Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G32040.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os025815 |
not found in 311aa |
AT5G25220.2 |
1st_not |
0.484931506 |
II |
Os025814 |
not found in 323aa |
AT5G25220.1 |
not_not |
0.484931506 |
III |
Os006715 |
not found in 313aa |
AT5G25220.1 |
not_not |
0.479452054 |
III |
Os010971 |
not found in 314aa |
AT1G62990.1 |
not_not |
0.430136986 |
III |
Sb009772 |
TFAGHRLRLSLRITVF in 344/444 |
AT5G25220.1 |
1st_not |
0.490410958 |
II |
Gm014302 |
not found in 400aa |
AT5G25220.2 |
1st_not |
0.571232876 |
II |
Gm014301 |
not found in 410aa |
AT5G25220.1 |
not_not |
0.571232876 |
III |
Gm009102 |
not found in 399aa |
AT5G25220.2 |
not_not |
0.567123287 |
III |
Gm039671 |
not found in 412aa |
AT5G25220.2 |
not_not |
0.558904109 |
III |
Gm039672 |
not found in 407aa |
AT5G25220.2 |
not_not |
0.558904109 |
III |
Gm047734 |
not found in 405aa |
AT5G25220.2 |
not_not |
0.557534246 |
III |
Gm047733 |
not found in 411aa |
AT5G25220.1 |
not_not |
0.557534246 |
III |
Gm046674 |
not found in 345aa |
AT5G25220.1 |
not_not |
0.523287671 |
III |
Gm036151 |
not found in 345aa |
AT5G25220.1 |
not_not |
0.523287671 |
III |
Gm036150 |
not found in 346aa |
AT5G25220.2 |
not_not |
0.523287671 |
III |
Gm046675 |
not found in 337aa |
AT5G25220.2 |
not_not |
0.523287671 |
III |
Gm046676 |
not found in 344aa |
AT5G11060.1 |
not_not |
0.523287671 |
III |
Gm024531 |
not found in 369aa |
AT5G11060.1 |
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0.519178082 |
III |
Gm002202 |
not found in 281aa |
AT1G62990.1 |
not_not |
0.447945205 |
III |
Gm046967 |
not found in 292aa |
AT1G62990.1 |
not_not |
0.446575342 |
III |
Gm042734 |
not found in 340aa |
AT5G25220.2 |
not_not |
0.445205479 |
III |
Gm011307 |
not found in 293aa |
AT1G62990.1 |
not_not |
0.445205479 |
III |
Gm029620 |
not found in 279aa |
AT1G62990.1 |
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0.438356164 |
III |
Pt007118 |
not found in 424aa |
AT5G25220.1 |
1st_not |
0.584931506 |
II |
Pt009401 |
not found in 426aa |
AT5G25220.1 |
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0.573972602 |
III |
Pt006008 |
not found in 338aa |
AT5G25220.2 |
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0.536986301 |
III |
Pt008243 |
not found in 334aa |
AT5G25220.1 |
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0.524657534 |
III |
Pt028672 |
not found in 301aa |
AT1G62990.1 |
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0.442465753 |
III |
Pp030484 |
not found in 636aa |
AT5G25220.1 |
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0.417808219 |
II |
Pp013684 |
not found in 518aa |
AT5G25220.2 |
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0.408219178 |
III |
Sm010116 |
not found in 293aa |
AT5G25220.2 |
1st_not |
0.461643835 |
II |
Sm017497 |
not found in 275aa |
AT5G11060.1 |
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0.452054794 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT4G32040.1 ------------------------------------------------------------
Os025815_Os06t0 ------------------------------------------------------------
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Sb009772_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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pp030484_Pp1s15 MQPRVALLSDCLHRERSLSDELIAQRGVGGLHRHIMRRAKDSPDDPIRQTPNHKPALQLG
gm046967_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sm010116_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm039671_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Os006715_Os02t0 ------------------------------------------------------------
