Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G22810.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os007705 |
not found in 316aa |
AT4G22810.1 |
1st_1st |
0.492307692 |
Ia |
Os023478 |
not found in 328aa |
AT4G22810.1 |
not_1st |
0.446153846 |
II |
Os018659 |
not found in 305aa |
AT4G17800.1 |
not_not |
0.428205128 |
III |
Os030224 |
not found in 289aa |
AT2G35270.1 |
not_not |
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III |
Sb027062 |
not found in 595aa |
AT2G45430.1 |
1st_not |
0.502564102 |
II |
Sb029863 |
not found in 559aa |
AT4G17800.1 |
not_not |
0.433333333 |
III |
Sb030528 |
not found in 455aa |
AT4G17800.1 |
not_not |
0.402564102 |
III |
Sb033333 |
not found in 547aa |
AT4G22810.1 |
not_1st |
0.402564102 |
II |
Sb010951 |
not found in 328aa |
AT4G35390.1 |
not_not |
0.4 |
III |
Gm029637 |
not found in 298aa |
AT4G22810.1 |
1st_1st |
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Ia |
Gm002179 |
not found in 300aa |
AT4G22810.1 |
not_1st |
0.530769230 |
II |
Gm047008 |
not found in 287aa |
AT4G22810.1 |
not_1st |
0.523076923 |
II |
Gm011358 |
not found in 283aa |
AT4G12050.1 |
not_not |
0.523076923 |
III |
Gm011357 |
not found in 283aa |
AT4G12050.1 |
not_not |
0.523076923 |
III |
Gm005962 |
not found in 310aa |
AT2G45430.1 |
not_not |
0.494871794 |
III |
Gm001449 |
not found in 288aa |
AT2G45430.1 |
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0.479487179 |
III |
Gm029807 |
not found in 250aa |
AT4G17800.1 |
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0.441025641 |
III |
Gm002022 |
not found in 250aa |
AT4G17800.1 |
not_not |
0.441025641 |
III |
Gm025903 |
not found in 270aa |
AT4G17800.1 |
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0.425641025 |
III |
Gm050287 |
not found in 268aa |
AT4G17800.1 |
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III |
Gm055277 |
not found in 295aa |
AT4G14465.1 |
not_not |
0.420512820 |
III |
Gm026406 |
not found in 270aa |
AT4G14465.1 |
not_not |
0.420512820 |
III |
Gm054095 |
not found in 268aa |
AT4G14465.1 |
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0.417948717 |
III |
Gm012067 |
not found in 276aa |
AT4G17800.1 |
not_not |
0.415384615 |
III |
Gm055489 |
not found in 267aa |
AT4G14465.1 |
not_not |
0.410256410 |
III |
Gm027914 |
not found in 280aa |
AT4G14465.1 |
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0.405128205 |
III |
Gm038768 |
not found in 253aa |
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III |
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not found in 303aa |
AT4G22810.1 |
1st_1st |
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not found in 302aa |
AT4G22810.1 |
not_1st |
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II |
Pt039340 |
not found in 298aa |
AT4G22810.1 |
not_1st |
0.561538461 |
II |
Pt017143 |
not found in 300aa |
AT2G45430.1 |
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0.538461538 |
III |
Pt034782 |
not found in 289aa |
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III |
Pt032727 |
not found in 298aa |
AT4G17800.1 |
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0.425641025 |
III |
Pt037731 |
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III |
Pt001435 |
not found in 256aa |
AT2G42940.1 |
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III |
Pt000774 |
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III |
Pt009910 |
not found in 298aa |
AT4G17800.1 |
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0.412820512 |
III |
Pt015327 |
not found in 284aa |
AT4G14465.1 |
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0.407692307 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT4G22810.1 ------------------------------------------------------------
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pt034782_POPTR_ MKRVQRERLRATDHSTI--------------------------------LANPWWTGQVG
gm055489_Glyma2 -------------------------------------------------MANRWWTGSVG
