Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G28500.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os022821 |
not found in 314aa |
AT4G28500.1 |
1st_1st |
0.653024911 |
Ia |
Os000796 |
not found in 433aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.539145907 |
III |
Os025299 |
not found in 332aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.494661921 |
III |
Os020501 |
not found in 348aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.455516014 |
III |
Sb025585 |
not found in 394aa |
AT4G28500.1 |
1st_1st |
0.647686832 |
Ia |
Sb019101 |
not found in 323aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.631672597 |
II |
Sb024600 |
not found in 632aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.535587188 |
III |
Sb003892 |
not found in 480aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.485765124 |
III |
Sb018150 |
not found in 265aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.450177935 |
III |
Sb018148 |
not found in 222aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.441281138 |
III |
Gm018943 |
not found in 326aa |
AT4G28500.1 |
1st_1st |
0.642348754 |
Ia |
Gm036334 |
not found in 312aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.640569395 |
II |
Gm041532 |
not found in 322aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.631672597 |
II |
Gm041531 |
not found in 322aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.631672597 |
II |
Gm036974 |
not found in 332aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.615658362 |
II |
Gm036973 |
not found in 332aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.615658362 |
II |
Gm034299 |
not found in 279aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.613879003 |
II |
Gm033470 |
not found in 284aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.610320284 |
II |
Gm037606 |
not found in 279aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.606761565 |
II |
Gm013312 |
not found in 375aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.546263345 |
III |
Gm000198 |
not found in 451aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.542704626 |
III |
Gm020071 |
not found in 452aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.539145907 |
III |
Gm018245 |
not found in 447aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.537366548 |
III |
Gm018246 |
not found in 409aa |
AT4G29230.1 |
not_not |
0.537366548 |
III |
Gm003575 |
not found in 424aa |
AT1G25580.1 |
not_not |
0.402135231 |
III |
Pt003226 |
not found in 299aa |
AT4G28500.1 |
1st_1st |
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Ia |
Pt037546 |
not found in 298aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
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II |
Pt020283 |
not found in 313aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
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II |
Pt025196 |
not found in 359aa |
AT4G28500.1 |
not_1st |
0.615658362 |
II |
Pt009615 |
not found in 452aa |
AT4G29230.1 |
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0.533807829 |
III |
Pt007485 |
not found in 455aa |
AT4G29230.1 |
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0.530249110 |
III |
Pt033735 |
not found in 422aa |
AT1G25580.1 |
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0.412811387 |
III |
Pt033734 |
not found in 423aa |
AT1G25580.1 |
not_not |
0.412811387 |
III |
Pt033736 |
