pt001264_POPTR_ -------------DGDWMLVGDVPWDMFVESCKRLRIMKGTEAT--------GLA-PRAM *. :*: :* ** * * :. ** *:. . AT4G14550.1 EKFKNRS-- pt033721_POPTR_ EKCKSRT-- gm028045_Glyma1 EKCKSRS-- Os041779_Os12t0 EKCKNRS-- gm007181_Glyma0 AKSKNRS-- pt001265_POPTR_ A-------- pt039463_POPTR_ EKCKNRSYK Sb031861_Sorbi1 GRGATTT-- gm055369_Glyma2 EKCKSRS-- pt001264_POPTR_ EKCKNRSFK
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