gm036151_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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gm014301_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm009102_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm046676_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm047734_Glyma1 ------------------------------------------------------------
AT4G32040.1 -----------------MSFNS--SHL---LPPQEDL----PLRHFTDQ-S-Q-------
Os025815_Os06t0 -----------------MAF-----HY--------------QDHALAMD-----------
pt006008_POPTR_ -----------------MAFQD--HHH----TPQEMTFQLPQHHHLSAS-----------
gm039672_Glyma1 -----------------MAY-----HN-HNLSQQDL-----PLHHFPNQ-----------
pt009401_POPTR_ -----------------MAY----HHN---LSSQDL-----PLHHFTDQ---QATENH--
gm047733_Glyma1 -----------------MAY-----HNHHNLSQQDLP----PLHHFPNQ-----------
Os010971_Os03t0 -----------------MQG------------------------------G---------
pt007118_POPTR_ -----------------MAF----HHN---LPSQDL-----PLHHFTDQ---QATENT--
gm014302_Glyma0 -----------------MAY-----HN-----PQDL-----PLHHFTDQ---QQHHNHTL
pp013684_Pp1s77 -----------------MTFDNDLSQD---GSLQQFS-ELWGSSRFTQRQS---------
pt008243_POPTR_ -----------------MAFED--HHH----IPQEMAFQL-QHHHLSAS-----------
gm036150_Glyma1 -----------------MAF-----HD-H--LQHEI-----GFQRFTEE---QELNEN--
Sb009772_Sorbi1 -----------------MSF-----HY--------------PDHGLSMD-----------
Sm017497_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm046675_Glyma1 -----------------MAF-----HD-H--LQHEI-----AFQRFTEE---QELTEN--
pt028672_POPTR_ -----------------MQE------------------------------P---------
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gm024531_Glyma0 -----------------MAF-----HE-H--LPHEI-----TFQPFAEEQQQQQLGQS--
gm011307_Glyma0 -----------------MQE------------------------------A---------
gm042734_Glyma1 -----------------MAF-----HD-H--LPHEI-----TFQPFTEE---QQLGQS--
pp030484_Pp1s15 SCNIGSVWRYRDCGRQMMAFNN-LSHD---VSLQQFP-ELWESSRFSQRHDTLDADQHT-
gm046967_Glyma1 -----------------MQE------------------------------A---------
Sm010116_Selmo1 -----------------MVA----------------------------------------
gm039671_Glyma1 -----------------MAY-----HN-HNLSQQDL-----PLHHFPNQ-----------
Os006715_Os02t0 -----------------MAF-----HY--------------PDHGLAMD-----------
gm036151_Glyma1 -----------------MAF-----HD-H--LQHEI-----GFQRFTEE---QELNEN--
gm046674_Glyma1 -----------------MAF-----HD-H--LQHEI-----AFQRFTEE---QELTEN--
gm002202_Glyma0 -----------------MQE------------------------------P---------
gm014301_Glyma0 -----------------MAY-----HN-----PQDL-----PLHHFTDQ---QQHHNHTL
Os025814_Os06t0 -----------------MAF-----HY--------------QDHALAMD-----------
gm009102_Glyma0 -----------------MAY----HHN-----PQEL-----PLHHFTDQ---QQHHNQPL
gm046676_Glyma1 -----------------MAF-----HD-H--LQHEI-----AFQRFTEE---QELTEN--
gm047734_Glyma1 -----------------MAY-----HNHHNLSQQDLP----PLHHFPNQ-----------
AT4G32040.1 ------------------------------------------------------------
Os025815_Os06t0 ------------------------------------------------------------
pt006008_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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pt009401_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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Os010971_Os03t0 ------------------------------------------------------------
pt007118_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm014302_Glyma0 PHNSLLSD-----------PAS---------KPAS-----------------------DP
pp013684_Pp1s77 ---SLGGDHAEHY----LDPRNLRNQ--LDGAPLPK-IEDEARKGKDH-LRDSEDEDHHR
pt008243_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm036150_Glyma1 ------RDMQQRLP----------------------------------------------
