Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G16750.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os009088 |
LPDLLLDLRYGPPSSGLS in 180/225 |
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II |
Os018335 |
not found in 217aa |
AT2G35700.1 |
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0.430267062 |
III |
Os009087 |
not found in 287aa |
AT2G44940.1 |
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III |
Os018333 |
not found in 284aa |
AT2G44940.1 |
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III |
Os018334 |
not found in 247aa |
AT2G35700.1 |
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III |
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not found in 365aa |
AT2G44940.1 |
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II |
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not found in 226aa |
AT2G44940.1 |
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III |
Sb011106 |
not found in 284aa |
AT2G44940.1 |
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III |
Sb014392 |
not found in 254aa |
AT2G35700.1 |
not_not |
0.409495548 |
III |
Sb014391 |
not found in 321aa |
AT2G44940.1 |
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III |
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II |
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III |
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not found in 287aa |
AT2G44940.1 |
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0.430267062 |
III |
Gm039871 |
not found in 244aa |
AT5G11590.1 |
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III |
Gm018205 |
not found in 258aa |
AT2G44940.1 |
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III |
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not found in 242aa |
AT5G25810.1 |
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0.412462908 |
III |
Gm025360 |
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AT5G11590.1 |
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III |
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AT5G11590.1 |
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III |
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not found in 149aa |
AT4G16750.1 |
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II |
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not found in 188aa |
AT5G11590.1 |
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III |
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II |
Pt010682 |
not found in 225aa |
AT4G16750.1 |
not_1st |
0.459940652 |
II |
Pt007862 |
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III |
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AT1G77200.1 |
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III |
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AT2G44940.1 |
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III |
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AT2G44940.1 |
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0.427299703 |
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III |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT4G16750.1 ------------------MQDSSSHESQRNLRSPVPEK-----------------T---G
pt010682_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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gm009314_Glyma0 ------------------------MRVSTETEPET-------------------------
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pt016119_POPTR_ ------------------MEKHIILEIDAQDNSLTSSS-----------------T-STT