not found in 302aa |
AT1G25580.1 |
not_not |
0.412811387 |
III |
Pt041449 |
not found in 428aa |
AT1G25580.1 |
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III |
Pp038220 |
not found in 484aa |
AT4G28500.1 |
1st_1st |
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Ia |
Sm011004 |
not found in 171aa |
AT4G29230.1 |
1st_not |
0.425266903 |
II |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT4G28500.1 ----------------------------------------------------MTWC----
gm041532_Glyma1 ----------------------------------------------------MTWC----
pt020283_POPTR_ ----------------------------------------------------MTWC----
pt033736_POPTR_ ----------------------------------------------------MAG-PW--
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Sb025585_Sorbi1 ---------------------------------------RGRDRSSSSSSTAMTWC----
Sb018148_Sorbi1 ----------------------------------------------------MSTS----
pt025196_POPTR_ MILFFFSFYVFILVALYFIFFIFFGRSELEAETTGKIPLWNENKRNT---IEMTWC----
pt037546_POPTR_ ----------------------------------------------------MTWC----
gm020071_Glyma0 ----------------------------------------------------MNKI----
pt033734_POPTR_ ----------------------------------------------------MAG-PW--
pp038220_Pp1s25 ----------------------------------------------------MDRV----
pt041449_POPTR_ ----------------------------------------------------MAG-PW--
Sm011004_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Sb003892_Sorbi1 ----------------------------------------------------MDGA----
gm036334_Glyma1 ----------------------------------------------------MTWC----
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gm037606_Glyma1 ----------------------------------------------------MTQC----
gm041531_Glyma1 ----------------------------------------------------MTWC----
pt033735_POPTR_ ----------------------------------------------------MAG-PW--
gm033470_Glyma1 ----------------------------------------------------MTQC----
gm013312_Glyma0 ----------------------------------------------------MNKI----
Os020501_Os05t0 ----------------------------------------------------MSSD----
pt009615_POPTR_ ----------------------------------------------------MSTR----
gm036973_Glyma1 -----------------------------MCKCIGKL------TKN-----KMTWC----
Sb019101_Sorbi1 ----------------------------------------------------MTWC----
Sb024600_Sorbi1 LLL--------------------------------RLALRAARRRNKNHPSPITTTHACA
Os025299_Os06t0 ----------------------------------------------------MDGV----
pt003226_POPTR_ ----------------------------------------------------MTWC----
pt007485_POPTR_ ----------------------------------------------------MTTK----
gm003575_Glyma0 ----------------------------------------------------MAGTSW--
gm000198_Glyma0 ----------------------------------------------------MSKI----
gm036974_Glyma1 -----------------------------MCKCIGKL------TKN-----KMTWC----
gm018246_Glyma0 ---------------------------------------------------MMSKI----
AT4G28500.1 -------------NDRSDVQ-TVER----IIPSPGAAESPVAS-----LPVSCH------
gm041532_Glyma1 -------------NDSDEDR-VIES-TTPTITITPNTDGIKLT-------EEIR------
pt020283_POPTR_ ------------NNNSEDER-VIQL-----VTSNPKEDTFVAA-----KTEEIR------
pt033736_POPTR_ ---------------------LVDG-------------NRFAT-----KIKSASGASNLE
Sb018150_Sorbi1 --------------STSD---LTDE-----------------------KLKDQQR-----
Os000796_Os01t0 ----------MNRGHISSSE-LIDA-----------------------KLEERR------
