Input
| Putative repression domain
|
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AT4G36900.1 |
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|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os023742 |
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AT4G36900.1 |
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AT1G46768.1 |
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT4G36900.1 -------META------------TEVATVVSTPAVTVAAVATRKR---------------
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Sb030094_Sorbi1 RDGREGSQENHANAKSSCRYHCCCCCCTCLHNPQPPSAGPQVRA--------SEREREKR
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Sb033446_Sorbi1 ------PHDHH-------------------HHP-----------------------RRSG
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:
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Sb033446_Sorbi1 NK------LLLPNQPGGWRGTPLP------SARRRSPRRLPRFRCRPRRCWAPVVERLRR
pt038369_POPTR_ GR--------QQNQEKPYRGI-------------------------------------RM
* *
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Sb033446_Sorbi1 RQGTAEAAAEVEEEEEEGGSIAAFGCASGASGWRRSASRTSGRGSGWVPTPPPSPPRAPT
pt038369_POPTR_ RKW-GKWVAEIREPNKRSRI------------W---------LGS---------------
*: .. *:
AT4G36900.1 ---YSTPEAAAR------------------------------------------------
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Sb033446_Sorbi1 TRPCSTSAAAPR---------GSTSPTSSTA-----------------------------
pt038369_POPTR_ ---YSTPIAAAR------------------------------------------------
::. *..*
AT4G36900.1 --------------AYDTAVFYLRGPSARLNF----------------------------
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* . . ** *
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Os019236_Os04t0 -----------------------PEEISSLASLSEGGGASEPREPDGGTLSAASIRKKAI
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Sb030094_Sorbi1 DRHDGAPAAPPRAPEAPPPPPPPPPPAAAACPRARGGGAPPA--GAEAVAAAASVERARQ
gm029915_Glyma1 -----------------------PELLIGEGAAALT---------GGCDMSAASIRKKAS
Os023742_Os06t0 -----------------------PDQLDGAGGGGAGAGGAE----DHRELTAAVIRKKAA
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gm008859_Glyma0 -----------------------PELLSQDDDV----STQQQ-----GNMSADSIRKKAT
Sb033446_Sorbi1 -----------------------PPPSARRRPRSAPASTRST--AALALASLAAVLPLRS
pt038369_POPTR_ -----------------------PDLIHQEDEL--------------CDVSAASIRKKAT
* : :
AT4G36900.1 EVGAQVDALEAAGAGG--------NRHHHHHQHQRGNHDYVDNHSDYRINDDLMECSSKE
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gm014043_Glyma0 QVGARVDALQTA-------------LQQSSST-----------------------HSIS-
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gm047356_Glyma1 EVGARVDALHRQ--------------HPHALP----------------------------
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Os019236_Os04t0 EVGSRVDALQTGMMVAPTTHHRERQKHHHHHHH---HHPHLQPHGEEQHHHHEQKHQRT-
pt001651_POPTR_ EVGARVDAFETA-------------LNHHHHR----HH------------DDRQRNSSNS
Sb030094_Sorbi1 EPGSKPGAEPRE------------------------------------------------
gm029915_Glyma1 E-----------------------------------------------------LLSASC
Os023742_Os06t0 EVGARVDAQHSVVGAAAPVP-----LQPPQPPPPQRR-----------------------
gm011914_Glyma0 EVGARVDALHRQ--------------DPHAPP----------------------------
gm008859_Glyma0 QVGARVDALQTA-------------LQQSSSS-----------------------HSAN-
Sb033446_Sorbi1 RCRPTIAAAPRT------------------------------------------------
pt038369_POPTR_ EVGAKVDALQTA-------------LHASPGD-----------------------NSPA-
.
AT4G36900.1 GFKRC-------NGSL---ERVDLN---------------------------KLPDPETS
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Os019236_Os04t0 ----------AWSGRA---KNPDLN---------------------------QAPSPENS
pt001651_POPTR_ TSSNDNNETVVDSREL-KSRPVDLN---------------------------KVPDPEDS
Sb030094_Sorbi1 -----------LRRRVTSERASDTARLNVNDDVRYRLFPFPRRRPALQHMPLSSPSPRTY
gm029915_Glyma1 GG---------GSGDF-AVRVVDLN---------------------------KMPEPESS
Os023742_Os06t0 -----------------RTKNPDLN---------------------------REPTPDTS
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Sb033446_Sorbi1 -----------PTSTGSPPRTPQTT----SDFVVVLLLPHPSTTLLVLR---QNYSPKG-
pt038369_POPTR_ ------------NRLL-LSEKPDLN---------------------------EYPENCDE
:
AT4G36900.1 DDD---------------
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Sb030094_Sorbi1 DDPS--------------
gm029915_Glyma1 DCE-WNVN----------
Os023742_Os06t0 DDE---------------
gm011914_Glyma0 DCDYWGGD----------
gm008859_Glyma0 ------------------
Sb033446_Sorbi1 ------------------
pt038369_POPTR_ E-----------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT4G36900.1 |
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