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Sb014391_Sorbi1 MD--------------APAQRAMAVDTGN---APTTSC-----------------S---S
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Os018333_Os04t0 ----------------------MEADASH---TPTTSS-----------------S---V
Os009088_Os02t0 ------------------------MDDSSFGSEPTTSS-----------------SGGEA
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Os018335_Os04t0 ------------------------MDDSHDLASPTSPD-----------------T---A
pt040183_POPTR_ -------MPLALARDLPIMEKHINLEIDAQDNPLASSS-----------------T-TTS
Sb027952_Sorbi1 --------------------------------AKYSTV--------------FYWT--QY
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Sb014393_Sorbi1 ------------------------VSTPQSLRPNSSTTAAPLHRQARRKPPW---TWTTL
pt007862_POPTR_ ------------------------MTDPLTSNSNSKKD-----------------S--SS
Os018334_Os04t0 ------------------------MEQEQVMSQESNSC-----------------T---C
pt008221_POPTR_ ------------------------MSDHHQQNSETESS-----------------S--TN
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gm025360_Glyma0 ------------------------MVEPPAAAATSESD-----------------T--TG
pt005791_POPTR_ ------------------------MSDHQQQNLETESS-----------------S--TK
Sb014392_Sorbi1 -------------------MSSSLMEHEQV---SEGCC-----------------T---C
Sb011106_Sorbi1 ------------------------MEADALLHAPTTSS-----------------S---C
pt008334_POPTR_ ------------------------MTVSPVSNSNSDTD-----------------S--TS
AT4G16750.1 KSS------------------------------------------------KTKN-----
pt010682_POPTR_ ----------MKDSTKQ-VSQNSSKRN----------------QDP-NNYESDKQAK---
gm011442_Glyma0 TTPSTSSSSSIEEATN-------TTKE------------------------KKKK-A---
gm009314_Glyma0 --------------------------------------------------KKIKRIRG--
pt029884_POPTR_ TSSFSSFPSPMKNSRKQDQSQDSSKRN----------------QDPKNNNESNKKAK---
gm047086_Glyma1 TTPSTSSSSSIEEATN------TTTKE------------------------KKKKRA---
pt016119_POPTR_ TTTTTTSSSSSSFSTTISYTDRISKKEENSIADPKGSRKSQELQ-SGNEGNKKRKTT---
gm039871_Glyma1 SFLPPSP-SPSPSSPPS------------------------------SEFKTEKRNR---
Sb014391_Sorbi1 SSSTSSSSV-------------VNDAPQEVVP-----------KNSCKGTNKRKRASSPD
pt011904_POPTR_ NSPPPSLATTITNKLNKQ-----------------------------NPIQQSSRSKVR-
gm040871_Glyma1 CHETPSSSTSTSNSSTSK-------PPKRNKT---------------EKQSKAKRNR---
Os009087_Os02t0 SDS------------GSCVTNGTREKREISK----------------HKQLKRKRSTSP-
gm018205_Glyma0 ST--------SSSSTSPTSNSESCTKEHSKTPQNDSTTSQTSLENGKDSKGCKKRQI---
Os018333_Os04t0 SVSFSSSSLSTSSSTSSLVDNGAQDRPKSSKP-----------KHAAK---KRKRAA---
Os009088_Os02t0 PASPPSTASSSSDGAGG----------------------------------KKKR-----
gm020101_Glyma0 KHSS---------SEAHL--------PAPDQ-------------------KRPKQARD--
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pt040183_POPTR_ TTKGNISSSSTPISCI---KHQGSKKEENSIA-PRVSRKAQELQSSGNEGGKRRKTA---
Sb027952_Sorbi1 SHSSGSSRRNAPAAAPE-------------------------------------------
gm006781_Glyma0 STSSSSSSSSSSSSTSPTSNKDSCTKEHTKTPQNDSTISQTSLENKEDSKECKKRQR---
Sb014393_Sorbi1 RSLPPRPPRPRPPPPPPL----PRRPPWARRS------------GRARTAAVTRRTAAC-
pt007862_POPTR_ IYSYFSSPTPSSTSSSGLSPN-PVSKPDPEKN-----------------LRKPKRPRE--
Os018334_Os04t0 SSSS---NDASSAACSSL----NASSPSSVDS-----------GSAGGGGGGKKR-----
pt008221_POPTR_ SLSPASPSSPLSNSTQSK-------KPLKDQD--------------FSPSKKIKRIR---
gm029710_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm025360_Glyma0 NTNTPSPSSSSSSSSSK------------------------------------KRARDN-
pt005791_POPTR_ AFSPPSPSSPSSNSNPSK-------KHQQDQD--------------FSPCKKITRIR---