pt028640_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Os023478_Os06t0 ------------------------------------------------------------
gm012067_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Sb033333_Sorbi1 -------PAAPSSIGTNAR-----------------------------SLARPCARPRTR
gm002022_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm055277_Glyma2 --------MGPSKHHMLA------------------------------TVANPWWTGQGG
gm005962_Glyma0 ------------------------------------------------------------
Sb030528_Sorbi1 -------PLQENKHHTNPKEIHPLLALAVYYFHHHHHHRTTSSTRAAELLILSLFSYPRK
pt011455_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt009910_POPTR_ ------------------------------------------------------------
AT4G22810.1 ------MDP-VQS---HGS---------QSSL-----PPPFHA-RDFQ-------L----
Os007705_Os02t0 ------MDP-VTAS-IHG-----------HHL-----PPPFNT-RDFH------------
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gm047008_Glyma1 ------MDP-ISA---HG-----------HSL-----PPPFHT-RDLH-------L----
gm029807_Glyma1 MAG---LD--------LST--------ASPFV------QSLHR-PDF-------------
pt032727_POPTR_ MAG---LD--------LGT--------TSRYV-----HQLHHR-PDLH-------L----
gm025903_Glyma0 MAG---ID--------LGS--------ASHFV-----HHRLQR-PDLE-------D----
gm011357_Glyma0 ------MDP-ISA---HG-----------HSL-----PPPFHT-RDLH-------L----
pt037731_POPTR_ ------M---------AGA-------------------------ADLT-------F----
pt015327_POPTR_ LPG---MD--------TSTS-------SSSPMKK----------PDLG-------I----
pt039340_POPTR_ ------MDP-VAA---HG-----------RPL-----PPPFHT-RDFH-------L----
Sb010951_Sorbi1 MPG---MDP------GGGG--------SSRYFH------QLLR-PQQQ--QQPSPL----
pt017143_POPTR_ ------MDP-VSA---HG-----------RPL-----PPPFHT-RDFH-------L----
gm026406_Glyma1 --------------------------------------------MDLS-------I----
gm011358_Glyma0 ------MDP-ISA---HG-----------HSL-----PPPFHT-RDLH-------L----
gm002179_Glyma0 ------MDP-ITA---HG-----------HSL-----PPPFHAGRDLH-------L----
pt001435_POPTR_ ------M---------AG------------------------------------------
gm054095_Glyma2 --------------------------------------------MDLS-------I----
Sb027062_Sorbi1 -------D---------------------NLLINMRNHMQFRRKFDLH------------
gm001449_Glyma0 -------------------------------M-----P-----------------I----
Os018659_Os04t0 MAG---LD--------LGTA-------ATRYV-----HQLHHLHPDLQ-------L----
gm038768_Glyma1 ------M---------FGE-----------------------------------------
Sb029863_Sorbi1 MAG---LD--------LGTA-------ATRYV-----HQLHHLHPDLQ-------L----
gm050287_Glyma1 MAG---ID--------LGS--------ASHFV-----HHRLER-PDLE-------D----
pt000774_POPTR_ MAG---FE---------GN--------NSRYVHGQN-HNNLLR-PELHLIQRPSSIPSSD
gm027914_Glyma1 LE-----------------N-------SGHSMKK----------PDLGF-----SM----
Os030224_Os08t0 MAG---LD--------LGT----------SYL-------HHHQ--SLH-------L----
pt034782_POPTR_ LPG---LD---------SSS-------NSPSLGKIN--------RELS-------I----
gm055489_Glyma2 LE-----------------N-------SGDSMKK----------PDLGF-----SM----
pt028640_POPTR_ ------MDP-VTA---HG-----------HSL-----PPPFHT-RDFQ-------L----
Os023478_Os06t0 ------MDP-VTAAAAHGGGHHHHHHFGAPPVAAFH-HHPFHHGGGAH------------
gm012067_Glyma0 MAG---LD--------LGS--------ASRFV------QNLHL-PDLH-------L----
Sb033333_Sorbi1 VAGRATMDPAVAAAAAHGGGHHF-----AQPVAPF--HHPFGGLGGHH------------
gm002022_Glyma0 MAG---LD--------LGT--------ASRFV------QSLHR-PDF-------------
gm055277_Glyma2 LSG---VD--------HPGT-------HSPGLGKRP--------SDLG-------I----
gm005962_Glyma0 ------MDP-VAA---QG-----------RPL-----PPPFLT-RDLH-------L----
Sb030528_Sorbi1 MAG---LD--------LGT---------SSYLH--QQHQHHHQ-VPLH-------L----
pt011455_POPTR_ ------MDP-VTA---HG-----------HSL-----PPPFHT-RDFQ-------L----
pt009910_POPTR_ MAG---LD--------LGT--------TSRYV-----HQLHHR-PDLQ-------L----
AT4G22810.1 ------------HLQQQQQE-FFL--HHHQQQRNQTD-GDQQGGSGG-------------
Os007705_Os02t0 -----------HH-LQQQQH-QLH-------LKTE----DDQGGGTPGVF----------
gm029637_Glyma1 -----------HH--QQQQH-QFH---SLQ----E----DEQSGSSGGL-----------
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gm025903_Glyma0 ------------------DE-NQQ--------DQD----NNLND----------------
