Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G24660.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os038169 |
not found in 417aa |
AT1G14440.2 |
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III |
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not found in 284aa |
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III |
Sb015999 |
not found in 311aa |
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III |
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not found in 621aa |
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III |
Sb012054 |
not found in 436aa |
AT1G14440.2 |
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III |
Sb010971 |
not found in 440aa |
AT1G75240.1 |
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III |
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not found in 241aa |
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III |
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not found in 259aa |
AT1G14440.2 |
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III |
Gm019670 |
not found in 283aa |
AT1G14440.2 |
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III |
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not found in 331aa |
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III |
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not found in 334aa |
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III |
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not found in 308aa |
AT3G28920.1 |
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0.416666666 |
III |
Gm044682 |
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III |
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III |
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AT1G75240.1 |
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III |
Pt020182 |
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0.436868686 |
III |
Pt036346 |
not found in 296aa |
AT2G18350.1 |
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Pt036345 |
not found in 331aa |
AT1G75240.1 |
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III |
Pt002164 |
not found in 339aa |
AT1G75240.1 |
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III |
Pt040110 |
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AT1G75240.1 |
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III |
Pt020175 |
not found in 334aa |
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III |
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AT3G28920.1 |
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III |
Pt004186 |
not found in 340aa |
AT3G28920.1 |
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0.406565656 |
III |
Pt018733 |
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III |
Pp026083 |
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III |
Pp005122 |
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Pp005121 |
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AT1G75240.1 |
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0.469696969 |
III |
Sm001402 |
FILFLSLSLSLCFPAK in 171/1004 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT4G24660.1 ----------------------------------------------------MNFED-QE
pt002548_POPTR_ ----------------------------------------------------MEIRGLEN
gm003140_Glyma0 ----------------------------------------------------MDMR--EQ
pt040110_POPTR_ ----------------------------------------------------MEIRGPEN
gm044682_Glyma1 ----------------------------------------------------MDMR--EQ
Sb012054_Sorbi1 MVSIVPLQRRPEASAATARS-----IFSLEPRSRREEDDGSGGP-----GGGMDLSG-TQ
Sb031548_Sorbi1 LVG-------------------------------------------------RSLQP-QL
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pt020175_POPTR_ ----------------------------------------------------MDITP---
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gm035046_Glyma1 ----------------------------------------------------MEIIT---