Sb014392_Sorbi1 SSSSFSNTTTTSGGGGSL----NASSPSSSDD------------SGGGGNKGTKR-----
Sb011106_Sorbi1 SDSG----------GGSCVINGAQER--LSKT-----------GGKPHKNVKRKRTAS--
pt008334_POPTR_ TYSS-SLQALSSSSSSGLSPN-PVSKPDPEEN-----------------PRKPKRPRES-
AT4G16750.1 ------------------------------------------------------------
pt010682_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm011442_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm009314_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pt029884_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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Sb014391_Sorbi1 SQEQEVEANGSTNNGHHQGEESSSCCCSTDDTEASVGDDK---A-------EEAAAATAT
pt011904_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm040871_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Os009087_Os02t0 -------APPPGCGG-GQGQEAA---VETDADAGAAGEEESSSCGGAGAG--------EG
gm018205_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Os018333_Os04t0 -------AEEPANAAHGAGEDTSS--CSTDDNAAASGKAQ---AGGGGGGVDSSSTCTAA
Os009088_Os02t0 ------------------------------------------------------------
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Sb014393_Sorbi1 ------------------------------------------ACGAGASGCRRSGS--PA
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gm029710_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm025360_Glyma0 -----------------------------------------------------------N
pt005791_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Sb014392_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb011106_Sorbi1 -------SPPAAPGGVAVAPEAT---VDDD-------------CGGGGG----------R
pt008334_POPTR_ -----------------------------------------------------------T
AT4G16750.1 --EQKGVS-KQPN--FRGVRMRQWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFSTPEMAARAHDVAAL
pt010682_POPTR_ --RRGNAG-RHPS--YRGVRMRQWGKWVSEIRQPKKKSRIWLGTFSTPEMAARAHDVAAL
gm011442_Glyma0 --NSN-EG-KHPT--YRGVRMRQWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPDMAARAHDVAAL
gm009314_Glyma0 ---GGDSS-KHPL--YRGVRMRNWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAAL
pt029884_POPTR_ --SGGNAG-RHPS--YRGVRMRQWGKWVSEIRQPKKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAAL
gm047086_Glyma1 --ISNIEG-KHPT--YRGVRMRQWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPDMAARAHDVAAL
pt016119_POPTR_ --RNENNG-KHPT--YRGVRMRSWGKWVCEIREPRKKSRIWLGTYPTAEMAARAHDVAAL
gm039871_Glyma1 -----ESN-KHPV--YRGVRMRNWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAAL
Sb014391_Sorbi1 RSSRSG-Y-KHPS--YRGVRRRSWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTAEMAARAHDVAAL
pt011904_POPTR_ -----DCS-KHPV--YRGVRRRAWGKWVSEIRQPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAAL
gm040871_Glyma1 -----DPT-KHPD--YHGVRMRNWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFATPEMAARAHDVAAL
Os009087_Os02t0 ERKRGDAG-RHPS--YRGVRRRSWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTAEMAARAHDVAAL
gm018205_Glyma0 --DNSNQN-HHPT--YRGVRMRNWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTYPTAEMAARAHDVAAL
Os018333_Os04t0 SAPRSG-F-KHPS--YRGVRRRSWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTAEMAARAHDVAAL
Os009088_Os02t0 --PRKD-G-HHPT--YRGVRMRSWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFATAEMAARAHDVAAL
gm020101_Glyma0 -----SSS-KHPV--FRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKNRIWLGTFATAEMAARAHDVAAL
Os018335_Os04t0 --PRND-G-RHPT--YRGVRMRSWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFATAEMAARAHDVAAL
pt040183_POPTR_ --ENEKNG-KHPT--YRGVRMRSWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTYPTAEMAARAHDVAAL
Sb027952_Sorbi1 ---------KHTSSYHDGAHESSWHDEAPCLRSRRRSGR----------SNSASSGLSSV
gm006781_Glyma0 --DNSNQN-HHPT--YRGVRMRNWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTYPTAEMAARAHDVAAL
Sb014393_Sorbi1 RSPASGWA-PSPP--RRWRRART--TWR---RSPSRAPATRTSTSRPRRTCSRARP----
pt007862_POPTR_ -TNSSNNS-KHPV--FRGVRMRTWGKWVSEIREPRKKNRIWLGTFSTPEMAARAHDVAAL
Os018334_Os04t0 --PRSDHL-KHPT--YRGVRMRSWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFDTAEMAARAHDVAAL
pt008221_POPTR_ -----DSN-KHPV--YRGVRMRNWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAAL
gm029710_Glyma1 --------------------MRKWGKWVSEIREPKKKSRIWLGSFSTPEMAARAHDVAAL
gm025360_Glyma0 NNSNSSSN-KHSV--YRGVRMRTWGKWVSEIREPRKKNRIWLGTFATAEMAARAHDVAAL
pt005791_POPTR_ -----DSS-KHPV--YRGVRMRNWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEKAARAHDAAAL
Sb014392_Sorbi1 --PRRD-L-KHPT--YRGVRMRTWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFDNPEMAARAHDAAAV
Sb011106_Sorbi1 QRKRGSAGTRHPT--FRGVRMRVWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTAEMAARAHDVAAL
pt008334_POPTR_ STSSNSNS-KHPV--FRGVRMRTWGKWVSEIREPRKKNRIWLGTFSTPEMAARAHDVAAL
*. : : :
AT4G16750.1 AIKGGSAHLNFPELAYHL-PRPAS-----------ADPKDIQEAAAA-AAAVDW------
pt010682_POPTR_ TIKGHSAHLNFPELAHEF-PRPAS-----------SSPKDIQAAAAL-AATLSC---KTS
gm011442_Glyma0 TIKGSSAYLNFPELADEL-PRPAS-----------TSPKDIQAAAAK-AAALDFGH-RSH
gm009314_Glyma0 SIKGPAAILNFPHLANSL-PRPAS-----------LAPRDVQAAAAK-AAHMD-------
pt029884_POPTR_ TIKGHSAHLNFPELAHEF-PRPAS-----------SSPKDIQAAAAL-AATLSC---KTS
gm047086_Glyma1 TIKGSSAYLNFPELAAKL-PRPAS-----------TSPKDIQAAAAK-ASALDFGH-QSH
pt016119_POPTR_ AIKGGSAYLNFPELVDEL-PRPLS-----------KSPKDIQAAAAK-AAAASFPETRHC
gm039871_Glyma1 SIKGNSAILNFPELAASL-PRPVS-----------LAPRDVQAAAAK-AAHMDLP-----
Sb014391_Sorbi1 AIKGRAAHLNFPDRAHEL-PRPAS-----------TSPA-AAAQAA--AGAADVQCDAPP
pt011904_POPTR_ CIKGDSAILNFPELADSL-PRPVS-----------VMPRDIQSAAAK-AAAMVEF-----
gm040871_Glyma1 SIKGHTAILNFPNIVNML-PRPVT-----------CAPRDIQAAAAE-AAAMVEF-----
Os009087_Os02t0 AIKGRAAHLNFPSLAHTL-PRPAS-----------TSPSDIQAAAAL-AAAA-----AAT
gm018205_Glyma0 AIKGHSAYLNFPELAQEL-PRPVS-----------TSPKDIQAAAAK-AANTAFEEVRHC
Os018333_Os04t0 AIKGRNAHLNFPDSAHEL-PRPES-----------TSPADIQAAAA--KAAAEVRCEEES
Os009088_Os02t0 AIKGRAAHLNFPDLAHEL-PRPAT-----------AAPKDVQAAAAL-AAAADFPASSAN
gm020101_Glyma0 AIKGNSAILNFPELAASL-PRPDS-----------NSPRDVQAAAAK-AAAMEVN-DVPT
Os018335_Os04t0 AIKGRTAHLNFPDLAHLL-PRPAT-----------AAPKDVQAAALLAAAAADFPSVSVD
pt040183_POPTR_ AIKGGSAYLNFPEFAHEL-PPPLS-----------KSPKDIQAAAAK-AAAASFTETRYC
Sb027952_Sorbi1 VAGGGEAEAETSSEAALA-SGPQS----------SSAPAALAGVAGKSAAAASAAAAWTS
gm006781_Glyma0 AIKGHSAYLNFPELAQEL-PRPAS-----------TSPKDIQAAASK-AANTAFEVVKHC
Sb014393_Sorbi1 -----------PRRPRTCRPRPRSPPPPTSLLCRRRAPAPVKAQAMPRAPRAAAPTTPAP
pt007862_POPTR_ SIKGNSAILNFPGLAGSL-PRPAS-----------NSPRDVQAAAAK-AASMDFNSTVTT
Os018334_Os04t0 AIKGRTVHLNFPDLAHLL-PRAAS-----------ASPKDVQAAAAL-AAAT-----ASP
pt008221_POPTR_ SIKGNPAILNFPELANYL-PRPAS-----------LAPRDVQAAAAK-AAQMDQF-----
gm029710_Glyma1 TIKGTSAFLNFPELASHL-PRPLT-----------TSPKDIQAAAAK-AAALNF------
gm025360_Glyma0 TIKGSSAILNFPELAATL-PRPAS-----------NSPRDVQAAAAK-AASMEAP-----
pt005791_POPTR_ SIKGNSAILNFPELANSL-PRPAS-----------LAPRDVQAAAAK-AAQMDNF-----
Sb014392_Sorbi1 AIKGRAAHLNFPDLAHEL-PRAAS-----------AAPKDVQAAAAL-AAATV---VVAA
Sb011106_Sorbi1 AIKGRAAHLNFPHLAHEL-PRPAS-----------TSPADIQAAAAK-AAAA-----AAA
pt008334_POPTR_ SIKGNSAILNFPKLAGSL-PRPAS-----------NSPRDVQAAAAK-AASMDFN-IVPS
. . . : * *