Sb009772_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sm017497_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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gm042734_Glyma1 ------RDMQRLLPLS--------------------------------------------
pp030484_Pp1s15 ---QGFDDTQ--FPKEPLEPNTNLHQVAMEIQPNATIIGDESSRGRNPVVNESDDREDDN
gm046967_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sm010116_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm039671_Glyma1 ---SILPDQQQQLPSSP-EPNS---------KPPS-----------------------D-
Os006715_Os02t0 ------------------------------------------------------------
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gm046674_Glyma1 ------RDMQQRLP----------------------------------------------
gm002202_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm014301_Glyma0 PHNSLLSD-----------PAS---------KPAS-----------------------DP
Os025814_Os06t0 ------------------------------------------------------------
gm009102_Glyma0 VDNSLLSD-----------PAS---------KPAS-----------------------DP
gm046676_Glyma1 ------RDMQQRLP----------------------------------------------
gm047734_Glyma1 ---SMLPD-QQLLPSSP-EPNS---------KPPS-----------------------DP
AT4G32040.1 ------------QPPPQ------------------RHFSE----------------TPSL
Os025815_Os06t0 ------------------------------------------------------------
pt006008_POPTR_ -----------PSTGPTWLSNAVLRRHDD-------VLTQ----------TRIEK-PENN
gm039672_Glyma1 -----------LQTAPNWLNDALLRT----------HYTETTTNDATTNTATVAA-AAAN
pt009401_POPTR_ ------------TAPPNWLNTALLRSQQPPQQQTHHHFTD-----------------NNN
gm047733_Glyma1 H---------PLQTAPNWLNDALLRT----------HYTD------TTNTATVATNSNVN
Os010971_Os03t0 ------------------------------------------------------------
pt007118_POPTR_ ------------TAPPNWLNTALLRSQQPPQQRTHHHFTD-----------------NNN
gm014302_Glyma0 H-----------QPAPNWLNNALLRT----------DYTH------TTTTTTTNT-AANN
pp013684_Pp1s77 HLLENEGSDTRACGPPTWLSSALLRQQ-----------------------------ADQS
pt008243_POPTR_ -----------SSTGPPWLSNAVLRRNGD-------FIT-------------IEK-TENT
gm036150_Glyma1 --------------PPTWLNN-------------------------------------VN
Sb009772_Sorbi1 --------------------------------------------------------AAAA
Sm017497_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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pt028672_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm029620_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm024531_Glyma0 ------------GGAPTWLN---------------------------------------N
gm011307_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm042734_Glyma1 ------------GGAPTWLN---------------------------------------N
pp030484_Pp1s15 HLLGTE--DGIVKNGRTWLNSALLREQ--------NQASEDRS-------------GYGD
gm046967_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sm010116_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm039671_Glyma1 -----------LQTAPNWLNDALLRT----------HYTETTTNDATTNTATVAA-AAAN
Os006715_Os02t0 ------------------------------------------------------------
gm036151_Glyma1 --------------PPTWLNN-------------------------------------VN
gm046674_Glyma1 --------------PPTWLN---------------------------------------N
gm002202_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm014301_Glyma0 H-----------QPAPNWLNNALLRT----------DYTH------TTTTTTTNT-AANN
Os025814_Os06t0 ------------------------------------------------------------
gm009102_Glyma0 H-----------QPAPNWLNNALLRT----------HYTD------NNNNNNVNA-ANNN
gm046676_Glyma1 --------------PPTWLN---------------------------------------N
gm047734_Glyma1 H---------PLQTAPNWLNDALLRT----------HYTD------TTNTATVATNSNVN
AT4G32040.1 VTA------SFLNLPT-----TLTTADSDLAP-----PHRNGDNSV-----ADTNPRWLS
Os025815_Os06t0 --A------------------AAAAAETGGHH----------------------------
