|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT4G14550.1 ------------------------------------------------------------ pt011954_POPTR_ MSSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMEKISDKLS pt015737_POPTR_ MTSIM----------------------------G---AE-------PEKYSM-------- pt002101_POPTR_ MTSIM----------------------------G---AET------ADTYSM-------- pt002787_POPTR_ -----------------------------------MAYESD------------------- pt039771_POPTR_ -MSPPLLGVVEEEGHSNVTLLASPASAESACLNGLELKERNYMGL-SDCSSVDS------ pt040947_POPTR_ -------------------------------MEGGVAYEND------------------- pt028468_POPTR_ -MSPE---------------------------NGSNLLESD------------------- pt030401_POPTR_ MYSIP--------------------------------KEHDYIGL-SETPSMENISEKLS pt005605_POPTR_ -MSMP--------------------------------LEHDYIGISSEVSSMENTSG--- AT4G14550.1 --------------------------------MNLKETELCLGLPGG------------- pt011954_POPTR_ S---SSSTLSTEENIN---SNSNSNSNSTNTSLNLKETELRLGLPGYQSPERKLTLPAAG pt015737_POPTR_ --------------------------------INFEETELRLGLPGG------------- pt002101_POPTR_ --------------------------------INYEETELRLGLPGG------------- pt002787_POPTR_ --------------------------------LNLKATELRLGLPGSDEPEKPSTTP--- pt039771_POPTR_ -------------------SAVSAASDERKTSLNLKATELRLGLPGSQSPERNHELSLLS pt040947_POPTR_ --------------------------------LNLKETELRLGLPGTGCTNEKGVS---- pt028468_POPTR_ -----------------------------AANVSFKETELTLGLPGESR----------G pt030401_POPTR_ SSSTSSSTLSTEEKNNSSSSNSNNNNKNNNTSLNMKETELRLGLPGSQSPERKPTVPAAG pt005605_POPTR_ -------------------TDTINISTTASKGLNLKATELRLGLPGSDSPERGNENQQLG :. : *** ***** AT4G14550.1 -----------TETVESPAKSG-------VGNKRGFSETVD-------------LKLN-- pt011954_POPTR_ VSLFGKD----IDTNNTNGYPLRPLKNLVSGTKRGFSDAIVGSSGKWVFSGSNGSEVDLG pt015737_POPTR_ -----------IGNGNDGEVAK-------SNGKRGFSETVD-------------LKLN-- pt002101_POPTR_ -----------ASNGNDGEAAK-------GNGKRGFSETVD-------------LKLN-- pt002787_POPTR_ ---------------------------SVRSNKRASPEISEESRSK-------------- pt039771_POPTR_ SALLDEKPFFPLHPSNDGHYSSTQ-KNVVSGNKRVFSDAMDEFSESKFLSN---SEVN-- pt040947_POPTR_ ---------------------------GARNNKRPFPETREEGGAN-------------- pt028468_POPTR_ LALIEK-----------------------TSGKRGFLETVD---------------LNL- pt030401_POPTR_ VSLVGKD----IDTNNTNAYSLIPVKNLVSGAKRVFSDAIDGSTGKWVFSG--------- pt005605_POPTR_ FSL-----------NNNNSKD----KSFVSGARRGFSVAIHGGSANWVFSGNAGSDPN-- . :* AT4G14550.1 -----LQSNKQ-------------GHVDLNTNG----------APKE------KTFLK-- pt011954_POPTR_ KGAILFSPR---------------GD-----NGNSQKSCVAGPAKKDDVAQSPKP-VQEK pt015737_POPTR_ -----LSTKES-------------GK------G----------GDEE------K-VMKEK pt002101_POPTR_ -----LSTKET-------------GK-----DG----------SDQE------KVVMKEK pt002787_POPTR_ ------------------------GSSSVSSNV----------ENGE------------- pt039771_POPTR_ ---AMLSPRPSPNMGLKPGMLENLGV-----QQAKVKEIVAPKAGQE------RPHAANE pt040947_POPTR_ ------------------------GKSDAQH------------DDQE------------- pt028468_POPTR_ ------------------------GR---SSNVDSDHNKYSGESETD------VP----- pt030401_POPTR_ ------------------------GD-----NGNPQKSRVAGPAKK-DVAQSPKP-VQEK pt005605_POPTR_ -----FSLR---------------GA-----N-----------SGKEGFPHSSKPVVQEN * AT4G14550.1 -----------DPSKP---------PAKAQVVGWPPVRNYRKNVMANQKSG--EAEEAMS pt011954_POPTR_ ISQVAAANEN--SSAP---------AAKAQVVGWPPIRSFRKNTMASSLVKNNEDVEGKS pt015737_POPTR_ T--VAPPAST-DPAKP---------PAKAQVVGWPPIRSFRKNVMAVQKNSNDNGEKSGS pt002101_POPTR_ T--VA-PRPN-DPAKP---------PSKAQVVGWPPIRSFRKNVMAVQKNSNDEGEKASS pt002787_POPTR_ -----------RDSAP---------PAKAQVVGWPPIRSYRKNCLQPKKNDQVDGA---- pt039771_POPTR_ TRPLRNSSAN-NSSAP---------APKAQVVGWPPIKSFRKNSLATT-SKNTEEVDGKA pt040947_POPTR_ -----------TASAPNTYSFDMHATCRVQIVGWPPIRSYRKNSLQPKKAEDEAAA---- pt028468_POPTR_ -----------NTAKP--------PAAKAQVVGWPPVRAYRKNAMKS------------- pt030401_POPTR_ NSQVAAANEN--SSAP---------AAKTQVVGWPPIRSFRKNTMASSLAKNNEDVDGKS pt005605_POPTR_ KSQVDGANTNGHGAAP---------ASKAQVVGWPPIRSFRKNTMASHLSKNDDGAEVKS : * . :.*:*****:: :*** : AT4G14550.1 SGG-GTVAFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYTSYKDLSDALAKMFSS--FTMGSYGAQGM--I pt011954_POPTR_ GYG---CLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTYSNYLELSSALEKMFSC--FTIGQCGSHGLRGQ pt015737_POPTR_ SGT--GVAFVKVSMDGAPYLRKVDLKLYKSYQELSDALGKMFSS--FTIGNCGSQGM--K pt002101_POPTR_ SGTTGTAAFVKVSMDGAPYLRKVDLKLYKSYRELSDALGKMFSS--FTIGNCGSQGT--K pt002787_POPTR_ ------GMYVKVSVDGAPYLRKIDLKVYKSYPELLKALENMFK---LTIGEYSENEG--- pt039771_POPTR_ GPG---ALFIKVSMDGAPYLRKVDLRNYSAYQELSSALEKMFSC--FTIGQYGSHGAPGR pt040947_POPTR_ ------GMYVKVSMDGAPYLRKIDLKVYKGYPELLKALENMFK---LTIGEYSEREG--- pt028468_POPTR_ ------CKYVKVAVDGAPYLRKVDLEMYNSYQQLLNALQDMFSCFSFTI----------R pt030401_POPTR_ GYG---YLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTYGNYLELSSALEKMFGC--FTIGQCGSHGLAAR pt005605_POPTR_ GSG---CLYVKVSMDGAPYLRKVDLKTFGSYMELSSALEKMFSC--FTIGQCGSHVVPGQ ::**::********:**. : * :* .** .** :*: AT4G14550.1 DFMNESKVMD--LLNSSEYVPSYEDKDGDWMLVGDVPWPMFVESCKRLRIMKGSEAIGLA pt011954_POPTR_ DGLTESRLKD--ILHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFTNSCRRLRIMKGSEAIGLA pt015737_POPTR_ DFMNESKLID--LLNGSDYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFVDSCKRLRIMKGSEAIGLA pt002101_POPTR_ DFMNESKLID--LLNSSEYVPTYEDKDGDWMLVGDVPWGMFVDSCKRLRIMKGSEAIGLA pt002787_POPTR_ -------------YNGSEFAPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFISSCKRLRIMKGSEARGLG pt039771_POPTR_ EMLSESKLKD--LLHGSEYVLTYEDKDGDWMLVGDVPWEMFIETCKRLRIMKSSDAIGLA pt040947_POPTR_ -------------YKGSEYAPTYEDKDGDWMLVGDVPWDMFLSSCKKLRIMKGSEAIGLG pt028468_POPTR_ NYLNERTIMEQEVNNGVEYVPTYEDKDGDWMMLGDVPWKMFVESCKRLRLMKSSEATGFA pt030401_POPTR_ DGLTESCLKD---LHGSEYVLTFEDKDGDWMLVGDVPWDMFTDSCRRLRIMKGSEAIGLA pt005605_POPTR_ DGLSESRLMD--LLHGSEYVLTYEDKDNDWMLVGDVPWKMFTDSCRRLRIMKGSEAIGLA :. ::. ::****.***::***** ** .:*::**:**.*:* *:. AT4G14550.1 PRAMEKFKNRS pt011954_POPTR_ PRAMEKCKNRN pt015737_POPTR_ PRAVEKCKNRI pt002101_POPTR_ PRAVEKCKNRS pt002787_POPTR_ C---------- pt039771_POPTR_ PRAMEKCKNRN pt040947_POPTR_ CGA-------- pt028468_POPTR_ PRTPSKCSSSS pt030401_POPTR_ PRAMEKCKNRN pt005605_POPTR_ PRAMEKCKSRN
|