gm034299_Glyma1 -------------SY-----------------PENN-HSIIVE-----RHKDS-------
Sb025585_Sorbi1 -------------NSFNDVR-AVEN----NLATAAAVAAAKKQ-----QQASSH------
Sb018148_Sorbi1 -------------NNTSD---LSDE-----------------------KLKDQRC-----
pt025196_POPTR_ ------------SNNSVYER-AIQL-----ATSSSKEDAFVEA-----ETNEIR------
pt037546_POPTR_ -------------NDCNDVQ-TIER----SSPPPCN-ASVIAQ-----RHKEC-------
gm020071_Glyma0 ----------GNLSCVRSSD-LIDA-----------------------KLEEHQ------
pt033734_POPTR_ ---------------------LVDG-------------NRFAT-----KIKSASGASNLE
pp038220_Pp1s25 ----------------ASNR-ILGA----------------------SKLR---------
pt041449_POPTR_ ---------------------LVDG-------------NRFAT-----KIKSASSASNHE
Sm011004_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Sb003892_Sorbi1 -----AAAAAATGSGGGGHR-RMDS-----------------------RIEEHGK-----
gm036334_Glyma1 -------------NDSDEER-GIDQLVAPAITPTSTNNTTVLTHDHHRKPTEIR------
gm018943_Glyma0 -------------NDSDEER-GIDQLVAPTITPTSTNNTTVLT-DHRTKASEIR------
Os022821_Os05t0 -------------NSFSDVRTAVDS----SLSPAAAVAAAAGK-----KAAASL------
gm018245_Glyma0 ----------SNLSSVSSSD-LIDA-----------------------KLEEHQ------
gm037606_Glyma1 -------------NY-----------------PQNS-HSIIVE-----RHKDS-------
gm041531_Glyma1 -------------NDSDEDR-VIES-TTPTITITPNTDGIKLT-------EEIR------
pt033735_POPTR_ ---------------------LVDG-------------NRFAT-----KIKSASGASNLE
gm033470_Glyma1 -------------SD-----------------SENNHHNIIVE-----GRKDS-------
gm013312_Glyma0 ----------SNLSCVRSSD-LIDA-----------------------KLEEHQ------
Os020501_Os05t0 ----GASGSIGMKHDDGDHRPSTGA-----------------------------------
pt009615_POPTR_ ----------CSMASISSSD-LIDA-----------------------KLEEHQ------
gm036973_Glyma1 -------------NDSDENR-VIES-ITPRITITPNTDDKKLT-------QEIR------
Sb019101_Sorbi1 -------------NGFNDVRAAVES----SLSPA---AAAVGK-----KAAASL------
Sb024600_Sorbi1 LPPGAAYEPDMNRGHSSSSK-LINE-----------------------KLEEHR------
Os025299_Os06t0 -----VAEDQAGGSGSGHRR-LIGS-----------------------RIEEHRK-----
pt003226_POPTR_ -------------NDCNDVQ-TIER----SSPPPCN-ASVIAQ-----RHKEC-------
pt007485_POPTR_ ----------SNMASISSSN-LIDA-----------------------KLEEHQ------
gm003575_Glyma0 ---------------------LVDK-------------SRIAT-----KIKCASGACDHG
gm000198_Glyma0 ----------SNLSSVSSSD-LIDA-----------------------KLEEHQ------
gm036974_Glyma1 -------------NDSDENR-VIES-ITPRITITPNTDDKKLT-------QEIR------
gm018246_Glyma0 ----------SNLSSVSSSD-LIDA-----------------------KLEEHQ------
AT4G28500.1 ---------KTCPSCGHNFKFH--EQAG-IHDLPGLPAGVKFDPTDQEVLEHLEGKVRDD
gm041532_Glyma1 --------TITCPSCGHNIEFK--DQGG-IHDLPGLPAGVKFDPNDQEILEHLEAKVASD
pt020283_POPTR_ --------RITCPSCGHNFEIQ--DQGGIIHDLPGLPAGVKFDPTDQEILEHLEAKVLSD
pt033736_POPTR_ RVEWKSDPCKTCPNCHHVIDNS--DV---VQEWPGLPRGVKFDPSDQEIIWHLLAKVSDG
Sb018150_Sorbi1 ----STPASRRCPSCDHELDCN--------PDMVGFPAGVKFDPSDQELIEHLESMVKEG
Os000796_Os01t0 -----ISTAKHCPSCGNKLDCK--------PDWVGLPAGVKFDPTDQELIEHLEAKVREE
gm034299_Glyma1 -------LIRTCPTCGHHVKCQ--EQAAGIHDLPGLPAGVKFDPTDQEILEHLEAKVRSD
Sb025585_Sorbi1 -----VNLIRTCPSCGHRAQYEQVQAAATIQDLPGLPAGVKFDPTDQELLEHLEGKARPD
Sb018148_Sorbi1 ----LTPASWRCPYCDHELNCN--------SYMVGFPAGVKFDPTDQELLEHLESMVKEG
pt025196_POPTR_ --------RITCPSCGHNFEFQ--DQGGIIHDLPGLPAGVKFDPTDQEILGHLEAKVLSD
pt037546_POPTR_ -------LIRSCPSCGHQMKCQ--DQAR-IHDLPGLPAGVKFDPTDLELLEHLEGKVKSD
gm020071_Glyma0 -----LCGSKQCPGCGHKFEGK--------PDWLGLPAGVKFDPTDQELIEHLEAKVEAK