pp026083_Pp1s3_ M----------DLGTG---------------------------------REGTD-PQ-QQ
pt036346_POPTR_ ----------------------------------------------------MELR--GQ
Sm001402_Selmo1 -----------------------------------------------------D------
Sb010971_Sorbi1 M----------EYK-----------------RSSHVEEEEEEDEE----EEEEDEEE-EE
pt004186_POPTR_ ----------------------------------------------------MDMTT---
gm050382_Glyma1 ----------------------------------------------------MDITP---
pt020182_POPTR_ M------------------------------------------------RKEMELSS-HE
gm030075_Glyma1 ----------------------------------------------------MAMRG-QQ
gm019670_Glyma0 ----------------------------------------------------MELSS-QE
Os038169_Os11t0 MVSILQLQTRTEASPASSASAAATRIFAV--RRQQQEQEGEEEEEEFEFQERMDLSG-AQ
Sb015999_Sorbi1 ----------------------------------------------------MDFDE-HD
gm002980_Glyma0 ----------------------------------------------------MEFED-QE
pt004187_POPTR_ ----------------------------------------------------MDMTT---
pp005121_Pp1s23 M----------DLGSG---------------------------------RDGTDQQQ-QQ
AT4G24660.1 E------------------------DMEMSG------VNPP---CGYDS-----------
pt002548_POPTR_ D-----------------------IRTSVP------------SSYSHQ------------
gm003140_Glyma0 D-----------------------KVIEMP------------STLGYN------------
pt040110_POPTR_ D-----------------------IRTSVP------------SSYSHQ------------
gm044682_Glyma1 D-----------------------KVIEMP------------STLDYN------------
Sb012054_Sorbi1 G------------------------ELAIP-------MHAN-VASPYG------------
Sb031548_Sorbi1 RR---------------------RAPAGAP------------------------------
pt036345_POPTR_ D-----------------------KGIVMP------------KSLNYNPPD---------
pt002164_POPTR_ E-----------------------KETVMP------------RS--FNPPN---------
pp005122_Pp1s23 QRGPHQTQQQQQQLPQPQPLASLPTSIPLL-------LPPALAVSNYHPTPVSVQPQHQQ
pt020175_POPTR_ -----------------------ATATATATGTATTPTNNNTNTTIPKSPEADTGTPTRI
pt018733_POPTR_ K------------------------DMPIS-------RNG-----SYA------------
Os017346_Os04t0 -------------------------HLSLV---------------PYE------------
gm045537_Glyma1 G------------------------EIPIP-------INSS---TTYG------------
gm035046_Glyma1 -----------------------PTATATNA--------------TAKSPEPDIETMTRI
pp026083_Pp1s3_ QKSSHQTQQQQ----QPQPLSPLPAPLPLL-------MPQPLAVSNFHSAPPPLQQHHQH
pt036346_POPTR_ D-----------------------KGIVMP------------KSLNYNPPD---------
Sm001402_Selmo1 --------------------------IPIP-------ISAQFSAAAIHET----------
Sb010971_Sorbi1 E-----------------------EDEEAR-------------SHRYTT-----------
pt004186_POPTR_ -----------------------TTTTPTPT------NNNNTNTPTPKSPEAYTETPARI
gm050382_Glyma1 -----------------------TTTI----------INTTTTPSAAKSPEHETETPTRI
pt020182_POPTR_ A------------------------GIPIP-------LNS-----TFG------------
gm030075_Glyma1 D-----------------------KEIEIP----------TTTTLGYNLPNR--------
gm019670_Glyma0 G------------------------EIPIP-------INSS---TTYG------------
Os038169_Os11t0 G------------------------ELPIP-------MHASAAASPFAG-----------
Sb015999_Sorbi1 D-----------------------GDEEMTP------MPVS---SSYDAP----------
gm002980_Glyma0 E-----------------------QEEELC------------------------------
pt004187_POPTR_ -----------------------TTTTPTPT------NNNNTNTPTPKSPEAYTETPARI
pp005121_Pp1s23 QRGPHQTQQQQQQLPQPQPLASLPTSIPLL-------LPPALAVSNYHPTPVSVQPQHQQ
AT4G24660.1 ----------------LSGE------------GATS------------------------
pt002548_POPTR_ -----------------SSG-----------LEGR-----------NGN-----HNGTTV
gm003140_Glyma0 -----NSS-SGSKL---SSP-----------IGERSS---------DQ---LPPHQSHTL
pt040110_POPTR_ -----------------SSG-----------LERR----------KDGN-----HNGSSV
gm044682_Glyma1 -----NSS-SSPKL---SSP-----------IGER-C---------DQ---LPPHQSHTL
Sb012054_Sorbi1 -----------------GGG------------GGGHVLQ-QLHGRGDHG--SNNNGQQSP
Sb031548_Sorbi1 -----------------SGPA---------GLRERHAELAAVR-------PLLLRVANAV