AT4G16750.1 -------------------KAPE------------------------------------S
pt010682_POPTR_ QKG---------------RETEAE---AELMLPRSLDSTLASNETQEYSL-NSPLR----
gm011442_Glyma0 DAE---------------SELSRA---VSSSIL-----------TQASSS-SSNSS----
gm009314_Glyma0 ---------------------------------------------------PSSLS---S
pt029884_POPTR_ PKG---------------RETEAE---DELMLPHSPDSTLASNETQEYSL-SSPLR----
gm047086_Glyma1 EAE---------------SELSQA---VSSSIQ-----------TQSSSS-SSN-S----
pt016119_POPTR_ EAE---------------AEAEADMSHAELNVSN-LSDNLAMDNIQESSS-SPS------
gm039871_Glyma1 ----------------------STSSSISSSL--------VPTTQSASSS-SSSLS---S
Sb014391_Sorbi1 SPS----------------PSPSPSSSAELLLP----SSPAADADASPEQ-AAAACC-LC
pt011904_POPTR_ ------------------------------------------NSPSPSSS-LSSSS---V
gm040871_Glyma1 ---------------------DREGSEAESS-----------------------------
Os009087_Os02t0 ----------------------DQCESSSSAVA----AATATDAEAAEST-SSAAA---S
gm018205_Glyma0 QIT---------------EE-EAEQNQAEQASS----STLSMDNPQEPSS-SHS------
Os018333_Os04t0 SPS----------------SSP----TAE-----------------QPEE-EAA-----C
Os009088_Os02t0 AGA---------------SNNPDGSDDAS-----------AGSASP-PP----------P
gm020101_Glyma0 TPS---------------------SSSSSAS-----------LSLSQSSS-WSSLA---V
Os018335_Os04t0 ANA----------------KSPDTCSVAS-----------A--ASPQPP----------P
pt040183_POPTR_ EGE---------------GGGE-----AELNVSN-LSDSLAMDNTQESSS-SPS------
Sb027952_Sorbi1 LGA------------------------------------AVAGRGSSPAS-SGKLRCAAR
gm006781_Glyma0 QIT---------------EEQEQEQNQAEQETS----STLSMDNTQEPSS-SHS------
Sb014393_Sorbi1 APR------------RRPRPRPRRRRPRRRT-----------PSPTRTTRCSTSRTC---
pt007862_POPTR_ VTTNVCNDENNSN-NNSTASNNNGSSSSQMT-----------QSSSSSSS-SSSST---V
Os018334_Os04t0 APA----------------LSPTPCHDVD----------AAADDEPEPA----------E
pt008221_POPTR_ ----------------------DQKSETTTT-----------TSPSSSS--TSSLT---S
gm029710_Glyma1 EAQ---------------VEAQAQ---AQLSI---------------PSS-SSE------
gm025360_Glyma0 -----------------------------------------PRTPPSPAS----------
pt005791_POPTR_ ----------------------DQKSETTTT-----------TTASSSSSCTSSLT---S
Sb014392_Sorbi1 SPA----------------VVPSSCGHDD----------ADAETEDLPP-----------
Sb011106_Sorbi1 AAD----------------ADVEQCESSSHHIA---------ETPSSSSS-SAANS---E
pt008334_POPTR_ APTKVCDDENNSNSNDSTASNNNRSSSSLVT-----------QSSSSPSS-SSTAE---V
AT4G16750.1 PSSTV--------------------TSSPVADDAF---SDLPDLLLDVND----------
pt010682_POPTR_ ----------------------------DDDDDTF---IDLPDILQGISH----------
gm011442_Glyma0 --------------------------SLKGVDDTF---LDLPDLSLDLSH----------
gm009314_Glyma0 LVSAM---------------------DLSSASDELSQIIELPSLESTDDG----------
pt029884_POPTR_ ----------------------------DDGDDTF---IDLPDILQD-QY----------
gm047086_Glyma1 --------------------------SLKGVDDTF---LDLPDLSLDLSH----------
pt016119_POPTR_ ----------------------------TDVDDKL---FDLPDLFIDGVN----------
gm039871_Glyma1 LTSAD---------------------LLPTASEELSEIIKLPRLETT-------------
Sb014391_Sorbi1 PEATM---------TTTHGDGGGGQGQGQGQESAL---FDLPDLLLDLRD----------
pt011904_POPTR_ TVSED---------------------VAESEEEYLSEIVELPNIEGSFDS----------
gm040871_Glyma1 ---------------------------------ELSEIVELPNIEESFE-----------
Os009087_Os02t0 PCAAT----------------------SSVEENAL---FDLPDLLLDLSD----------
gm018205_Glyma0 ----------------------------TIDDDTL---FDLPDLFPDGNN----------
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Os009088_Os02t0 PDA---------------------------ADDAL---FDLPDLLLDLRYG---------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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