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pt037731_POPTR_ -----------PS------------------LGSE-------------------------
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gm026406_Glyma1 -----------NERSLVRER-Q----------EEE----EEEE-----------------
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pt001435_POPTR_ --------------------------------DSE-------------------------
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Sb027062_Sorbi1 ---DTNSSKRWKKRAKSLNH-----LSCVCVRADQLL--ERRRTATGGARVPSVGCFWRQ
gm001449_Glyma0 ----------IPH------H-QFQ--PHHNHQNTE----DE-AGNGR-------------
Os018659_Os04t0 ------------------QH-SYA----KQHEPSD----DDPNGSGGGG----------N
gm038768_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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pt000774_POPTR_ SRDNNNTPSPPDHANQTAHH-H----PDSS-----------ATTSSGGG-----------
gm027914_Glyma1 -----------NESTVTGNH-I----------GEE----DED------------------
Os030224_Os08t0 ------------------RH-------------------DD----GGAG-----------
pt034782_POPTR_ -----------NETS---NR-S----------GGR----DEDD-----------------
gm055489_Glyma2 -----------NESAVTGNH-T----------GEE-----EE------------------
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Os023478_Os06t0 --------------YPA----AFQ---QFQEEQQQLV---AAAAAAGGM-----------
gm012067_Glyma0 ------------------QQ-NYQQPRHKRDSEEQ----ETPPNPGTAL-----------
Sb033333_Sorbi1 -----------HHLFPGQQHPAFQ---HFQEQQRQLELLGAGGGVPGGV-----------
gm002022_Glyma0 -------------------N-QQQ--------ESE----EDAK-----------------
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gm005962_Glyma0 ----------HPH------H-QFQ--PHHNNQNTE----DE-AGNGR-------------
Sb030528_Sorbi1 ------------------HH-------------------DDGVGAGGGG-----------
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pt009910_POPTR_ ------------------QH-QPD--------PED----EDPNRAGDGL-----------
AT4G22810.1 ---NR-QIKMDREETSDNIDNIANNSG---------------SEGKDID-IHGGSG----
Os007705_Os02t0 --GSR-GTKRDHDD-----DE--NSGNGHG----------SGGDGGDLA-LVPPSG----
gm029637_Glyma1 ---NLAAHKREREE---------NNN----------------SDGKE-------------
gm047008_Glyma1 ------AQKREREE---------NSN----------------------------------
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gm025903_Glyma0 ------------------------------------------HEGLDLI--TPNPG----
gm011357_Glyma0 ------AQKREREE---------NSN----------------------------------
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pt015327_POPTR_ ------DERENSDE----------------------------------------------
pt039340_POPTR_ ---NR-GQKREHAEI-------ATNNN-------------NTAEGKEL------------
Sb010951_Sorbi1 -------------------DQ---------------------------------------
pt017143_POPTR_ ---NR-GQKREHDEI--------NNNN-------------NTVEGLEL------------
gm026406_Glyma1 ------DERDNGDE----------------------------------------------
gm011358_Glyma0 ------AQKREREE---------NSN----------------------------------
gm002179_Glyma0 ---NL-AHKREHEE---------NNNN-------------NSSDGKE-------------
pt001435_POPTR_ ----R-IMERNQES---------EKGH-------------DRRPNMEAI-LVASKL----
gm054095_Glyma2 ------DERDNGDE----------------------------------------------
Sb027062_Sorbi1 LHVAEQVRRQSLEEAW------IHSAGGGELRRLLRTRENSCTVGLCLC-----------
gm001449_Glyma0 ------GQKRDRDE---------NAGGGGGA----TTPPQGGGEGKE-------------
Os018659_Os04t0 SNGGPY----------------------------------GDHDG-----GSSSSG----
gm038768_Glyma1 -------MDRKQEQ---------DKGN-------------SNMSGIDVA-LISPKV----
Sb029863_Sorbi1 NNGGPY----------------------------------GEHDG-----GSSSSG----
gm050287_Glyma1 ------------------------------------------HEGLDLV--TPNSG----
pt000774_POPTR_ -------------------TN---------------------------------------
gm027914_Glyma1 --------RENSDE----------------------------------------------
Os030224_Os08t0 -----------SDD--------------------------GGHDDL-----SPGSGGGGG
pt034782_POPTR_ ------DDRDTGDE----------------------------------------------
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Os023478_Os06t0 ---AKQEL---VDES----NNTINSGG-------------SNGSG----------G----