pt036345_POPTR_ -----NRD-SSSKVP-NSAP------------ARR-----------DH------HHAAAV
pt002164_POPTR_ -----NRD-SSSRIP--SAP------------TRR-----------DH------RHTDTV
pp005122_Pp1s23 ---HHEMP-GAAKPKLLNTPS-----------GNGGSV---------------QSKSDHV
pt020175_POPTR_ ---------PQTKPLSFTNG-----------VLKRHHP----H--HHHL-----------
pt018733_POPTR_ -----------------GGN------------GHSH----------------------TV
Os017346_Os04t0 -----------------GGSA-----------GGGG------------------------
gm045537_Glyma1 -----------------HGNGH--------GHGHGHGL--MIH--HD---------HNHI
gm035046_Glyma1 ---HQNPN-PNPKPVSFSNG-----------VLKRH------H--VNHR-----------
pp026083_Pp1s3_ HQLHHEIP-SSTKLKLLNTSS-----------GNGGSV---------------PSKGDHV
pt036346_POPTR_ -----NRD-SSSKVP-NSAP------------ARR-----------DH------HHAAAV
Sm001402_Selmo1 ----------AAKLKLL--AS-----------GNG-------------------TPAAQV
Sb010971_Sorbi1 ---------AAAAAAPVGAPQQQQQQVHAQALGLGS--------------------HPSL
pt004186_POPTR_ ---------HDTKPLSFTNG-----------VLKRHPP---HH--HHHH-----------
gm050382_Glyma1 ---TTPITPTTTKTLSFSNG-----------VLKRH------H--HHHL-----------
pt020182_POPTR_ -----------------GAH------------GHGHGH--LIH--HDHP--AVPHNHNNI
gm030075_Glyma1 ----DSSS-SSSKL---SSPT----------VGERSSS------DHDQQHHQPTHQTRTL
gm019670_Glyma0 -----------------HGN------------GHGHGL--MIH--HD---------HNHI
Os038169_Os11t0 -------------MGAHGGA------------GGGHVV--ELH-RHEH---VGNNGQ---
Sb015999_Sorbi1 ------MQ-PAGLVAGLGGG------------GGGGTPK-P----GDSG-----------
gm002980_Glyma0 ----------------MGGG------------GAGYDPT---------------------
pt004187_POPTR_ ---------HDTKPLSFTNG-----------VLKRHPP---HH--HHHH-----------
pp005121_Pp1s23 ---HHEMP-GAAKPKLLNTPS-----------GNGGSV---------------QSKSDHV
AT4G24660.1 -----------------SGGGGVGR-----------------------------------
pt002548_POPTR_ L--TYTQTLD--------------------------HQR---------------------
gm003140_Glyma0 VFTDPPQTSS--HHHNLYPPSLPPNPLQLP---QPHH-----------------------
pt040110_POPTR_ L--TFTQTLD--------------------------HPR---------------------
gm044682_Glyma1 VFTDPPQTSS--HHHNLYPPSLPPNPLQLP---QPHH-----------------------
Sb012054_Sorbi1 VSAAAL-------------TPSPP-------------------------VAAVEETESS-
Sb031548_Sorbi1 VAAPRQGVLVV-VH---------------P------HLEHA-------------------
pt036345_POPTR_ L----PHALG---HQSLYQQQQQQQAQ---------------------------------
pt002164_POPTR_ L----PHTLDL-EHQSLYQQQQQQQKQLNP---Q--HQA--------------------C
pp005122_Pp1s23 AADQAREIV---------------------------------------------------
pt020175_POPTR_ ------------------------------------HNHF--------------------
pt018733_POPTR_ TSAAAAQVP--------TIGHSSPS-----------------------------SQQEDQ
Os017346_Os04t0 ------------------------------------------------------------
gm045537_Glyma1 ISSSAP-------------SNGIPTT-----------------------MQQQEEEEEEE
gm035046_Glyma1 ------------------------------------------------------------
pp026083_Pp1s3_ GADQAREIL---------------------------------------------------
pt036346_POPTR_ L----PHALG---HQSLYQQQQQQQAQ---------------------------------
Sm001402_Selmo1 GSGAAVVVVS--------------------------------------------------
Sb010971_Sorbi1 MDSAAFSRPLLPPNSSLVTQPPLPPPGFLPAHRQPPHQLHPRKVERDRDRAAGAQQQPQV
pt004186_POPTR_ ------------------------------------HHHF--------------------
gm050382_Glyma1 ------------------------------------HH----------------------
pt020182_POPTR_ ISSTAPQIP--------SSNNGTSI--------------------------TTASIDDNH
gm030075_Glyma1 IFNETP-------HHNLYPPPPPPPPALAP------H-----------------------
gm019670_Glyma0 ISSTAP-------------SNGIPT--------------------------MQQEEDHGL
Os038169_Os11t0 --AMAM-------------ASPPPTN-----------------------VAVAAEQEGSP
Sb015999_Sorbi1 --GGSFRTPG-----GVVVGGGVGG-----------------------------------
gm002980_Glyma0 ----RMKVP--------VAAEPVRS-----------------------------------
pt004187_POPTR_ ------------------------------------HHHF--------------------
pp005121_Pp1s23 AADQAREIV---------------------------------------------------