pt033734_POPTR_ RVEWKSDPCKTCPNCHHVIDNS--DV---VQEWPGLPRGVKFDPSDQEIIWHLLAKVSDG
pp038220_Pp1s25 --------------CDNNAAAHQ-------VKLDSFPAGVRFDPSDEELLEHLAAKIGRS
pt041449_POPTR_ RVAWKSDPCKTCPNCHHVIDNS--DV---VQEWPGLPRGVKFDPSDQEIIWHLLAKAGNG
Sm011004_Selmo1 ---------SQAP-----------------QDWTGLPAGVKFDPNDKEILDHLAAKI-GR
Sb003892_Sorbi1 ----YLSESSCCSQCGHKTERK--------LDWVGLPAGVKFDPTDQELIEHLQAKVRAA
gm036334_Glyma1 --------TITCPSCGHNIEFQ--DQTG-INDLPGLPAGVKFDPNDQEILEHLEAKVFSD
gm018943_Glyma0 --------TLTCPSCGQNIEFQ--DQTG-INDLPGLPAGVKFDPNDQEILEHLEAKVLSD
Os022821_Os05t0 -----AVLVKMCPSCGHRARYE--QETTTIQDLPGLPAGVKFDPTDQELLEHLEGKARPD
gm018245_Glyma0 -----LCGSKQCPGCGHKFEGK--------PDWLGLPAGVKFDPTDQELTEHLEAKVEAK
gm037606_Glyma1 -------LIRTCPTCGLHVKCQ--EQAAGIHDLPGLPAGVKFDPTDQEILEHLEAKVRSD
gm041531_Glyma1 --------TITCPSCGHNIEFK--DQGG-IHDLPGLPAGVKFDPNDQEILEHLEAKVASD
pt033735_POPTR_ RVEWKSDPCKTCPNCHHVIDNS--DV---VQEWPGLPRGVKFDPSDQEIIWHLLAKVSDG
gm033470_Glyma1 -------LIRTCPTCGHHIKCQ--DQGGGIHDLPGLPAGVKFDPTDQEILEHLEAKVRSD
gm013312_Glyma0 -----LCGSKQCPGCGHKFEGK--------PDWLGLPAGVKFDPTDQELIEHLEAKIEAK
Os020501_Os05t0 -------SSRRCPSCGHDPDCNK------PFDMVGMPAGVRFDPTDQELIEHLEAKVKDG
pt009615_POPTR_ -----LCGSKQCPGCGHKLEGK--------PDWLGLPAGVKFDPTDQELIEHLEAKVEAK
gm036973_Glyma1 --------TTACPSCGHNIAFK--DKGG-IHDLPGLPAGVKFDPNDQEILEHLEAKVASD
Sb019101_Sorbi1 -----AVLVKMCPSCGHRAQYE--QESTTIQDLPGLPAGVKFDPTDQELLEHLEGKARPD
Sb024600_Sorbi1 -----ISTAKHCPHCGEKIDSK--------PDWVGLPAGVKFDPTDQELIEHLEAKVKDE
Os025299_Os06t0 ----YMSEESCCPRCGHKIDRK--------LDWVGLPAGVKFDPTDQELIEHLEAKVRPG
pt003226_POPTR_ -------LIRSCPSCGHQIKCQ--DQAR-IHDLPGLPAGVKFDPTDQELLEHLEGKVKSD
pt007485_POPTR_ -----LCGSKQCPGCGHKLEGK--------PDWLGLPAGVKFDPTDQELIEHLEAKVEAK
gm003575_Glyma0 KVIWKSNPTKACPNCQHAIDNG--DV---AQEWPGLPKGVKFDPSDQEIIWHLLAKVGVG
gm000198_Glyma0 -----LCGSKQCPGCGHKFEGK--------PDWLGLPAGVKFDPTDQELIEHLEAKVEAK
gm036974_Glyma1 --------TTACPSCGHNIAFK--DKGG-IHDLPGLPAGVKFDPNDQEILEHLEAKVASD
gm018246_Glyma0 -----LCGSKQCPGCGHKFEGK--------PDWLGLPAGVKFDPTDQELTEHLEAKVEAK
.:* **:***.* *: ** .
AT4G28500.1 AKK--LHPLIDEFIRTI-DGENGICYTHPEKLPGVNKDGTVRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm041532_Glyma1 ACK--LHPLIDEFIPTL-EGENGICYTHPEKLPGVSKDGQIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
pt020283_POPTR_ RRK--LHPLIDEFIPTI-EGENGICYSHPEKLPGVSNDGQIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
pt033736_POPTR_ GIK--PHPFIKEFIPTV-DNDDGICYTHPQNLPGVKQDGSISHFFHRAIKAYNTGTRKRR
Sb018150_Sorbi1 GSR--AHPLIGDFIHTIDQGNDGICYTHPENLPGVTRNGVSKHFFHRPSKAYTSGTRKRR
Os000796_Os01t0 GSR--SHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPEKLPGVTRDGLSKHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm034299_Glyma1 IHK--LHPLIDEFIPTL-EGENGICCTHPEKLPGVSKDGLIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
Sb025585_Sorbi1 ARK--LHPLIDEFIPTI-EGENGICYTHPERLPGVGKDGLIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
Sb018148_Sorbi1 GSR--AHPLIGDFVTTL-QGDDGICYTHPENLPGVTRDGVSKHFFHRPSKAYTSGTRKRR
pt025196_POPTR_ KRK--LHPLIDEFIPSI-EGENGICYTHPENLPGVSNDGQIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
pt037546_POPTR_ TCK--VHPLIDEFIPTI-DGENGICYTHPEKLPGVSKDGLIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm020071_Glyma0 NMK--SHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPEKLPGVTRDGLSRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
pt033734_POPTR_ GIK--PHPFIKEFIPTV-DNDDGICYTHPQNLPGVKQDGSISHFFHRAIKAYNTGTRKRR