gm012067_Glyma0 -------APFDNDD--------------------------DKSQGLELA-----SG----
Sb033333_Sorbi1 ---NKQELGVGGDDS----NNTINSAG-------------SNGSGDGAV-----AG----
gm002022_Glyma0 ----------------------------------------------------PQDG----
gm055277_Glyma2 ---------DNRDE----------------------------------------------
gm005962_Glyma0 ------GQKRDRDE---------NVGGGGGA----TTPPHGGGEGKE-------------
Sb030528_Sorbi1 -----------SDD---------------------------GQDSL-----SPGSGGGGG
pt011455_POPTR_ ---NK-SLKRERDE---------NNNS------------MGNSEGKE-------------
pt009910_POPTR_ GSVGRFSTDHNPDD--------------------------GLHQGLDLVATAANSG----
AT4G22810.1 --------------------EGGGGSGGDHQ----------MT--RRPRGRPAGSKNKPK
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gm029637_Glyma1 ----------------------GGAGSAETE----------IS--RRPRGRPAGSKNKPK
gm047008_Glyma1 ---------------------GNNEGAGEAE----------IT--RRPRGRPAGSKNKPK
gm029807_Glyma1 ----------PH---------------HQGD----------VV-GRRPRGRPAGSKNKPK
pt032727_POPTR_ ----------Q------------------GD----------LV-GRRPRGRPAGSKNKPK
gm025903_Glyma0 ----------P------------------GD----------VV-GRRPRGRPPGSKNKPK
gm011357_Glyma0 ----------------------NNEGAGEAE----------IT--RRPRGRPAGSKNKPK
pt037731_POPTR_ ----------PKAV------PPVSS-APDGE----------TM-IRRPRGRPAGSKNKPK
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pt039340_POPTR_ ---------------------VPSSAGGEGE----------IT--RRPRGRPAGSKNKPK
Sb010951_Sorbi1 ----------PSSSALVPVEGGSGGGGGSGS----------GTPTRRPRGRPPGSKNKPK
pt017143_POPTR_ ---------------------VPSSSGGEGE----------IS--RRPRGRPAGSKNKPK
gm026406_Glyma1 ----------PKE--------------GAVE----------AG-TRRPRGRPPGSKNKPK
gm011358_Glyma0 ----------------------NNEGAGEAE----------IT--RRPRGRPAGSKNKPK
gm002179_Glyma0 ---------------------GGGAGSGETE----------IS--RRPRGRPAGSKNKPK
pt001435_POPTR_ ----------PKAV------PPISS-ARGGE----------TL--RRPRGRPAGSKNKPK
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Sb027062_Sorbi1 SEHVILLQRQPLVH-------------GVGERRCHYHHRP----SRRERADDAAAHHLPL
gm001449_Glyma0 ---------------------SGSGDGGGSD----------MG--RRPRGRPAGSKNKPK
Os018659_Os04t0 ----------PATD---------GAVGGPGD----------VV-ARRPRGRPPGSKNKPK
gm038768_Glyma1 ----------PKAV------SPVSSAAAEGD----------TL--RRPRGRPAGSKNKPK
Sb029863_Sorbi1 ----------PGAG------DAPGGSGGNGE----------MV-ARRPRGRPPGSKNKPK
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pt000774_POPTR_ ----------PN---------------------------------RRPRGRPAGSKNKPK
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pt028640_POPTR_ ---------------------LITSGDGDGE----------IT--RRPRGRPAGSKNKPK
Os023478_Os06t0 --------------------EEQRQ--QSGEEQHQQGAAAPVV-IRRPRGRPAGSKNKPK
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Sb033333_Sorbi1 --------------------ADQQAGGGDGDQQQQQHA---LV-MRRPRGRPAGSKNKPK
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gm005962_Glyma0 ---------------------PGSEDGGGSD----------MG--RRPRGRPAGSKNKPK
Sb030528_Sorbi1 G--------TPSS--------AGGAGIGGGE----------IV-ARRPRGRPPGSKNKPK
pt011455_POPTR_ ---------------------LITSGSGEGE----------IT--RRPRGRPSGSKNKPK
pt009910_POPTR_ ----------P------------------GD----------IM-ARRPRGRPPGSKNKEK
** *. ..:::
AT4G22810.1 P----------------------------PIIITRDSANALRTHVMEIGDGCDLVESVA-
Os007705_Os02t0 P----------------------------PIIITRDSANTLRTHVMEVAGGCDISESIT-
gm029637_Glyma1 P----------------------------PIIITRDSANALKTHVMEVADGCDIVESVS-
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gm029807_Glyma1 P----------------------------PVIITRESANTLRAHILEVANGCDVFESVA-
pt032727_POPTR_ P----------------------------PVIITRESANTLRAHILEVGNGCDVFECVA-
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* . . : :.. : :: * . :
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**. .: : . * : :* .: * : : : *
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. * * :. . : : * * :::.. .. . *: : : . *
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:
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:
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