AT4G24660.1 ----------------SKGVG-------------------------------------AK
pt002548_POPTR_ QPSRSPN--PDRLAIISSG-----------------------PNSKTS-----------N
gm003140_Glyma0 RPRRD----PDPSSIISPPI-----------ISTTPTTAPPQPHTTTT-----------L
pt040110_POPTR_ QPSRSPN--PDRLAIISSG-----------------------SNSKTS-----------N
gm044682_Glyma1 RPRRD----PDPSPIISPP-------------RTTPPQ--PQPHTTTT-----------L
Sb012054_Sorbi1 --GKK----RGPVA----GAS-------------------------------------SA
Sb031548_Sorbi1 ---------PLHAHLLAEALH-----------RRVVQLLQPPP---------------GL
pt036345_POPTR_ KPTTDLDLTPDPVQATTPIATTGAINTAQTPSRSLSRSPPPTP--ASSA----------S
pt002164_POPTR_ KPTRDLDLTPDPTQATTPVATTSATNTAPTPSRSISRSPPPPPTSASSA----------S
pp005122_Pp1s23 -----------RQAVQVAGAASE------------SASAKLSN------------VKKGA
pt020175_POPTR_ ---------------------------------------APPP---------------VV
pt018733_POPTR_ RPYKK------------------------------------------------------V
Os017346_Os04t0 ------------------GGG---------------------------------------
gm045537_Glyma1 DRYKK------------------------------------------------------V
gm035046_Glyma1 ----------------------------------------------------------AA
pp026083_Pp1s3_ -----------RQAVQGAAAGNE------------SASTKPSN------------VKKGT
pt036346_POPTR_ KPTTDLDLTPDPVQATTPIATTGAINTAQTPSRSLSRSPPPTP--ASSA----------S
Sm001402_Selmo1 ----------GEAGAAAAAAGGD------------SKSKRP-------------------
Sb010971_Sorbi1 RRHQE----PARNGVLGGGGGGG------------GGAAPPSAASTLGLVSVGPVVEAAQ
pt004186_POPTR_ ---------------------------------------SPSP---------------IV
gm050382_Glyma1 ----------------------------------------PMP---------------AV
pt020182_POPTR_ VPYKK------------------------------------------------------M
gm030075_Glyma1 RPTSD----PDLSTPIAPT-------------SNPSRTAPPQTTTTTTST--------PS
gm019670_Glyma0 GSYKK------------------------------------------------------V
Os038169_Os11t0 VAGKK----RGGMAVVGGGGG-------------------------------------VA
Sb015999_Sorbi1 ----------------GAGGG-------------------------------------G-
gm002980_Glyma0 ----------------TNGGG-------------------------------------GR
pt004187_POPTR_ ---------------------------------------SPSP---------------IV
pp005121_Pp1s23 -----------RQAVQVAGAASE------------SASAKLSN------------VKKGA
AT4G24660.1 IRYRECLKNHAV-----NIGGHAVDGCCEFMPS-----------GEDG--TLDALKCAAC
pt002548_POPTR_ TRYRECLRNHAA-----NVGGSVYDGCGEFMPG-----------GEEG--SLEALKCAAC
gm003140_Glyma0 FRYRECLKNHAA-----SMGGHVTDGCGEFMPN-----------GEEG--TPESLKCAAC
pt040110_POPTR_ TRYLECLRNHAA-----SVGGNVFDGCGEFMPG-----------GEEG--SLEALKCAAC
gm044682_Glyma1 FRYRECLKNHAA-----SMGGHVTDGCGEFMPN-----------GEEG--TPESFKCAAC
Sb012054_Sorbi1 VKYRECLKNHAA-----AIGGNATDGCGEFMPS-----------GEEG--SLEALKCSAC
Sb031548_Sorbi1 LRETQ----HAGLLLRRELGPEPLPGRRALLLPVRMSRRVVRVVGLRGRRAVVVLLLMVH
pt036345_POPTR_ TRYRECLKNHAA-----SMGGHVLDGCGEFMPG-----------GEEG--TLESFKCAAC
pt002164_POPTR_ IRYRECLKNHAA-----SMGGHVLDGCGEFMPG-----------GEEG--TPETFKCAAC
pp005122_Pp1s23 FRYRECQKNHAA-----SIGGHALDGCGEFMPG-----------GQEG--TVGALRCAAC
pt020175_POPTR_ ITYKECLKNHAA-----TIGGHALDGCGEFMPSP---------TATHT--DPTSLKCAAC
pt018733_POPTR_ MRYKECLKNHAA-----AIGGNATDGCGEFIPG-----------GEEG--SLEALKCSAC
Os017346_Os04t0 -KYKECMRNHAA-----AMGGQAFDGCGEYMPA-----------------SPDSLKCAAC
gm045537_Glyma1 VRYRECLKNHAA-----AMGGNATDGCGEFMPS-----------GKEG--SIEALNCSAC
gm035046_Glyma1 VVYKECLKNHVA-----SLGGHALDGCGEFMPSP---------AATAD--DPSSIKCAAC
pp026083_Pp1s3_ VRYRECQKNHAA-----SIGGHALDGCGEFMPG-----------GEEG--TVDALRCAAC
pt036346_POPTR_ TRYRECLKNHAA-----SMGGHVLDGCGEFMPG-----------GEEG--TLESFKCAAC
Sm001402_Selmo1 VRYTQCLKNHAA-----GIGGHALDGCGEFMPC-----------GEEG--TLDALKCAAC
Sb010971_Sorbi1 WRYRECLRNHAA-----RLGAHVLDGCCEFMPS-----------GSDG--A-AALACAAC
pt004186_POPTR_ IAYKECLKNHAA-----TIGGHALDGCGEFMPSP---------IATHT--NPTSLKCAAC
gm050382_Glyma1 VTYKECLKNHAA-----NLGGLALDGCGEFMPSP---------TATAA--DPSSIKCAAC
pt020182_POPTR_ VRYRECLKNHAA-----SMGGNATDGCGEFMPS-----------GEEG--SIEALTCSAC