pp038220_Pp1s25 SRK--PHPFLDEFIHTL-VEEDGICRTHPENLPGVKKDGSSCHYFHRPSMAYTTGTRKRR
pt041449_POPTR_ GIK--SHPFIKEFIPTV-ENDDGICYTHPKNLPGVKQDGSISHFFHRAIKAYNTGTRKRR
Sm011004_Selmo1 GGK--PHALIDEFIPTL-EDDEGICSKHPEKLPGVKSDGSSSHFFHRPSNAYTKGTRKRR
Sb003892_Sorbi1 SAAAPSHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPERLPGLTKDGRSRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm036334_Glyma1 VPK--LHPLIDEFIPTL-EGENGICYTHPEKLPGVSKDGQIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm018943_Glyma0 VPK--LHPLIDEFIPTL-EGENGICYTHPEKLPGVRKDGQIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
Os022821_Os05t0 SRK--LHPLVDEFIPTI-EGENGICYTHPERLPGVSKDGLVRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm018245_Glyma0 NMK--SHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPEKLPGVTRDGLSKHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm037606_Glyma1 IHK--LHPLIDEFIPTL-EGENGICCTHPEKLPGVSKDGLIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm041531_Glyma1 ACK--LHPLIDEFIPTL-EGENGICYTHPEKLPGVSKDGQIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
pt033735_POPTR_ GIK--PHPFIKEFIPTV-DNDDGICYTHPQNLPGVKQDGSISHFFHRAIKAYNTGTRKRR
gm033470_Glyma1 IHK--LHPLIDEFIPTL-EGENGICYTHPEKLPGVSKDGLIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm013312_Glyma0 NMK--SHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPEKLPGVTRDGLSRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
Os020501_Os05t0 GST--SHPLIDEFIHTI-QGEDGICYTHPENLPGVTRDGLSKHFFHRSAKAYPTGTRKRR
pt009615_POPTR_ DMR--SHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPEKLPGVTRDGLSRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm036973_Glyma1 ACK--LHPLIDEFIPTL-EGENGICYTHPEKLPGVSKDGQIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
Sb019101_Sorbi1 TRK--LHPLVDEFIPTI-DGENGICYTHPENLPGVSKDGLVRHFFHRPSRAYTTGTRKRR
Sb024600_Sorbi1 GSR--SHPLIDEFIPTI-DGEDGICYTHPEKLPGVTRDGLSKHFFHRPSKAYTTGTRKRR
Os025299_Os06t0 GEAA-AHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPEKLPGVSKDGLSRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
pt003226_POPTR_ TRK--VHPLIDEFIPTI-DGENGICYTHPEKLPGVSKDGLIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
pt007485_POPTR_ DMR--SHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPEKLPGVTRDGLSRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm003575_Glyma0 DSK--SHPFIDEFITTL-EVDDGICYTHPQNLPGVRQDGSASHFFHRAIKAYNTGTRKRR
gm000198_Glyma0 NMK--SHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPEKLPGVTRDGLSRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm036974_Glyma1 ACK--LHPLIDEFIPTL-EGENGICYTHPEKLPGVSKDGQIRHFFHRPSKAYTTGTRKRR
gm018246_Glyma0 NMK--SHPLIDEFIPTI-EGEDGICYTHPEKLPGVTRDGLSKHFFHRPSKAYTTGTRKRR
*.:: :*: :: ::*** .**:.***: :* *:***. ** .******
AT4G28500.1 KV---------------------------------HTDSDV---------GGETRWHKTG
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Sb025585_Sorbi1 KV---------------------------------HTDEQ----------GGETRWHKTG
Sb018148_Sorbi1 KI---------------------------------QSKRG--------EDVGEARWHKTG
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gm020071_Glyma0 KI---------------------------------QNECDLQ--------GGETRWHKTG
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pp038220_Pp1s25 KI---------------------------------QTDDVPDG-------GTDVRWHKTG
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*: :. *****
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:*:*
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