pt006008_POPTR_ TN----NG-----------------SEE--------------------------------
gm039672_Glyma1 SNV---NGSNFLNLNPGA-------SDA----------------------------QW--
pt009401_POPTR_ TN-------NFLNLHTAATTATATTSDSNSHN-----P-----------------VQWLS
gm047733_Glyma1 VKV---NGSNFLKLNPGA-------SDA----------------------------QWLA
Os010971_Os03t0 ------------------------------------------------------------
pt007118_POPTR_ TN-------NFLNLHSATPSTTATTSDSASHN-----P-----------------TQWLS
gm014302_Glyma0 SN----NSTNFLNLHTSA-------SDSG---------------------------QWQA
pp013684_Pp1s77 LDGTE-------NCQSESEKWCPVCSANGRQSCVCNTRMHAGDGNATSFLNQNTYTHWLS
pt008243_POPTR_ TN----NG-----------------SEE--------------------------------
gm036150_Glyma1 VNA---RQQNFLD------------SEKSVD-----------------------------
Sb009772_Sorbi1 AAA------------------AAAAAAAASSP----------------------------
Sm017497_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm046675_Glyma1 VNA---RQQNFLD------------TEKSVD-----------------------------
pt028672_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm029620_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm024531_Glyma0 SNAATLRQQNFLHLQPES---AATAAQQNDDV----------------------------
gm011307_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm042734_Glyma1 STAATLRQQNFLHLQPES---AAT-TQQNDD-----------------------------
pp030484_Pp1s15 HNAAE--------------RWCPVCSASGSQSCMCGMPMHAGDSSTISFPNQSTYTHWLS
gm046967_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Sm010116_Selmo1 -------------------------EEQG-------------------------------
gm039671_Glyma1 SNV---NGSNFLNLNPGA-------SDA----------------------------QW--
Os006715_Os02t0 -----------------------PSSAAASSP----------------------------
gm036151_Glyma1 VNA---RQQNFLD------------SEKSVD-----------------------------
gm046674_Glyma1 VNA---RQQNFLD------------TEKSVD-----------------------------
gm002202_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm014301_Glyma0 SN----NSTNFLNLHTSA-------SDSG---------------------------QWQA
Os025814_Os06t0 --A------------------AAAAAETGGHH----------------------------
gm009102_Glyma0 TN----NGTNFLNLHTST-------SDSG---------------------------QWLA
gm046676_Glyma1 VNA---RQQNFLD------------TEKSVD-----------------------------
gm047734_Glyma1 VKV---NGSNFLKLNPGA-------SDA----------------------------QWLA
AT4G32040.1 FHS-EMQNTG--EVRSEVIDGV---NADGETIL---------------------------
Os025815_Os06t0 -------------HPGFVGAGGV--VGGG-------------------------------
pt006008_POPTR_ ----------------ELIDSVSD------------------------------------
gm039672_Glyma1 ----PALHR----HPGEVIDA-----GAGDSM------VEHADLKGGG------------
pt009401_POPTR_ RSSSSLLNR----NHSDVIDDV---AAGGDHAIITSISQESSELKNMNKGEGEAM-----
gm047733_Glyma1 R---PALHR----HPGEVIDD-----GAGESM------VEHADLK---------------
Os010971_Os03t0 -------------DHGGMEMGVGSFTG-G------GGGGECSSSSATAAAAAAAA-----
pt007118_POPTR_ RSSSSLLNR----NHSTVIDDVSAAAAGGDHPIIASMSQESSELKSMNKSEGETMV----
gm014302_Glyma0 R---PILNR----NHSEVIDDV---AGAG---------AESGDLK---------------
pp013684_Pp1s77 MQGTGMHGPGHEHRPGPELDGKDNDFGVD-----RPQFRMATELNLSAA-HGRDGQRFL-
pt008243_POPTR_ ----------------ELVDSVSD------------------------------------
gm036150_Glyma1 --------R----NRSE-------------------SNCESEDLR---------------
Sb009772_Sorbi1 -------------NPS----GF----SSP-------------------------------
Sm017497_Selmo1 ------------------------------------------------------------
gm046675_Glyma1 --------R---NNRSE-------------------SNCESEDLR---------------
pt028672_POPTR_ -------------NLGMMGSGSGGALG-G------LSSGEMSVS----------------
gm029620_Glyma1 -------------GL-------------G------MM-GEVS------------------
gm024531_Glyma0 ----RAMDR----NRTE-------------------SNSEADDLA---------------
gm011307_Glyma0 -------------GL-----------GMG------MVSGEVSA-----------------