gm030075_Glyma1 IRYRECLRNHAA-----SMGSHVVDGCGEFMAS-----------GEEG--TPESLRCAAC
gm019670_Glyma0 VRYRECLKNHAA-----AMGGNATDGCGEFMPS-----------GEEG--TIEALNCSAC
Os038169_Os11t0 VKYRECLKNHAA-----AIGGNATDGCGEFMPS-----------GEEG--SLEALKCSAC
Sb015999_Sorbi1 TRYRECLKNHAV-----GIGGHAVDGCGEFMAA-----------GEDG--SIDALRCAAC
gm002980_Glyma0 ARYRECLKNHAV-----GIGGHALDGCGEFMAA-----------GMEG--TLDALKCAAC
pt004187_POPTR_ IAYKECLKNHAA-----TIGGHALDGCGEFMPSP---------IATHT--NPTSLKCAAC
pp005121_Pp1s23 FRYRECQKNHAA-----SIGGHALDGCGEFMPG-----------GQEG--TVGALRCAAC
: *. :* * : : .
AT4G24660.1 GCHRNFHRKETESIG----------GRA------------------HRVPT---------
pt002548_POPTR_ ECHRNFHRREIDGE-------TQ---FSPGSRRSATMVHSLQLPPPLPSPAVL-------
gm003140_Glyma0 ECHRNFHRKEPHQGVLVESQ-LQ---HV------LLNKNNRNINTIIHSPDS--------
pt040110_POPTR_ DCHRNFHRRELDGE-------IQ---FSPGSRRSTTMVHSLQLAPPLPSPTVL-------
gm044682_Glyma1 ECHRNFHRKEPHQGVVLESQLLQ---HV-------LNKNSRNIN-ILHSPHS--------
Sb012054_Sorbi1 GCHRNFHRKEVDDD------DDDVYAAADG-----------FSGLGLGHGHRAA----RR
Sb031548_Sorbi1 GAQRHHHARRRRGQ----------------------------------------------
pt036345_POPTR_ ECHRNFHRREIDGE-------PQ---CVAN--STLYKISNGQRN-ILP-PQHLVTS----
pt002164_POPTR_ ECHRSFHRREIDGA-------PQ---CVAN--STCYKNSNGKRN-ILPFPQQLVTS----
pp005122_Pp1s23 DCHRNFHRREVEGEVL--------C-EC--------------------------------
pt020175_POPTR_ GCHRNFHRREPEDS-----------------------------------PPHTTAIT---
pt018733_POPTR_ NCHRNFHRKEIDGE-----CSYD-CHHH--------------------YPVMSNIGSGRL
Os017346_Os04t0 GCHRSFHRRAAAGIG---------------------------GGPVFFRP----------
gm045537_Glyma1 HCHRNFHRKEVEA-----------------------------------------------
gm035046_Glyma1 GCHRNFHRREPEES-----------------------------------PISPATHH---
pp026083_Pp1s3_ DCHRNFHRREVEGEVL--------C-EC--------------------------------
pt036346_POPTR_ ECHRNFHRREIDGE-------PQ---C---------------------------------
Sm001402_Selmo1 DCHRNFHRREVEGEPS--------CLEC--------------------------------
Sb010971_Sorbi1 CCHRSFHRREAIPGGV---------AAAVA------------VSPSPVTPTAGAGANSSR
pt004186_POPTR_ GCHRNFHRREPEDS-----------------------------------PPHTATTT---
gm050382_Glyma1 GCHRNFHRREPEDP-----------------------------------PITSNTTH---
pt020182_POPTR_ NCHRNFHRKEIEGEH--TSCTGDHCYHN--------------------SPVHFNRLGRKV
gm030075_Glyma1 ECHRNFHRKEVEGELRPQPQ-PQPQTHVPNYHSYYTNKHNGHLH--YPTPSSS-------
gm019670_Glyma0 HCHRNFHRKEVEGE---PSCD----YH------------------------HLNINRRRH
Os038169_Os11t0 GCHRNFHRKEADDL------DADSCAAA----------------------LRAAAGRHHH
Sb015999_Sorbi1 GCHRNFHRKESDSPT--GGGGADPAAAA------------------ALSPAAITA-----
gm002980_Glyma0 SCHRNFHRKEADSSAVVAFSGGDP----------------------YLIP----------
pt004187_POPTR_ GCHRNFHRREPEDS-----------------------------------PPHTATTT---
pp005121_Pp1s23 DCHRNFHRREVEGEVL--------C-EC--------------------------------
.:* .* :
AT4G24660.1 --------------YYNR---P---------------------------PQ----PHQPP
pt002548_POPTR_ ------------HHHHHHHQ-RYS------------------------------------
gm003140_Glyma0 --------------HHHLQF-PTPH-----------------------------------
pt040110_POPTR_ -------------HHHHHHQ-RYS------------------------------------
gm044682_Glyma1 --------------HHVLH-----------------------------------------
Sb012054_Sorbi1 LLAPAMA-----HPHHKTGG-G---------------------------GGLLISGADPY
Sb031548_Sorbi1 ------------RRHQQP---PVVVRRGQRAQRAQWMVVVVVVPVPVQLPR--VAASAPT
pt036345_POPTR_ -CAPRQPFP---HQHHRYHQ-GTL------------------------------------
pt002164_POPTR_ -HAPPQSAS--LHPHQRYHH-GTL------------------------------------
pp005122_Pp1s23 ---------------KRKPK-PGMQ-----------------------LGAGIVTPHQLP
pt020175_POPTR_ --------TIEYQPHHRHHP-P------------------------------------PP
pt018733_POPTR_ ISG-----------HHNG-----------------------------------IIGSPPQ
Os017346_Os04t0 -PPPPQP-----HSHHAAL----------------------------------------Q
gm045537_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm035046_Glyma1 --------VLEYRPHHRHHP-P------------------------------------PP
