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Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT4G28640.1 -MEGG-----SASGSA------SALSNDENLVVSCEDSSSPIGNELELGLTL---SLGRK pt040421_POPTR_ -MQGG-----FLGGGSGGSVCMSTVSMEDNVLMSSEDSSSPDEGELELGLGL---SLGGA pt040422_POPTR_ -MQGG-----FLGGGSGGSVCMSTVSMEDNVLMSSEDSSSPDEGELELGLGL---SLGGA pt034336_POPTR_ MMEGCLGLL-GGGGSSGASTNKSTLSKVE--VIEAEASSYPVEAELELGLGL---SLGSG pt041570_POPTR_ MMAGGLGSLGGGGGSSGASTNDSTMSKVE--VVEAEASSYPVEAELELGLSLGSGGRGGG pt034335_POPTR_ MMEGCLGLL-GGGGSSGASTNKSTLSKVE--VIEAEASSYPVEAELELGLGL---SLGSG * * .*.: *::* : ::..* ** * ****** * . * AT4G28640.1 ------GYRDCR-VYAD-----------------DSSSSSSSSSLSRASVIAGIKRTADS pt040421_POPTR_ SGFKDFGQRSSQ-QYARILTAKDLPSKVSSSSCCSSTTSSSSSTLSRANATAGTKRAADS pt040422_POPTR_ SGFKDFGQRSSQ-QYARILTAKDLPSKVSSSSCCSSTTSSSSSTLSRANATAGTKRAADS pt034336_POPTR_ GGGK--GKANAWGECGRILTAKDFPSV----------------------------RAADS pt041570_POPTR_ GGGK--GKANARGERGRILTAKDFPSV----------------------------RAADS pt034335_POPTR_ GGGK--GKANAWGECGRILTAKDFPSVVSQPQ--RPNNNNSMPSTCVVGAVSGTKRAADS * .. . *:*** AT4G28640.1 MAATSG------QVVGWPPIRTYRMNSMVNQAKASATEDPNLEISQAVNKNRS------- pt040421_POPTR_ VSASNGA--ASSQVVGWPPIRSHRMHIMVNQAKSQATEEFN-----SMNKRKNAVEEKV- pt040422_POPTR_ VSASNGA--A-SQVVGWPPIRSHRMHIMVNQAKSQATEEFN-----SMNKRKNAVEEKV- pt034336_POPTR_ VSHEGGSPTAGSQVVGWPPIRAYRMNSLVSQAKAARAEEEK-GIG-EKDKSKENLKKKIC pt041570_POPTR_ VSHEGGSPTAGSQVVGWPPIRAYRMNSLVNQAKAARAEEDK-GIG-EKDISKDNLKKKIC pt034335_POPTR_ VSHEGGSPTAGSQVVGWPPIRAYRMNSLVSQAKAARAEEEK-GIG-EKDKSKENLKKKIC :: .* *********::**: :*.***: :*: : : :. AT4G28640.1 --------DSTKMRNSMFVKVTMDGIPIGRKIDLNAHKCYESLSNTLEEMFLKPKLGSRT pt040421_POPTR_ -GNKNINIGNTKTRTSLFVKVNMDGTLIGRKVDLNAHGCYETLAQALENMFLR----TTT pt040422_POPTR_ -GNKNINIGNTKTRTSLFVKVNMDGTLIGRKVDLNAHGCYETLAQALENMFLR----TTT pt034336_POPTR_ NGNKTNATGNEKGHLG-FVKVNMDGVPIGRKVDLNAHACYETLAQALEEMFFR---STTT pt041570_POPTR_ NGNKTSAPSNEKGHLG-FVKVNMDGIPIGRKVDLNAHACYETLAQALEEMFFR---SATT pt034335_POPTR_ NGNKTNATGNEKGHLG-FVKVNMDGVPIGRKVDLNAHACYETLAQALEEMFFR---STTT .. * : . ****.*** ****:***** ***:*:::**:**:: : * AT4G28640.1 LETDGHMETPV-KILPD---------GSSGLVLTYEDKEGDWMLVGDVPWGMFIGSVRRL pt040421_POPTR_ TLNMARLSTPEHKIMIDAKRHSQLLGGSSEFVLTYEDKDGDWMLVGDVPWGMFISSVKRL pt040422_POPTR_ TLNMARLSTPEHKIMIDAKRHSQLLGGSSEFVLTYEDKDGDWMLVGDVPWGMFISSVKRL pt034336_POPTR_ INSIGGQK-PLSK-------FSKLLDGSSEFVLTYEDKEGDWMLVGDVPWGMFLTSVKRL pt041570_POPTR_ INSIGGEKRQVTK-------PSKLLDGLSEFLLTYEDKEGDWMLVGDVPWGMFLNSVKRL pt034335_POPTR_ INSIGGQK-PLSK-------FSKLLDGSSEFVLTYEDKEGDWMLVGDVPWGMFLTSVKRL . . . * * * ::******:**************: **:** AT4G28640.1 RIMKTSEATGKAQMIL----------- pt040421_POPTR_ RIMRMSEATGLGK-------------- pt040422_POPTR_ RIMRMSEATGLGK-------------- pt034336_POPTR_ RIMRTSEANGLAPRLQDRNEKQRSKPV pt041570_POPTR_ RIMRTSEANGLAPRFQDRNEKQRIKPV pt034335_POPTR_ RIMRTSEANGLAPRLQDRNEKQRSKPV ***: ***.* .
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