gm042734_Glyma1 ------------------------------------SNSEPDDLA---------------
pp030484_Pp1s15 MQGANMLASQ--HRTGGEVDA----KAAGFTVS-PQSTKMATELNLSPAGHGRDNHALFT
gm046967_Glyma1 -------------GLG---------MGMG------MMSGEVSA-----------------
Sm010116_Selmo1 --------------------------GGG-------------------------------
gm039671_Glyma1 ----PALHR----HPGEVIDA-----GAGDSM------VEHADLKGGG------------
Os006715_Os02t0 -------------NPSFSPGGG----GGG-------------------------------
gm036151_Glyma1 --------R----NRSE-------------------SNCESEDLR---------------
gm046674_Glyma1 --------R---NNRSE-------------------SNCESEDLR---------------
gm002202_Glyma0 -------------SL-------------G------LM-GEVS------------------
gm014301_Glyma0 R---PILNR----NHSEVIDDV---AGAG---------AESGDLK---------------
Os025814_Os06t0 -------------HPGFVGAGGV--VGGG-------------------------------
gm009102_Glyma0 R---PILNR----NHSEVIDDV---TGAGDSNM---AAAESGDLK---------------
gm046676_Glyma1 --------R---NNRSE-------------------SNCESEDLR---------------
gm047734_Glyma1 R---PALHR----HPGEVIDD-----GAGESM------VEHADLK---------------
AT4G32040.1 -----GVVGGE----------------------DWRSAS-YKAAILRHPMYEQLLAAHVA
Os025815_Os06t0 -----GGGGWE---------------------------R-EKAAIAAHPLYERLLEAHVA
pt006008_POPTR_ ---------------------------------NWERAK-CKAEILGHPLYEQLLAAHVA
gm039672_Glyma1 -----GDGGGDAV--------------------NWQIGR-WKAEILQHPLYEQLLSAHVS
pt009401_POPTR_ -----DSGGGESV-------------------VNWQNAR-YKADILTHPLYDQLLSAHVA
gm047733_Glyma1 ------DGGGDAV--------------------SWQIGR-CKTEILQHPLYEQLLSAHVA
Os010971_Os03t0 ----AAAAAAE-----------------------AEERQLLKGEIAVHPLCEQLVAAHVG
pt007118_POPTR_ ---ESGGGGGEAV-------------------VNWQNAK-CKADILAHPLYDQLLSAHVA
gm014302_Glyma0 ---------GETAPVD--------------GLLNWQNAR-LKAEILTHPLYEQLLSAHVA
pp013684_Pp1s77 --ELHPSLGGARYAGDYGR----TDWDGARHKAEWEEIR-NRALIVNHPLYPEMLMNHAA
pt008243_POPTR_ ---------------------------------NWERAK-CKAEILGHPFYEQLLAAHVA
gm036150_Glyma1 --------------------------------------E-YKADILGHPLYDQLLSAHVS
Sb009772_Sorbi1 -----GVVGGE---------------------------R-EKAAIAAHPLYERLLEAHVA
Sm017497_Selmo1 -----------------------------------MNAG-LKADIVTHPLYEQLLEAHVA
gm046675_Glyma1 --------------------------------------E-YKADILGHPLYDQLLSAHVS
pt028672_POPTR_ -------LSGD------------------------QSRQ-LKAEIATHPLYEQLLSAHVS
gm029620_Glyma1 ---------GD------------------------QHRQ-LKAEIATHPLYEQLLAAHVA
gm024531_Glyma0 --------------------------------------E-YKADILGHPLYDQLLSAHVS
gm011307_Glyma0 --------AGDH---------------------HHHHRQ-VKAEIATHPLYEQLLSAHVS
gm042734_Glyma1 --------------------------------------E-YKADILGHPLYDQLLSAHVS
pp030484_Pp1s15 DPRHSVAQGGSRYAEDYERTEHQTDWEGATQKMEWEQAR-DKFLIVAHPLYPDLLNAHAS
gm046967_Glyma1 --------AGD------------------------HHRQ-VKAEIANHPLYEQLLSAHVS
Sm010116_Selmo1 -------GGMDSK--------------------LWQSAR-LKADLVTHPLYEQLLSAHIS
gm039671_Glyma1 -----GDGGGDAV--------------------NWQIGR-WKAEILQHPLYEQLLSAHVS
Os006715_Os02t0 -----GVGGGE---------------------------R-EKAAVAAHPLYERLLEAHVA
gm036151_Glyma1 --------------------------------------E-YKADILGHPLYDQLLSAHVS
gm046674_Glyma1 --------------------------------------E-YKADILGHPLYDQLLSAHVS
gm002202_Glyma0 ---------GD------------------------HHRQ-LKAEITTHPLYEQLLAAHVA
gm014301_Glyma0 ---------GETAPVD--------------GLLNWQNAR-LKAEILTHPLYEQLLSAHVA
Os025814_Os06t0 -----GGGGWE---------------------------R-EKAAIAAHPLYERLLEAHVA
gm009102_Glyma0 ---------GDAA----------------------ANAR-LKAEILAHPLYEQLLSAHVA
gm046676_Glyma1 --------------------------------------E-YKADILGHPLYDQLLSAHVS
gm047734_Glyma1 ------DGGGDAV--------------------SWQIGR-CKTEILQHPLYEQLLSAHVA
: : **: :: * .
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