pp026083_Pp1s3_ ---------------KRKQK-PGVQ-----------------------LGAAVITSQHPP
pt036346_POPTR_ --------------HHRYHQ-GTL------------------------------------
Sm001402_Selmo1 --------------HHRKDK-K--------------------------------------
Sb010971_Sorbi1 VMPLLLA-----PPHMHTR--P---------------------------PHVPASPASAP
pt004186_POPTR_ --------TIQYQSHHRHHPLP------------------------------------PP
gm050382_Glyma1 --------VIEYQPHHRHHP-P------------------------------------PP
pt020182_POPTR_ ILG-----------HHKS-----------------------------------ILAPEAL
gm030075_Glyma1 ------------SLHHRLVT-PTS------------------------------------
gm019670_Glyma0 ILG-----------PHKN-----------------------------------LLPPEAL
Os038169_Os11t0 LLGPALP-----HHHHKN---G---------------------------GGLLVAGGDPY
Sb015999_Sorbi1 -YGAAAA-----HHHHH---------------------------------QFSPYYRTPA
gm002980_Glyma0 --------------HHHP---P---------------------------PQFAAYYRHPA
pt004187_POPTR_ --------TIQYQSHHRHHPLP------------------------------------PP
pp005121_Pp1s23 ---------------KRKPK-PGMQ-----------------------LGAGIVTPHQLP
AT4G24660.1 GYLH--------LTSPAA----------------PYRPPAAS------------G-----
pt002548_POPTR_ ----------MGLHTSPN--------------TANMVQPMSV----------AFG---GV
gm003140_Glyma0 ----------SHLHGGPP-----------------VVQPVML----------GFG----G
pt040110_POPTR_ ----------MGLHTSPN--------------TANMVQPMSV----------AFG---GT
gm044682_Glyma1 -----------GVVGGP-------------------VQPVML----------GFG----G
Sb012054_Sorbi1 G-AYAAS------RALPPALPPP-PGHGHAH-HHQYVMPLNM------------------
Sb031548_Sorbi1 RRLLAVEVAVAPARRAPERVQRPFLARG-----HELAAPVRR------------------
pt036345_POPTR_ -----------SAYTTP-------------------IAPMIM----------SFGRGDGG
pt002164_POPTR_ -----------STYTTP-------------------IAPMMM----------SFG---GG
pp005122_Pp1s23 GGTNTSTPM------------------------GALALPPSAGAMTPLTTAALSA--GG-
pt020175_POPTR_ QAHPQHNRS-PNSASPPPISS-----------SYYPSAPHMLLAL---------------
pt018733_POPTR_ GYPTSS--FISS-RAPPP---------------HQVVVSYKN------------G--GAN
Os017346_Os04t0 GFLPSSVPA----PAPPP----------------QLALPYHAVPAAAWHHAAAAA--AGR
gm045537_Glyma1 ----AA-------RSVPP---------------HQMIMPYNI------------G--IGH
gm035046_Glyma1 ------HRS-PNSASPPPISS-------------YPSAPHMLLAL---------------
pp026083_Pp1s3_ GGTIPSTPM------------------------ATLALPPSAGVMTPLTMAALST--GG-
pt036346_POPTR_ -----------SAYTTP-------------------IAPMIM----------SFGRGDGG
Sm001402_Selmo1 ----------------------------------RLMLPSRSGEL---------------
Sb010971_Sorbi1 AALTESSS--EELRVPAP---------------AHPAAPATTHP----------------
pt004186_POPTR_ QAQPLHNGS-PNSASPPPISS-----------SYYPSGPHMLLAL---------------
gm050382_Glyma1 LHAAAAARS-PNSASPPPISS-----------SYYPSAPHMLLAL---------------
pt020182_POPTR_ GYPTATGTLIPSRASAPH---------------HQMIMSYNM------------G-----
gm030075_Glyma1 -----------------------------------LVSPVMM----------AFG-----
gm019670_Glyma0 GYPTAA-------RSVPP---------------HQMIMPYNIG-----------G--IGH
Os038169_Os11t0 GAAYAAA------RALPPP-PPP-PPHGHHH-HHQIIMPLNM------------------
Sb015999_Sorbi1 GYLLHQH---QQLAAAAA---------GHMQMQRPLALPSTS------------H--SG-
gm002980_Glyma0 GYLHVAG---QQHRSAVG---------G------TLALPSTS------------G--GGG
pt004187_POPTR_ QAQPLHNGS-PNSASPPPISS-----------SYYPSGPHMLLAL---------------
pp005121_Pp1s23 GGTNTSTPM------------------------GALALPPSAGAMTPLTTAALSA--GG-
.
AT4G24660.1 ------DE-EDTS--------------------------------------NPSSSGGT-
pt002548_POPTR_ SGGTESSSEDLNP-----------FQSN----------------ADGVPPPPPYVM----
gm003140_Glyma0 SGPAESSSEDLNM-----------FQTNDHGGGGNN------LLLSSVQQQPPLLS--SS
pt040110_POPTR_ SGGTESSSEELNP-----------FQSN----------------AEGA-PPPPYVM----
gm044682_Glyma1 SGPAESSSEDLNM-----------FQTLDHRGGGN--------LLSSSVQQPP-LS--SS
Sb012054_Sorbi1 MHTSESDEME--G------------------GGGGA-------VAGCVDAARGGGSGGSS
Sb031548_Sorbi1 ---------------------AP-------ADGRR-------VVLQALAVPHPCSP----
pt036345_POPTR_ GAAAESSSEDLNM-----------YQSN----------------LQGQASVQPSM-----
