|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT4G18890.1 ------------------------------------------------------------ Os007138_Os02t0 ------------------------------------------------------------ pt030016_POPTR_ ------------------------------------------------------------ gm037331_Glyma1 ------------------------------------------------------------ pt030017_POPTR_ ------------------------------------------------------------ gm034552_Glyma1 ------------------------------------------------------------ pt026020_POPTR_ ------------------------------------------------------------ pt025437_POPTR_ ------------------------------------------------------------ gm034553_Glyma1 ------------------------------------------------------------ gm037329_Glyma1 ------------------------------------------------------------ Sb033896_Sorbi1 RLAAAAVTAEQRRLRSDYHYQFLLLRRFLPLLLLCSAPSPPPKFHTSNNKQIKASKGEQG Os025252_Os06t0 ------------------------------------------------------------ AT4G18890.1 -----------------------MTSGT------------RTPTWKERENNKRRERRRRA Os007138_Os02t0 -----------------------MMNGG---------GGGRVPTWRERENNRRRERRRRA pt030016_POPTR_ -----------------------MTSGT------------RLPTWKERENNKRRERRRRA gm037331_Glyma1 -----------------------MTSVA------------RQPTWKERENNKRRERRRRA pt030017_POPTR_ -----------------------MTSGT------------RLPTWKERENNKRRERRRRA gm034552_Glyma1 -----------------------MTSGA------------RQPTWKERENNKRRERRRRA pt026020_POPTR_ -----------------------MTSGT------------RLPTWKERENNKRRERRRRA pt025437_POPTR_ ------------------------------------------------------------ gm034553_Glyma1 -----------------------MTSGT------------RLPTWKERENNKKRERRRRA gm037329_Glyma1 -----------------------MTSVA------------RQPTWKERENNKRRERRRRA Sb033896_Sorbi1 TAGVCVCAAPAGQIREIRRSGAPMTSGA--GGAAAGIGGTRVPTWRERENNRRRERRRRA Os025252_Os06t0 -----------------------MTNGAGGGGGGGGLGGTRVPTWRERENNRRRERRRRA AT4G18890.1 IAAKIFAGLRIHGNFKLPKHCDNNEVLKALCNEAGWTVEDDGTTYRKGCK-P-MDRMDLM Os007138_Os02t0 IAAKIYAGLRAYGNYTLPKHCDNNEVLKALCNEAGWTVEPDGTTYRKGCKPPASELADQL pt030016_POPTR_ IAAKIFSGLRMYGNYKLPKHCDNNEVLKALCNEAGWTVEPDGTTFRKGCK-P-VERMDIL gm037331_Glyma1 IAAKIFSGLRMYGNYKLPKHCDNNEVLKALCNEAGWTVEADGTTYRKGCKPP-VERMDIV pt030017_POPTR_ IAAKIFSGLRMYGNYKLPKHCDNNEVLKALCNEAGWTVEPDGTTFRKGCK-P-VERMDIL gm034552_Glyma1 IAAKIFSGLRMYGNYKLPKHCDNNEVLKALCNEAGWTVEADGTTYRKGCKPP-VERMDIV pt026020_POPTR_ IAAKIFSGLRMYGNFKLPKHCDNNEVLKALCNEAGWAVEPDGTTYRKGCK-P-AEHMDII pt025437_POPTR_ --------------------------------------------------------MDII gm034553_Glyma1 IAAKIFAGLRMYGNFKLPKHCDNNEVLKALCNKAGWTVEPDGTTYRKGCK-P-SEGMEIV gm037329_Glyma1 