Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G24660.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Gm040204 |
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AT4G24660.1 |
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not found in 251aa |
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II |
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not found in 258aa |
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II |
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not found in 298aa |
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II |
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0.525252525 |
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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AT4G24660.1 SGEGAT--SSGGGGVGRSKGVGA---------KIRYRECLKNHAVNIGGHAVDGCCEFMP
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*:** :** * *** :*:.
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gm045537_Glyma1 S--GKEGSIEALNCSACHCHRNFHRKEVEA------------------------------
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gm014640_Glyma0 A--GEEGTLEAVICAACNCHRNFHRKEIDGE--------------------TSPYQHRSQ
. ... * * ******:*
AT4G24660.1 -----------------PTYYNRPPQPHQPPG---YL---HL-TSPAAPYR---------
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gm002980_Glyma0 ----PPP-------QFAAYYRH-------PAG---YL---HV---AGQQHRSAVGGTLAL
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gm044682_Glyma1 N-ILHSPHS----------HHVLH----------------GVVGGP------------VQ
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gm004654_Glyma0 P--PPPPLH--HHHQFSPYYHHRVPQHPTAAG---YIH-HHL-TPPMSQHRP-----LAL
gm009414_Glyma0 P--QPQPLHPQYHHQFSPYYHRAPP--PSAAG---YLH-HHLVTPPVSQHRP-----LAL
gm003140_Glyma0 NTIIHSPDS----------HHHLQF--PTPH--------SHLHGGPP----------VVQ
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gm022731_Glyma0 P--LPPPV------PFAAYYRT-------PPG---YP---HM---TGHQRAM-----LAH
gm045537_Glyma1 ----------------------------------------AARSVPPHQ--------MIM
gm053999_Glyma2 -------------------------------G---YP---RV---QGQQCTT-----LAL
gm004386_Glyma0 -------------------------------G---YP---HV---QGQQCTT-----LAL
gm053998_Glyma2 -------------------------------G---YP---HV---QGQQCTT-----LAL
gm014640_Glyma0 P--QPQPLHPQYHHQFSPYYHRAPP--PSAAG---YLH-HHLVTPPVSQHRP-----LAL
AT4G24660.1 PPAA-SG--------DEEDTSNPSSS-------GG-------------------------
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gm014640_Glyma0 PPLA-SGGVFS---REEEDMSNPSSSGG---GGGGGFS-GG---------GGSG-----S
. :
AT4G24660.1 -TTKRFRTKFTAEQKEKMLAFAERLGWRIQKHDDVAVEQFCAETGVRRQVLKIWMHNNKN
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gm002980_Glyma0 GSKKRFRTKFTVEQKEKMLELAEKLGWRIQKQDEAVVQAFCNETGVKRHVLKVWMHNNKH
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gm009414_Glyma0 GTKKRFRTKFTQEQKDKMLAFAEELGWRIQKHDEVAVEQFCAETCVKRHVLKVWMHNNKH
gm003140_Glyma0 SSKKRFRTKFTQQQKDRMMEFAEKLGWKIQKQDEQELHQFCSQVGVRRQVFKVWMHNSKQ
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gm053998_Glyma2 SSKKRFRTRFTQEQKEKMLAFAEKLGWRILKHDESAVQEFCAETSIQPHVLKVWVNNNKN
gm014640_Glyma0 GTKKRFRTKFTQEQKDKMLAFAEKLGWRIQKHDEAAVEQFCAETCIKRHVLKVWMHNNKH
*****:*: .** :* :.:.:.*:: :.:: : ** : : *:*:*::*.
AT4G24660.1 SLGKKP------------------------------------------------------
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gm044682_Glyma1 --AMK-------------------------------------------------------
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gm014640_Glyma0 TLANSEQ--------------------------------------HS--AGNGS------
AT4G24660.1 -----------------------------------------
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gm053998_Glyma2 -----------------------------------------
gm014640_Glyma0 -------NHL--------NSTTIIENSQFS-----------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT4G24660.1 |
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gm009415_Glyma0 |
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