pt002164_POPTR_ GAAAESSSEDLNM-----------YQSD----------------LQGQSSAQPLI-----
pp005122_Pp1s23 --LTDSDEQDDGL-------------GN--SAGGM-----------MISMRSPSAI----
pt020175_POPTR_ ------------------------------SGGVSGLNENVNINAPPRAGSSP-------
pt018733_POPTR_ AITSESDEKEEDN------------------GGG-------------ILTTRP-----VE
Os017346_Os04t0 AGSETPPRMDDFG---------P---GS--AGGSG-------------------SGGGGI
gm045537_Glyma1 HLPSESDEQEDAA------------------AGAG----------MVQLSSRP--S-SAQ
gm035046_Glyma1 ------------------------------SGGAG-------LSVAPENTAAPAPP---H
pp026083_Pp1s3_ --PTDSDEQDDGL-------------GN--SGGGM-----------MMSMRSPSAI----
pt036346_POPTR_ GAAAESSSEDLNM-----------YQSN----------------LQGQASVQPSM-----
Sm001402_Selmo1 ------DDQGVYM-------------PN--AGG-------------------PN-L----
Sb010971_Sorbi1 ----------------------PHAQVA--VGGSA--------------SAPPAPS----
pt004186_POPTR_ ------------------------------SGGVSGLNENANINVPPPVGSSP-------
gm050382_Glyma1 ------------------------------SAGLA---------APPESTAAPSAA----
pt020182_POPTR_ SLPSESDEQEDGG------------------G---------------VLMARP-----AQ
gm030075_Glyma1 -GPAESSSEDLNM-----------FQSNT--GGAQ---------LISVQQHAPLL----S
gm019670_Glyma0 HLPSESDEQEDGG------------------GGGG----------MVQLSSRPISS-QQQ
Os038169_Os11t0 IHTSESDEMDVSG------------------GGGG--------------VGRGGGS--SS
Sb015999_Sorbi1 ----RVDEGDDMSGLIGPLVVAPMVGMS--LGGSG--------------GGGPSGSGGSG
gm002980_Glyma0 TQSTREDQ-EDIS-------------------------------------NNPS-AGGTG
pt004187_POPTR_ ------------------------------SGGVSGLNENANINVPPPVGSSP-------
pp005121_Pp1s23 --LTDSDEQDDGL-------------GN--SAGGM-----------MISMRSPSAI----
AT4G24660.1 --TKRFRTKFTAEQKEKMLAFAERLGWRIQKHDDVAVEQFCA--------ETGVRR-QVL
pt002548_POPTR_ -SKKRFRTKFTPEQKDKMMEFADKVGWRINKQDDEEVHKFCA--------EVGVRR-QVF
gm003140_Glyma0 SSKKRFRTKFTQQQKDRMMEFAEKLGWKIQKQDEQELHQFCS--------QVGVRR-QVF
pt040110_POPTR_ -SKKRHRTKFTQEQKDKMMEFAEKVGWRINKQDEEEVERFCA--------EVGVRR-QVF
gm044682_Glyma1 SSKKRFRTKFTQQQKDRMMEFAEKLGWKIQKQDEQELHQFCS--------QVGVRR-QVF
Sb012054_Sorbi1 SSRKRFRTKFTPEQKARMLEFAERVGWRLQRLDDGMVQAFCQ--------EIGVKR-RVL
Sb031548_Sorbi1 ------ASSCAAHGHHRQLPVLGLLRHHVRRRHVPAVRAMVMLLLVVPVVQPQVRRASAA
pt036345_POPTR_ -SRKRFRTKFSQDQKDKMTEFAEKLGWRIQKQDEQEVQQFCS--------QVGVKR-KVF
pt002164_POPTR_ -SKKRFRTRFSEEQKDKMMEFAEKLGWRIQKQDEQEVQQFCS--------QVGVKR-KVF
pp005122_Pp1s23 --KKRFRTKFSTEQKDQMCAFAEELGWRIQKHDEAAVQEFCT--------TVGVKR-HVL
pt020175_POPTR_ --RKRFRTKFSQSQKERMHQFAEKVGWKMQKRDEDLVQEFCN--------EVGVDR-SAL
pt018733_POPTR_ KLRKRFRTKFTEEQKQKMLNFAEKAGWKMQKLEESVVQGLCQ--------ELGIKR-RVL
Os017346_Os04t0 FGRKRFRTKFTPEQKERMREFAEKQGWRINRNDDGALDRFCV--------EIGVKR-HVL
gm045537_Glyma1 LVKKRFRTKFSQDQKDKMLNFAEKVGWKIQKQEESVVQHFCQ--------EIGVKR-RVL
gm035046_Glyma1 HSRKRFRTKFTQEQKEKMHEFADKVGWKMQRRDEEMVMEFCN--------EIGVDR-GVL
pp026083_Pp1s3_ --KKRFRTKFTNEQKDQMCAFAEKVGWRIQKHDEASVQEFCA--------TAGIKR-HVL
pt036346_POPTR_ -SRKRFRTKFSQDQKDKMTEFAEKLGWRIQKQDEQEVQQFCS--------QVGVKR-KVF
Sm001402_Selmo1 --KKRFRTKFTGDQKERMLAFADKVGWKIQKHDEAEVQQFCN--------EVGVKR-HVL
Sb010971_Sorbi1 --KKRFRTKFTAEQKDRMREFAHRVGWRIHKPDADAVDAFCA--------QVGVSR-RVL
pt004186_POPTR_ --RKRFRTKFSQSQKERMYQFAERVGWKMQKRDEDLVQEFCN--------EVGVDR-GVL
gm050382_Glyma1 LSRKRFRTKFSQEQKEKMHKFAEKVGWKIQKRDEDLIHEFCN--------EVGVDR-SVL
pt020182_POPTR_ LMKKRFRTKFSQEQKEKMLNFAEKVGWKLQKQEETVVQQFCQ--------EIGVKR-RVL
gm030075_Glyma1 SSKKRFRTKFSQHQKDRMMEFADKIDWKIHKHNEQEVQQFCS--------QVGVKR-QVF
gm019670_Glyma0 LVKKRFRTKFSQEQKDKMLNFAEKVGWKIQKQEESVVQQFCQ--------EIGVKR-RVL
Os038169_Os11t0 SSKKRFRTKFTAEQKARMLEFAERVGWRLQKLDDAMVHHFCQ--------EIGVKR-RVL
Sb015999_Sorbi1 SGKKRFRTKFTQEQKDRMLAFAERLGWRIQKHDEAAVQQFCE--------EVCVKR-HVL
gm002980_Glyma0 S-KKRFRTKFTVEQKEKMLELAEKLGWRIQKQDEAVVQAFCN--------ETGVKR-HVL
pt004187_POPTR_ --RKRFRTKFSQSQKERMYQFAERVGWKMQKRDEDLVQEFCN--------EVGVDR-GVL
pp005121_Pp1s23 --KKRFRTKFSTEQKDQMCAFAEELGWRIQKHDEAAVQEFCT--------TVGVKR-HVL
: : : : . ::.: . : : : * .