IAAKIFSGLRMYGNYKLPKHCDNNEVLKALCNEAGWTVEADGTTYRKGCKPP-VERMDIV Sb033896_Sorbi1 IAAKIFAGLRAYGNYNLPKHCDNNEVLKALCNEAGWTVEPDGTTYRKGCKPLATERPDPI Os025252_Os06t0 IAAKIYAGLRAYGNYNLPKHCDNNEVLKALCNEAGWTVEPDGTTYRKGCKPPQAERPDPI : : AT4G18890.1 NG-STSASPCSSYQHSPRASYNPSPSSSSFPSPTNPF------------GDANSLIPWLK Os007138_Os02t0 GR-SPSASPCSSYQPSPR-------GTSSFPSSGSSSQITLGGG---GGGEGSSLIPWLK pt030016_POPTR_ GV-SATTSPCSSYHPSPCASYNPSPGSSSFPSPASSSYAANAN------MDCNSLIPWLK gm037331_Glyma1 GG-SAAASPCSSYHPSPCASYNPSPGSSCLPSPRASPFPPNPN------ADGNSLIPWLK pt030017_POPTR_ GV-SATTSPCSSYHPSPCASYNPSPGSSSFPSPASSSYAANAN------MDCNSLIPWLK gm034552_Glyma1 GG-SAAASPCSSYHPSPCASYNPSPGSSCLPSPRASPYPPNHN------ADGNSLIPWLK pt026020_POPTR_ GG-SATASPCSSYLPSPCASYNPSPGSSSFPSPVSSSYAANAN------LDDNSLLPWLK pt025437_POPTR_ GG-SASASPCSSYHQSPCASYNPSPASSSFPSPVSSRYAANGNGN--VDADANSLIPWLR gm034553_Glyma1 GGSSAAASPCSSYHPSPCASYNPSPGSS------SPYYTQIPN------PDGNSLIPWLK gm037329_Glyma1 GG-SAAASPCSSYHPSPCASYNPSPGSSCLPSPRASPFPPNPN------ADGNSLIPWLK Sb033896_Sorbi1 GR-SASPSPCSSYQPSPRASYNPSPASSSFPSSGSSSHITLGGNNFMGGVEGNSLIPWLK Os025252_Os06t0 GR-SASPSPCSSYQPSPRASYNPSPASSSFPSSGSSSHITIGGNSLIGGVEGSSLIPWLK . *.:.****** ** .:* . : .**:***: AT4G18890.1 NL-------SSNSPSKLP-----FFHGNSISAPVTPPLARSPT-----------RD---- Os007138_Os02t0 TLSSAGVGIGGGSSSKFPA-HYSYFGGGSISAPVTPPSG-SPP-RTPRLKTAAWEEYHHH pt030016_POPTR_ NLSSAS---SSASSSKFPH---LYIHGGSISAPVTPPLS-SPTARTARIKA-DWED---- gm037331_Glyma1 NLSSGS---SSASSSKLPQ---LYIPNGSISAPVTPPIS-SPSSRKPQIRA-DWED---- pt030017_POPTR_ NLSSAS---SSASSSKFPH---LYIHGGSISAPVTPPLS-SPTARTARIKA-DWED---- gm034552_Glyma1 NLSSGS---SSASSSKLPQ---LYIPNGSISAPVTPPIS-SPSSRKPRINA-DWED---- pt026020_POPTR_ NL-------SSASSSKLPH---LYIHGGSISAPVTPPLS-SPTARTPRIKT-GWED---- pt025437_POPTR_ NLSSGS---SSASPKHPNH---LFIHTGSISAPVTPPLS-SPTARTPRTRN-DWDD---- gm034553_Glyma1 NLSTAS---SSASSPKLPH---LYLHSGSISAPVTPPLS-SPTARTPRINA-EWDE---- gm037329_Glyma1 NLSSGS---SSASSSKLPQ---LYIPNGSISAPVTPPIS-SPSSRKPQIRA-DWED---- Sb033896_Sorbi1 NLSSSS---SFASSSKFPQLHHLYFNGGSISAPVTPPSS-SPT-RTPRIKT-DWEN---- Os025252_Os06t0 TLPLSS---SYASSSKFPQLHHLYFNGGSISAPVTPPSS-SPT-RTPRLRT-DWEN---- .* . *. : :: .********* . **. : AT4G18890.1 --QVTIP--------------------------------------------DSGWLSGMQ Os007138_Os02t0 HAGSVL--PPWATVGASYAYAASSSLPNSTPPSPR-RKVAAAAAAAGGGNDAAAWLAGFQ pt030016_POPTR_ --QSIR--PGWG--GQHYSFL-----PSSTPPSPG-RQIVP----------DPEWFRGIR gm037331_Glyma1 --QSNCP-TAWG--GPAYTFV-----PSSTPPSPG-RQVA-----------ETDWFSKIR pt030017_POPTR_ --QSIR--PGWG--GQHYSFL-----PSSTPPSPG-RQIVP----------DPEWFRGIR gm034552_Glyma1 --LSTRP-AAWG--GPAYTFL-----PSSTPPSPG-RQVA-----------ETDWFSKIR pt026020_POPTR_ --QPIH--PGWC--GQHY--L-----PSSTPPSPG-RQIVP----------DPGWFAGIR pt025437_POPTR_ --PAAG--QSWM--GQNYSFLPS-SMPSSTPPSPG-RQVLP----------DSGWLAGIQ gm034553_Glyma1 --QSARPGPGWTR-QQHYSFL-----PSSSPPSPG-RQVV-----------DPEWFAGIK gm037329_Glyma1 --QSNCP-TAWG--GPAYTFV-----PSSTPPSPG-RQVA-----------ETDWFSKIR Sb033896_Sorbi1 --PSVQ--PPWA--GANYA-----SLPNSQPPSPGHHQVAP----------DPAWLAGFQ Os025252_Os06t0 --ASVQ--PPWA--SANYT-----SLPNSTPPSPG-HKIAP----------DPAWLSGFQ . *: :: AT4G18890.1 TPQSG--PSSPTFSLVS--RNPF-FDKEAFKMGD--CNSPMW-TPGQSGNCSPAIPAGVD Os007138_Os02t0 ISSAG--PSSPTYSLVAPPPNPFGAAAAAAG-----SSSRV-----MSGACSP-VAGG-- pt030016_POPTR_ IPQGG--PTSPTFSLVA--SNPFGFKEEAFGGGGSNGGSRMW-TPGQSGTCSPAIAAGSD gm037331_Glyma1 IPQGGLAPTSPTFSLVS--SNPFGLKEDAMVG----SGSRMWTTPGASGTCSPAVAAGSE pt030017_POPTR_ IPQGG--PTSPTFSLVA--SNPFGFKEEAFGGGGSNGGSRMW-TPGQSGTCSPAIAAGSD gm034552_Glyma1 IPQVGLTPTSPTFSLVS--SNPFGFKEDAMGG----SGSRMWTTPGASGTCSPAVAAGSE pt026020_POPTR_ LPQGG--PTSPTFSLVA--SNPFGFKEEALAG----GGSRMW-TPGQSGTCSPAIAAGSD pt025437_POPTR_ IPQSG--PSSPTFSLVS--RNPFGFKEEALSG----AGSRMW-TPGQSGTCSPAVPAGID gm034553_Glyma1 LPHVS--PTSPTFSLVS--SNPFAFKEHALPS----SGSPMW-TPAQSGTCSPAVPPGSY gm037329_Glyma1 IPQGGLAPTSPTFSLVS--SNPFGLKEDAMVG----SGSRMWTTPGASGTCSPAVAAGSE Sb033896_Sorbi1 ISSAG--PSSPTYSLVA--PNPFGIFKETIA-----STSRMC-TPGQSGTCSP-VMGGVP Os025252_Os06t0 ISSAG--PSSPTYNLVS--PNPFGIFKEAIA-----STSRVC-TPGQSGTCSP-VMGGMP . . *:***:.**: *** : * : ** *** : * AT4G18890.1 QNSDVPMADGMTAEFAFGCNAMA---ANGMVKPWEGERIHG-ECVSD--DLELTLGNSRT Os007138_Os02t0 ---DVQMADAARREFAFGGEG---GKMTGLVKAWEGERIHE-ECGSD--DLELTLGSSMT pt030016_POPTR_ HTADIPMAE-ISDEFAFRCNAT------GLVKPWEGERIHE-ECGSD--DLELTLGNSRT gm037331_Glyma1 NTSDIPMAEAVSDEFAFGSSSS------GLVNAWKGERIHEASFGTD--DLELTLGSSKT pt030017_POPTR_ HTADIPMAE-ISDEFAFRCNAT------GLVKPWEGERIHE-ECGSD--DLELTLGNSRT gm034552_Glyma1 NTSDIPMAEAVSDEFAFGSSSS------VLVNAWKGERIHEASFGTD--DLELTLGSSKT pt026020_POPTR_ QTADIPMAEVISDEFAFRCNAT------GLVKPWEGERIHE-ECGSD--DLELTLGNSRT pt025437_POPTR_ QTADVPMADSMAAEFAFGSNTA------GLVKPWEGERIHE-ECVSD--DLELTLGNSST gm034553_Glyma1 QNADIPMSDAVSDEFAFGSNVL------GLVKPWEGERIHE-EFGSD--DLELTLGNSKT gm037329_Glyma1 NTSDIPMAEAVSDEFAFGSSSS------GLVNAWKGERIHEASFGTD--DLELTLGSSKT Sb033896_Sorbi1 IHHDVQMVDGAPDDFAFGSSSNGNNESPGLVKAWEGERIHE-ECASDEHELELTLGSSKT Os025252_Os06t0 AHHDVQMVDGAPDDFAFGSSSNGNNESPGLVKAWEGERIHE-ECASD--ELELTLGSSKT *: * : :*** . :*:.*:***** . :* :******.* * AT4G18890.1 R---- Os007138_Os02t0 RGDR- pt030016_POPTR_ R---- gm037331_Glyma1 R---- pt030017_POPTR_ R---- gm034552_Glyma1 RLLHK pt026020_POPTR_ R---- pt025437_POPTR_ R---- gm034553_Glyma1 R---- gm037329_Glyma1 RLLHK Sb033896_Sorbi1 RADPS Os025252_Os06t0 RADPS *
|