AT4G24660.1 KIWMHNNKN-----------SLGKK-----------------------------------
pt002548_POPTR_ KVWMHNNKN------------LKKQPQ---------------------------------
gm003140_Glyma0 KVWMHNSKQ-----------ALKKKQM---------------------------------
pt040110_POPTR_ KVWMHNNKN------------LKKQQQQ-------------------------------Q
gm044682_Glyma1 KVWMHNSKQ-----------AMKKKQL---------------------------------
Sb012054_Sorbi1 KVWMHNNKH-----------NLATKRLEASP--------------------AAAQEQQAM
Sb031548_Sorbi1 AAGMHCHRQLALRPGKIHALSLTSSAA-AAP-----------------------------
pt036345_POPTR_ KVWMHNNKQ-----------AMKKKQV---------------------------------
pt002164_POPTR_ KVWMHNNKQ-----------SMKKKQT---------------------------------
pp005122_Pp1s23 KVWMHNNKH-----------TVGKKP----------------------------------
pt020175_POPTR_ KVWMHNNKN-----------SFGKKEHLNGN--NDDNIRSSN------------------
pt018733_POPTR_ KVWMHNNKH-----------NYVKN-----------------------------------
Os017346_Os04t0 KVWMHNHKN-----------QLASSPTSAAA--------------------AAAGV---M
gm045537_Glyma1 KVWMHNNKH-----------NLAKKI----------------------------------
gm035046_Glyma1 KVWMHNNKN-----------TFAKKDNLNGNSIGNVAIVSANGVAPIGAVGSATVRSSVH
pp026083_Pp1s3_ KVWMHNNKH-----------TMGKKPT---------------------------------
pt036346_POPTR_ KVWMHNNKQ-----------AMKKKQV---------------------------------
Sm001402_Selmo1 KVWMHNNKH-----------TLGKKM----------------------------------
Sb010971_Sorbi1 KVWMHNNKH------------LARIP--PSP--------------------PSSHQPPPL
pt004186_POPTR_ KVWMHNNKN-----------SLGKKEHLNGN--NNDILRSNN------------------
gm050382_Glyma1 KVWMHNNKN-----------TFAKK---------DNNIVFEN------------------
pt020182_POPTR_ KVWMHNNKH-----------SLAKK-----------------------------------
gm030075_Glyma1 KVWMHNNKQT---------TSSKKQQM---------------------------------
gm019670_Glyma0 KVWMHNNKH-----------NLAKK-----------------------------------
Os038169_Os11t0 KVWMHNNKH-----------NLAKKPLPSSP--------------------PPPPQ----
Sb015999_Sorbi1 KVWMHNNKH-----------TLGKK-----------------------------------
gm002980_Glyma0 KVWMHNNKH-----------TL--------------------------------------
pt004187_POPTR_ KVWMHNNKN-----------SLGKKEHLNGN--NNDILRSNN------------------
pp005121_Pp1s23 KVWMHNNKH-----------TVGKKP----------------------------------
** ::
AT4G24660.1 -P----------------------------------------------------------
pt002548_POPTR_ -PTSS---------------------T---------------------------------
gm003140_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pt040110_POPTR_ VPLDE---------------------NP--------------------------------
gm044682_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sb012054_Sorbi1 APGMA---------------------SPPPPPPPQH---HMPL------HMPAAVMPPPP
Sb031548_Sorbi1 VPRCNKSC-CGCSEGLNQDGKE---------------------------GASSCLVKP--
pt036345_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt002164_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp005122_Pp1s23 ------------------------------------------------------------
pt020175_POPTR_ -LENS-Y-------SNNESNKDITNNNNN--------NNHHHFENDSH-AAHVGTNGSSS
pt018733_POPTR_ ---ST---------------------SS--------------------------------
Os017346_Os04t0 NPGAGIGLGTGLGTGISGDGDGDDDDTDDSPP-------------------RAAVSSPSP
gm045537_Glyma1 NPPTT---------------------TAPPPPPP-------------------------P
gm035046_Glyma1 VHEHEHG-------GINGNGSGDNNHNPLGS------RDVNEYENDSGTNGGGGTNGSSS
pp026083_Pp1s3_ ------------------------------------------------------------
pt036346_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Sm001402_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Sb010971_Sorbi1 LPPHH------------------HDHHPPPPPPPHHIHHHHP--------------PPPP
pt004186_POPTR_ -LENSDN-------SNNEANKNITNDNNNGSEGLNHHHNHHHFENESHVGVHVGTNGSSS
gm050382_Glyma1 -PNNNHG-------SGSGGGEDPAEDPS---------RNHYG-------GVNVGANGSSS
pt020182_POPTR_ NPSTT---------------------TTTSNS----------------------------
gm030075_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm019670_Glyma0 NPPTT---------------------AAPPPP----------------------------
Os038169_Os11t0 IPPMS---------------------MPPSPPPPQ---------------IPPMSMPPSP
Sb015999_Sorbi1 -P----------------------------------------------------------
gm002980_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pt004187_POPTR_ -LENSDN-------SNNEANKNITNDNNNGSEGLNHHHNHHHFENESHVGVHVGTNGSSS
pp005121_Pp1s23 ------------------------------------------------------------
AT4G24660.1 -------------------------
pt002548_POPTR_ -------------------------
gm003140_Glyma0 -------------------------
pt040110_POPTR_ -------------------------
gm044682_Glyma1 -------------------------
Sb012054_Sorbi1 PPLPTQTGPSCHRGGPGSPLPLKLE
Sb031548_Sorbi1 -------------------------
pt036345_POPTR_ -------------------------
pt002164_POPTR_ -------------------------
pp005122_Pp1s23 -------------------------
pt020175_POPTR_ SS-----------------------
pt018733_POPTR_ -------------------------
Os017346_Os04t0 SPISV--------------------
gm045537_Glyma1 PP-----------------------
gm035046_Glyma1 SS-----------------------
pp026083_Pp1s3_ -------------------------
pt036346_POPTR_ -------------------------
Sm001402_Selmo1 -------------------------
Sb010971_Sorbi1 PPPPQQQHDA---------------
pt004186_POPTR_ SS-----------------------
gm050382_Glyma1 SS-----------------------
pt020182_POPTR_ -------------------------
gm030075_Glyma1 -------------------------
gm019670_Glyma0 -------------------------
Os038169_Os11t0 PPMPMPM--------PPSPPQLKLE
Sb015999_Sorbi1 -------------------------
gm002980_Glyma0 -------------------------
pt004187_POPTR_ SS-----------------------
pp005121_Pp1s23 -------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT4G24660.1 |
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